用于治疗诊断的生物标志物制造技术

对可用于诊断、治疗相关或预后方法的生物标志物进行评估以表征表型(如状况或疾病)或者疾病的阶段或进程。来自体液的循环生物标志物可用于确定生理状态谱或确定表型。这些生物标志物包括核酸、蛋白质以及循环结构，如囊泡。生物标志物可用于治疗诊断目的以选择针对疾病、状况、疾病阶段以及状况阶段的候选治疗方案，并且还可用于确定疗效。所述生物标志物可以是循环生物标志物，包括囊泡和微RNA。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于治疗诊断的生物标志物
技术介绍
用于诸如癌症这样的状况和疾病的生物标志物包括生物分子，诸如蛋白质、肽、月旨质、RNA、DNA及它们的变体和修饰。特异性生物标志物(例如DNA、RNA和蛋白质)的鉴定可以提供用于状况或疾病的诊断、预后或治疗诊断(theranosis)的生物印记。生物标志物可在体液中检测，包括循环DNA、RNA、蛋白质和囊泡(vesicle)。循环生物标志物包括蛋白质(诸如PSA和CA125)以及核酸(诸如SEPT9DNA和PCA3信使RNA(mRNA))。循环生物标志物还包括循环囊泡。囊泡是从细胞上脱落的由膜包封的结构，并且其可见于多种体液中，包括血液、血浆、血清、乳汁、腹水、支气管肺泡灌洗液和尿液。囊泡还可作为蛋白质、RNA、DNA、病毒和朊病毒的运送媒介而参与细胞之间的通讯。微RNA是调控信使RNA转录和降解的短RNA。已经在体液中发现了微RNA并且已经观察到其是从肿瘤细胞上脱落的囊泡内的组分。与疾病相关的循环生物标志物(包括囊泡和/或微RNA)的分析可有助于检测疾病或其严重程度、确定对疾病的易感性以及进行治疗决策。生物样品中存在的囊泡提供了生物标志物的来源，例如，所述生物标志物存在于囊泡内(囊泡有效负载)或存在 于囊泡表面上。囊泡的特征(例如尺寸、表面抗原、细胞源的确定、有效负载)还可提供诊断、预后或治疗诊断的信息。仍然存在着对可用于检测和治疗疾病的生物标志物进行鉴定的需求。与囊泡相关的微RNA和其它生物标志物以及囊泡的特征可用于诊断、预后或治疗诊断。本专利技术提供了用于通过检测生物标志物而表征表型的方法和系统，所述生物标志物是疾病或疾病进程的指示。所述生物标志物可以是循环生物标志物，包括囊泡和微RNA。专利技术概述本文公开了用于通过分析囊泡(诸如存在于来自受试者细胞的生物样品中的囊泡)来表征表型的方法和组合物。表征受试者或个体的表型可以包括但不限于诊断疾病或状况，预后疾病或状况，确定疾病阶段或状况阶段、药物的效力、生理状况、器官危境(organdistress)或器官排斥反应、疾病或状况的进展、与疾病或状况的治疗相关性关联或者特定的生理或生物学状态。在一个方面，本专利技术提供了在需要的受试者中治疗诊断疾病或失调的方法，其包括:在来自所述受试者的样品中鉴定囊泡群体的生物印记，其中所述生物印记包括一种或多种细胞特异性生物标志物的存在或水平和/或一种或多种疾病特异性生物标志物的存在或水平，以及一种或多种一般囊泡生物标志物的存在和水平；以及将所述生物印记与参照进行比较，其中所述比较是所述受试者对于治疗剂是响应者或非响应者的指示，由此而治疗诊断所述疾病或失调。在一些实施方案中，所述受试者此前尚未暴露于所述治疗剂。在其它实施方案中，所述治疗诊断包括测定治疗的效力。本文提供的方法可在体外进行，其中在体外环境中评估所述生物标志物。在一些实施方案中，所述受试者当前并未受到对所述疾病或失调的治疗。在其它的实施方案中，所述受试者正处于对所述疾病或失调的现行治疗中。所述方法可进一步包括对所述受试者施用所述治疗剂。可在单一分析中实施鉴定生物印记的方法。例如，可使用多重方法评估多种生物标志物。在一些实施方案中，在多重分析中评估所述生物印记中的所有标志物。在其它实施方案中，所述生物标志物中的一些在单一分析中评估并且在不同的分析中评估一种或多种其它生物标志物，所述不同的分析也可以是多重分析。例如，可在第一多重分析中评估多种囊泡表面生物标志物，并且可在第二多重分析中评估多种微RNA。可将所述第一和第二多重分析的结果相结合以鉴定包含囊泡表面生物标志物和微RNA的生物印记。在一些实施方案中，受到评估的样品包括体液。所述体液可包括任意适合的体液，包括但不限于外周血、血清、血浆、腹水、尿液、脑脊液(CSF)、痰、唾液、骨髓、滑液、房水、羊水、耳垢、乳汁、支气管肺泡灌洗液、精液、前列腺液、考珀液(cowper’ s fluid)或预射精液、女性射出液、汗液、排泄物、毛发、泪液、囊液、胸腔积液和腹水液、心包液、淋巴液、食物糜、乳糜、胆汁、间质液、经血、脓液、皮脂、呕吐物、阴道分泌物、粘膜分泌物、稀便(stoolwater)、胰液、鼻腔灌洗液、支气管肺抽吸液、囊胚腔液(blastocylcavity fluid)或脐带血。在一些实施方案中，所述体液包括血清或血浆。所述囊泡群体包括囊泡的任何可用的群体。在一些实施方案中，所述囊泡群体具有20nm至1500nm的直径。在其它实施方案中，所述囊泡群体包含直径20nm至800nm的囊泡。在其它实施方案中，所述囊泡群体包含直径20nm至200nm的囊泡。可对所述囊泡群体进行尺寸排阻色谱、密度梯度离心、差速离心、纳米膜超滤、免疫吸附捕获、亲和纯化、亲和捕获、免疫分析、微流体分离或它们的组合。可在所述样品上实施这些方法以分离或捕获所需的囊泡。还可在事先不实施分离或捕获所述囊泡群体的技术的情况下评估所述囊泡群体。所述一种或多种细胞特异性生物标志物、一种或多种疾病特异性生物标志物以及一种或多种一般囊泡生 物标志物可包括蛋白质。所述蛋白质可以是囊泡表面抗原和/或囊泡有效负载。在一些实施方案中，所述一种或多种疾病特异性生物标志物包括EpCAM、B7H3、⑶24、组织因子或其组合。在一些实施方案中，所述一种或多种一般囊泡生物标志物包括CD63、CD9、CD81、CD82、CD37、CD53、Rab_5b、MFG-E8、膜联蛋白 V 或其组合。可使用结合剂鉴定本专利技术的生物印记。在一些实施方案中，鉴定生物印记包括将所述样品与对于两种不同的分析物特异性的至少两种结合剂接触。例如，鉴定生物印记可包括将所述样品与对于三种不同的分析物特异性的至少三种结合剂接触。所述结合剂可以是可结合于目标生物标志物的任何有用的实体。用于本专利技术的结合剂包括但不限于抗原、DNA分子、RNA分子、抗体、抗体片段、适体、类肽、zDNA、肽核酸(PNA)、锁核酸(LNA)、凝集素、肽、枝状物、膜蛋白标记剂或化学化合物。鉴定本专利技术的生物印记可包括对一种或多种核酸的评估。鉴定本专利技术的生物印记还可包括对一种或多种核酸、肽、蛋白质、脂质、抗原、碳水化合物和/或蛋白聚糖的评估。所述一种或多种核酸可以是，但不限于，DNA、mRNA、微RNA、snoRNA、snRNA、rRNA、tRNA、siRNA、hnRNA或shRNA。在一些实施方案中，所述核酸包括一种或多种微RNA。所述微RNA可以是循环生物标志物或可与囊泡结合，例如作为囊泡有效负载。所述一种或多种核酸可以是 miR-21、miR-205、miR-92、miR-147、miR-141 或 miR-574 中的一种或多种。所述一种或多种核酸可以是图3-6、19-24、26-30、32、33、36、40-42、47、51、53-57和/或60中列出的一种或多种微RNA。所述一种或多种核酸可以是选自miR-21、miR-205、miR-92、miR-147或miR-574中的一种或多种微RNA。可以使用统计判别分析和归类方法鉴定所述受试者是响应者还是非响应者。本文所使用的响应者包括预计对候选治疗有反应的受试者，无论所述治疗此后是否有效。响应者还包括对当前治疗具有部分反应的受试者。在一些实施方案中，本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...

【专利技术属性】
技术研发人员：D·D·哈尔伯特，C·库斯里奇，G·波斯特，M·克拉斯，D·斯佩兹勒，T·帕夫洛夫斯基，A·塔西纳托，D·霍尔特曼，
申请(专利权)人：卡里斯生命科学卢森堡控股有限责任公司，
类型：
国别省市：