本发明专利技术提供食管癌诊断用组合物、试剂盒或DNA芯片或者使用该组合物、试剂盒或DNA芯片检测食管癌的方法。所述食管癌诊断用组合物、试剂盒或DNA芯片含有多种多核苷酸,所述多种多核苷酸选自:与来自食管癌患者的不含食管癌的组织相比在来自食管癌患者的食管癌组织中表达水平发生变化的多核苷酸、其变异体或其片段。
【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术涉及对确定或检测食管癌有用的诊断(确定或检测)用组合物、利用该组 合物的食管癌检测或确定方法、及利用该组合物的食管癌诊断或检测试剂盒。
技术介绍
食管是连接咽和胃的管腔状器官,大部分存在于胸腔,一部分存在于颈部和腹腔。 在胸腔上部,食管位于气管和脊椎之间,在胸腔下部,食管被心脏、大动脉和肺包围。食管具 有将从口摄入的食物输送到胃的作用。2001年日本人的癌死亡率为10万人中有238. 8人。死亡原因中食管癌所占的比 例逐年增加,2001年男性的食管癌死亡例占到所有癌症死亡例的5. 0%、女性占到1. 4%0 食管癌的发病年龄的高峰在60 70岁,男性发病较多。另外,吸烟、饮酒、嗜好热食品等环 境因素与发病密切相关。并且,一般认为由于在食管壁内部或周围,血管和淋巴管丰富,所 以发生的癌症多出现转移。食管癌的治疗根据进展程度(日本食管疾病研究会编临床 病理食管癌治疗规范 1999年)或转移、及全身状况而决定。食管癌的标准治疗方法记载于日本食管疾病研究会 编“食管癌治疗方针”(2002年)。目前最普通的治疗方法是手术疗法,即切除含有癌细胞 的食管和包括淋巴结的周围组织(淋巴结清扫(lymph node dissection)),并利用胃等其 他器官重建食管。但是,手术疗法、特别是大范围的淋巴结清扫给患者带来很大的负担,还 必须考虑手术后的生活质量评分OiOL)降低的问题。对于粘膜内的早期癌症,有时可以在 内窥镜下实施粘膜剥除术。另外,从根治疗法、对症疗法两方面考虑,有时可以进行放射线 照射。进而,与手术疗法或放射线疗法组合,进行化学疗法。目前,一般认为在化学疗法中, 并用5-氟尿嘧啶和顺钼的治疗方法是最有效的。食管癌通常是在患者感觉吞咽时有不适感、吞咽困难、胸骨后部疼痛及胸部不适 感等自觉症状进行就诊时被发现。但是,上述症状的出现是由癌在食管内生长导致的,患者 因自我检测而就诊时发现的癌已经扩散或转移到食管壁外,通常预后不良。食管癌可以通过食管造影检查、内窥镜检查及活组织检查进行确定。在进行内窥 镜检查时或手术时采集活组织检查标本,制作病理标本,并且通过病理组织学分类加以诊 断。此时,需要开发一种快速简便的诊断方法,该方法能根据内窥镜检查得到的细胞的性质 预测是否有食管癌。至今为止,已有人提出使用食管癌组织中特异性含有的标记物的分子生物学诊断 方法。该方法能快速地得到客观的结果,有助于快速诊断。目前,作为食管癌临床检查用标记物,除使用作为血清中的蛋白质标记物的SCC、 CYFRA21-1、CEA等之外,还报道了专利文献1、2中记载的蛋白质等。但是,上述标记物缺 少灵敏度、特异性,即使是灵敏度最高的CYFRA21-1,其灵敏度也只是33. 9% (非专利文献 1) 43. 9% (非专利文献幻左右。因此,尚不能达到通过对上述血清中的标记物及其组 合进行检测来确定食管癌细胞是否存在的阶段。 另外,作为使用了用于特异性判断从受试者采集的活检试样中是否含有食管癌 细胞的基因的标记物,公开了染色体异常(例如参见专利文献3,4)或基因的后生序列 (epigenetic sequences)(例如专利文献5),除此之外,还报道了多个利用DNA芯片全 面解析基因表达的结果(例如,参见专利文献6、非专利文献3 8)。特别是,专利文献 6中,提供了 20种基因,所述基因通过组合检测来确定是否存在食管癌细胞,但由于分别 使用不同的判断机器判断含有食管癌细胞和不含食管癌细胞,所以不仅诊断复杂,而且在 一方判断机器预测含有食管癌细胞,另一方预测不含食管癌细胞时,还存在无法进行诊断 的情况。另外,作为以单独的基因表达作为指标的标记物,报道了专利文献7、非专利文 献9、10中记载的SPRR3基因(Small proline-rich protein 3)、非专利文献11中记载 的fgf3基因、专利文献7、非专利文献12中记载的CSTB基因(cystatin B、liver thiol proteinase inhibitor)、专利文献 8 中记载的 UCP2 基因(mitochondrial uncoupling protein 2)及 C0L3A1 (3,region for pro-alpha (III) collagen)、专利文献 7 中记载的 UPK IA 基因(uroplakin 1A)、非专利文献 13 中记载的 HSPA IB 基因(Heat Shock 70kDa Protein 1)等。另外,作为上皮系恶性肿瘤的标记物,已知专利文献9中记载的RRMl基因 (ribonucleotide reductase Ml polypeptide)等。但是,即使利用上述基因,也不能充分 地诊断是否存在食管癌。 专利文献1 日本特开2003-259872号公报 专利文献2 日本特表2000-511536号公报 专利文献3 日本特开2001-17200号公报 专利文献4 日本特开2002-27M97号公报 专利文献5 日本特表2004-505612号公报 专利文献6 国际公开第2006/118308号说明书 专利文献7 国际公开第2003/042661号说明书 专利文献8 国际公开第2003/076594号说明书专利文献9 国际公开第2006/119464号说明书非专利文献 1 Nakamura, T.等,1998, Diseases of the Esophagus,第 11 卷,P. 35-39 非专利文献2 =Kawaguchi, H.等,2000,Cancer,第 89 卷,p. 1413-1417 非专利文献3 :Luo, Α.等,2004 年,Oncogene,第 23 卷,ρ· 1291-1299 非专利文献4 Zhi,H.等,2003年,International Journal of Cancer,第 106卷, p. 327-333非专利文献5 :Lu, J.等,2001 年,International Journal of Cancer,第 91 卷, p. 288-294非专禾Ij文献 6 :Kazemi-Noureini,S.等,2004 年,World Journal of Gastroenterology,第 10 卷,p.1716-1721非专利文献7 :Xu, S. H.等,2003 年,World Journal of Gastroenterology,第 9 卷,p. 417-422非专利文献8 :Su, H.等,2003 年,Cancer Research,第 63 卷,p. 3872-3876非专利文献9 :Chen, B. S.等,2000 年,Carcinogenesis,第 21 卷,p. 2147-2150非专利文献10 =Abraham, J. M.等,1996 年,Cell Growth & Differentiation,第 7 卷,p. 855-860非专利文献11 :Kitagawa,Y.等,1991 年,Cancer Research,第51 卷,p. 1504-1508非专利文献 12 =Shiraishi, T.等,1998 年本文档来自技高网...
【技术保护点】
一种食管癌诊断用组合物,其中,含有选自下述(a)~(e)所示的多核苷酸、其变异体或其片段中的3个以上多核苷酸:(a)由序列号1~38表示的碱基序列组成的多核苷酸、其变异体、或其含有15个以上连续碱基的片段,(b)含有序列号1~38表示的碱基序列的多核苷酸,(c)由与序列号1~38表示的碱基序列互补的碱基序列组成的多核苷酸、其变异体、或其含有15个以上连续碱基的片段,(d)含有与序列号1~38表示的碱基序列互补的碱基序列的多核苷酸,(e)在严格条件下与所述(a)~(d)中的任一多核苷酸杂交的多核苷酸、或其含有15个以上连续碱基的片段。
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...
【专利技术属性】
技术研发人员:妙本阳,
申请(专利权)人:东丽株式会社,
类型:发明
国别省市:JP
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