青光眼发病风险的判定方法技术

本发明专利技术提供是否存在青光眼风险的判定方法，该判定方法包括以下步骤：在来自受检者的样品中，在体外检测存在于如下各核苷酸序列的第３１位的单核苷酸多态性的等位基因和／或基因型的步骤，所述核苷酸序列为选自ＳＥＱ　ＩＤ　ＮＯ：２０３～５１４所示的核苷酸序列的至少一个核苷酸序列或其互补序列（步骤Ａ）；以及将上述步骤Ａ中检测到的等位基因和／或基因型与ＳＥＱ　ＩＤ　ＮＯ：２０３～５１４所示的核苷酸序列中包含高风险等位基因的至少一个等位基因和／或基因型进行比较的步骤（步骤Ｂ）。根据本发明专利技术的方法，通过分析样品中的本发明专利技术的单核苷酸多态性的等位基因或基因型，可以判定样品提供者的青光眼发病风险的高低，根据该风险，样品提供者可以采取预防青光眼的措施、或者接受适当的治疗。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术涉及一种检测与青光眼发病有关的单核苷酸多态性或青光眼发病风险高的单核苷酸多态性的存在的方法、以及用于该检测方法的试剂盒。
技术介绍
青光眼是一种由于视网膜神经节细胞死亡而导致特征性视神经乳头凹陷和视野缺损的疾病。眼压升高被认为是青光眼中乳头凹陷和视野缺损的主要原因。另一方面，还存在一种眼压在经统计计算得到出的正常范围内的青光眼，但这种情况下，对其个体而言该眼压也是足以产生视野缺损的高眼压，所以也认为是发生了青光眼。 治疗青光眼的基本原则是保持低眼压，为了保持低眼压，就必需要考虑导致高眼压的原因。因此，在青光眼的诊断中，重要的是根据眼压的高低及其原因对青光眼进行分类。作为导致眼压升高的原因，充满眼内的房水的主要排出经路-隅角是否存在闭塞是重要的。从上述观点考虑，原发性青光眼大致分为伴有隅角闭塞的隅角闭塞型青光眼和不伴有隅角闭塞的隅角开放型青光眼。其中，隅角开放型青光眼又分为伴有眼压升高的狭义的隅角开放型青光眼、即原发性隅角开放型青光眼和眼压在正常范围内的正常眼压青光眼。 很久以来就已知青光眼与遗传有关，有报道称在隅角开放型青光眼中，有5～50％具有家族史，通常有20～25％是遗传性的。根据上述报道，人们在进行探索青光眼的致病基因的研究，作为研究的成果，有人报道了肌球蛋白样蛋白(Myocilin，MYOC)基因的突变与隅角开放型青光眼有关(参照专利文献1)、而视神经蛋白基因(optineurin，OPTN)的突变与正常眼压青光眼有关(参照非专利文献1)。但仅凭这些基因还无法说明所有青光眼的遗传因素，于是设想还存在未知的青光眼相关基因。 另一方面，单核苷酸多态性是指在个体基因组的核苷酸序列中，发现一个碱基变成其它碱基的置换突变，该突变在其生物种的集团中以某种程度的频率、通常约1％以上的频率存在。单核苷酸多态性存在于基因上的内含子、外显子或除此以外的基因组的所有区域。 专利文献1日本特开2000-306165号公报 非专利文献1Rezaie T其他作者11名，Science，2002年，第295卷，No.5557，第1077～1079页.
技术实现思路
专利技术所要解决的课题 通常，将眼压或眼底照片用作青光眼的简单检查，但通过这些检查还不能确诊青光眼。除此之外，通常还进行视野检查，但却存在以下问题检查时间长，患者负担大；以及患者必需适应检查，所以初次检查结果的可靠性低等。 另一方面，如上所述，在青光眼的发病中强烈怀疑有遗传因素的参与，但决定性的致病基因还未确定。另一方面，即使根据单一基因的突变或多态性还无法说明与疾病有关，但却认为可如下说明青光眼的发病与遗传因素有关存在多个与青光眼有关的比较稳定的基因突变或多态性，各个突变或多态性结合起来发挥作用。 本专利技术人等为了找出与青光眼有关的基因，着眼于基因组上的多态性、特别是单核苷酸多态性。 通过找出与青光眼发病有关的多态性，具有该多态性、即在青光眼患者中高频率确认到的多态性的人，甚至在发病前就预知将来青光眼的发病风险高。或者，该多态性可用于筛选是否需要进行初期青光眼的视野检查，上述初期青光眼通过简单的青光眼判定、即测定眼压或眼底照片等方法难以检测，只能通过视野检查作出初次诊断。即，通过了解青光眼发病风险，样品提供者可以采取预防青光眼发病的措置。另外，可以采取例如通过精密检查作出的早期确诊和开始治疗等防止视野狭窄所必需的措置，所以找出与青光眼发病相关的多态性具有深远意义。 本专利技术的课题在于提供通过检测与青光眼发病有关的单核苷酸多态性来预测青光眼发病风险的方法、和用于该检测方法的试剂盒。 解决课题的方法 本专利技术人等对青光眼患者和不具有青光眼家族史的非患者的基因组(常染色体)上所存在的公知多态性部位进行综合分析，发现了与青光眼发病有关的单核苷酸多态性。在该单核苷酸多态性中进一步发现了在青光眼患者中高频率确认到的等位基因及其对立等位基因、以及各等位基因的组合、即在青光眼患者中高频率确认到的基因型。并且发现通过将上述多个与青光眼发病有关的单核苷酸多态性组合起来进行判定，可以精度更高地判定样品提供者是否容易发生青光眼，从而完成了本专利技术。 即，本专利技术涉及下述～。 是否存在青光眼风险的判定方法，该方法包括以下步骤 步骤A在体外检测在来自受检者的样品中存在于如下各核苷酸序列的第31位的单核苷酸多态性的等位基因和/或基因型的步骤，所述核苷酸序列为选自SEQ ID NO203～514所示的核苷酸序列的至少一个核苷酸序列或其互补序列；以及 步骤B将上述步骤A中检测到的等位基因和/或基因型与SEQ IDNO203～514所示的核苷酸序列中包含高风险等位基因的至少一个等位基因和/或基因型进行比较的步骤， 当上述步骤A中检测到的等位基因为上述高风险等位基因时，判定存在青光眼风险；或者，当上述高风险等位基因符合显性遗传模型、且上述步骤A中检测到的基因型为包含上述高风险等位基因的基因型的纯合子或杂合子时，判定存在青光眼风险；当上述高风险等位基因符合隐性遗传模型、且上述步骤A中检测到的基因型为包含上述高风险等位基因的基因型的纯合子时，判定存在青光眼风险。 是否存在青光眼风险的判定方法，该方法包括以下步骤 步骤C1在体外检测在来自受检者的样品中存在于核酸分子的如下各核苷酸序列的第31位的单核苷酸多态性的等位基因和/或基因型的步骤，上述核酸分子包含选自SEQ ID NO203～514所示的核苷酸序列的至少一个核苷酸序列或其互补序列；或 步骤C2使用含有核苷酸序列的核酸分子，在体外检测上述单核苷酸多态性的等位基因和/或基因型的步骤，上述核苷酸序列包含选自SEQ ID NO515～694所示的核苷酸序列的至少一个核苷酸序列或其互补序列；以及 步骤D将上述步骤C1或C2中检测到的等位基因和/或基因型与至少一个核酸分子进行比较的步骤，上述核酸分子含有SEQ IDNO203～514所示的核苷酸序列中包含高风险等位基因的等位基因和/或基因型， 上述步骤C1或C2中检测到的等位基因为上述高风险等位基因时，判定为存在青光眼风险；或者，当上述高风险等位基因符合显性遗传模型、且上述步骤C1或C2中检测到的基因型为包含上述高风险等位基因的基因型的纯合子或杂合子时，判定为存在青光眼风险；当上述高风险等位基因符合隐性遗传模型、且上述步骤C1或C2中检测到的基因型为包含上述高风险等位基因的基因型的纯合子时，判定为存在青光眼风险。 判定是否存在青光眼风险的试剂盒，该试剂盒含有下述核酸分子包含选自SEQ ID NO203～514所示的核苷酸序列的至少一个核苷酸序列或其互补序列或它们的部分序列的核酸分子，该核酸分子包含存在于各核苷酸序列的第31位的单核苷酸多态性；和/或含有核苷酸序列的核酸分子，所述核苷酸序列包含选自SEQ ID NO515～694所示的核苷酸序列的至少一个核苷酸序列或其互补序列；该试剂盒用于在体外检测在来自受检者的样品中上述单核苷酸多态性的等位基因和/或基因型。 是否存在青光眼风险的判定方法，该方法包括以下步骤 步骤(i)从来自受检者的样品中提取核酸分子的步骤； 步骤(ii)对于上述步骤(i)中提取的核酸分子，将存在于如下各核苷酸序列的第本文档来自技高网...

【技术保护点】
是否存在青光眼风险的判定方法，该方法包括以下步骤：　步骤Ａ：在来自受检者的样品中，在体外检测存在于如下各核苷酸序列的第３１位的单核苷酸多态性的等位基因和／或基因型的步骤，所述核苷酸序列为：选自ＳＥＱ　ＩＤ　ＮＯ：２０３～５１４所示的核 苷酸序列的至少一个核苷酸序列或其互补序列；以及　步骤Ｂ：将上述步骤Ａ中检测到的等位基因和／或基因型与ＳＥＱ　ＩＤＮＯ：２０３～５１４所示的核苷酸序列中包含高风险等位基因的至少一个等位基因和／或基因型进行比较的步骤；　当上述步骤Ａ 中检测到的等位基因为上述高风险等位基因时，判定存在青光眼风险；或者，当上述高风险等位基因符合显性遗传模型、且上述步骤Ａ中检测到的基因型为包含上述高风险等位基因的基因型的纯合子或杂合子时，判定存在青光眼风险；当上述高风险等位基因符合隐性遗传模型、且上述步骤Ａ中检测到的基因型为包含上述高风险等位基因的基因型的纯合子时，判定存在青光眼风险。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...

【专利技术属性】
技术研发人员：木下茂，田代启，中野正和，八木知人，森和彦，池田阳子，谷口孝纯，景山正明，
申请(专利权)人：参天制药株式会社，木下茂，田代启，
类型：发明
国别省市：JP[日本]