耐热菌类的检测方法技术

技术编号:7138388 阅读:315 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
本发明专利技术提供一种耐热菌类的检测方法,所述检测方法使用含有序列号24~35或者83~86中任一个所记载的碱基序列或者其互补序列的核酸,或者使用含有在该碱基序列中使一个或者数个碱基缺失、置换或者添加而得到并能够用于耐热菌类的检测的碱基序列或者其互补序列的核酸,对耐热菌类进行鉴定。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术涉及一种。
技术介绍
耐热的菌类(真菌类)广泛分布于自然界,在蔬菜、水果等农作物上繁殖,并污染 以这些农作物为原料的饮食品。然而,耐热的菌类与通常的其他菌类相比具有高的耐热性。 例如即使对酸性饮料进行加热灭菌处理,耐热菌类也可以生存、繁殖,从而成为造成发霉的 原因。因此,耐热菌类被作为引起重大事故的重要有害菌而被戒备。作为从加热灭菌处理后的饮食品中检测出来的污染事故的原因菌的主要的耐 热菌类,已知有属于丝衣霉(Byssochlamys)属、篮状菌(Talaromyces)属、新萨托菌 (Neosartorya)属、以及半内果菌(Hamigera)属的耐热菌类。与形成子囊孢子的其他耐热 菌类相比,属于上述4个属的菌类具有非常高的耐热性,加热灭菌后的生存可能性也较高。 另一方面,上述4个属之外的耐热菌类,由于可以在通常的灭菌条件下被杀灭,所以只要不 出现灭菌不良等的情况,造成污染事故的可能性是很低的。因此,为了防止饮食品以及这些 原材料中的耐热菌类引起的事故,检测和鉴别属于这4个属的耐热菌类是特别重要的。此外,在调查危害事故发生时的事故原因以及对策上,事故的原因菌的鉴定也是 必要的。因此,如果可以鉴别上述4个属的耐热菌类的话,就可以更加迅速地检测和鉴别事 故的原因菌。另一方面,作为现有的耐热菌类的检测和鉴别方法,有将被检测体在PDA培养基 等上培养然后进行检测和鉴别的方法。但是,此方法直到能够确认菌落需要大约7天。而 且,由于菌种的鉴定是基于菌的特征器官的形态进行的,所以直到能够确认形态学上的特 征又需要大约7天的培养。因此,如果用此方法,耐热菌类的检测和鉴别需要约14天。这 样的耐热菌类的检测和鉴别需要长时间,这从饮食品的卫生管理、原材料的鲜度保证、流通 上的限制等观点来看,肯定无法得到满足。因此,需要确立更迅速的耐热菌类的检测和鉴别 方法。作为菌类的迅速的检测和鉴别方法,已知有利用PCR(聚合酶链式反应)法进行的 检测方法(例如,参考专利文献1 4)。但是,在这些方法中,有难于特异并且迅速检测特 定的耐热菌类的问题。专利文献1 特表平11-5057 号公报专利文献2 特开2006-61152号公报专利文献3 特开2006-304763号公报专利文献4 特开2007-174903号公报
技术实现思路
本专利技术的课题在于提供一种特异并且迅速检测、鉴别作为饮食品污染的主要原因 的菌耐热菌类的方法。作为如上所述难于检测出耐热菌类的原因之一,可列举通过利用现有公知引物的 PCR法而出现假阳性或者假阴性的结果。本专利技术人等对于克服此问题,并能够特异检测和鉴别出特定耐热菌类的新的DNA 区域进行了探索和深入的研究。其结果发现在耐热菌类的微管蛋白基因或者^S rDNA的D1/D2区域以及ITS区域中,存在着与其他菌类有明显区别的具有特异的碱基序列 的区域(以下,称其为“可变区”),以此可变区为靶点,就可以对上述耐热菌类进行特异且 迅速的检测和鉴别。基于此知识从而完成了本专利技术。根据本专利技术,提供了以下方法本专利技术涉及一种检测选自丝衣霉(Byssochlamys)属、篮状菌(Talaromyces)属、 新萨托菌(Neosartorya)属、烟曲霉(Aspergi 1 lusfumigatus)以及半内果菌(Hamigera) 属中的至少一种耐热菌类的方法,其是包括下述1) 4)中的至少一个工序的耐热菌类检 测方法。1)用下述(A-I)或者(A-II)的核酸,对属于丝衣霉(Byssochlamys)属的菌类进 行鉴定的工序,(A-I)含有序列号M或者25记载的碱基序列或者其互补序列的核酸;(A-II)含有在序列号M或者25记载的碱基序列中使一个或者数个碱基缺失、置 换或者添加而得到并且能够用于检测属于丝衣霉属的菌类的碱基序列或者其互补序列的 核酸;2)用下述(B-I)或者(B-II)的核酸,对属于篮状菌(Talaromyces)属的菌类进行 鉴定的工序,(B-I)含有序列号沈 31中任一个记载的碱基序列或者其互补序列的核酸;(B-II)含有在序列号沈 31中任一个记载的碱基序列中使一个或者数个碱基缺 失、置换或者添加而得到并且能够用于检测属于篮状菌属的菌类的碱基序列或者其互补序 列的核酸;3)用下述(C-I)或者(C-II)的核酸,对属于新萨托菌(Neosartorya)属的菌类以 及/或者烟曲霉(AsperRillus fumiRatus)进行鉴定的工序,(C-I)含有序列号32 34或者83 86中任一个所记载的碱基序列或者其互补 序列的核酸;(C-II)含有在序列号32 34或者83 86中任一个所记载的碱基序列中使一 个或者数个碱基缺失、置换或者添加而得到并且能够用于检测属于新萨托菌属的菌类以及 /或者烟曲霉的碱基序列或者其互补序列的核酸;4)用下述(D-I)或者(D-II)的核酸,对属于半内果菌(HamiRera)属的菌类进行 鉴定的工序,(D-I)含有序列号35记载的碱基序列或者其互补序列的核酸;(D-II)含有在序列号35记载的碱基序列中使一个或者数个碱基缺失、置换或者 添加而得到并且能够用于检测属于半内果菌属的菌类的碱基序列或者其互补序列的核酸。此外,本专利技术涉及用于耐热菌类的检测的以下(I)或者(II)的核酸。(I)含有序列号M 35或者83 86中任一个所记载的碱基序列或者其互补序 列的核酸;(II)含有在序列号M 35或者83 86中任一个所记载的碱基序列中使一个或 者数个碱基缺失、置换或者添加而得到并且能够用于耐热菌类的检测的碱基序列或者其互 补序列的核酸。另外,本专利技术涉及可以和上述(I)或者(II)的核酸进行杂交,并且作为用于特异 性检测耐热菌类的核酸探针或者核酸引物而发挥功能的耐热菌类的检测用寡核苷酸。此外,本专利技术涉及含有将上述检测用寡核苷酸作为核酸探针或者核酸引物的耐热 菌类检测用试剂盒。根据本专利技术,可以提供一种特异并且迅速地检测、鉴别作为饮食品污染事故的主 要原因菌的耐热菌类的方法。附图说明图1是烟曲霉(Aspergillus fumigatus)、费希尔新萨托菌 (Neosartoryafischeri var. fischeri),刺抱新萨托菌(Neosartorya fischeri var. spinosa)的β -微管蛋白基因的碱基序列的一部分的比较图。图2是表示榛色钩囊菌(Hamigera avellanea)以及芽枝状枝孢(Cladosporium cladosporoides)的β -微管蛋白基因的碱基序列图。图3是表示实施例1 (A-I)的属于丝衣霉属的菌类的鉴别结果的电泳图。图4是使用实施例1 (Α-2)的纯黄丝衣菌(Byssochlamys fulva)的各菌株的电泳 图。图5是使用实施例1 (A-2)的雪白丝衣菌(Byssochlamys nivea)的各菌株的电泳 图。图6是实施例I(B-I)的属于篮状菌属的菌类的鉴别结果的电泳图。图7是实施例1 (B-2)的属于篮状菌属的菌类的鉴别结果的电泳图。图8是表示实施例1(B_2)的属于篮状菌属的菌类的鉴别结果的电泳图。图9-1是实施例1 (B-3)的电泳图。图9-2是实施例1 (B-4)的电泳图。图10是使用本文档来自技高网
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【技术保护点】
1.一种检测选自丝衣霉(Byssochlamys)属、篮状菌(Talaromyces)属、新萨托菌(Neosartorya)属、烟曲霉(Aspergillus fumigatus)以及半内果菌(Hamigera)属中的至少一种耐热菌类的方法,其是包括下述1)~4)中的至少一个工序的耐热菌类的检测方法,1)用下述(A-I)或者(A-II)的核酸对属于丝衣霉(Byssochlamys)属的菌类进行鉴定的工序,(A-I)含有序列号24或者25记载的碱基序列或者其互补序列的核酸;(A-II)含有在序列号24或者25记载的碱基序列中使一个或者数个碱基缺失、置换或者添加而得到并且能够用于检测属于丝衣霉属的菌类的碱基序列或者其互补序列的核酸;2)用下述(B-I)或者(B-II)的核酸对属于篮状菌(Talaromyces)属的菌类进行鉴定的工序,(B-I)含有序列号26~31中任一个记载的碱基序列或者其互补序列的核酸;(B-II)含有在序列号26~31中任一个记载的碱基序列中使一个或者数个碱基缺失、置换或者添加而得到并且能够用于检测属于篮状菌属的菌类的碱基序列或者其互补序列的核酸;3)用下述(C-I)或者(C-II)的核酸对属于新萨托菌(Neosartorya)属的菌类以及/或者烟曲霉(Aspergillus fumigatus)进行鉴定的工序,(C-I)含有序列号32~34或者83~86中任一个所记载的碱基序列或者其互补序列的核酸;(C-II)含有在序列号32~34或者83~86中任一个所记载的碱基序列中使一个或者数个碱基缺失、置换或者添加而得到并且能够用于检测属于新萨托菌属的菌类以及/或者烟曲霉的碱基序列或者其互补序列的核酸;4)用下述(D-I)或者(D-II)的核酸对属于半内果菌(Hamigera)属的菌类进行鉴定的工序,(D-I)含有序列号35记载的碱基序列或者其互补序列的核酸;(D-II)含有在序列号35记载的碱基序列中使一个或者数个碱基缺失、置换或者添加而得到并且能够用于检测属于半内果菌属的菌类的碱基序列或者其互补序列的核酸。...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】JP2008-1399992008年5月28日1.一种检测选自丝衣霉(Byssochlamys)属、篮状菌(Talaromyces)属、新萨托菌 (Neosartorya)属、烟曲霉(Aspergillus fumigatus)以及半内果菌(Hamigera)属中的至 少一种耐热菌类的方法,其是包括下述1) 4)中的至少一个工序的耐热菌类的检测方法,1)用下述(A-I)或者(A-II)的核酸对属于丝衣霉(Byssochlamys)属的菌类进行鉴定 的工序,(A-I)含有序列号M或者25记载的碱基序列或者其互补序列的核酸;(A-II)含有在序列号M或者25记载的碱基序列中使一个或者数个碱基缺失、置换 或者添加而得到并且能够用于检测属于丝衣霉属的菌类的碱基序列或者其互补序列的核 酸;2)用下述(B-I)或者(B-II)的核酸对属于篮状菌(Talaromvces)属的菌类进行鉴定 的工序,(B-I)含有序列号沈 31中任一个记载的碱基序列或者其互补序列的核酸;(B-II)含有在序列号沈 31中任一个记载的碱基序列中使一个或者数个碱基缺失、 置换或者添加而得到并且能够用于检测属于篮状菌属的菌类的碱基序列或者其互补序列 的核酸;3)用下述(C-I)或者(C-II)的核酸对属于新萨托菌(Neosartorya)属的菌类以及/ 或者烟曲霉(Aspergillus fumigatus)进行鉴定的工序,(C-I)含有序列号32 34或者83 86中任一个所记载的碱基序列或者其互补序列 的核酸;(C-II)含有在序列号32 34或者83 86中任一个所记载的碱基序列中使一个或者 数个碱基缺失、置换或者添加而得到并且能够用于检测属于新萨托菌属的菌类以及/或者 烟曲霉的碱基序列或者其互补序列的核酸;4)用下述(D-I)或者(D-II)的核酸对属于半内果菌(HamiRera)属的菌类进行鉴定的工序,(D-I)含有序列号35记载的碱基序列或者其互补序列的核酸;(D-II)含有在序列号35记载的碱基序列中使一个或者数个碱基缺失、置换或者添加 而得到并且能够用于检测属于半内果菌属的菌类的碱基序列或者其互补序列的核酸。2.如权利要求1所述的耐热菌类的检测方法,其特征在于,为了进行鉴定,决定被检测菌的微管蛋白基因区或者^S rDNA的D1/D2区域以及 ITS区域的碱基序列,确认在该区域的碱基序列中是否含有所述的(A-I) (D-II)中任一 个的碱基序列。3.如权利要求1所述的耐热菌类的检测方法,其特征在于,为了进行鉴定,标记与所述(A-I) (D-II)中任一个核酸在严格条件下进行杂交的检 测用寡核苷酸,使得到的检测用寡核苷酸与从检测对象物中提取的核酸在严格条件下进行 杂交,测定经杂交的检测用寡核苷酸的标记。4.如权利要求1所述的耐热菌类的检测方法,其特征在于,为了进行鉴定,基因扩增由所述(A-I) (D-II)中任一个核酸中的一部分或者全部区 域构成的核酸,确认有无扩增产物。5.如权利要求4所述的耐热菌类的检测方法,其特征在于,采用聚合酶链反应(PCR)法进行所述扩增反应。6.如权利要求4所述的耐热菌类的检测方法,其特征在于,采用环介导等温扩增(LAMP)法进行所述扩增反应。7.如权利要求4 6中任一项所述的耐热菌类的检测方法,其特征在于,所述1) 4)的工序分别是下述1-1) 4-1)的工序,1-1)将能够与以下区域杂交的寡核苷酸用作核酸引物进行基因扩增反应的工序,其 中,所述区域为所述(A-I)或者(A-II)的核酸中的区域,且满足下述(1) (4)这4个条 件(1)含有属于丝衣霉(Bvssochlamvs)属的菌类所固有的基因的碱基序列以大约10个 碱基连续出现的区域,(2)寡核苷酸的GC含量在30% 80%,(3)寡核苷酸的自退火的可能性低,(4)寡核苷酸的Tm值在55°C 65°C ;2-1)将能够与以下区域杂交的寡核苷酸用作核酸引物进行基因扩增反应的工序,其 中,所述区域为所述(B-I)或者(B-...

【专利技术属性】
技术研发人员:细谷幸一
申请(专利权)人:花王株式会社
类型:发明
国别省市:JP

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