本发明专利技术涉及一种分子生物学技术领域的智利番茄SCF复合体CUL1亚基蛋白序列及核酸序列；本发明专利技术涉及的智利番茄LA2405E3泛素连接酶SCF复合体亚单位CUL1蛋白序列如SEQ?ID?NO.3所示；本发明专利技术还涉及编码前述CUL1蛋白序列的核酸序列。利用本发明专利技术的CUL1蛋白基因，可以筛选出与之相关或者发生相互作用的物质、受体、抑制剂以及拮抗剂等；利用本发明专利技术可以通过基因工程手段过表达或低表达该基因，进一步研究由S-核酸酶介导的自交不亲和机制，对获得能够克服远缘杂交不亲和的野生番茄品种以及番茄品种的改良具有重要的理论支撑。
【技术实现步骤摘要】
【专利摘要】本专利技术涉及一种分子生物学
的智利番茄SCF复合体CUL1亚基蛋白序列及核酸序列；本专利技术涉及的智利番茄LA2405E3泛素连接酶SCF复合体亚单位CUL1蛋白序列如SEQ?ID?NO.3所示；本专利技术还涉及编码前述CUL1蛋白序列的核酸序列。利用本专利技术的CUL1蛋白基因，可以筛选出与之相关或者发生相互作用的物质、受体、抑制剂以及拮抗剂等；利用本专利技术可以通过基因工程手段过表达或低表达该基因，进一步研究由S-核酸酶介导的自交不亲和机制，对获得能够克服远缘杂交不亲和的野生番茄品种以及番茄品种的改良具有重要的理论支撑。【专利说明】智利番茄SCF复合体CUL1亚基蛋白序列及核酸序列
本专利技术属于分子生物学
，具体涉及一种智利番茄SCF复合体CUL1亚基蛋白序列及核酸序列。
技术介绍
番爺(Solanum lycopersicum),属于爺科番爺属，是世界重要的蔬菜作物和经济作物之一，现被广泛栽培于世界各地。据联合国粮农组织2013年统计数据显示，2011年全球番茄种植面积4.73X 106公顷，总产量达1.59X 108吨，生产总值为5.82X 101°美元，在全球粮农产品中占第八位。在番茄栽培生产中，由于叶霉病，灰霉病，以及各种虫害的发生，常给番茄产量和质量造成严重影响。相对于栽培番茄来讲，野生种及其近缘野生种具有多种特质，如抗菌性，耐旱性，耐盐性，且可溶性固形物含量高，具较高的维生素C，为改良育种提供了丰富的资源，通过远缘杂交将野生番茄的优良性状转移到栽培番茄中成为育种的主要技术。自交不亲和性是广泛存在于开花植物的种内生殖障碍。番茄由于同时存在自交不亲和自交亲和两种生殖机制，因此成为研究自交不亲和的模式植物。严格的自交不亲和性以及相应的与普通番茄种间杂交的单侧不亲和性，成为番茄遗传研究和育种工作最大的障碍。因此对于番茄自交不亲和机制的研究越来越多。目前研究发现茄科、蔷薇科、玄参科均是由雌配子决定因子s —核酸酶和花粉决定因子SLF介导的一类自交不亲和。SLF是F-box家族的一员，参与SCF复合体的组成，已成为研究最深而且最多的一个亚基，在拟南芥已发现的SLF基因已有700多种。泛素介导的蛋白水解是生物体中蛋白质调控的重要环节，是生物代谢的调控中心。而SCF复合体是泛素降解系统中最大的一类E3泛素连接酶复合体，通过介导多种信号蛋白和调控蛋白的泛素化来调控细胞周期、信号转导、转录水平，是多种生物代谢的关键调控因子。SCF复合体属于RING类的泛素连接酶，广泛存在于真核生物中，是植物中最大的一类多亚基E3酶，由⑶L1、SKP1、RBXU F-Box四个亚基组成。⑶L1是SCF复合体的中心，具有桥梁的作用，通过一侧的长柄状结构与SKP1结合通过SKP1接头作用与F-Box家族蛋白连接，另一侧的球状区域与RBX1形成一个二亚基催化中心，利用RBX1的RING锌指结构与E2泛素结合酶相作用，最后完成底物蛋白的识别和泛素化。目前发现真核生物中CUL蛋白存在五个同源家族。CUL1蛋白是CUL家族中最早被分离出来的一类，目前已在许多物种中的被克隆分离出来，如拟南芥、矮牵牛、梨、金鱼草。CUL1蛋白由N端415个氨基酸以及C端360个氨基酸组成，N端具有由五个螺旋组成的三个重复区域，C端由4HB (4螺旋束)组成且高度保守，从4HB开 始的200个碱基被认为是CUL蛋白家族的同源区域(包含H24螺旋、部分折叠片，WH-A区域)。目前的研究已经对于SCF复合体在自交不亲和中的的作用和功能已经有了部分证据。通过研究对比自交不亲和番茄中的⑶L1基因组成，有助于加深对自交不亲和和单侧杂交不亲和机制的认识，进而为克服远缘杂交，改良番茄育种提供了理论基础。经现有技术文献检索，尚未发现与本专利技术相同或者相似的技术主题。
技术实现思路
本专利技术的目的在于克服现有技术中的不足，提供一种智利番茄SCF复合体CUL1亚基蛋白序列及核酸序列。本专利技术公开了智利番茄中SCF复合体E3泛素连接酶亚基CUL1的编码序列，利用本专利技术公开的基因序列，通过转基因手段过表达或低表达该基因，可以进一步研究对于S-核酸酶介导的自交不亲和机制，同时对于番茄远缘杂交不亲和具有重要的理论支撑，进而对于番茄品种的改良具有重要的意义。本专利技术是通过以下技术方案实现的，第一方面，本专利技术涉及一种智利番茄LA2405E3泛素连接酶SCF复合体亚单位⑶L1蛋白序列，所述蛋白序列如SEQ ID N0.3所不。第二方面，本专利技术涉及一种编码前述⑶L1蛋白序列的核酸序列。优选地，所述核酸序列如SEQ ID N0.3所示。优选地，所述核酸序列如SEQ ID N0.1所示。第三方面，本专利技术还涉及一种编码所述的CUL1蛋白序列的核酸序列的用途，所述用途是利用基因工程手段或者干扰手段，调控所述核酸序列的表达，引起S-核酸酶介导的自交不亲和机制，获得改良的番茄品种。本专利技术具有如下的有益效果:利用本专利技术的CUL1蛋白，可以筛选出与之相关或者发生相互作用的物质、受体、抑制剂以及拮抗剂等；利用本专利技术可以通过基因工程手段，进一步研究由S-核酸酶介导的自交不亲和机制，对获得能够克服远缘杂交不亲和的野生番茄品种具有重要的理论支撑，进而对于番茄品种的改良具有重要的意义。同时，对于本领域技术人员而言，当明确本专利技术的核酸序列后，与SEQ ID N0.1第1-5931位的核苷酸序列有至少70%的同源性；或者所述的核苷酸序列能在中度严紧条件下与SEQ ID N0.1中从核苷酸第1-5931位的核苷酸序列杂交；这些序列显然也属于本专利技术的保护范畴；此外，具有SEQ ID N0.2所示的cDNA序列以及SEQ ID N0.3所示的氨基酸序列的多肽、或其保守性变异多肽、或其活性片段，或其活性衍生物，也应在本专利技术的保护范畴。本专利技术根据茄科基因序列数据库，运用生物信息学手段，通过序列比对和电子拼接，设计出合适的引 物，利用分子克隆的方法，克隆出野生智利番茄LA2405中E3泛素连接酶SCF复合体亚单位⑶L1蛋白基因；在智利番茄中⑶L1基因有19个外显子和18个内含子组成，产生长度为740个氨基酸的⑶L1蛋白。此外本专利技术涉及大肠杆菌DH5 a BL-21菌株，该菌已在萨姆布鲁克J，拉塞尔DW.分子克隆实验指南。黄培棠，王嘉玺，朱厚础，等译.第三版.北京:科技出版社，2002，中公开。大肠杆菌DH5aBL-21菌株、pMD19-T Simple载体、胶回收试剂盒等均可通过商业渠道取得。在本专利技术中，“分离的”、“纯化的” DNA是指，该DNA或片段已从天然状态下位于其两侧的序列中分离出来，还指该DNA或片段已经与天然状态下伴随核酸的组分分开，而且已经与在细胞中伴随其的蛋白质分开。在本专利技术中，术语“E3泛素连接酶SCF复合体亚单位⑶L1蛋白编码序列”指编码具有E3泛素连接酶SCF复合体亚单位⑶L1蛋白活性的核苷酸序列。该术语还包括能编码具有与野生的番茄E3泛素连接酶SCF复合体亚单位⑶L1相同功能蛋白的SEQ ID N0.2中开放阅读框序列的变异形式。这些变异形式包括(但并不限于):若干个(通常为1-90个，较佳地1-60个，更佳地1-20个，最佳地1-10个)核苷酸的缺失、插入和/或取代，以及在5’和本文档来自技高网...
【技术保护点】
一种智利番茄LA2405E3泛素连接酶SCF复合体亚单位CUL1蛋白序列，其特征在于，所述蛋白序列如SEQ?ID?NO.3所示。
【技术特征摘要】
【专利技术属性】
技术研发人员：赵凌侠，高美凤，彭会珍，陈露露，瞿海鸥，
申请(专利权)人：上海交通大学，
类型：发明
国别省市：
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