本发明专利技术公开了一种人SAMD9L基因及其编码蛋白产物的应用,该SAMD9L基因序列,尤其是其编码蛋白的开放读码框序列在肿瘤中发生错义突变、无义突变、移码突变等不同形式的基因结构变异,可作为诊断肝癌的特异性标志基因,使肝癌诊断更加准确、快速。本发明专利技术的人SAMD9L蛋白可以施用于肿瘤病人,以治疗或减轻病人因SAMD9L蛋白缺失、无功能或异常而导致的有关病症,且可通过转基因技术使本发明专利技术的人SAMD9L基因在癌细胞中过量表达,或通过体外补给SAMD9L蛋白,以控制癌细胞增殖、转移而达到治疗肿瘤的目的。
【技术实现步骤摘要】
人SAMD9L基因及其编码蛋白产物的应用
本专利技术涉及一种基因及其编码蛋白产物的应用,特别是涉及一种人SAMD9L基因及其编码蛋白产物在肝癌诊断、治疗中的应用。
技术介绍
肝癌每年导致60万人死亡,是严重威胁我国人民健康的恶性肿瘤之一。肝癌发病涉及多种因素,包括乙肝病毒、丙肝病毒、酒精、黄曲霉素污染等。在我国肝癌病人中,乙肝病毒感染是主要因素。癌基因的激活、抑癌基因的失活是肝癌发病的分子机制。尽管之前的研究已发现了肝癌中抑癌基因,例如TP53的失活,癌基因的激活,例如β-catenin、gpl30都是体细胞突变所导致的,但肝癌发生发展中的遗传学事件还不是很清楚。遗传异常是肿瘤发生、转移所必须的,但是目前在临床肝癌样本中仅发现少数基因具有相对低频率的体细胞突变提示还可能存在其它重要基因的体细胞突变能够导致肝癌发生及转移。人SAMD9L基因定位于人7q21.2染色体上,其横向同源基因SAMD9基因与其头尾相接。该基因普遍表达于人各组织中,发挥调控细胞增殖、抑制瘤性。外显子组测序是针对基因组中的蛋白质编码区,靶向富集外显子区域测序,以发现疾病相关遗传变异的技术。该技术近年越来越多地应用于发现人类基因组低频变异、鉴定单基因遗传病致病基因和肿瘤等复杂疾病易感基因研究,成为人类疾病相关变异研究的重要工具。目前,还没有出现涉及人SAMD9L蛋白抑制肿瘤用途的公开报道。
技术实现思路
本专利技术要解决的技术 问题之一是提供一种SAMD9L基因及其表达产物在制备诊断肝癌的产品中的应用。本专利技术要解决的技术问题之二是提供一种SAMD9L基因及其表达产物在制备治疗肝癌的药物中的应用。本专利技术要解决的技术问题之三是提供一种抑制肿瘤细胞生长的药物组合物。本专利技术要解决的技术问题之四是提供本专利技术的人SAMD9L蛋白在制备抑制肿瘤生长的药物中的应用。为了解决上述技术问题,本专利技术通过如下技术方案实现:在本专利技术的一个方面,提供了 SAMD9L基因及其表达蛋白在制备诊断肝癌的产品中的应用。所述诊断肝癌的产品包括:用DNA序列分析法诊断肝癌的产品或用定量PCR诊断肝癌的产品。其中,所述用DNA序列分析法诊断肿瘤的产品包括:特异性扩增SAMD9L基因的引物与测序引物;用定量PCR诊断肝癌的产品,包括:特异性扩增SAMD9L基因的引物。用于制备用DNA序列分析法诊断肝癌的产品中的人SAMD9L基因的引物,具有如SEQ ID NO: 1-2,3-4,5-6,7-8,9-10,1卜12,13-14,15-16,17-18,19-20,2卜22,23-24 或25-26所示的序列或其互补序列。用于制备用定量PCR诊断肝癌的产品的一对特异扩增人SAMD9L基因的引物中,上游引物序列具有如SEQ ID NO: 27所示的序列或其互补序列,所述引物对的下游引物序列具有如SEQ ID N0:28所示的序列或其互补序列。在本专利技术的另一方面,还提供了一种载体,它包含人SAMD9L基因。所述SAMD9L基因包括与目前国际公共核酸序列数据库GeneBank中SAMD9L基因(NM_152703)DNA序列具有70%以上同源性,且编码相同功能蛋白质的DNA序列;在本专利技术的另一方面,还提供了一种含有上述载体的遗传工程化的宿主细胞。本专利技术的人SAMD9L基因及其表达产物,还可在制备治疗肝癌的药物中的应用。其中,所述治疗肝癌的药物包括:含有人SAMD9L基因的药物,携带SAMD9L基因的载体或宿主细胞所形成的药物,或人SAMD9L蛋白质药物。在本专利技术的另一方面,还提供了一种抑制肿瘤细胞生长的药物组合物,该组合物含有安全有效量的所述的人SAMD9L蛋白质(人SAMD9L基因编码的蛋白质)及药学上可接受的载体。本专利技术还提供了一种人SAMD9L蛋白质在制备抑制肿瘤生长、转移的药物中的应用。所述SAMD9L蛋白包括SAMD9L蛋白其保守性变异蛋白质、或其活性片段,或其活性衍生物,具有与SAMD9L蛋白质相同功能的变异形式。这些变异形式包括(但并不限于):若干个(通常为1-50个,较佳地1-30个,更佳地1-20个,最佳地1-10个)氨基酸的缺失、插入和/或取代,以及在C末端和/或N末端添加一个或数个(通常为20个以内,较佳地为10个以内,更佳地为5个以内)氨基酸。例如,在本领域中,用性能相近或相似的氨基酸进行取代时,通常不会改变蛋白质的功能。又比如,在C末端和/或N末端添加一个或数个氨基酸通常也不会改变蛋白质的功能。本专利技术的人SAMD9L蛋白质的变异形式包括:同源序列、保守性变异体、等位变异体、天然突变体、诱导突变体、在高或低的严紧条件下能与SAMD9L的DNA杂交的DNA所编码的蛋白、以及利用抗SAMD9L蛋白质的抗血清获得的多肽或蛋白。本专利技术还提供了其他蛋白质,如包含SAMD9L蛋白质或其片段的融合蛋白。除了几乎全长的蛋白质外,本专利技术还包括SAMD9L蛋白质的可溶性片段。通常,该片段具有SAMD9L多肽序列的至少约10个连续氨基酸,通常至少约30个连续氨基酸,较佳地至少约50个连续氨基酸,更佳地至少约50个连续氨基酸,更佳地至少约80个连续氨基酸,最佳地至少约100个连续氨基酸。本专利技术中,“SAMD9L保守性变异蛋白质”指与SAMD9L蛋白氨基酸序列相比,有至多10个,较佳地至多8个,更佳地至多5个氨基酸被性质相似或相近的氨基酸所替换而形成蛋白质。本专利技术还包括SAMD9L蛋白或多肽的类似物。这些类似物与天然SAMD9L蛋白质的差别可以是氨基酸序列上的差异,也可以是不影响序列饿修饰上的差异,或者兼而有之。这些蛋白质包括天然或诱导的遗传变异体。诱导变异体可以通过各种技术得到,如通过辐射或暴露于诱变剂而产生随机诱变,还可通过定点诱变法或其他已知分子生物学的技术。类似物还包括具有不同于天然L-氨基酸的残基(如D-氨基酸)的类似物,以及具有非天然存在的或合成的氨基酸(如β、Y-氨基酸)的类似物。应理解,本专利技术的蛋白质并不限于上述列举的代表性的蛋白质。修饰(通常不改变一级结构)形式包括:体内或体外的蛋白质的化学衍生形式如乙酰化或羧基化。修饰还包括糖基化,如那些在蛋白质的合成和加工中或进一步加工步骤中进行糖基化修饰而产生的蛋白质。这种修饰可以通过将多肽暴露于进行糖基化的酶(如哺乳动物的糖基化酶或去糖基化酶)而完成。修饰形式还包括具有磷酸化氨基酸残基(如磷酸酪氨酸,磷酸丝氨酸,磷酸苏氨酸)的序列。还包括被修饰从而提高了其抗蛋白水解性能或优化了溶解性能的蛋白质。在本专利技术中,可选用本领域已知的各种载体,如市售的载体,包括质粒,粘粒,噬菌体,病毒等。在生产本专利技术的SAMD9L蛋白质时,可以将SAMD9L编码序列可操作地连于表达调控序列,从而形成SAMD9L蛋白表达载体。在本专利技术中,“可操作地连于”指这样一种状况,即线性DNA序列的某些部分能够影响同一线性DNA序列其他部分的活性。例如,如果信号肽DNA作为前体表达并参与蛋白质的分泌,那么信号肽(分泌前导序列)DNA就是可操作地连于蛋白质DNA ;如果启动子控制序列的转录,那么它是可操作地连于编码序列;如果核糖体结合位点被置于能使其翻译的位置时,那么它是可操作地连于编码序列。一般,“可操作地连于”意味着相邻,而对于分泌前导序列则意味着在阅读本文档来自技高网...
【技术保护点】
一种人SAMD9L基因及其表达产物的应用,其特征在于:所述人SAMD9L基因及其表达产物在制备诊断肝癌的产品中的应用。
【技术特征摘要】
1.一种人SAMD9L基因及其表达产物的应用,其特征在于:所述人SAMD9L基因及其表达产物在制备诊断肝癌的产品中的应用。2.如权利要求1所述的应用,其特征在于:所述诊断肝癌的产品包括:用DNA序列分析法诊断肝癌的产品或用定量PCR诊断肝癌的产品。3.如权利要求2所述的应用,其特征在于:所述用DNA序列分析法诊断肿瘤的产品包括:特异性扩增SAMD9L基因的引物与测序引物; 用定量PCR诊断肝癌的产品,包括:特异性扩增SAMD9L基因的引物。4.一种人SAMD9L基因及其表达产物的应用,其特征在于:所述人SAMD9L基因及其表达产物在制备治疗肝癌的药物中的应用。5.如权利要求4所述的应用,其特征在于:所述治疗肝癌的药物包括:含有人SAMD9L基因的药物,携带SAMD9L基因的载体或宿主细胞所形成的药物,或人SAMD9L蛋白质药物。6.一种人SAMD9L蛋白质的应用,其特征在于:所述人SAMD9L蛋白质在制备抑制肿瘤生长、转移的药物中的应用。7.一种用于...
【专利技术属性】
技术研发人员:王群,韩泽广,邓庆,
申请(专利权)人:上海人类基因组研究中心,
类型:发明
国别省市:
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