【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及甲病毒属西门利克森林病毒复合组,特别是盖塔病毒全基因组序列、 扩增方法及引物。
技术介绍
盖塔病毒属于甲病毒属西门利克森林病毒复合组,主要分布在东南亚和澳大利亚北部太平洋沿岸。此病毒能够引起猪、马等牲畜发热、皮疹、后肢水肿、淋巴结肿大及流产等症状。在我国通过对发热病人血清筛查发现零星病例盖塔病毒中和抗体阳性,说明此病毒和人类疾病相关联,需要进行深入研究。
技术实现思路
本专利技术目的是提供盖塔病毒(GZ0885株)全基因组序列、扩增方法及引物,并进一步提供盖塔病毒全基因组序列快速测定方法,这一专利技术对获得盖塔病毒全基因组序列并应用于研究盖塔病毒进化及其分子流行病学具有重要意义,同时本专利技术为制备盖塔病毒疫苗株提供最佳候选株,将盖塔病毒适应于哺乳动物细胞,为盖塔病毒的预防与控制提供保障。为实现以上目的,本专利技术采用以下技术方案盖塔病毒(GZ0885株)全基因组序列扩增方法,它包括1、盖塔病毒适应哺乳动物来源细胞系及盖塔病毒的纯化;2病毒RNA的提取;3、病毒RNA的逆转录;4、病毒全基因组序列扩增引物的设计与合成;5基因片段的PCR扩增;6、PCR产物直接进行序列测定及序列拼接。具体实施例方式实施例1、盖塔病毒适应哺乳动物来源细胞系及盖塔病毒的纯化在P2实验室取在C6/36细胞传代三次含盖塔病毒的细胞上清感染BHK-21 (金黄地鼠肾)细胞[培养液MEM培养液,谷胺酰胺(30g/l),2%双抗(青、链霉素10,000U/ 1),2% NaHCO3 (75g/l),10 %胎牛血清],并在BHK-21细胞上进行连续传代使其适应于 BHK-21 ...
【技术保护点】
1.盖塔病毒全基因组序列,其特征在于:基因组全长包括11690个核苷酸,不包括5’端帽子结构、3’端的多聚核苷酸尾,整个基因组编码一个多聚蛋白,5’端2/3编码非结构蛋白,3’端1/3编码结构蛋白,序列如下:ATGGCGGACGTGTGACATCACCGTTCGCTCTTTCTAGGATCCTTTGCTACTCCACATAGTGAGAGACAAACAACCCAAATGAAGGTAACCGTGGACGTTGAGGCTGATAGCCCATTCCTTAAGGCCCTTCAGAAGGCGTTTCCCGCCTTTGAGGTTGAATCACAGCAGGTCACACCGAATGACCATGCTAACGCTAGAGCATTTTCGCATCTGGCTACTAAACTGATTGAGCAAGAGGTTCCAACAGGCGTCACCATCCTGGACGTGGGTAGTGCACCCGCAAGGAGGTTGATGTCTGACCACACCTACCACTGCATCTGCCCCATGAAAAGTGCGGAAGACCCAGAGAGACTGGCGAATTACGCTCGAAAGCTGGCGAAAGCATCGGGGACTGTG ...
【技术特征摘要】
1.盖塔病毒全基因组序列,其特征在于基因组全长包括11690个核苷酸,不包括5’ 端帽子结构、3’端的多聚核苷酸尾,整个基因组编码一个多聚蛋白,5’端2/3编码非结构蛋白,3’端1/3编码结构蛋白,序列如下ATGGCGGACGTGTGACATCACCGTTCGCTCTTTCTAGGATCCTTTGCTACTCCACATAGTGAGAGACAAACAACCCAAATGAAGGTAACCGTGGACGTTGAGGCTGATAGCCCATTCCTTAAGGCCCTTCAGAAGGCGTTTCCCGCCTTTGAGGTTGAATCACAGCAGGTCACACCGAATGACCATGCTAACGCTAGAGCATTTTCGCATCTGGCTACTAAACTGATTGAGCAAGAGGTTCCAACAGGCGTCACCATCCTGGACGTGGGTAGTGCACCCGCAAGGAGGTTGATGTCTGACCACACCTACCACTGCATCTGCCCCATGAAAAGTGCGGAAGACCCAGAGAGACTGGCGAATTACGCTCGAAAGCTGGCGAAAGCATCGGGGACTGTGCTAGACAAGAATGTGTCCGGAAAGATAACGGACCTACAAGACGTCATGGCCACTCCAGACTTGGAATCCCCGACTTTTTGCCTGCATACTGACGAGACGTGCCGCACTAGGGCTGAGGTCGCCGTGTACCAGGACGTATACGCTGTGCACGCACCGACGTCACTGTACCACCAGGCCATCAAAGGCGTCAGGACGGCGTATTGGATTGGATTCGACACCACTCCATTCATGTTCGAGGCACTAGCGGGCGCGTACCCTGCGTACTCGACCAACTGGGCAGATGAGCAAGTGCTGCAAGCTCGTAACATCGGCCTGTGCGCGACAGGCCTCTCCGAGGGGCGTCGCGGCAAACTCTCCATTATGAGAAAAAAGTGCTTGCGACCGAGCGACAGAGTAATGTTTTCGGTCGGGTCCACCTTGTACACCGAGAGCCGAAAGCTGCTGCGCAGCTGGCATTTACCTTTCGTGTTTCACCTGAAGGGTAAGAACAGTTTTACCTGCAGGTGCGACACGGTGGTGTCATGCGAAGGTTATGTGGTAAAGAAGATCACCATAAGCCCGGGCATATATGGAAAAACAGTCGATTACGCAGTTACCCATCACGCAGAGGGTTTCCTGATGTGTAAGATCACTGATACAGTCAGAGGAGAAAGAGTCTCTTTCCCGGTCTGTACCTATGTGCCTGCAACCATATGCGACCAGATGACGGGTATACTTGCCACTGATGTGACACCAGAGGATGCCCAGAAGCTCCTGGTTGGATTGAACCAACGCATAGTGGTGAACGGTAGGACGCAAAGAAACACAAACACAATGAAAAACTACCTACTGCCAGTGGTAGCGCAAGCATTCAGTAAATGGGCACGAGAGGCACGCGCAGACATGGAGGACGAAAAACCCCTAGGCACCAGAGAACGCACGTTGACGTGTTGTTGCCTGTGGGCGTTCAAAAGCCACAAAACCCACACCATGTATAAGCGGCCTGAAACACAAACTATCGTCAAAGTGCCTTCCACTTTTGACTCCTTTGTGATACCGAGCCTGTGGTCATTCAGTCTTTCCATGGGTATCAGACAGAGGATCAAATTGCTACTCAGCGCAAGAATGGCCCAAGGCCTACCATACTCAGGAGATCGCACTGAAGCTCGCGCGGCAGAAGAAGAAGAGAAGGAGGTGCAGGAGGCTGAACTTACGAGGGCAGCGCTGCCACCGCTAGTGAGCGGCTCTTGTGCTGACGATATCGCCCAGGTGGATGTAGAGGAACTAACCTTCAGAGCCGGAGCCGGGGTTGTGGAAACACCCAGGAATGCCCTGAAGGTTACACCGCAAGCACACGACCATCTCATAGGCTCCTACTTGATCCTTTCCCCCCAAACGGTGTTGAAAAGCGAGAAGCTGGCACCCATCCACCCTCTTGCTGAGCAAGTCACGGTCATGACCCACTCTGGAAGATCCGGCAGATACCCAGTCGACAAGTACGACGGACGGGTATTGATCCCAACAGGAGCAGCCATCCCAGTGAGTGAGTTCCAGGCACTCAGCGAGAGCGCAACCATGGTGTACAATGAGAGGGAATTTATAAATCGCAAGCTACACCACATAGCGCTATACGGGCCAGCCTTGAATACCGACGAGGAAAGCTACGAAAAAGTGAGAGCCGAAAGGGCAGAGACAGAGTATGTGTTCGACGTGGACAAGAAGGCATGTATCAAGAAGGAGGAGGCATCAGGCCTTGTGTTAACAGGGGACCTAATCAATCCACCTTTCCACGAATTCGCATACGAAGGACTCAAGATCCGCCCAGCAGCCCCGTACCACACGACGATCATTGGTGTGTTTGGCGTTCCGGGTTCGGGCAAGTCGGCTATCATTAAGAATATGGTGACGACTCGCGATCTGGTGGCCAGTGGAAAGAAGGAGAACTGCCAAGAGATCATGAATGATGTAAAGAGGCAACGCGGGTTGGACGTAACCGCTAGGACCGTCGACTCAATCTTATTGAATGGGTGCAAGAAAGGCGTAGAAAACCTTTACGTCGATGAGGCGTTCGCGTGTCACTCGGGTACTTTGCTAGCGCTCATCGCGCTGGTGAGACCGTCAGGTAAGGTAGTACTGTGCGGCGACCCTAAGCAGTGTGGTTTCTTCAATTTGATGCAACTGAAGGTGCACTATAACCACAACATATGTACAAGGGTGCTCCATAAGAGCATCTCCAGAAGATGCACTCTACCTGTTACGGCGATCGTGTCCACCCTGCACTACCAAGGGAAGATGAGAACGACGAACCGATGCAACACCCCCATTCAGATTGACACCACCGGTTCCTCCAAACCAGCCTCAGGAGATATCGTGTTAACGTGCTTCCGCGGCTGGGTGAAGCAACTGCAAATCGACTATCGTGGACACGAGGTGATGACCGCAGCCGCTTCCCAGGGTCTGACAAGGAAAGGCGTGTACGCCGTGAGACAGAAAGTGAACGAAAACCCACTGTACTCACCTCTGTCGGAGCACGTCAACGTGCTGTTGACCCGAACTGAAAACCGACTGGTGTGGAAGACACTGTCGGGTGACCCGTGGATAAAGGTGTTAACCAATGTTCCACGTGGGGATTTCAGTGCAACTCTGGAGGAATGGCAAGAAGAACATGACGGTATCATGAGAGTGTTGAACGAGCGACCGGCGGAGGTCGATCCATTCCAAAACAAGGCTAAGGTGTGCTGGGCAAAATGTCTGGTGCAAGTTCTTGAGACGGCCGGAATACGTATGACGGCAGATGAATGGAACACCATCTTGGCTTTCAGAGAGGACAGAGCGTACTCACCAGAAGTCGCTCTCAACGAGATTTGCACTCGTTACTACGGCGTTGACCTAGACAGCGGCCTATTCTCAGCGCAGTCGGTTTCCCTCTTTTATGAGAACAACCATTGGGACAACAGGCCTGGAGGACGCATGTACGGGTTCAACCATGAAGTAGCCAGGAAATACGCAGCCAGGTTTCCATTTCTACGTGGCAACATGAACTCGGGGCTACAACTAAATGTCCCTGAGAGGAAGCTCCAGCCCTTTAGCGCTGAATGCAACATAGTCCCATCCAATCGTCGGTTACCGCATGCTCTGGTCACAAGTTATCAGCAGTGCCGTGGGGAGAGGGTAGAGTGGTTGCTGAAAAAGATTCCAGGTCACCAAATGTTACTCGTAAGTGAGTACAACCTGGTGATACCTCACAAAAGAGTCTTCTGGATTGCACCTCCGCGGGTGTCAGGCGCGGACCGCACGTACGACTTGGACCTAGGGTTACCTATGGATGCAGGCCGTTACGACCTGGTATTCGTCAACATCCATACTGAGTACCGGCAACACCACTACCAACAATGCGTCGACCATTCAATGCGCCTGCAGATGCTGGGAGGGGATTCACTACACCTGCTCAGACCAGGAGGCTCGCTGCTGATGAGAGCATATGGTTACGCAGACAGAGTCAGCGAGATGGTGGTGACAGCCCTGGCTAGGAAATTCTCGGCGTTCCGTGTCCTGAGACCGGCGTGTGTGACGAGCAACACAGAAGTGTTCCTGCTGTTTTCTAACTTTGATAACGGCAGAAGAGCGGTAACCTTGCACCAAGCTAACCAAAAACTTAGCTCAATGTATGCCTGCAACGGATTGCACACTGCTGGTTGTGCACCGTCATACAGGGTCCGCCGCGCAGATAATTCAGGACACAGTGAGGAAGCGGTCGTAAATGCTGCCAATGCCAAAGGTACCGTGAGCGACGGAGTGTGCAGGGCGGTTGCTAAGAAGTGGCCATCATCTTTCAAAGGGGCTGCAACTCCAGTCGGCACAGCCAAAATGATCCGCGCAGATGGCATGACCGTAATCCACGCAGTGGGACCAAACTTCTCCACCGTAACAGAAGCCGAAGGGGACAGAGAGCTAGCGGCCGCGTATCGAGCTGTGGCTAGCATAATTAGTACCAATAACATAAAGAGCGTCGCTGTACCGCTGCTGTCCACAGGCACCTTCTCCGGCGGTAAGGACAGAGTGATGCAGTCCTTGAACCACTTATTCACGGCACTGGACGCAACCGACGCAGACGTGGTTATCTACTGCAGAGATAAAAACTGGGAAAAGAAGATTCAGGAAGCCATCGACAGGCGGACGGCAATCGAGCTCGTATCTGAAGACGTGACCTTGGAAACCGATCTGGTTAGGGTACACCCGGACAGTTGCTTAGTCGGCAGAAATGGTTACAGTGCAACTGACGGTAAACTGTACTCTTACCTTGAGGGCACGAGGTTCCACCAGACGGCGGTCGACATGGCTGAAATATCAACTTTATGGCCAAGACTCCAAGATGCTAACGAGCAGATCTGCCTGTACGCCCTAGGGGAGACGATGGACAGCATACGCACTAAATGCCCAGTAGAGGACGCCGATTCGTCTACGCCGCCGAAAACGGTACCGTGTCTATGTCGGTATGCGATGACCGCGGAGCGGGTTGCCAGACTTAGGATGAATAACACCAAAAACATCATCGTGTGCTCC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【专利技术属性】
技术研发人员:梁国栋,王力华,付士红,
申请(专利权)人:中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,
类型:发明
国别省市:11
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