用于稳定p53突变体的化合物制造技术

技术编号:4924734 阅读:371 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
本发明专利技术提供了用于稳定携带Y220C突变的p53蛋白的式(I)的化合物:其中X选自CRX和N;RN1选自H和C1-4烷基,其可以被SH或卤素取代;RC1选自H和SH;RC2选自H和可选取代的C1-7烷基;RC3选自H和可选取代的C1-7烷基;RX选自H,OH和NH2;RC4选自:(i)可选取代的C3-12含N杂环基;(ii)C(=O)NRN5RN6,其中RN5和RN6独立地选自H,可选取代的C1-7烷基,可选取代的C3-20杂环基和可选取代的C5-20芳基,或RN5和RN6与它们连接的氮原子形成可选取代的含N的C5-7杂环基;(iii)C(=O)ORO1,其中RO1选自H,可选取代的C1-7烷基,可选取代的C3-20杂环基和可选取代的C5-20芳基;(iv)C(=O)NHNHSO2RS1,其中RS1选自H,可选取代的C1-7烷基,可选取代的C3-20杂环基和可选取代的C5-20芳基;(v)OC(=O)RC8,其中RC8选自H,可选取代的C1-7烷基,可选取代的C3-20杂环基和可选取代的C5-20芳基;(vi)OC(=O)NRN7RN8,其中RN7和RN8独立地选自H,可选取代的C1-7烷基,可选取代的C3-20杂环基和可选取代的C5-20芳基,或RN7和RN8与它们连接的氮原子形成可选取代的含N的C5-7杂环基;和(vii)C(=O)CH2NH2,C(=O)NHNH2,CHC(CN)2,CHC(CN)C(=O)NH2和羧基;RC5选自H,OH和NH2;或RC4和RC5与它们键接的碳原子一起形成式(II)的含5个或6个环原子的可选取代芳环:其中Q表示O,N或CRQ1=CRQ2,其中RQ1和RQ2独立地选自H,OH和NH2;RC6选自H,OH和NH2;而RC7选自可选取代的C3-12含N杂环基,NHC(=O)RC9,CH2NRN2RN3和NHC(=S)NHRN4,其中RC9选自可选取代的C1-7烷基,可选取代的C3-20杂环基和可选取代的C5-20芳基,RN2和RN3独立地选自H,可选取代的C1-7烷基,可选取代的C3-20杂环基和可选取代的C5-20芳基,或RN2和RN3与它们连接的氮原子形成可选取代的含N的C5-7杂环基,而RN4选自可选取代的C1-7烷基,可选取代的C3-20杂环基和可选取代的C5-20芳基,并当RC4和RC5没有键接在一起时,RC3可以另外地选自ORO2,其中RO2是C1-4烷基基团,和C(

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术涉及具有结合至p53蛋白分子的能力的化合物,以及这样的化合物的用途。
技术介绍
肿瘤抑制蛋白p53是一种393个氨基酸的转录因子,其调节细胞周期并在癌症发 展中起关键作用。响应于细胞应力,如UV照射、缺氧和DNA损伤,P53诱导与Gl和 G2细胞周期停滞和凋亡相关的许多基因的转录(参考文献1 3)。在约50%的人类癌 症中,p53由于p53基因中的错义突变而被失活(参考文献4,5)。p53的多功能性在其结构复杂性中反映。在p53四聚体中的每一个链由若干结构 域构成。存在良好限定的DNA-结合和四聚合结构域以及高度活动的、很大程度上未形 成结构的区域(参考文献6 11)。大多数p53癌症突变定位于该蛋白的DNA-结合核心 结构域(DNA-binding core domain)(参考文献4)。这个结构域在结构上的特征在于,通 过X-射线晶体学与其同族DNA复合(参考文献6)以及通过NMR在溶液中的其游离形 式(参考文献12)。它由两个反平行β -折叠的中央β -夹心结构(β -sandwich)构成用 作用于DNA-结合表面的基本支架。DNA-结合表面由两个通过锌离子稳定的β-转角环 (β-turn loop) (L2和L3)和一个环-折叠-螺旋基序构成。这些结构元件一起形成富含带 正电荷的氨基酸并与各种p53响应元件形成特异性接触的延伸DNA-结合表面。在人体 癌症中最经常突变的6个氨基酸残基位于或靠近该DNA-结合表面(参见,在WWW_p53. iarc.fr上的p53突变数据库的释放R10)(参考文献4)。这些残基已被分类为“接触”残 基(Arg248,Arg273)或“结构”残基(Argl75,Gly245,Arg249,Arg282),取决于它 们是否直接接触DNA或在维持该DNA-结合表面的结构完整性方面起的作用(参考文献 6)。然而,癌症相关的突变并不限于DNA-结合表面,而也发现于该蛋白的β-夹心 区域。在DNA-结合表面外,最常见的突变是Y220C。它位于连接β-链S7和S8的 转角起始处的β "夹心的远端。Tyr220的苯部分形成该β -夹心的疏水核心的一部分, 而羟基基团指向溶剂。越来越多的证据表明,在体温下仅边界地稳定的ρ53,已经演化为高度动态的和 本质上不稳定的(参考文献12)。已经使用ρ53的功能热稳定性合成变体,称之为“T_p53C”。这种变体具有取 代M133L、V203A、N239Y和N268D。这种变体,其在其他方面具有基本上野生型的 特性,已经用作载体以在形式上允许通过X-射线晶体学确定它们的结构的p53的各种已 知的致癌突变。具有Y220C突变的T_p53C的结构已经描述过(参考文献13)。在位置220处 具有酪氨酸,Tyr220的苯部分形成β-夹心的疏水核心的一部分,而羟基指向溶剂。在 突变体中,当存在半胱氨酸时,突变产生溶剂进入裂缝(cleft),其在指定位置处用水分子填充,而使核心结构域的整个结构保持完整。突变后的结构变化连接两个相当浅的表 面裂缝(预先存在于野生型中),从而在T-p53C_Y220C中形成长的延长裂缝,其在突变 位点具有最深的点。位于夹心的核心中的相邻疏水侧链的位置并未显著移动。然 而,突变导致疏水相互作用丧失以及这些疏水核心残基的次最佳包装。然而,在整个结 构中,不存在大于0.9 A的C α位移。
技术实现思路
本专利技术的专利技术人已经发现,许多含有吲哚、咔唑或相关支架的化合物结合至 T-p53C-Y220C并稳定该蛋白,从而提高其熔化温度。因此,在一个方面,本专利技术提供了一种用于稳定携带Y220C突变的p53蛋白的 方法,该方法包括使该p53与式⑴的化合物(及其异构体、盐、溶剂化物、受保护形式 和前药)接触权利要求(51) Int. Cl.A01N 43/00 {2Q>Q)&. 01)1. 一种用于治疗具有其中p53携带Y220C突变的病变或肿瘤的主体的方法中的式⑴2.根据权利要求1所述的方法,其中Rni选自H、乙基、丙基和环丙基。3.根据权利要求1或权利要求2所述的方法,其中Rei是H。4.根据权利要求1 3任一项所述的方法,其中Re2是H。5.根据权利要求1 3任一项所述的方法,其中Re2是可选取代的CV7烷基,其中的 可选取代基选自CV7烷基、C3_7杂环基、C5_7芳基、卤素、羟基、醚基、硝基、氰基、酰 基、幾基、 酯基、酰胺基、氨基、酰基酰胺基、脲基、酰氧基和硫羟基。6.根据权利要求1 5任一项所述的方法,其中Re3是H。7.根据权利要求1 5任一项所述的方法,其中Re3是可选取代的CV7烷基,其中 的可选取代基可以选自CV7烷基、C3_7杂环基、C5_7芳基、卤素、羟基、醚基、硝基、氰 基、酰基、羧基、酯基、酰胺基、氨基、酰基酰胺基、脲基、酰氧基和硫羟基。8.根据权利要求1 7任一项所述的方法,其中Rx是H。9.根据权利要求1 8任一项所述的方法,其中Re4是可选取代的C3_12含N杂环基, 而Re5是H。10.根据权利要求1 8任一项所述的方法,其中Re4是C(= 0)NRN5RN6,而沪是H。11.根据权利要求10所述的方法,其中Rn5选自H和CV4烷基,而#6选自H,可 选取代的CV4烷基,其中的可选取代基选自羟基、氨基和C5_9芳基;和可选取代的C5_6杂 环基,其中的可选取代基是CV4烷基。12.根据权利要求10所述的方法,其中Rn5和Rn6与它们连接的氮原子形成可选取代 的哌啶基或哌嗪基,其中的可选取代基选自CV7烷基、羟基、C5_7杂环基、C5_7芳基、氨 基和酰基。13.根据权利要求1 8任一项所述的方法,其中Re4是C(ZO)OR01,而Re5是H。14.根据权利要求13所述的方法,其中R01是可选取代的CV4烷基,其中的可选取代 基选自醚基、氧脲基、C5_6芳基和酰胺基。15.根据权利要求1 8任一项所述的方法,其中Re4是C(= O)NHNHSO2Rsi,而Rc5 是 H。16.根据权利要求15所述的方法,其中Rsi是可选取代的C5_6芳基基团,其中的可选 取代基选自烷氧基、醚基和CV7烷基。17.根据权利要求1 8任一项所述的方法,其中Re4是0C(= 0)NRN7RN8,而Re5是H。18.根据权利要求17所述的方法,其中Rw是H,而#8是可选取代的C5_6芳基,其中的可选取代基选自卤素。19.根据权利要求1 8任一项所述的方法,其中#4是0((= 0)]^8,而Re5是H。20.根据权利要求19所述的方法,其中Rc8是可选取代的C5_7杂环基。21.根据权利要求1 8任一项所述的方法,其中Re4选自C(= 0)CH2NH2、C(= O) NHNH2、CHC (CN) 2> CHC (CN) C ( = O) NH2 和羧基,而 Rc5 是 H。22.根据权利要求1 8任一项所述的方法,其中Re4和Re5与它们键接的碳原子一起 形成下式的含5个或6个环原子的可选取代芳环23.根据权利要求22所述的方法,其中Re6是H。24.根据权利要求22或权利要求23所述的方法,其中Rct是可选取代的C3_12含N杂 环基。25.根据权利要求22或权利要求23所述的方法,其中Re7本文档来自技高网
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【技术保护点】
一种用于治疗具有其中p53携带Y220C突变的病变或肿瘤的主体的方法中的式(Ⅰ)的化合物:  ***  其中X选自CR↑[X]和N;  R↑[N1]选自H和C↓[1-4]烷基,其可以被SH或卤素取代;  R↑[C1]选自H和SH;  R↑[C2]选自H和可选取代的C↓[1-7]烷基;  R↑[C3]选自H和可选取代的C↓[1-7]烷基;  R↑[X]选自H、OH和NH↓[2];  R↑[C4]选自:  (i)可选取代的C↓[3-12]含N杂环基;  (ii)C(=O)NR↑[N5]R↑[N6],其中R↑[N5]和R↑[N6]独立地选自H、可选取代的C↓[1-7]烷基、可选取代的C↓[3-20]杂环基和可选取代的C↓[5-20]芳基,或者R↑[N5]和R↑[N6]与它们连接的氮原子形成可选取代的含N的C↓[5-7]杂环基;  (iii)C(=O)OR↑[O1],其中R↑[O1]选自H、可选取代的C↓[1-7]烷基、可选取代的C↓[3-20]杂环基和可选取代的C↓[5-20]芳基;  (iv)C(=O)NHNHSO↓[2]-R↑[S1],其中R↑[S1]选自H、可选取代的C↓[1-7]烷基、可选取代的C↓[3-20]杂环基和可选取代的C↓[5-20]芳基;  (v)OC(=O)R↑[C8],其中R↑[C8]选自H、可选取代的C↓[1-7]烷基、可选取代的C↓[3-20]杂环基和可选取代的C↓[5-20]芳基;  (vi)OC(=O)NR↑[N7]R↑[N8],其中R↑[N7]和R↑[N8]独立地选自H、可选取代的C↓[1-7]烷基、可选取代的C↓[3-20]杂环基和可选取代的C↓[5-20]芳基,或者R↑[N7]和R↑[N8]与它们连接的氮原子形成可选取代的含N的C↓[5-7]杂环基;和  (vii)C(=O)CH↓[2]NH↓[2]、C(=O)NHNH↓[2]、CHC(CN)↓[2]、CHC(CN)C(=O)NH↓[2]和羧基;  R↑[C5]选自H、OH和NH↓[2];  或者R↑[C4]和R↑[C5]与它们键接的碳原子一起形成下式的含5个或6个环原子的可选取代芳环:  ***  其中Q表示O、N或CR↑[Q1]=CR↑[Q2],其中R↑[Q1]和R↑[Q2]独立地选自H、OH和NH↓[2];  R↑[C6]选自H、OH和NH↓[2];而  R↑[C7]选自可选取代的C↓[3-12]含N杂环基、NHC(=O)R↑[C9]、CH↓[2]NR↑[N2]R↑[N3]和NHC(=S)NHR↑[N4],其中R↑[C9]选自可选取代的C↓[1-7]烷基、可选取代的C↓[3-20]杂环基和可选取代的C↓[5-20]芳基,R↑[N2]和R↑[N3]独立地选自H、可选取代的C↓[1-7]烷基、可选取代的C↓[3-20]杂环基和可选取代的C↓[5-20]芳基,或者R↑[N2]和R↑[N3]与它们连接的氮原子形成可选取代的含N的C↓[5-7]杂环基,而R↑[N4]选自可选取代的C↓[1-7]烷基、可选取代的C↓[3-20]杂环基和可选取代的C↓[5-20]芳基,  并且当R↑[C4]和R↑[C5]没有键接在一起时,R↑[C3]可以另外地选自OR↑[O2]-,其中R↑[O2]-是C↓[1-4]烷基基团,和C(=O)OR↑[O3]-,其中RO↑[3]-是C↓[1-4]烷基基团,并且R↑[C2]可以另外地选自卤素。...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...

【专利技术属性】
技术研发人员:艾伦费尔斯特弗兰克伯克勒安德烈亚斯约尔格尔
申请(专利权)人:医学研究委员会
类型:发明
国别省市:GB

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