ATP6V1B2基因突变体及其应用制造技术

本发明专利技术涉及分离的编码ATP6V1B2突变体的核酸、分离的多肽、筛选易感常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征的生物样品的方法、筛选易感常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征的生物样品的系统以及用于筛选易感常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征的生物样品的试剂盒。其中，分离的编码ATP6V1B2突变体的核酸，与SEQ?ID?NO：1相比，具有c.C1516T突变。通过检测该突变体在生物样品中是否存在，可以有效地检测生物样品是否易感常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征。

【技术实现步骤摘要】
ATP6V1B2基因突变体及其应用
本专利技术涉及ATP6V1B2基因突变体及其应用。具体地，本专利技术涉及分离的编码ATP6V1B2突变体的核酸、分离的多肽、筛选易感常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征的生物样品的方法、筛选易感常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征的生物样品的系统以及用于筛选易感常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征的生物样品的试剂盒。
技术介绍
先天性耳聋伴甲发育不良综合征（deafnessandonychodystrohysyndrome,DOD）按遗传方式通常可分为两个特殊群体：常染色体隐性遗传的DOOR综合征（deafness–onychodystrohy–osteodystrophy-mentalretardationsyndrome）和常染色体显性遗传的DDOD综合征（dominantdeafnessandonychodystrohysyndrome）。DOOR综合征主要表现为先天性感音神经性聋、甲发育不良或缺失、拇指三节指骨以及不同程度的智力发育缓慢、癫痫、哑症等。此外，大多数DOOR综合征病人尿及血浆中α-酮戊二酸浓度增高。而DDOD综合征具有较轻的以上症状，即表现为先天性耳聋，甲发育不全，通常不涉及智力发育迟缓，无尿及血浆α-酮戊二酸的改变，圆锥形发育不全的牙齿也是DDOD综合征特点之一。而智力发育障碍是DOOR和DDOD综合征鉴别的重要特征。然而，现阶段对先天性耳聋伴甲发育不良综合征，尤其是DDOD综合征，尚无有效的诊断、治疗方法，且DDOD综合征的致病基因尚未明确，因此，目前对DDOD综合征的研究仍有待深入。
技术实现思路
本专利技术旨在至少解决现有技术中存在的技术问题之一。为此，本专利技术的一个目的在于提出DDOD综合征（有时也称为“常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征”）的致病基因及其致病突变。本专利技术是基于专利技术人的下列工作而完成的：专利技术人通过高通量外显子组测序联合候选基因突变验证的方法确定了常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征的致病基因及其致病突变（ATP6V1B2，c.C1516T）。根据本专利技术的第一方面，本专利技术提出了一种分离的编码ATP6V1B2突变体的核酸。根据本专利技术的实施例，该核酸与SEQIDNO：1相比，具有c.C1516T突变。根据本专利技术的实施例，专利技术人确定了ATP6V1B2的突变体，该突变体与DDOD综合征的发病密切相关，从而通过检测该突变体在生物样品中是否存在，可以有效地检测生物样品是否易感常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征。根据本专利技术的第二方面，本专利技术提出了一种分离的多肽。根据本专利技术的实施例，该多肽与SEQIDNO：2相比，具有p.R506X突变。通过检测生物样品中是否表达该多肽，可以有效地检测生物样品是否易感常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征。根据本专利技术的第三方面，本专利技术提出了一种筛选易感常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征的生物样品的方法。根据本专利技术的实施例，该方法包括以下步骤：从生物样品提取核酸样本；确定所述核酸样本的核酸序列；所述核酸样本的核酸序列与SEQIDNO：1相比，具有c.C1516T突变是所述生物样品易感常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征的指示。通过根据本专利技术实施例的筛选易感常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征（即DDOD综合征）的生物样品的方法，可以有效地筛选易感DDOD综合征的生物样品。根据本专利技术的第四方面，本专利技术提出了一种筛选易感常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征的生物样品的系统。根据本专利技术的实施例，该系统包括：核酸提取装置，所述核酸提取装置用于从所述生物样品提取核酸样本；核酸序列确定装置，所述核酸序列确定装置与所述核酸提取装置相连，用于对所述核酸样本进行分析，以便确定所述核酸样本的核酸序列；判断装置，所述判断装置与所述核酸序列确定装置相连，以便基于所述核酸样本的核酸序列与SEQIDNO：1相比，是否具有c.C1516T突变，判断所述生物样品是否易感常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征。利用该系统，能够有效地实施前述筛选易感常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征的生物样品的方法，从而可以有效地筛选易感常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征的生物样品。根据本专利技术的第五方面，本专利技术提出了一种用于筛选易感常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征的生物样品的试剂盒。根据本专利技术的实施例，该试剂盒含有：适于检测ATP6V1B2基因突变体的试剂，其中与SEQIDNO：1相比，所述ATP6V1B2基因突变体具有c.C1516T突变。利用根据本专利技术的实施例的试剂盒，能够有效地筛选易感常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征的生物样品。本专利技术的附加方面和优点将在下面的描述中部分给出，部分将从下面的描述中变得明显，或通过本专利技术的实践了解到。附图说明本专利技术的上述和/或附加的方面和优点从结合下面附图对实施例的描述中将变得明显和容易理解，其中：图1显示了根据本专利技术实施例的筛选易感DDOD综合征的生物样品的系统及其组成部分的示意图，其中，A为根据本专利技术实施例的筛选易感DDOD综合征的生物样品的系统的示意图，B为根据本专利技术实施例的核酸提取装置的示意图，C为根据本专利技术实施例的核酸序列确定装置的示意图；以及图2显示了根据本专利技术实施例的对2个患者家系成员的ATP6V1B2基因突变位点c.C1516T突变的Sanger测序验证峰图。具体实施方式下面详细描述本专利技术的实施例，所述实施例的示例在附图中示出，其中自始至终相同或类似的标号表示相同或类似的元件或具有相同或类似功能的元件。下面通过参考附图描述的实施例是示例性的，仅用于解释本专利技术，而不能理解为对本专利技术的限制。ATP6V1B2基因突变体根据本专利技术的第一方面，本专利技术提出了一种分离的编码ATP6V1B2突变体的核酸。根据本专利技术的实施例，与SEQIDNO：1相比，该核酸具有c.C1516T突变。在本文中所使用的表达方式“编码ATP6V1B2突变体的核酸”，是指与编码ATP6V1B2突变体的基因相对应的核酸物质，即核酸的类型不受特别限制，可以是任何包含与ATP6V1B2突变体的编码基因相对应的脱氧核糖核苷酸和/或核糖核苷酸的聚合物，包括但不限于DNA、RNA或cDNA。根据本专利技术的一个具体示例，前面所述的编码ATP6V1B2突变体的核酸为DNA。根据本专利技术的实施例，专利技术人确定了ATP6V1B2基因的突变体，该突变体与常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征的发病密切相关，从而通过检测该突变体在生物样品中是否存在，可以有效地检测生物样品是否易感常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征，也可以通过检测该突变体在生物体中是否存在，可以有效地预测生物体是否易感常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征。该编码ATP6V1B2突变体的核酸，是本申请的专利技术人通过高通量外显子组测序联合候选基因突变验证的方法确定的常染色体显性遗传先天性耳聋伴甲发育不良综合征的致病基因上的突变。并且，在现有技术中并未见ATP6V1B2基因及其c.C1516T突变与DDOD综合征相关的报道。野生型ATP6V1B2基因的cDNA本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种分离的编码ATP6V1B2突变体的核酸，其特征在于，与SEQ?ID?NO：1相比，所述核酸具有c.C1516T突变，任选地，所述核酸为DNA。

【技术特征摘要】
1.一种分离的编码ATP6V1B2突变体的核酸，其特征在于，与SEQIDNO：1相比，所述...

【专利技术属性】
技术研发人员：袁永一，戴朴，戴梅枝，王丽娟，吴婧，王俊，汪建，杨焕明，
申请(专利权)人：中国人民解放军总医院，深圳华大基因科技有限公司，
类型：发明
国别省市：