【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】虚拟细胞染色相关申请本申请要求2010年12月7日提交的美国临时申请系列号61/420,708、2011年3月8日提交的美国临时申请系列号61/450,519和2011年9月30日提交的美国临时申请系列号61/541,375在35U.S.C.§119(e)下的权益。上述申请的公开内容通过引用并入本文,如同完整地阐述。
本公开内容一般地涉及生物学材料的成像,更具体地涉及用于细胞和有关结构的虚拟染色的系统、方法、软件和计算机可用介质。
技术介绍
在成像实验中,使用染料或染色剂来标记生物细胞的不同细胞器或结构。例如,将细胞的这些结构染色,以分析或研究细胞。经常同时将细胞的2个或更多个结构染色。这被称作多路染色。串扰是从多路染色发射的颜色的重叠或混合。如果在从多路染色发射的颜色中存在过多的串扰,那么不可能区分各个结构。所以,也就不可能鉴别或分析细胞的特定结构用于实验。传统地,在包括多路染色的成像实验中,通过试验和误差已经很大程度上实现了串扰防止。通常,购买试剂,执行方案,将细胞染色,并使用适合的显微镜来确定串扰是否明显。然后反复地执行这些步骤,直到发现不会产生串扰的染色剂组合。这样的方案经常需要购买和使用超过必要的试剂,且也可以显著增加执行成像实验所需的总时间。
技术实现思路
提供了用于建立虚拟细胞染色的系统和方法。具体地,提供了用于使在多路染色应用中使用的试剂之间的颜色串扰最小化的技术。在一个方面,提供了用于显示生物细胞的一种或多种细胞结构的系统。所述系统包括存储器、输入装置、显示器和处理器。所述存储器被构造成存储生物细胞的多个细胞结构以及每个细胞结构的一种或多种染 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2010.12.07 US 61/420,708;2011.03.08 US 61/450,519;1.一种用于显示生物细胞的一种或多种人工建立的细胞结构的系统,所述系统包括:存储器,所述存储器被构造成存储生物细胞的多个虚拟细胞结构和每个细胞结构的一种或多种虚拟染色颜色;输入装置;显示器;和处理器,所述处理器与所述存储器、所述输入装置和所述显示器通信,所述处理器被构造成从所述输入装置接收第一和第二选定细胞结构,其中所述第二选定细胞结构与第一选定细胞结构不是相同的细胞结构;从所述存储器检索所述第一和第二选定细胞结构中每一种的一种或多种染色颜色;将所述第一和第二选定细胞结构中每一种的一种或多种染色颜色显示在所述显示器上;从所述输入装置接收第一和第二选定染色颜色;和将具有所述第一选定染色颜色的第一选定细胞结构和具有所述第二选定染色颜色的第二选定细胞结构显示在所述显示器上的示例性人工建立的细胞图像中,所述示例性人工建立的细胞图像代表具有所述第一选定染色颜色的第一选定细胞结构以及具有所述第二选定染色颜色的第二选定细胞结构的染色,其中显示器上的所述示例性人工建立的细胞图像包括在第一选定染色颜色和第二选定染色颜色之间的串扰。2.根据权利要求1所述的系统,其中所述存储器被进一步构造成,存储能够产生每种染色颜色的一种或多种试剂产品,且其中所述处理器被进一步构造成,从所述存储器检索第一和第二选定染色颜色的一种或多种试剂产品,在所述显示器上显示第一和第二选定染色颜色的一种或多种试剂产品,从所述输入装置接收选择的试剂产品,和在所述显示器上显示所述选择的试剂产品。3.根据权利要求1所述的系统,其中所述多个虚拟细胞结构被存储为图像。4.根据权利要求3所述的系统,其中所述图像是三维图像。5.根据权利要求1所述的系统,其中所述示例性人工建立的细胞图像是2个或更多个细胞图像的编绘图。6.根据权利要求2所述的系统,其中所述处理器被进一步构造成,在所述显示器上显示所述选择的试剂产品作为可选项,当被选择时,所述可选项会提供关于所述选择的试剂产品的更多信息。7.根据权利要求2所述的系统,其中所述处理器被进一步构造成,在所述显示器上显示可选项,当被选择时,所述可选项开始定购所述选定的试剂产品的过程。8.一种用于显示生物细胞的人工建立的细胞结构的方法,所述方法包括:使用存储器,存储生物细胞的多个虚拟细胞结构和每个细胞结构的一种或多种虚拟染色颜色;使用处理器,从输入装置接收第一和第二选定细胞结构,其中第二选定细胞结构与第一选定细胞结构不同;使用所述处理器,从所述存储器检索所述第一和第二选定细胞结构中每一种的一种或多种染色颜色;使用所述处理器,在显示器上显示所述第一和第二选定细胞结构中每一种的一种或多种染色颜色;使用所述处理器,从所述输入装置接收第一和第二选定染色颜色;和使用所述处理器,将具有第一选定染色颜色的第一选定细胞结构和具有第二选定染色颜色的第二选定细胞结构显示在所述显示器上的示例性人工建立的细胞图像中,所述示例性人工建立的细胞图像代表具有所述第一选定染色颜色的第一选定细胞结构和具有第二选定染色颜色的第二选定细胞结构的染色,其中显示器上的所述示例性人工建立的细胞图像包括使用处理器在第一选定染色颜色和第二选定染色颜色之间的串扰。9.根据权利要求8所述的方法,所述方法另外包括:存储能够产生每种染色颜色的一种或多种试剂产品,使用所述处理器从所述存储器检索所述第一和第二选定染色颜色的一种或多种试剂产品,使用所述处理器在所述显示器上显示所述第一和第二选定染色颜色的一种或多种试剂产品,使用所述处理器从所述输入装置接收选择的试剂产品,和使用所述处理器在所述显示器上显示所述选择的试剂产品。10.根据权利要求8所述的方法,其中所述多个虚拟细胞结构被存储为图像。11.根据权利要求10所述的方法,其中所...
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