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一种药物筛选方法技术

技术编号:7953174 阅读:238 留言:0更新日期:2012-11-08 22:44
本发明专利技术公开了一种药物筛选方法,包括如下步骤:(1)将模式生物按SNP次要位点的多少分组排序,以SNP次要位点数目正常组为标准,选出SNP次要位点数多于正常组的一组模式生物;(2)将待测药物分别作用SNP次要位点多的一组模式生物;(3)选出对模式生物起作用的一组药物。该方法通过SNP次要位点多的动物模型来筛选对遗传变异过多而起作用的化合物,提供了一种全新的药物筛选方法。本发明专利技术的方法可检测各种化合物对这些品系分裂或生殖能力或其它复杂形状的影响,从而获得只对次要位点过多的一组有强烈效果的药物。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于生物医药领域,具体涉及一种药物的筛选方法。
技术介绍
在漫长的物种进化过程中,同一个物种面对相同的自然选择有的能够成功的存活并很好的发展下来有的则惨遭淘汰,对于我们人类有的人吸烟喝酒却长寿,也有人自幼就身体虚弱,同一种治疗肿瘤的药物对一些人效果显著,对另一些人则完全无效。我们都知道不同的生活条件并不能造成我们如此巨大的差异,且这些差异都具有不同程度的遗传性。人类基因组序列图的绘制完成为我们解答这个问题敞开了一扇大门。那么我们应该如何去利用蕴含在其中的大量遗传信息呢?现在我们越来越发现大多数疾病的发生都能与我们的基因有关联,所以当前几乎所有的研究重点都侧重于建立某个或某些基因或SNP与疾病的关系。SNP主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引 起的DNA序列多态性。现在普遍认为SNP研究是人类基因组计划走向应用的重要步骤,SNP在基因组中分布相当广泛,平均约300bp就有一个(Halushka, M. K. , et al. , Patternsof single-nucleotide polymorphisms in candidate genes for blood—pressurehomeostasis. Nat Genet, 1999. 22 (3) :p. 239-47 ;Cargill, M. , et al. , Characterizationof single-nucleotide polymorphisms in coding regions of human genes. NatGenet, 1999. 22(3) :p. 231-8)大量存在的SNP位点,使人们有机会发现SNP与各种疾病的联系(Abdolmaleky, H. M.,et al. , Epigenetic alterations of the dopaminergicsystem in major psychiatric disorders. Methods Mol Biol, 2008. 448:p. 187-212 ;Gelernter, J. , H. Kranzler and J. Cubells, Genetics of two mu opioid receptorgene(0PRM1)exon I polymorphisms:population studies, and allele frequenciesin alcohol-and drug-dependent subjects. Mol Psychiatry,1999.4(5):p. 476-83),并应用于疾病的检测与治疗(Meyers, J. H. , et al. , TIM-4 is the ligand forTIM-1, and the TIM-1-TIM-4interaction regulates T cell proliferation. NatImmunol, 2005. 6(5):p. 455-64 ;Cai,P.C. , et al., Association of TIM4 promoterpolymorphism_1419G>A with childhood asthma in a Chinese Han population. TissueAntigens, 2009. 74(1) :p. 11-6)。另一方面生物进化自然选择理论作为生物学的至关重要的组成部分在分子层面却步履维艰,自然选择究竟在分子进化过程中起了多大的作用如何起的作用也一直争执不休,并受到中性理论的有力挑战。SNP是人类可遗传的变异中最常见的一种。占所有已知多态性的90%以上。SNP在人类基因组中广泛存在,这种变异通常由单个碱基的转换(transition)或颠换(transversion)所引起。在基因组DNA中,任何碱基均有可能发生变异,因此SNP既有可能在基因序列内,也有可能在基因以外的非编码序列上。总的来说,位于编码区内的SNP (coding SNP,cSNP)比较少,从对生物的遗传性状的影响上来看,cSNP又可分为2种一种是同义cSNP (synonymous cSNP),即SNP所致的编码序列的改变并不影响其所翻译的蛋白质的氨基酸序列,突变碱基与未突变碱基的含义相同;另一种是非同义CSNP (non-synonymous cSNP),指碱基序列的改变可使以其为蓝本翻译的蛋白质序列发生改变,从而影响了蛋白质的功能。这种改变常是导致生物性状改变的直接原因。cSNP中约有一半为非同义cSNP。cSNP在外显子内,其变异率仅及周围序列的1/5 (Li,W. H. andL. A. Sadler, Low nucleotide diversity in man. Genetics, 1991. 129(2):p.513-23 ;Nickerson, D. A. , et al. , DNA sequence diversity in a 9.7-kb region of the humanlipoprotein lipase gene. Nat Genet, 1998. 19 (3) :p. 233-40),但它在遗传性疾病研究中却常常具有显而易见的意义,因此cSNP的研究受到了更多地关注(Fay,J. C.,G.J. Wyckoff and C. I. ffu, Positive and negative selection on the human genome.Genetics,2001.158(3):p. 1227-34 ;Kawase, T. , et al. , Alternative splicing due toan intronic SNP in HMSD generates a novel minor histocompatibility antigen.Blood, 2007. 110(3) :p. 1055-63)。而位于所谓“垃圾’DNA中的单个SNP却无法引起我们的注意,决大多数SNP是位于这些“垃圾” DNA中,而90%左右的人基因组被认为是“垃圾”,因而决大多数SNP被普遍的认为或假设为是不具有功能的,是中性的
技术实现思路
本专利技术旨在提供一种筛选治疗常见复杂疾病的药物的方法。为了达到上述目的,本专利技术提供的技术方案为所述药物筛选方法,包括如下步骤(I)将模式生物按SNP次要位点的多少分组排序,以SNP次要位点数目正常组为标准,选出SNP次要位点数多于正常组的一组模式生物;(2)将待测药物分别作用SNP次要位点多的一组模式生物;(3)选出对模式生物起作用的一组药物。其中,所述的模式生物为酵母;步骤(2)所述的待测药物包括治疗精神疾病的药物及其他化合物;步骤(3)所述的药物是对SNP次要位点多的一组酵母有抑制生长作用的治疗精神疾病的药物。下面以酵母实验为例对本专利技术做进一步说明(I)将所选酵母按SNP次要位点数目分成次要位点数目正常组、次要位点多数目组和次要位点少数目组;其中,所述次要位点多数目组是指次要位点数目多于正常组的酵母,所述次要位点少数目组是指次要位点数目少于正常组的酵母;(2本文档来自技高网
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【技术保护点】
一种药物筛选方法,包括如下步骤:(1)将模式生物按SNP次要位点的多少分组排序,以SNP次要位点数目正常组为标准,选出SNP次要位点数多于正常组的一组模式生物;(2)将待测药物分别作用SNP次要位点多的一组模式生物;(3)选出对模式生物起作用的一组药物。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:黄石
申请(专利权)人:黄石
类型:发明
国别省市:

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