一种利用实时荧光定量PCR检测H7N9禽流感病毒的试剂盒制造技术

技术编号:9005070 阅读:224 留言:0更新日期:2013-08-08 00:49
本发明专利技术公开了利用实时荧光定量PCR检测H7N9禽流感病毒的试剂盒,其特征在于包括:(1)RNA提取试剂、逆转录试剂、实时荧光定量PCR扩增反应试剂;(2)用于扩增样本cDNA的两对引物H7-F、H7-R和N9-F、N9-R,及相应的探针H7-probe、N9-probe。本发明专利技术的用于检测H7N9禽流感病毒核酸的试剂盒,通过对病毒RNA抽提,逆转录和实时荧光定量PCR,可检测H7N9禽流感病毒,该试剂盒所得的结果具有高准确性,高敏感性,高特异性和短检测窗口期等优点,为疫病早诊断、早治疗、降低病死率以及控制疫情争取时间。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属生命科学和生物
,特别是一种用于检测H7N9禽流感病毒的试剂盒。
技术介绍
流感病毒属于正粘病毒科(orthomyxoviridae),有包膜、分节段基因组的单负链RNA病毒。根据核蛋白和包膜内侧面的Ml蛋白的抗原性将流感病毒分甲(A)、乙(B)、丙(C)三型。甲型流感病毒再根据包膜表面血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase, NA)两种刺突的抗原性分若干亚型,目前包括Hl H16亚型,NA包括NI N9亚型。所有人类的流感病毒都可以引起禽类流感,但不是所有的禽流感病毒都可以引起人类流感,禽流感病毒中,H3、H5、H7、H9可以传染给人,其中H5为高致病性。H3为人犬共患,依据 流感病毒特征可分为HxNx共135种亚型,H7N9亚型禽流感病毒是其中的一种。这个病毒的生物学特点、致病力、传播力,还没有依据进行分析判断。H7N9亚型禽流感病毒是甲型流感中的一种,既往仅在禽间发现,未发现过人的感染情况。但我国人感染H7N9禽流感于2013年3月底在上海和安徽两地率先发现。H7N9型禽流感是全球首次发现的新亚型流感病毒,尚未纳入我国法定报告传染病监测报告系统,并且至2013年4月初尚未有疫苗推出。中国国家卫生和计划生育委员会2013年3月3日印发人感染H7N9禽流感诊疗方案、防控方案及医院感染预防与控制技术指南。根据人感染H7N9禽流感诊疗方案(2013年第I版),人感染H7N9禽流感传染源目前尚不明确,根据以往经验及本次病例流行病学调查,推测可能为携带H7N9禽流感病毒的禽类及其分泌物或排泄物。传播途径为经呼吸道传播,也可通过密切接触感染的禽类分泌物或排泄物等被感染,直接接触病毒也可被感染。现尚无人与人之间传播的确切证据。现阶段高危人群主要是从事禽类养殖、销售、宰杀、加工业者,以及在发病前I周内接触过禽类者。诊疗方案指出,人感染H7N9禽流感潜伏期一般为7天以内。患者一般表现为流感样症状,如发热,咳嗽,少痰,可伴有头痛、肌肉酸痛和全身不适。重症患者病情发展迅速,表现为重症肺炎,体温大多持续在39°C以上,出现呼吸困难,可伴有咯血痰;可快速进展出现急性呼吸窘迫综合征、纵隔气肿、脓毒症、休克、意识障碍及急性肾损伤等。根据流行病学接触史、临床表现及实验室检查结果,可作出人感染H7N9禽流感的诊断。在流行病学史不详的情况下,根据临床表现、辅助检查和实验室检测结果,特别是从患者呼吸道分泌物标本中分离出H7N9禽流感病毒,或H7N9禽流感病毒核酸检测阳性,可以诊断。
技术实现思路
鉴于核酸检测是直接检测病原体核酸,具有高敏感,高特异和短检测窗口期等优点,为疫病早诊断、早治疗、降低病死率以及控制疫情争取时间。本专利技术提供了一种实时荧光定量PCR检测H7N9禽流感病毒的试剂盒,用于检测H7N9禽流感病毒核酸。一种利用实时荧光定量PCR检测H7N9禽流感病毒的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括: (1)RNA提取试剂、逆转录试剂、实时荧光定量PCR扩增反应试剂; (2)用于扩增样本cDNA的引物及探针,包括: 检测H7N9禽流感病毒包膜表面血凝素H7的引物及探针:H7-F: GGGffTTCACMTACAGYGGAATAAGH7-R: ACAGGARCCATTTCATCTCYGCH7-probe: FAM-CAACSAGTGCATGTAGGAGATCAGGffTCTTC-TAMARA检测H7N9禽流感病毒神经氨酸酶N9的引物及探针:N9-F: TGARTGCAGGTTCTATGCTCTCAN9-R: TGTATACTGTGGGYGGTGATGAN9-Probe: HEX-CTCAAACGGAACAATACACGATAGGTCCCA-TAMARA。 进一步地,所述RNA提取试剂包括QIAamp Viral RNA mini Kit ;所述逆转录试剂包括 5 X RT-Buffer, IOOuM Primer Mix, 100U/ul ReverTra Ace 逆转录酶和 DEPC 水;所述实时荧光定量PCR扩增反应试剂包括qPCR Mix,50 X R0X,扩增引物及探针和灭菌水。更进一步地,所述试剂盒的使用方法包括以下步骤: (1)用RNA提取试剂提取呼吸道标本的RNA; (2)用逆转录试剂将步骤(I)中得到的RNA进行反转录为cDNA; (3)使用弓I物H7-F、H7-R和N9_F、N9_R及相应探针H7-probe、N9_probe在单管PCR反应体系中对步骤(2)得到的cDNA进行实时荧光定量PCR检测。其中,实时荧光定量PCR反应程序:95°C IOmin预变性;95°C 15sec,58°C35sec,39个循环。步骤(I)的具体抽取步骤如下: I)吸取560ul准备好的buffer AVL (含有carrier RNA)到1.5ml离心管中。(根据样品的实际量按比例调整buffer AVL-carrier RNA)。2)将140ul血浆,血清,尿液,培养细胞上清液或是无细胞体液加入到装有bufferAVL-carrier RNA的离心管中。斡旋15秒,混匀。(为保证裂解效率,一定要彻底混匀,形成均一溶液。只溶解过一次的样品也仍然可用)。3)室温放置lOmin。( 10分钟足够,延长时间不会增加产物质量。Buffer AVL可以使潜在的污染和Rnase失活)。4)瞬时离心,将盖子上的液滴甩回管底。5)样品中加入560ul无水乙醇(96% 100% ),斡旋15s充分混勻。然后瞬时离心,将盖子上的液滴甩回管底。(只可以用乙醇,因为其他酒精会降低产量和纯度。不能使用变性酒精,因为其中含有其他物质。如果样品量大于140ul,按比例增加乙醇的量。该步骤要充分混匀,形成均一溶液,以保证产量)。6)吸取630ul上步中的溶液小心的加入column(已装入到2ml离心管中)中,注意不要碰到柱子的边缘。盖上盖子,6000Xg (8000rpm)离心lmin。将column放入新的2ml离心管中,弃去旧的收集管。(每一个column都要盖上,以防交叉污染。SOOOrpm的速度是为了限制噪音,全速离心也是可以的,不会影响产物。如果溶液没有完全透过膜,可以更高的速度再次离心,直到溶液完全透过)。7)小心的打开column的盖子,重复第6步。(如果样品量超过了 140ul,那么重复此步骤,直到所有的裂解液都上柱)。8)小心的打开column盖子,加入500ul buffer Affl0盖上盖子,8000rpm离心,lmin。将column放入新的2ml收集管(Kit提供)中,弃去旧的收集管。(即使样品量大于140ul,也无需增加buffer Affl的量)。9)小心的打开column盖子,加入500ul buffer AW2。盖上盖子,全速离心(14000rpm), 3min0接着进行第11步,或者先进行第10步,以避免buffer AW2残留,然后再进行第11步。(buffer AW2残留会影响下游实验。有些离心机在减速时会发生振动,导致回流,使得buffer AW2接触到column。将column和收集管从离心机里拿出来时也可能会导致该现象产生,因本文档来自技高网
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【技术保护点】
一种利用实时荧光定量PCR检测H7N9禽流感病毒的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括:(1)?RNA提取试剂、逆转录试剂、实时荧光定量PCR扩增反应试剂;(2)?用于扩增样本cDNA的引物及探针,包括:检测H7N9禽流感病毒包膜表面血凝素H7的引物及探针:H7?F:?GGGWTTCACMTACAGYGGAATAAGH7?R:?ACAGGARCCATTTCATCTCYGCH7?probe:?FAM?CAACSAGTGCATGTAGGAGATCAGGWTCTTC?TAMARA检测H7N9禽流感病毒神经氨酸酶N9的引物及探针:N9?F:?TGARTGCAGGTTCTATGCTCTCAN9?R:?TGTATACTGTGGGYGGTGATGAN9?Probe:?HEX?CTCAAACGGAACAATACACGATAGGTCCCA?TAMARA。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:陈奕磊李文静王淑一黎飒徐建成
申请(专利权)人:杭州艾迪康医学检验中心有限公司
类型:发明
国别省市:

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