本发明专利技术涉及进行基于分子决定簇的功能性杀伤免疫球蛋白样受体(KIR)等位基因分型和配体分型的测定。具体地本发明专利技术提供了用于基于KIR2DL1的位置245、HLA-C的位置77以及HLA-B和HLA-A的位置83上的多态性对具有独特功能性质的KIR2DL1和KIR配体的不同等位基因组群进行分型的单核苷酸多态性(SNP)测定的方法、组合物和试剂盒。所述测定适合用于预测健康、疾病和移植中的NK细胞活性。
【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术涉及进行基于分子决定簇的功能性杀伤免疫球蛋白样受体(KIR)等位基因分型和配体分型的测定。具体地本专利技术提供了用于基于KIR2DL1的位置245、HLA-C的位置77以及HLA-B和HLA-A的位置83上的多态性对具有独特功能性质的KIR2DL1和KIR配体的不同等位基因组群进行分型的单核苷酸多态性(SNP)测定的方法、组合物和试剂盒。所述测定适合用于预测健康、疾病和移植中的NK细胞活性。
技术介绍
天然杀伤(NK)和T细胞在针对转化或病毒感染的细胞的免疫力中起着中心和补充作用(Vely等人2001)。NK细胞通过使用控制其激活、增殖和效应子功能的细胞表面受体的集库区分健康与异常细胞(Lanier等人2005)。人NK细胞的标志是I类HLA特异性杀伤细胞免疫球蛋白样受体(KIR)的表达(Uhrberg等人2005)。KIR不仅在单个NK细胞的水平上变化性地表达而且它们还是高度多态性和多基因性的，这样，KIR簇的基因含量在个体间是变化的(Uhrberg等人2005)。迄今为止已知存在15个KIR基因(+2个假基因)，11个编码具有两个免疫球蛋白结构域(KIR2D基因)的受体，4个编码具有3个结构域(KIR3D)的受体。KIR家族被进一步分成抑制性KIR和刺激性KIR。抑制性KIR基因的特征在于，特征性的基于免疫受体酪氨酸的抑制性基序(ITIM)的长细胞质尾(在其名称中通过“L”来表示长)。相反地，刺激性KIR具有缺乏ITIM的短细胞质尾(在其名称中通 过“S”来表示短)，但在跨膜区中具有带电荷的氨基酸，所述氨基酸为激活分子提供了停泊位点(Uhrberg等人2005)。许多人类疾病据报道与KIR基因含量的差异相关，包括自身免疫性疾病、炎症性障碍、感染性疾病、免疫缺乏症、癌症和生殖系统障碍(Kulkarni等人2008)。由于缺乏用于KIR等位基因的不同功能组群的高通量分型的快速方法，此类疾病与KIR的等位基因间的功能异质性之间的关系仍不清楚。在下列参考文献中公开了除其它医学方法外，KIR基因型分型用于移植的用途:Lebedeva 等人，，，Comprehensive Approach to High-Resolution KIR Typing，，HumTmmun., 68 (9): 789-96 (2007) ；Gonzalez 等人，，，Killer Cell Immunoglobulin-LikeReceptor Allele Discrimination by High-Resolution Melting^ HumTmmun., 70 (10): 858-63 (2009) ；Yun 等人，，，A Novel Method for KIR-Ligand Typingby Pyrosequencing To Predict NK Cell Alloreactivity”Blood (ASH Annual MeetingAbstracts)106:Abstractl407(2005)(也参见 Yun 等人，”A Novel Method forKIR-Ligand Typing by Pyrosequencing To Predict NK Cell Alloreactivity，，ClinImmunol.123 (3): 272-280 (2007).) ；Leung 等人，，，Comparison of Killer Ig-LikeReceptor Genotyping and Phenotyping for Selection of Allogeneic Blood StemCell Donors，，J Immun.174:6540-6545 (2005) ；Dinauer 等人，，，Primers, Methods andKits For Detecting Killer-Cell Immunoglobulin-Like Receptor Alleles，， 美国专利申请公布号US2008/0280289 (也参见国际申请公布号W02005/046459选择的部分；和 KIR Genotyping Product Brochure2004.) ；Chen 等人，”Natural KillerImmunoglobul in-Like Receptor (KIR) Assay ”国际申请公布号 W02009/051672。也参见 PCT/US2008/011671 ;Trachtenberg 等人，”Methods and Compositions For KIR Genotyping^美国专利申请公布号US2008/0213787 (也参见国际申请公布号W02007/041067.)；Houtchens 等人，，，High-Throughput Killer Cell Immunoglobulin-Like ReceptorGenotyping By MALD1-TOF Mass Spectrometry With Discovery of Novel Alleles，，Immunogenetics.59 (7): 525-37 (2007).；Gomez-Lozano 等人，，，Genotyping of HumanKiller-Cell Immunoglobulin-Like Receptor Genes by Polymerase Chain Reactionwith Sequence-Specific Primers:An Update” Tissue Antigens 59 (3):184-193(2002)；和Shilling等人，，，Allelic Polymorphism Synergizes with Variable Gene Content toIndividualized Human KIR Genotype，，J Immunol.168:2307-2315 (2002)。将所述每一篇参考文献通过引用整体并入本文。此外，一些可获得的KIR基因分型试剂盒包括Inno-Train, ”KIR-Ready Gene”产品手册 9/2005 ；Miltenyi Biotec, ”KIR 分型试剂盒”产品手册 2009 ；Invitrogen, ”KIR 基因分型SSP试剂盒”产品手册11/2006 ;和Tepnel Lifecodes, ”KIR分型”6/2005。将所述每一个产品手册通过引用整体并入本文。因此，由于疾病易感性与各种KIR配体群(constellation)关联以及等位基因分型在移植的成功中起着重要作用，所以需要用于检测KIR及其配体的分子决定簇的新型方法、组合物和试剂盒。专利技术概述本专利技术涉及进行基于分子决定簇的功能性杀伤免疫球蛋白样受体(KIR)等位基因分型和配体分型的测定。具体地，本专利技术`提供了用于基于KIR2DL1的位置245、HLA-C的位置77以及HLA-B和HLA-A的位置83上的多态性对具有独特功能性质的KIR2DL1和KIR配体的不同等位基因组群进行分型的单核苷酸多态性(SNP)测定的方法、组合物和试剂盒。所述测定适合用于预测本文档来自技高网...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...
【专利技术属性】
技术研发人员：W·梁，R·巴里，
申请(专利权)人：圣朱德儿童研究医院，
类型：
国别省市：
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