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mRNA3’末端文库及其构建、测序方法和用途技术

技术编号:9236371 阅读:220 留言:0更新日期:2013-10-09 23:47
本发明专利技术公开了mRNA3’末端文库及其构建、测序方法和用途。其中,构建mRNA3’末端文库的方法包括:(a)将待测样本的总RNA进行片段化处理;(b)以RNA片段作为模板进行第一反转录合成cDNA第一链;(c)将DNA-RNA杂合体进行第一反转录合成cDNA第二链;(d)以双链cDNA作为模板进行体外转录;(e)以cRNA作为模板进行第二反转录合成cDNA第一链;(f)以第二反转录产物作为模板进行PCR扩增;(g)回收300-500bp的PCR产物,以便获得目的片段,该目的片段构成所述mRNA3’末端文库。该方法简单易行、成本低、可重复性好,适用于微量样本,并且获得的mRNA3’末端文库包含生物信息准确、信息量大,能够有效用于确定待测样本3’UTR的序列信息。

【技术实现步骤摘要】

【技术保护点】
一种构建mRNA3’末端文库的方法,其特征在于,包括以下步骤:(a)将待测样本的总RNA进行片段化处理,以便获得RNA片段;(b)以所述RNA片段作为模板,利用第一引物进行第一反转录合成cDNA第一链,以便获得DNA?RNA杂合体;(c)将所述DNA?RNA杂合体进行第一反转录合成cDNA第二链,以便获得双链cDNA;(d)以所述双链cDNA作为模板进行体外转录,以便获得cRNA;(e)以所述cRNA作为模板,利用第二引物进行第二反转录合成cDNA第一链,以便获得第二反转录产物;(f)以所述第二反转录产物作为模板进行PCR扩增,以便获得PCR产物;(g)回收300?500bp的PCR产物,以便获得目的片段,所述目的片段构成所述mRNA3’末端文库,其中,所述第一引物具有SEQ?ID?NO:1所示的核苷酸序列,所述第二引物具有SEQ?ID?NO:2所示的核苷酸序列。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:徐安龙孙雨付永贵李宇新梁嘉慧
申请(专利权)人:中山大学
类型:发明
国别省市:

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