【技术实现步骤摘要】
技术介绍
技术实现思路
【技术保护点】
1.一种寡核苷酸集，所述寡核苷酸集包含寡核苷酸的多个子集，其中：
2.如权利要求1所述的寡核苷酸集，其中所述索引序列集中的任何两个索引序列之间的汉明距离不小于第一标准值，其中所述第一标准值为至少2。
3.如权利要求1所述的寡核苷酸集，其中所述寡核苷酸集包含(a)双链的或Y形的测序衔接子，每一个双链的或Y形的测序衔接子的每条链包含所述索引序列集的索引序列或其反向互补物；或者(b)单链寡核苷酸对，每一对在试剂中一起被提供，一对中的每一个寡核苷酸包含所述索引序列集的索引序列或其反向互补物。
4.如权利要求3所述的寡核苷酸集，其中(a)每一个Y形的或双链的测序衔接子包含第一链和第二链，所述第一链包含选自所述索引序列集中的第一子集的第一索引序列，所述第二链包含选自所述索引序列集中的第二子集(或所述第二子集的反向互补物)的第二索引序列；或者(b)每一对寡核苷酸包含第一寡核苷酸和第二寡核苷酸，所述第一寡核苷酸包含选自所述索引序列集中的第一子集的第一索引序列，所述第二寡核苷酸包含选自所述索引序列集中的第二子集(或所述第二子集的反向互补物)的第二索引序列。>
5.如权利要求4所述的寡核苷酸集，其中每一个Y形的测序衔接子的所述第一链包含P5流动池扩增引物结合位点，并且每一个Y形的测序衔接子的所述第二链包含P7’流动池扩增引物结合位点。
6.如权利要求4所述的寡核苷酸集，其中所述第一子集包含表1中列出的子集，并且所述第二子集包含表2中列出的子集。
7.如权利要求1所述的寡核苷酸集，其中所述寡核苷酸的多个子集中的每一个子集包含索引序列，所述索引序列对应于以下序列之一中的10聚体的反向互补物：SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:17或SEQ ID NO:19。
8.如权利要求4所述的寡核苷酸集，其中所述第一子集和所述第二子集是相同的。
9.如权利要求8所述的寡核苷酸集，其中每一个Y形的测序衔接子的所述第一链包含P5流动池扩增引物结合位点，并且每一个Y形的测序衔接子的所述第二链包含P7’流动池扩增引物结合位点。
10.如权利要求8所述的寡核苷酸集，其中所述子集选自表3中的索引序列的子集之一。
11.如权利要求1所述的寡核苷酸集，其中所述索引序列集包含SEQ ID NO:9中的10聚体。
12.如权利要求1所述的寡核苷酸集，其中所述寡核苷酸的多个子集中的每一个子集包含对应于以下序列之一中的10聚体的索引序列：SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:17、SEQ IDNO:18、或SEQ ID NO:19。
13.如权利要求1所述的寡核苷酸集，其中所述寡核苷酸集被提供在包含多个单独的隔室的容器中。
14.如权利要求13所述的寡核苷酸集，其中每一个隔室包含多个寡核苷酸，所述多个寡核苷酸包含所述索引序列集中的一个索引序列，所述一个索引序列不同于被包含在其他隔室中的索引序列。
15.如权利要求13所述的寡核苷酸集，其中每一个隔室包含(a)第一多个寡核苷酸，所述第一多个寡核苷酸包含所述索引序列集中的第一索引序列和(b)第二多个寡核苷酸，所述第二多个寡核苷酸包含所述索引序列集中的第二索引序列，所述隔室中(a)和(b)的有序组合不同于任何其他隔室中(a)和(b)的有序组合。
16.一种寡核苷酸集，所述寡核苷酸集主要由寡核苷酸的多个子集组成，其中：
17.如权利要求16所述的寡核苷酸集，其中所述索引序列集中的任何两个索引序列之间的汉明距离不小于第一标准值，其中所述第一标准值为至少2。
18.一种用于制备用于多重大规模平行测序的多个寡核苷酸的方法，所述方法包括：
19.如权利要求18所述的方法，其中所述索引序列集中的任何两个索引序列之间的汉明距离不小于第一标准值，其中所述第一标准值为至少2。
20.如权利要求18所述的方法，其中步骤(a)包含：
...【技术特征摘要】
1.一种寡核苷酸集，所述寡核苷酸集包含寡核苷酸的多个子集，其中：
2.如权利要求1所述的寡核苷酸集，其中所述索引序列集中的任何两个索引序列之间的汉明距离不小于第一标准值，其中所述第一标准值为至少2。
3.如权利要求1所述的寡核苷酸集，其中所述寡核苷酸集包含(a)双链的或y形的测序衔接子，每一个双链的或y形的测序衔接子的每条链包含所述索引序列集的索引序列或其反向互补物；或者(b)单链寡核苷酸对，每一对在试剂中一起被提供，一对中的每一个寡核苷酸包含所述索引序列集的索引序列或其反向互补物。
4.如权利要求3所述的寡核苷酸集，其中(a)每一个y形的或双链的测序衔接子包含第一链和第二链，所述第一链包含选自所述索引序列集中的第一子集的第一索引序列，所述第二链包含选自所述索引序列集中的第二子集(或所述第二子集的反向互补物)的第二索引序列；或者(b)每一对寡核苷酸包含第一寡核苷酸和第二寡核苷酸，所述第一寡核苷酸包含选自所述索引序列集中的第一子集的第一索引序列，所述第二寡核苷酸包含选自所述索引序列集中的第二子集(或所述第二子集的反向互补物)的第二索引序列。
5.如权利要求4所述的寡核苷酸集，其中每一个y形的测序衔接子的所述第一链包含p5流动池扩增引物结合位点，并且每一个y形的测序衔接子的所述第二链包含p7’流动池扩增引物结合位点。
6.如权利要求4所述的寡核苷酸集，其中所述第一子集包含表1中列出的子集，并且所述第二子集包含表2中列出的子集。
7.如权利要求1所述的寡核苷酸集，其中所述寡核苷酸的多个子集中的每一个子集包含索引序列，所述索引序列对应于以下序列之一中的10聚体的反向互补物：seq id no:11、seq id no:13、seq id no:15、seq id no:17或seq id no:19。
8.如权利要求4所述的寡核苷酸集，其中所述第一子集和所述第二子集是相同的。
9.如权利要求8所述的寡核苷酸集，其中每一个y形的测序衔接子的所述第一链包含p5流动池扩增引物结合位点，并且每...
【专利技术属性】
技术研发人员：瑞恩·凯利，戈登·比恩，埃里克·弗马斯，
申请(专利权)人：伊鲁米那股份有限公司，
类型：发明
国别省市：
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