染色体10q26上的年龄-相关黄斑病变(ARM)易感基因制造技术

基因PLEKHAL和LOC387715中的等位基因变异在这里作为年龄相关黄斑变性(ARM)危险因子被识别。因而提供了一种方法用于识别个体中发生ARM的危险性，包括识别PLEKHAL和/或LOC387715中含有等位基因变异体。相关的设备，如阵列，经鉴定可用于实施这些方法。

【技术实现步骤摘要】
染色体10q26上的年龄-相关黄斑病变(ARM)易感基因本申请是2006年6月7日递交的申请号为200680027015. 0，专利技术名称为“染色体10q26上的年龄-相关黄斑病变(ARM)易感基因”的分案申请。专利技术者迈克尔 B 高瑞约翰纳 加科伯斯多缇尔耶维特 P 孔利丹尼尔 E 威克斯特玛麦 S 马何-费瑞瑟罗伯特 E 费瑞尔
技术介绍
年龄-相关黄斑病变(已知为一种年龄-相关的黄斑变性)是一种在老年人群中引起中心失明的主要原因，并且大量研究表明一种强潜力基因组成了这种复杂疾病。使用大家系的基因组-范围连锁扫描，患病同胞对，及最近的表型不一致同胞对，已经鉴定了大量潜在的易感 位点。(Klein 等，1998 Age-related maculardegeneration.Clinical features in a large family and linkage tochromosome lq. Archivesof Ophthalomolgy 116 1082-1088. ；Weeks 等 2000A full genomescan for agerelated maculopathy. Human Molecuar Genetics 9 :1329-1349 ;Majewski 等，2003Age~related macular degeneration-a genome scan in extendedfami lies. Am JHum Genet 73 :540-550 ；Schick 等 2003 AwhoIe-genome screen of a quantitativetrait of age-relatedmaculopathy in sibships from the Beaver Dam Eye Study.Am J HumGenet 72 :1412-1424 ;Seddon 等 2003 A genomewide scan forage-relatdmacular degeneration provides evidence for linkage toseveral chromosomalregions. Am J Hum Genet 73 :780-790 ;Abecasis 等 2004-Age-related maculardegeneration a high—resolution genome scan for susceptibility Loci in apopulationenriched for late—stage disease. Am J Hum Genet 74 :482-494 ;Iyengar等，2004 Dissection of genomewide-scan data in extendedfami lies reveals a majorlocus and oligogenic susceptibility forage-related macular degeneration.Am J Hum Genet 74 :20-39 ；Kenealy 等 2004 Linkage analysis for age-relatedmaculardegeneration supports a gene on chromosome 10q26. Mol VislO :57-61 ；Schmidt 等 2004 Ordered subset linkage analysis supportsa susceptibility locusfor age-related macular degeneration onchromosome 16pl2. BMC Genet 5 18 ；Weeks等 2004 Age-relatedmaculopathy a genomewide scan with continued evidenceofsusceptibility loci within the lq31，10q26，and 17q25 regions. Am JHum Gemet75 :174-189 ;Scantangelo 等 2005 A Discordant Sib-Pair Linkage Analysis ofAge-Related Macular Degeneration. Ophthalmic Genetics 26 :61-68)基因组-范围交联扫描强烈显示10q26区域含有年龄-相关黄斑变性(AMD)基因(Weeks等2004)；该区域已经被许多其他研究所支持并且是最近meta分析中的顶-级区域(Fisher等2005 Meta-analysis of genome scans ofage-related macular degeneration. HumMol Genet. 2005 Augl ； 14 (15) :2257-64)。最近，Science 上的三篇文章(Edwards 等2005Complement Factor H Polymorphism and Age-Related MacularDegeneration.Science 308，421-424 ;Haines 等 2005 ComplementFactor H Variant Increases theRisk of Age-Related MacularDegeneration.Science 308，419-421. Klein 等 2005ComplementFactor H Polymorphism in Age-Related Macular Degeneration.Science308,385-389)鉴定了对应于染色体I上交联信号的补体因子H(CFH)上的等位基因变体，其在家族和零星情况中导致ARM重要归因危险性。这些发现已经被证实(Conley等2005Candidate gene analysis suggests a role for fatty acid biosynthesisandregulation of the complement system in the etiology ofage-related maculopathy.Hum Mol Genet 14 :1991-2002 ;Hageman等(2005a)From The Cover A common haplotypein thecomplement regulatory gene factor H(HF1/CFH)predisposesindividualsto age-related macular degeneration. Proc natl Acad SciUSA 102 :7227-7232 ；和 Zareparsi 等 2005a Strong Association of the Y402H Variant in ComplementFactor H at lq32 withSusceptibility to 本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种体外检测包括与年龄?相关黄斑病变易感性有关的多态性的核酸样品的方法，该方法包括在样品中检测SEQ?ID?NO：20(rs10490924)的第270碱基处是否存在胸腺嘧啶或者鸟嘌呤，其中，在一个或者两个等位基因上存在胸腺嘧啶说明该核酸样品包括一种多态性，这种多态性显示增加的年龄?相关黄斑病斑易感性，并且，在两个等位基因处存在鸟嘌呤说明该核酸样品包括一种多态性，这种多态性显示减少的年龄?相关黄斑病斑易感性。

【技术特征摘要】
2005.06.08 US 60/688,5721.一种体外检测包括与年龄-相关黄斑病变易感性有关的多态性的核酸样品的方法，该方法包括在样品中检测SEQ ID N0:20(rsl0490924)的第270碱基处是否存在胸腺嘧啶或者鸟嘌呤，其中，在一个或者两个等位基因上存在胸腺嘧啶说明该核酸样品包括一种多态性，这种多态性显示增加的年龄-相关黄斑病斑易感性，并且，在两个等位基因处存在鸟嘌呤说明该核酸样品包括一种多态性，这种多态性显示减少的年龄-相关黄斑病斑易感性。2.—种体外检测包括与年龄-相关黄斑病变易感性有关的多态性的核酸样品的方法，该方法包括检验PLEKHA1、PRSS11、L0C387715中一个或者一个以上的等位基因变体从而检测主体基因组SEQ ID NO 20(rsl0490924)的第270碱基处的多态性，其中，在SEQ ID NO:20 (rsl0490924)的第270碱基处存在胸腺嘧啶显示增加的年龄-相关黄斑病斑易感性，并且在SEQ ID NO 20(rsl0490924)的第270碱基处存在鸟嘌呤显示减少的年龄-相关黄斑病斑易感性。3.根据权利要求1或者2所述的方法，其中所述年龄-相关黄斑病斑是严重的年龄-相关黄斑病斑。4.根据权利要求1所述的方法，其中所述检测步骤包括在样品的染色体10q26的PLEKHAI/LOC387715/PRSS11位点上检测等位基因变体。5.根据权利要求1或者2所述的方法，包括检测LOC387715的rsl0490924上的胸腺嘧啶或者鸟嘌呤。6.根据权利要求1或2所述的方法，包括检测单核苷酸多态性rs4146894上的碱基。7.根据权利要求1或2所述的方法，包括检测单核苷酸多态性rsl045216上的碱基。8.根据权利要求1或2所述的方法，包括检测单核苷酸多态性rsl882907上的碱基。9.根据权利要求1或2所述的方法，包括检测单核苷酸多态性rs760336上的碱基。10.根据权利要求1或2所述的方法，包括检测单核苷酸多态性rs763720上的碱基。11.权利要求1或2所述的方法进一步包括检测样品中补体因子H相对于单核苷酸多态性rs800292的多态性。12.权利要求1或2所述的方法进一步包括检测样品中补体因子H相对于单核苷酸多态性rs 1853...

【专利技术属性】
技术研发人员：迈克尔·B·高瑞，丹尼尔·E·威克斯，耶维特·P·孔利，罗伯特·费瑞尔，约翰纳·加科伯斯多缇尔，特玛麦·S·马何费瑞瑟，
申请(专利权)人：匹兹堡大学，
类型：发明
国别省市：