一种组织特异性差异甲基化区域检测方法和系统技术方案

本发明专利技术公开一种组织特异性差异甲基化区域ｔＤＭＲ检测方法和系统，该方法包括：通过全基因组测序获得全基因组上单点甲基化信息；根据全基因组上单点甲基化信息基于预选条件确定全基因组上种子ｔＤＭＲ；对种子ｔＤＭＲ向两侧延伸，基于延伸终止条件获得候选ｔＤＭＲ；基于过滤条件对候选ｔＤＭＲ进行过滤获得ｔＤＭＲ结果。本发明专利技术的方法和系统能明确全基因组上每一个位点的甲基化状态，在全基因组范围确定ｔＤＭＲ，大大提高了检测效率，降低了成本。经后续验证，本发明专利技术找到的ｔＤＭＲ准确率在８５％以上，经在多物种中验证（不仅限于哺乳动物），本发明专利技术的方法较Ｖａｒｄｈｍａｎ　Ｒａｋｙａｎ等的方法有更高的精确度和敏感度。

【技术实现步骤摘要】

【技术保护点】
一种组织特异性差异甲基化区域ｔＤＭＲ检测方法，其特征在于，包括：通过全基因组测序获得全基因组上单点甲基化信息；根据所述全基因组上单点甲基化信息基于预选条件确定全基因组上种子ｔＤＭＲ；对所述种子ｔＤＭＲ向两侧延伸，基于延伸终止条件获得候选ｔＤＭＲ；基于过滤条件对所述候选ｔＤＭＲ进行过滤，获得ｔＤＭＲ结果。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员：余昶，
申请(专利权)人：深圳华大基因科技有限公司，
类型：发明
国别省市：94[中国|深圳]