本发明专利技术公开了一种用于鉴别水稻籼亚种生态型的引物组合物及其应用。所述引物组合物由如下引物对组成：序列1和2所示DNA组成rm216引物对、序列3和4所示DNA组成rm225引物对、序列5和6所示DNA组成rm235引物对、序列7和8所示DNA组成rm25引物对、序列9和10所示DNA组成rm23引物对、序列11和12所示DNA组成rm244引物对、序列13和14所示DNA组成rm253引物对、序列15和16所示DNA组成rm267引物对、序列17和18所示DNA组成rm296引物对、序列19和20所示DNA组成rm223引物对、序列21和22所示DNA组成rm258引物对。该引物组合物可用于水稻籼亚种生态型鉴定，具有快捷高效、灵敏度高、分辨力好、结果准确可靠等优点。
【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及一种用于鉴别水稻籼亚种生态型的引物组合物及其应用。
技术介绍
水稻(Oryza sativa L.)是世界上最重要的粮食作物之一。中国作为亚洲栽培稻的起源地之一(Oka 1988)，拥有丰富的稻种资源。目前，国家种质资源库收集保存栽培稻7 万余份，其中籼稻种质资源占67% (ICGR CAAS 1996)。我国籼稻种植面积占水稻总面积的 70%，而且，籼稻是实现杂交化程度最高的水稻，杂交籼稻种植面积已占中国籼稻面积的近 80%。因此，籼稻在我国水稻研究和生产实践中具有重要的地位。栽培稻的分类一直受到各国科学家的高度重视，国内外学者相继提出了多种分类体系。籼、粳是亚洲栽培稻遗传分化的主流，已有了比较一致的认识。每个亚种内的遗传分化及分类却一直没有一致的意见。进入20世纪80年代以来，我国杂交稻产量徘徊不前，其中最主要的原因是亲本的遗传基础狭窄，而拓宽杂交稻亲本间的遗传差异，可以在一定程度上提高组合的优势强度。 然而，根据不同地区的生态条件所划分的生态类型无法有效反映亲本间的遗传差异，对杂种优势的预测效果不理想。另外，水稻中籼、粳亚种间杂种优势的利用已得到广泛的关注， 但是，由于存在Fl代半不育等诸多问题，亚种间杂种优势一直难以直接利用，亚种内不同生态类型间的杂种优势利用已成为育种家的共识。但是，有关合理、可行的亚种内生态型的划分研究较少。亚种内不同生态型间杂种优势的利用已成为杂交稻进入更高发展阶段，开展超高产育种的一个主要方向。要进行籼稻亚种内不同生态型间杂种优势的超高产育种，首先要正确判别能够反映品种间遗传差异的生态型。然而，大量育成品种由于广泛杂交而具有复杂的血缘，对这些品种的分类是栽培稻分类的新任务。
技术实现思路
本专利技术的目的是提供一种用于鉴别水稻籼亚种生态型的引物组合物及其应用。本专利技术提供的辅助鉴别水稻籼亚种生态型的引物组合物，由rm216引物对、rm225 引物对、rm235引物对、rm25引物对、rm23引物对、rm244引物对、rm253引物对、rm267引物对、η 96引物对、rm223引物对和rm258引物对组成；所述rm216引物对为序列表的序列1所示DNA(上游引物)和序列表的序列2所示DNA(下游引物)组成的引物对；所述rm225引物对为序列表的序列3所示DNA(上游引物)和序列表的序列4所示DNA(下游引物)组成的引物对；所述rm235引物对为序列表的序列5所示DNA(上游引物)和序列表的序列6所示DNA(下游引物)组成的引物对；所述rm25引物对为序列表的序列7所示DNA (上游引物)和序列表的序列8所示DNA (下游引物)组成的引物对；所述rm23引物对为序列表的序列9所示DNA (上游引物)和序列表的序列10所示DNA (下游引物)组成的引物对；所述rm244引物对为序列表的序列11所示DNA(上游引物)和序列表的序列12所示DNA(下游引物)组成的引物对；所述rm253弓丨物对为序列表的序列13所示DNA (上游引物)和序列表的序列14所示DNA (下游引物)组成的引物对；所述rm267引物对为序列表的序列15所示DNA (上游引物)和序列表的序列16 所示DNA(下游引物)组成的引物对；所述η 96引物对为序列表的序列17所示DNA(上游引物)和序列表的序列18所示DNA (下游引物)组成的引物对；所述rm223引物对为序列表的序列19所示DNA (上游引物)和序列表的序列20所示DNA (下游引物)组成的引物对；所述rm258引物对为序列表的序列21所示DNA(上游引物)和序列表的序列22所示 DNA(下游引物)组成的引物对。所述水稻籼亚种生态型可为早籼生态型、中间型生态型或晚籼生态型。所述引物组合物中的每条引物在合成时，可以引入各种标记，如荧光标记。所述引物组合物可用于辅助鉴别水稻籼亚种生态型。所述水稻籼亚种生态型可为早籼生态型、中间型生态型或晚籼生态型。所述的引物组合物可用于制备辅助鉴别水稻籼亚种生态型的试剂盒。所述水稻籼亚种生态型可为早籼生态型、中间型生态型或晚籼生态型。本专利技术还保护一种辅助鉴别水稻籼亚种生态型的试剂盒，含有所述引物组合物。 所述水稻籼亚种生态型可为早籼生态型、中间型生态型或晚籼生态型。所述试剂盒中，还可包括用于提取基因组DNA的试剂和/或用于PCR扩增的试剂。所述试剂盒中的各个组分可为液体，也可为冻干粉。本专利技术还保护一种应用所述引物组合物辅助鉴别水稻籼亚种生态型的方法，所述水稻籼亚种生态型可为早籼生态型、中间型生态型或晚籼生态型，所述方法包括如下步骤(1)以待测水稻的基因组DNA为模板，分别用所述rm216引物对、所述rm225弓丨物对、所述rm235引物对、所述rm25引物对、所述rm23引物对、所述rm244弓丨物对、所述rm253 引物对、所述rm267引物对、所述η 96引物对、所述rm223引物对和所述rm258引物对进行PCR扩增，得到PCR扩增产物；(2)检测采用各个所述引物对得到的所述PCR扩增产物，按照如下标准进行赋值采用所述RM216引物对，如果得到130bp的PCR扩增产物、rm216_130 = 1，如果没有得到130bp的PCR扩增产物、rm216_130 = 0 ；采用所述rm225引物对，如果得到146bp的PCR扩增产物、rm225_146 = 1，如果没有得至Ij 146bp的PCR扩增产物、rm225_146 = 0 ；采用所述rm235引物对，如果得到IMbp的PCR扩增产物、rm235_lM = 1，如果没有得至Ij 124bp的PCR扩增产物、rm235_124 = 0 ；采用所述rm25引物对，如果得到148bp的PCR扩增产物、rm25_148 = 1，如果没有得到148bp的PCR扩增产物、rm25_148 = 0 ；采用所述rm223引物对，如果得到147bp的PCR扩增产物、rm223_147 = 1，如果没有得至Ij 147bp的PCR扩增产物、rm223_147 = 0 ；采用所述rm23引物对，如果得到134bp的PCR扩增产物、rm23_134 = 1，如果没有得到134bp的PCR扩增产物、rm23_134 = 0 ；采用所述rm244引物对，如果得到152bp的PCR扩增产物、η 44_152 = 1，如果没有得到的PCR扩增产物、ηι 44_152 = 0 ；采用所述rm258引物对，如果得到122bp的PCR扩增产物、rm258_122 = 1，如果没有得到122bp的PCR扩增产物、rm258_122 = 0 ；采用所述rm244引物对，如果得到151bp的PCR扩增产物、η 44_151 = 1，如果没有得到151bp的PCR扩增产物、ηι 44_151 = 0 ；采用所述rm253引物对，如果得到140bp的PCR扩增产物、rm253_140 = 1，如果没有得至Ij 140p的PCR扩增产物、rm253_140 = 0 ；采用所述rm267引物对，如果得到156bp的PCR扩增产物、η 67_156 = 1，如果没有得至Ij 156ρ的PCR扩增产物、rm267_156 = 0 ；采用所述rm296引物对，如果得到118bp的PCR扩增产物、本文档来自技高网...
【技术保护点】
１．辅助鉴别水稻籼亚种生态型的引物组合物，由ｒｍ２１６引物对、ｒｍ２２５引物对、ｒｍ２３５引物对、ｒｍ２５引物对、ｒｍ２３引物对、ｒｍ２４４引物对、ｒｍ２５３引物对、ｒｍ２６７引物对、ｒｍ２９６引物对、ｒｍ２２３引物对和ｒｍ２５８引物对组成；所述ｒｍ２１６引物对为序列表的序列１所示ＤＮＡ和序列表的序列２所示ＤＮＡ组成的引物对；所述ｒｍ２２５引物对为序列表的序列３所示ＤＮＡ和序列表的序列４所示ＤＮＡ组成的引物对；所述ｒｍ２３５引物对为序列表的序列５所示ＤＮＡ和序列表的序列６所示ＤＮＡ组成的引物对；所述ｒｍ２５引物对为序列表的序列７所示ＤＮＡ和序列表的序列８所示ＤＮＡ组成的引物对；所述ｒｍ２３引物对为序列表的序列９所示ＤＮＡ和序列表的序列１０所示ＤＮＡ组成的引物对；所述ｒｍ２４４引物对为序列表的序列１１所示ＤＮＡ和序列表的序列１２所示ＤＮＡ组成的引物对；所述ｒｍ２５３引物对为序列表的序列１３所示ＤＮＡ和序列表的序列１４所示ＤＮＡ组成的引物对；所述ｒｍ２６７引物对为序列表的序列１５所示ＤＮＡ和序列表的序列１６所示ＤＮＡ组成的引物对；所述ｒｍ２９６引物对为序列表的序列１７所示ＤＮＡ和序列表的序列１８所示ＤＮＡ组成的引物对；所述ｒｍ２２３引物对为序列表的序列１９所示ＤＮＡ和序列表的序列２０所示ＤＮＡ组成的引物对；所述ｒｍ２５８引物对为序列表的序列２１所示ＤＮＡ和序列表的序列２２所示ＤＮＡ组成的引物对。...
【技术特征摘要】
【专利技术属性】
技术研发人员：李自超，张冬玲，张洪亮，王美兴，王凤梅，宋立莹，马占峰，
申请(专利权)人：中国农业大学，
类型：发明
国别省市：11
0来自[美国] 2015年04月12日 05:15鉴别是指分辨一些事物的真假，多用于古物的鉴定。是属于现代汉语中的白话词汇，在现代虽然该词比较少见，但在古代是属于使用频率较高的汉语词汇。在一般场合比较常见。