本发明专利技术公开了一种牡蛎单孢子虫LAMP检测试剂盒,它采用环介导等温扩增(LAMP)技术,并根据牡蛎单孢子虫共有的基因保守区设计了两个特异性内引物、两个特异性外引物和两个特异性环引物。应用本发明专利技术的LAMP检测试剂盒,仅需通过对组织样品进行DNA提取并进行环介导等温扩增,即可检测出牡蛎单孢子虫,解决了现有技术检测时间长、工作量大、交叉污染、操作复杂等缺陷,具有特异性强、敏感性高、快速且成本低、操作方法更简单,特别适于基层现场快速检测牡蛎单孢子虫的需要。
【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及牡蛎单孢子虫检测领域,尤其是一种牡蛎单孢子虫LAMP检测试剂盒。
技术介绍
单孢子虫(Haplospori dium sp)对牡蛎养殖的危害较大,主要感染牡蛎血细胞、 结蒂组织和消化道上皮,可引起牡蛎较高的死亡率,在美洲、大洋洲和亚洲等国家的感染普遍存在。单孢子虫的传统检测方法有电镜观察、组织细胞学检查、原位杂交等,这些方法费时费力,缺乏专一性,在实际工作中具有一定的局限性。目前,虽已建立起单孢子虫PCR和荧光定量PCR检测方法,其检测敏感性也比较高,但是常规PCR需要使用PCR仪和进行凝胶电泳,荧光定量PCR则需要使用更加昂贵的荧光定量PCR仪和试剂等,,因而难以适应基层现场检测需要。
技术实现思路
本专利技术要解决的技术问题是提供一种特异性强、敏感性高、仪器要求低、操作快速简便且成本低的牡蛎单孢子虫LAMP检测试剂盒,以满足基层现场快速检测牡蛎单孢子虫的需要。为解决上述技术问题本专利技术采用如下技术方案牡蛎单孢子虫LAMP检测试剂盒,该试剂盒含有以下试剂反应液A 含有IOX等温反应缓存液、Bst DNA聚合酶8U/ul、IOmM dNIPs、25mM硫酸镁、20uM的内引物l、20uM的内引物2、20uM的外引物l、20uM的外引物2、20uM的环引物1、20碰的环引物2、511甜菜碱、6251^钙黄绿素和12.5mM氯化锰;IOX等温反应缓存液含有200mM pH值为8. 8的三羟基甲基氨基甲烷盐酸盐、IOOmM氯化钾、IOOmM硫酸铵、20mM硫酸镁和曲拉通X-100 ;内引物 1 序列为 AGTCCGAAAACTTTGATTTCTCTCATAGTCCCAACTATAAACTATGTCG,内引物 2 序列为 GGAGTATGCTCGCAAGGGTGGTCAAATTAAGCCGCAGG,外引物1 序列为 GACGATCAGATACCGTCG,外引物2 序列为 TGGTAAGTTTTACCGTGTTGA,环引物1 序列为 GGAAGTAAACTTGCCCAATGCTTAG,环引物2 序列为 ACGGAAGGGCACCACCAGAT。反应液A每管Mul,其组成为2. 5ul IOX等温反应缓存液、1. Oul Bst DNA聚合酶8U/ul、3ul IOmM dNTPs,3ul 25mM硫酸镁、0. 25ul 20uM的内引物 1、0. 25ul 20uM的内引物2、2ul 20uM的外引物l、2ul 20uM的外引物2、Iul 20uM的环引物1、Iul 20uM的环引物2、0.5ul5M甜菜碱、Iul 625 μ M钙黄绿素和Iul 12. 5mM氯化锰和5. 5ul双蒸水。本专利技术采用环介导等温扩增(LAMP)技术,并根据牡蛎单孢子虫共有的基因保守区(见序列表SEQ. ID. No. 1)设计了两个特异性内引物、两个特异性外引物和两个特异性环引物,由此专利技术了用于快速检测牡蛎单孢子虫的牡蛎单孢子虫LAMP检测试剂盒。应用本专利技术的LAMP检测试剂盒建立牡蛎单孢子虫检测方法,仅需通过对组织样品进行DNA提取并进行环介导等温扩增,即可检测出牡蛎单孢子虫。该法无需昂贵的PCR仪只需普通水浴锅,却比PCR检测有更高的灵敏度,且不必通过凝胶电泳观察结果,操作简单而快速,特别适用于基层现场检测。另外,常规的LAMP方法,需要在反应结束后开盖加入STOR Green I或Gene Finder染料来显色,容易造成假阳性一方面,反应产物易形成气溶胶而污染周围环境造成假阳性;另一方面,SYBR Green I或Gene Finder染料还会由于引物二聚体而引起假阳性。因此,本专利技术使用内加钙黄绿素+氯化锰替代了外加的STOR Green I和Gene Finder 染料,即在配置LAMP反应液时就加入反应液中而无需LAMP反应后再开盖加入;而且,钙黄绿素+氯化锰仅在发生LAMP反应时才出现绿色,避免了 STOR Green I和Gene Finder染料带来的假阳性问题,所以具有更好的特异性。附图说明图1是应用本专利技术牡蛎单孢子虫LAMP检测试剂盒的检测方法特异性试验结果图。图1中1单孢子虫,2折光马尔太虫,3副溶血弧菌,4派琴虫,5溶藻弧菌,6河弧菌,7拟态弧菌,8牡蛎组织。图2是应用本专利技术牡蛎单孢子虫LAMP检测试剂盒的检测方法敏感性试验结果图。图2中1-8分别为以下不同浓度的牡蛎单孢子虫DNA Ing/管,IOOpg/管,IOpg/ 管,Ipg/ 管,IOOfg/ 管,IOfg/ 管,Ifg/ 管,0. Ifg/ 管。图3是PCR方法检测牡蛎单孢子虫敏感性试验结果图。图3中M为IOObp DNA ladder, 1-8分别为以下不同浓度的牡蛎单孢子虫DNA Ing/ 管,IOOpg/ 管,IOpg/ 管,Ipg/ 管,IOOfg/ 管,IOfg/ 管,Ifg/ 管,0. Ifg/ 管。具体实施例方式一、牡蛎单孢子虫LAMP检测试剂盒的配制反应液A 每管Mul,其组成为2. 5ul IOX等温反应缓存液、1. Oul Bst DNA聚合酶8U/ul、3ul IOmM dNTPs,3ul 25mM硫酸镁、0. 25ul 20uM的内引物 1、0. 25ul 20uM的内引物2、2ul 20uM的外引物l、2ul 20uM的外引物2、Iul 20uM的环引物1、Iul 20uM的环引物 2、0.5ul 5M甜菜碱、Iul 625 μ M钙黄绿素和Iul 12. 5mM氯化锰和5. 5ul双蒸水。其中,IOX等温反应缓存液含有200mM pH值为8. 8的三羟基甲基氨基甲烷盐酸盐、IOOmM氯化钾、IOOmM硫酸铵、20mM硫酸镁和1 %曲拉通X-100。内引物 1 序列为 AGTCCGAAAACTTTGATTTCTCTCATAGTCCCAACTATAAACTATGTCG (见序列表 SEQ. ID. No. 2),内引物 2 序列为 GGAGTATGCTCGCAAGGGTGGTCAAATTAAGCCGCAGG (见序列表 SEQ. ID. No. 3),外引物1 序列为 GACGATCAGATACCGTCG(见序列表 SEQ. ID. No. 4),外引物2 序列为 TGGTAAGTTTTACCGTGTTGA(见序列表 SEQ. ID. No. 4),环引物1 序列为 GGAAGTAAACTTGCCCAATGCTTAG(见序列表 SEQ. ID. No. 6),环引物 2 序列为 ACGGAAGGGCACCACCAGAT (见序列表 SEQ. ID. No. 7)。二、应用本专利技术牡蛎单孢子虫LAMP检测试剂盒检测牡蛎单孢子虫的方法(以下简称LAMP检测法)1、组织样品中DNA的提取使用北京天跟生物工程公司的海洋动物组织基因组DNA提取试剂盒(商品名海洋动物组织基因组DNA提取试剂盒,型号DP3M-0;3)提取组织DNA,浓度能达到20ng/ul。2、牡蛎单孢子虫LAMP反应以提取的牡蛎单孢子虫DNA为模板,在装有MyL反应液A管中加入1 μ L待检 DNA构成25ul反应体系;LAMP反应程序如下62°C 60min,然后80°C 5min。直接用肉眼观察颜色变化,如颜色变为绿色,则说明样品中含有牡蛎单孢本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种牡蛎单孢子虫LAMP检测试剂盒,其特征在于该试剂盒含有以下试剂:反应液A:含有10×等温反应缓存液、Bst DNA聚合酶8U/ul、10mM dNTPs、25mM硫酸镁、20uM的内引物1、20uM的内引物2、20uM的外引物1、20uM的外引物2、20uM的环引物1、20uM的环引物2、5M甜菜碱、625μM钙黄绿素和12.5mM氯化锰;所述10×等温反应缓存液含有200mM pH值为8.8的三羟基甲基氨基甲烷盐酸盐、100mM氯化钾、100mM硫酸铵、20mM硫酸镁和1%曲拉通X-100;所述内引物1序列为AGTCCGAAAACTTTGATTTCTCTCATAGTCCCAACTATAAACTATGTCG,所述内引物2序列为GGAGTATGCTCGCAAGGGTGGTCAAATTAAGCCGCAGG,所述外引物1序列为GACGATCAGATACCGTCG,所述外引物2序列为TGGTAAGTTTTACCGTGTTGA,所述环引物1序列为GGAAGTAAACTTGCCCAATGCTTAG,所述环引物2序列为ACGGAAGGGCACCACCAGAT。
【技术特征摘要】
【专利技术属性】
技术研发人员:谢芝勋,谢丽基,庞耀珊,刘加波,邓显文,谢志勤,
申请(专利权)人:广西壮族自治区兽医研究所,
类型:发明
国别省市:45
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