本发明专利技术公开了一种鸭甲肝病毒通用的LAMP检测试剂盒。本发明专利技术采用环介导等温扩增(LAMP)技术,根据鸭甲肝病毒3D基因的保守序列设计一对外引物和一对内引物(如SEQ?NO.1-4),建立鸭甲肝病毒的检测试剂盒,包含以下成分:TRIZol;反应液;SYBR?Green?Ⅰ;阳性对照;DEPC处理水。本发明专利技术试剂盒具有操作简便、检测快速、敏感性高、特异性好等优点,特别是对仪器的要求低,非常适合在基层实验室,甚至现场进行快速诊断。
【技术实现步骤摘要】
【专利摘要】本专利技术公开了一种鸭甲肝病毒通用的LAMP检测试剂盒。本专利技术采用环介导等温扩增(LAMP)技术,根据鸭甲肝病毒3D基因的保守序列设计一对外引物和一对内引物(如SEQ?NO.1-4),建立鸭甲肝病毒的检测试剂盒,包含以下成分:TRIZol;反应液;SYBR?Green?Ⅰ;阳性对照;DEPC处理水。本专利技术试剂盒具有操作简便、检测快速、敏感性高、特异性好等优点,特别是对仪器的要求低,非常适合在基层实验室,甚至现场进行快速诊断。【专利说明】—种鸭甲肝病毒通用的LAMP检测试剂盒
本专利技术涉及一种鸭甲肝病毒通用的LAMP检测试剂盒,专用于鸭甲肝病毒的诊断,属于生物
。
技术介绍
鸭甲肝病毒(Duck hepatitis A virus,DHAV)引起的鸭病毒性肝炎是影响我国养鸭业发展的主要疾病之一。该病毒主要感染3周龄内的雏鸭,感染率高、发病快、死亡率高,若不及时治疗,死亡率可达50%以上。该病波及面广、发病率高、危害严重,每年都会给我国的养鸭业造成严重的经济损失。鸭甲肝病毒分为A、B、C三个基因型,它们之间无抗原交叉性,目前在我国流行的主要是A型和C型。对于鸭甲肝病毒的实验室诊断,可以采取传统的血清中和实验,但该方法存在耗时长、不易标准化等缺点。也可以采取快速、灵敏、特异的分子生物学检测技术,如RT-PCR、荧光定量PCR等,但这些方法需要PCR仪或者荧光定量PCR仪、电泳系统等较为复杂的仪器设备,大多数小型或个体的养殖场,缺乏此类硬件条件,使得这些方法的推广与应用受到限制。环介导等温扩增(LAMP)技术是一种新的体外扩增特异性基因的分子生物学方法。该方法只需要简单的水浴锅,在30-90min内即可扩增大量的目的基因,而且可以不需要核酸电泳的方法来判断结果,仅通过在紫外线下肉眼观察就能判断结果。LAMP检测技术具有操作简便、检测快速、高效实用等优点,非常适合在基层实验室,甚至现场进行快速诊断。
技术实现思路
本专利技术的目的是利用L AMP技术建立一种鉴别鸭甲肝病毒通用的检测试剂盒,该试剂盒具有快速、准确、敏感性高、特异性好、成本低等特点,完全能够满足基层现场快速检测鸭甲肝病毒感染的需要。本专利技术的技术方案是:一种鸭甲肝病毒通用的LAMP检测试剂盒,其特征是,包括以下组分(50次量):I)TRIZol:50ml ;2)反应液:2000 μ L,包括 IOXBst buffer250 μ L、dNTP(10mmol/L) 100 μ L、MgCl2(25mmol/L)300y L, betaine (5mol/L) 200 μ L、外引物 DHV-F3、DHV-B3 (10 μ mol/L)各50μ L、内引物 DHV-FIP、DHV-BIP (40 μ mol/L)各 100 μ L、RNA 酶抑制剂(40U/μ L) 100 μ L、反转录酶 AMV (5U/ μ L) 100 μ L、Bst DNA 聚合酶(8U/ μ L) 100 μ L、DEPC 处理水 550 μ L ;3) SYBR Green I:100μ L ;4)阳性对照:重组质粒T-DH250 μ L,浓度为0.1ng/ μ L ;5) DEPC 处理水:1ml。上述试剂除SYBR Green I购自Invitrogen公司外,其余均购自大连宝生物(TAKARA)公司。所述检测引物DHV-F3、DHV-B3、DHV-FIP, DHV-BIP 依次为:DHV-F3:5’-ATCTGGYTGTGCTGTTGGRAT-3’ (SEQ N0.1)DHV-B3:5’-CATARCAYTGRTTGATGTCATAKCC-3’ (SEQ N0.2)DHV-FIP:5’-ACTCARAGABCCATCRAAWCCAGTTTTGAGTGGGAYAATYTGTTRGC-3’ (SEQN0.3)DHV-BIP: 5' -CHCAYTATGTAACTGATGAGATHTGGTTTTACAGTRGTRCAKGGDGAT CCTGA-3’(SEQ N0.4)(R = A^G;Y = C^T;H = A, T^C ;D=G, A或T;W = A或T;B = G,T 或C;K =G或T)所述重组质粒T-DH的详细制备方法:按照TRIZol试剂说明提取A型鸭甲肝病毒RNA,利用引物DHV-F3/DHV-B3进行RT-PCR,扩增目的条带,反应条件如下:RT 反应体系(20μ L):10mmol/L dNTPl.0 μ L、5 X RT 缓冲液 4.0 μ L、20pmol/μ L 的引物 DHV-B31.0 μ L、40U/ μ L RNA 酶抑制剂 0.5 μ L、RNA 模板 I μ L、DEPC 水 11.5 μ L ;置于PCR扩增仪进行反应,5U/ μ L反转录酶AMVl μ L于70°C 5min后加入;反应程序:70°C 5min,42°C 30min,95°C 2min。PCR 反应体系(50μ L):ddH2039y L、20pmol/y L 的引物 DHV-F31.0 μ L、10XPCR缓冲液4.5 μ L、5U/ μ L Taq DNA聚合酶0.5 μ L、RT产物5.0 μ L ;置于PCR扩增仪进行反应,反应程序:95°C 2min预变性;94°C变性15sec、60°C退火15sec、72°C延伸20sec,共30个循环;72°C 延伸 5min。回收目的条带,与载体pMD18-T连接,转化DH5a感受态细胞,提取质粒,PCR鉴定阳性后送上海博尚生物工程有限公司测序。序列正确的质粒标记为T-DH作为鸭甲肝病毒的阳性对照。所述检测试剂盒的操作步骤:1)RNA提取:取200 μ L待检鸭病料匀浆液,加入Iml TRIZol,充分震荡,静置IOmin后加入200 μ L氯仿,充分混匀,静置5min后,12000rpm离心IOmin,取上清加入等体积的异丙醇,充分混匀后,放_20°C静置Ih以上。然后12000rpm离心15min,弃掉上清,加入75%酒精500 μ L,12000rpm离心5min,弃掉上清,RNA沉淀干燥后加入10 μ L DEPC处理水,备用;2) LAMP反应:取20 μ L反应液,加入5 μ L待检RNA,混匀后按下面的程序进行反应:6(TC 90min,85°C 2min ;3)阳性对照:取20 μ L反应液,加入5μ L阳性对照物,混匀后按下面的程序进行反应:60°C 90min,85°C 2min ;4)结果判断:可采取两种方法判断结果。一是电泳观察:取5 μ L PCR产物加入1.5%琼脂糖凝胶中进行电泳观察,若出现阶梯状条带,可判断为鸭甲肝病毒阳性;若未出现,则可判断为鸭甲肝病毒阴性。二是肉眼观察:反应结束后,取I μ L SYBR Green I加入产物中,混匀后在紫外线下观察结果。若有白色荧光,可判断为鸭甲肝病毒阳性;若无,则可判断为鸭甲肝病毒阴性。本专利技术具有下列优点:1.本专利技术建立的LAMP检测方法对鸭甲肝病毒RNA的最低检出量为0.lpg,敏感性比RT-PCR方法提高10倍;2.本专利技术建立的LAMP检测技术具有操作简便、检测快速、高效实用等优点,特别是对仪器的要求低,非常本文档来自技高网...
【技术保护点】
一种鸭甲肝病毒通用的LAMP检测试剂盒,其特征是,它包括下述引物:正向外引物DHV?F3:5“?ATCTGGYTGTGCTGTTGGRAT?3“;反向外引物DHV?B3:5“?CATARCAYTGRTTGATGTCATAKCC?3“;正向内引物DHV?FIP:5“?ACTCARAGABCCATCRAAWCCAGTTTTGAGTGGGAY?AATYTGTTRGC?3“;反向内引物DHV?BIP:5“?CHCAYTATGTAACTGATGAGATHTGGTTTTACAGTRGT?RCAKGGDGAT?CCTGA?3“;其中R=A或G;Y=C或T;H=A,T或C;D=G,A或T;W=A或T;B=G,T或C;K=G或T。
【技术特征摘要】
【专利技术属性】
技术研发人员:于可响,黄兵,李玉峰,马秀丽,史玉颖,姜亦飞,林树乾,宋敏训,李峰,
申请(专利权)人:山东省农业科学院家禽研究所,
类型:发明
国别省市:
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。