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一种血清microRNAs试剂盒及其应用制造技术

技术编号:8188186 阅读:171 留言:0更新日期:2013-01-09 23:52
本发明专利技术属于生物技术制药领域,具体涉及一种血清microRNAs试剂盒及其应用。本发明专利技术在基因组范围内通过solexa测序筛选出在正常人和患者血清中表达存在明显差异的一组miRNAs,然后利用RT-qPCR法进行了两个阶段独立样本的复筛和验证,筛出了由5个miRNAs(miR-21,miR-29a,miR-200a,miR-25和miR-486-5p)组成的宫颈癌血清指纹谱。本发明专利技术通过ROC曲线分析,发现筛选出的这组血清miRNAs标志物对于诊断宫颈癌具有较高的灵敏度和特异性。由此制备了一种能用于宫颈癌早期检测的诊断试剂盒。所述组合、方法能够用于宫颈癌的早期检测,具有高特异性、高效性、高灵敏度、检测成本低、取材方便、样本易存放等优点。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于生物技术制药领域,具体涉及ー种血清microRNAs试剂盒及其应用
技术介绍
宫颈癌是女性常见恶性肿瘤之一,是指发生在子宫阴道部及宫颈管的恶性肿瘤。宫颈癌的发病率仅次于乳腺癌,居于女性肿瘤发病率的第二位,全球每年约有50万宫颈癌新发病例,占所有癌症新发病例比重高达5%,我国毎年新发宫颈癌病例约为13. 2万,属于高发区。宫颈癌的死亡率也很高,全球每年约有23万女性死于宫颈癌,我国每年约有3万女性死于宫颈癌。采取有效的诊断方法,早期诊断早期治疗,能够有效降低癌症的发生率,提闻治愈率。MicroRNAs (miRNA)是ー类长度约为22nt的非编码单链小分子RNA,miRNA基因以 单拷贝、多拷贝或基因簇等形式存在于基因组中,并且大部分定位于基因间隔区,在进化上高度保守,MiRNA的转录独立于其他基因,不具有开放阅读框(ORF)所以不翻译成蛋白质,而是在体内多种生理过程中起到调控作用,包括细胞増殖、分化、凋亡等。本实验室前期通过系统的研究发现miRNAs稳定地存在于哺乳动物的血清中。血清中稳定存在多种miRNA的发现也引起了人们对其来源和产生方式的研究和探索。目前认为血清中的miRNA与相关组织的分泌密切相关。MiRNAs具有内在的调控基因表达的功能,提不那些在肿瘤中特异性表达的miRNAs可能在肿瘤的发生和发展的过程中发挥特殊的作用,近期,在对肿瘤患者血清miRNAs变化机制的研究中发现,在肿瘤中高表达的miRNA可能发挥与癌基因相似的作用,而在肿瘤中低表达的miRNA可能与抑癌基因有相似的作用,这对于肿瘤的临床诊断、治疗方案的选择和预后具有指导意义。与组织检测方法相比,以血清作为检测样本具有取材方便、基本无创伤性、可连续体外检测等优点。构建肿瘤特异性血清microRNA表达谱,有望成为ー种基于血清检测癌症的分子标记。
技术实现思路
本专利技术的需要解决的问题是通过检测宫颈癌血清中miRNA的表达水平,筛选并鉴定能够作为宫颈癌检测标志物的血清miRNAs,进行血清miRNA检测试剂盒的研制。I.本专利技术首先在基因组范围内通过solexa测序筛选出在正常人和患者血清中表达存在明显差异的ー组miRNAs ;然后利用RT-qPCR法进行了两个阶段独立样本的复筛和验证;最后利用ROC曲线法分析其灵敏度和特异性。2.血清采集均严格按照如下步骤进行收集患者和正常人全血,在室温下3000g离心IOmin去除血细胞并收集血清,然后将收集的血清在4°C条件下,12000g离心15min,进一歩去除残留的血细胞,离心后收集血清置于-80°C冰箱保存待用。3. ー组由5种血清miRNAs组成的宫颈癌血清诊断标志物,分别是miR-21,miR-29a, miR-200a, miR-25和miR-486_5p。ROC曲线分析结果显示,对比传统血清SCC和CA125检测,血清miRNAs标志物具有高灵敏度和特异性。本专利技术与现有技术相比其有益效果是筛选出的疾病特异血清miRNA,进行血清miRNA检测试剂盒的研制,该芯片可以识别宫颈癌病人的发病及分级情況,实现宫颈癌早期诊断的目的。本专利技术的主要创新点包括血清miRNA是ー种新型生物标志物;血清miRNA监测是一种系统、全面的检测试剂盒,与组织检测方法相比,以血清作为检测样本具有取材方便、基本无创伤性,本专利技术采用严密、多阶段的验证和评价体系。四附图说明图I为5种血清miRNAs在宫颈癌患者和正常人中表达存在明显差异; 图2由5种血清miRNAs组成的宫颈癌标志物的ROC曲线分析结果 图3为本专利技术实验设计流程 五具体实施方式 I、进行Solexa测序实验时,我们分别混合了 20例宫颈癌患者(每人2ml)和20位健康对照(每人2ml)的血清。每组混合血清的总RNA是严格按照Trizol LSReagent (Invitrogen, Carlsbad, CA)的人工操作指南提取的。I) 将收集的血清样本包括AMI组和正常对照组的血清分别进行混合,得到两组混合血清,体积均为40 ml,分别提取混合血清RNA。2) 按混合血清体积(均为40 ml) 2:1的比例加入TRIzol,用力震荡均匀后,室温静置15min,然后加入TRIzol 1/5体积的氯仿,用力震荡均匀,室温静置15min。3) 静置结束后10000 g,4°C,离心15 min,离心毕收集上清。4) 将3)中收集的上清置于除酶管子中,加入上清等体积的水饱和酚,用カ震荡均勻后 10000 g,4°C,离心 5 min。5) 离心毕,收集上清,加入上清1/2体积的水饱和酚和1/2体积的氯仿,用力震荡均勻后10000 g,4°C,离心5 min。6) 离心毕,收集上清,加入上清等体积的氯仿,用力震荡均匀后10000 g,4°C,离心5 min。7) 离心毕,收集上清,加入上清等体积的异丙醇,用力震荡均匀后在冰上沉淀I h 后 10000 g,4°C,离心 30 min。8) 离心毕,去上清,留沉淀,先用3 ml 75%的こ醇逐个清洗管子,然后用3 ml的TRIzol清洗こ醇洗涤后的管子。こ醇清洗后分装到除酶的2 ml的离心管后12000 g,4°C,离心 15 min。9) 离心毕,取沉淀,用8)中洗管壁的TRIzol分别再次完全溶解沉淀,加入Trizol 1/5体积的氯仿,混勻室温静置10 min后12000 g,4°C,离心15 min。10)离心毕,取上清,加入上清等体积异丙醇,冰上静置15 min后12000 g,4°C,离心 15 min。11)离心毕,去上清,留沉淀,用I ml 75%的DEPCこ醇加入沉淀中涡漩后12000g, 4°C,离心 15 min。12)离心毕,去上清,留沉淀,待沉淀干燥后加50 ul DEPC水至RNA完全溶解,测定RNA浓度。2、在做RT-qPCR实验吋,我们用酚/氯仿抽提法在200 U I血清中提取RNA。13)将250 U I血清放入已除酶的I. 5 ml离心管中,加入250 U I DEPC水稀释,涡旋混匀。14)混匀毕,加入250 U I水饱和酹并剧烈震荡,室温静置两分钟,然后加入250U I氯仿,剧烈震荡在室温静置5 min后4°C,12000 g,离心5 min。15)离心毕,取上清,加入上清1/10体积的醋酸钠溶液(C=3M/L,pH=5. 3)并加入上清两倍体积的异丙醇,涡旋混匀后_20°C静置30 min,4°C, 12000 g离心20 min。16)离心毕,去上清,留RNA沉淀,加入I ml 75% DEPCこ醇,涡旋混匀,洗涤RNA沉淀,洗涤毕4°C,12000 g,离心20 min。17)离心毕,去上清,留沉淀,在室温下晾干沉淀约10 min后加入20 DEPC水, 溶解RNA沉淀。待RNA完全溶解之后放入_80°C低温冰箱留存待用。3、本文使用 TaqMan探针引物(Applied Biosystems, Foster City, CA, USA)利用RT-qPCR技术定量分别检测特异性miRNA和基因的表达。针对每一 miRNA均设计了ー个含相同莖环结构(stem-loop structure)的基因特异性反向引物,将所有的基因特异性反向本文档来自技高网
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【技术保护点】
一种血清microRNAs试剂盒,其特征是由5种血清miRNAs组成的宫颈癌血清检测标志物,5种标志物为miR?21,?miR?29a,?miR?200a,?miR?25和miR?486?5p。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:项阳吴元赭贾文慧张辰宇张秦
申请(专利权)人:南京大学
类型:发明
国别省市:

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