【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】序列和疫苗本文中提及的所有出版物、专利申请、专利和其他参考资料以其全文通过引用合并入本文。本专利技术是在通过美国能源部项目U.S. DE-FG02-90ER40542的政府 支持下完成。因此，美国政府具有本专利技术的某些权利。
技术介绍
慢病毒属于病毒的逆转录病毒家族。术语lenti是慢 的拉丁文。慢病毒的特征在于具有长潜伏期和直接感染邻近细胞而不 必形成细胞外颗粒。它们的'ft速周转(turnover ),加上它们在细胞 内长期保持的能力，使慢病毒特别善于逃避被感染的受试者的免疫反 应。慢病毒包括免疫缺陷病毒，例如人免疫缺陷症病毒(HIV)、猿猴免 疫缺陷病毒(SIV)、猫免疫缺损病毒(FIV)和马感染性贫血病毒(equine infectious anemia viruses, EIAV)。慢病毒感染可引起严重的疾病， 并且，如果不进行治疗，可以是致命的。在最近几年，已开发了减少 病毒载量和改善HIV感染的症状的几种抗逆转录病毒药物和药物混合 物。然而，尽管它们是成功的，但这些药物通常不能全根除病毒感染。 相反，病毒通常以潜伏存留在被感染的受试者中。也已经进行许多产 生抗慢病毒疾病例如HIV的疫苗的努力。然而，迄今为止，还没有可 商购获得的疫苗。因此，在本领域需要开发抗慢病毒例如HIV的新型 药物和疫苗。专利技术概述 本专利技术提供了与人基因组中的相对照的基因相比在HIV 病毒的基因组中过度出现(over-represented)的三核苷酸序列基序 AGG。 AGG基序也以高水平存在于其他病毒的基因组中。据认为AGG基序是抑制性核苷酸信号序列或和INS序列。...
【技术保护点】
已进行了突变从而将一个或多个ＡＧＧ序列改变成非ＡＧＧ序列的病毒核酸。
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】US 2006-7-13 60/830,498;US 2007-3-13 60/906,6111.已进行了突变从而将一个或多个AGG序列改变成非AGG序列的病毒核酸。2. 权利要求l的病毒核酸，其中所述病毒是慢病毒。3. 权利要求l的病毒核酸，其中所述病毒是HIV。4. 包含导致一个或多个AGG序列改变成一个或多个非AGG序列的 突变的HIV核酸。5. 包含导致^g、 ； o/或e/3r基因中的一个或多个AGG序列改变 成非AGG序列的一个或多个突变的病毒核酸。6. 包含导致^sg、 po/或e/2r基因中的一个或多个AGG序列改变 成非AGG序列的一个或多个突变的HIV核酸。7. 具有在gM基因中拥有少于47个AGG序列的序列的HIV核酸。8. 具有在^g基因中拥有少于大约45个AGG序列的序列的HIV 核酸。9. 具有在gag基因中拥有少于大约43个AGG序列的序列的HIV 核酸。10. 具有在^g基因中拥有少于大约41个AGG序列的序列的HIV 核酸。11. 具有在^g基因中拥有少于大约39个AGG序列的序列的HIV 核酸。12. 具有在^g基因中拥有少于大约37个AGG序列的序列的HIV 核酸。13. 具有在^2g基因中拥有少于大约35个AGG序列的序列的HIV 核酸。14. 具有在^2g基因中拥有少于大约33个AGG序列的序列的HIV 核酸。15. 具有在^g基因中拥有少于大约31个AGG序列的序列的HIV 核酸。16. 具有在^g基因中拥有少于大约29个AGG序列的序列的HIV 核酸。17. 具有在^g基因中拥有少于大约27个AGG序列的序列的HIV 核酸。18. 具有在^g基因中拥有少于大约25个AGG序列的序列的HIV 核酸。19. 具有在^g基因中拥有少于25个AGG序列的序列的HIV核酸。20. 包含一个或多个图1中显示的AGG突变的HIV核酸。21. 用于产生具有一个或多个突变的AGG序列的突变病毒核酸的 方法，所述方法包括提供包含一个或多个AGG序列的病毒核酸和将 一个或多个AGG序列突变成非AGG序列。22. 权利要求21的方法，其中如果一个或多个AGG序列存在于编 码蛋白质的病毒核酸的区域中，那么选择突变AGG序列产生的非AGG 序列以使其不改变由所述病毒核酸编码的蛋白质的氨基酸序列。23. 权利要求21的方法，其中如果一个或多个AGG序列存在于编 码蛋白质的病毒核酸的区域中，那么选择突变AGG序列产生的非AGG 序列以使其不改变由所述病毒核酸编码的蛋白质的结构、功能或免疫 原性。24. 权利要求21的方法，其中使用如下方法进行将一个或多个 AGG序列改变成非AGG序列的步骤，所述方法选自定点诱变、寡核苷 酸指导的诱变、阳性抗生素选择法、单一限制性位点消除法、脱氧尿 苷整合法、磷疏酰整合法和基于PCR的诱变。25. 权利要求21的方法，其中所述病毒核酸包含所述病毒的整个 基因組。26. 权利要求21的方法，其中所述病毒核酸包含病毒基因组的部 分，该部分足以指导病毒颗粒在宿主细胞中的产生。27. 权利要求21的方法，其中所述病毒核酸包含病毒基因组的部 分，该部分足以指导至少一种病毒蛋白质的表达。28. ^5l利要求21的方法，其中所述病毒核酸编码至少一种病毒蛋白质或其片段、衍生物、变体或同源物。29. 权利要求28的方法，其中所述病毒核酸编码至少一种选自 GAG、 P0L、 ENV的病毒蛋白质和其片段、衍生物和同源物。30. 具有已进行了突变从而将一个或多个AGG序列改变成非AGG 序列的基因组的突变病毒。31. 不是慢病毒的重组病毒，其中所述重组病毒包含已进行了突 变从而将一个或多个AGG序列改变成非AGG序列的慢病毒核酸序列。32. 包含已进行了突变从而将一个或多个AGG序列改变成非AGG序列的病毒核酸序列的病毒疫苗。33. 包含已进行了突变从而将一个或多个AGG序列改变成非AGG 序列的HIV核酸序列的HIV病毒疫苗。34. 包含具有比野生型病毒的AGG更少的AGG的病毒核酸序列的 病毒疫苗。35. 包含具有比野生型HIV的AGG更少的AGG的HIV核酸序列的 HIV疫苗。36. 能够比相应的野生型病毒更高地表达蛋白质的病毒疫苗，其 中所述病毒疫苗包含具有比野生型病毒核酸序列更少的AGG序列的核 酸序列。37. 能够比相应的野生型HIV病毒更高地表达蛋白质的HIV疫苗， 其中所述HIV疫苗包含具有比野生型HIV病毒核酸序列更少的AGG序 列的核酸序列。38. 包含通过表达病毒核酸产生的蛋白质的病毒疫苗，所述病毒 核酸已进行了突变从而将一个或多个AGG序列改变成非AGG序列。39. 权利要求38的病毒疫苗，其中在体外在宿主细胞中表达蛋白质。40. 权利要求38的病毒疫苗，其中使用无细胞体外转录和翻译系 统表达所述蛋白质。41. 包含从HIV核酸表达的蛋白质的HIV疫苗，所述HIV核酸已 进行了突变从而将一个或多个AGG序列改变成非AGG序列。42. 权利要求41的HIV疫苗，其中在体外在宿主细胞中表达所述 蛋白质。43. 权利要求41的HIV病毒疫苗，其中使用无细胞体外转录和翻 译系统表达所述蛋白质。44. 包含权利要求32 - 43的任一项的疫苗和其他组分的免疫原 性组合物，所述其他组分选自药学上可接受的稀释剂、载体、赋形剂 和佐剂。45. 用于免疫受试者以抗病毒的方法，所述方法包括对所述受试 者施用有效量的权利要求32、 34、 36和38 - 40的任一项的疫苗或免 疫原性组合物。46. 用于免疫受试者以抗HIV攻击的方法，所述方法包括对所述 受试者施用有效量的权利要求33、 35、 37和39-41的任一项的疫苗 或免疫原性组合物。47. 用于免疫受试者以抗病毒的方法，所迷方法包括对所述受试 者施用有效量的编码病毒的核酸，所述核酸已进行了突变从而将一个 或多个AGG序列改变成非AGG序列。48. 用于免疫受试者以抗HIV的方法，所述方法包括对所述受试 者施用有效量的编码人免疫缺陷病毒的核酸，所述核酸已进行了突变 从而将一个或多个AGG序列改变成非AGG序列。49. 用于免疫受试者以抗病毒的方法，所述方法包括对所述受试 者施用有效量的从病毒核酸表达的病毒蛋白质，所述病毒核酸已进行 了突变从而将一个或多个AGG序列改变成非AGG序列。50. 用于免疫受试者以抗HIV的方法，所述方法包括对所述受试 者施用有效量的从HIV核酸表达的蛋白质，所述HIV核酸已进行了突 变从而将一个或多个AGG序列改变成非AGG序列。51. 用于最优化病毒蛋白质在宿主中的产生的方法，所述方法包括(a)提供(i)宿主细胞，(ii)来自宿主细胞的基因组的至少一部 分的核苷酸序列，和(iii)病毒核酸序列；(b) 鉴定一个或多个与核苷酸的随机分布相比，在宿主序列中出 现不足或在宿主序列中过度出现的核苷酸序列基序，其中各基序长度 为大约6个核苷酸；(c) 确定所述病毒序列是否包含一个或多个在(b)中鉴定为出现 不足或过度出现的基序；(d) 改变所述病毒序列以增加出现不足的序列的数目或减少过 度出现的序列的数目，或同时进行两者，以在宿主中最优化蛋白质的 产生。52. 用于最优化用于疫苗产生的病毒核酸序列以使所述病毒核酸 序列得到改变，从而获得增加的病毒蛋白质的产生的方法，所述方法 包括(a) 提供(i)宿主细胞，(ii)来自宿主细胞的基因组的至少一 部分的核苷酸序列，和(iii)病毒核酸序列；(b) 鉴定一个或多个与核苷酸的随机分布相比，在宿主序列中 出现不足或在宿主序列中过度出现的核普酸序列基序，其中各基序长 度为大约6 -大约12个核苷...
【专利技术属性】
技术研发人员：R拉巴丹，M科拉森内兹，H洛宾斯，D威登，A勒维纳，
申请(专利权)人：高等研究学院，
类型：发明
国别省市：US[美国]
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