System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 一种基于哑铃型探针与RCA相结合用于KRAS基因检测的产品及其用途制造技术_技高网

一种基于哑铃型探针与RCA相结合用于KRAS基因检测的产品及其用途制造技术

技术编号:44972900 阅读:6 留言:0更新日期:2025-04-12 01:47
本发明专利技术涉及一种基于哑铃型探针与RCA相结合用于KRAS基因检测的产品,所述产品包括哑铃型探针、DNA连接酶以及RCA扩增试剂,所述哑铃型探针包括茎部和两环部,两环部的端部经茎部连接,所述哑铃型探针的其中一个环含有G‑四链体适配体PW17互补序列,另一个环含有G‑四链体适配体T30695的互补序列,所述RCA扩增试剂包括Phi29DNA聚合酶和dNTPs和Phi29DNA聚合酶反应缓冲液,在DNA连接酶与检测基因的介导下哑铃型探针的茎部打开,切口连接形成闭合环状结构,并作为RCA的模板。采用上述技术方案,本发明专利技术提供了一种基于哑铃型探针与RCA相结合用于KRAS基因检测的产品,与传统方法相比,在测试基因的单核苷酸突变时,更方便、更高效。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物,尤其是涉及一种基于哑铃型探针与rca相结合用于kras基因检测的产品及其用途。


技术介绍

1、kras 是一个在细胞信号传导中起关键作用的基因,主要调节细胞生长、分裂和生存。kras 基因的突变在各种人类癌症中经常遇到。特别是,在非小细胞肺癌(nsclc)中kras 突变的发生率约为 30%,在结直肠癌(crc)中为 30-50%,在胰腺导管腺癌中为 80%。突变通常发生在密码子 12 的单个核苷酸替换上,g12d 是最常见的。g12d 突变占 kras突变癌症的 20-50%,具体取决于癌症类型。这些突变导致kras蛋白持续活化,可以刺激细胞增殖并抑制细胞凋亡,促进肿瘤的发生和发展。kras g12d突变给传统治疗带来了挑战,对于结直肠癌,g12d通常导致对化疗反应较差和复发风险较高。g12d患者也无法从已被证明对其他疗法耐药的crc患者有益的抗egfr治疗中获益。

2、鉴于kras g12d单核苷酸突变在预后评估和治疗决策中起着关键作用,聚合酶链反应(pcr)和下一代测序(ngs)是检测基因突变最常用的方法,其特点是高特异性和敏感性。然而,这些方法都依赖于特殊的成本设备和专业操作人员。


技术实现思路

1、本专利技术的目的:为了克服现有技术的缺陷,本专利技术提供了一种基于哑铃型探针与rca相结合用于kras基因检测的产品,可以用肉眼判断结果,无需精密仪器,与传统方法相比,在测试基因的单核苷酸突变时,更方便、更高效。

2、本专利技术的技术方案:一种基于哑铃型探针与rca相结合用于kras基因检测的产品,所述产品包括哑铃型探针、dna连接酶以及rca扩增试剂,所述哑铃型探针包括茎部和两环部,两环部的端部经茎部连接,所述哑铃型探针的其中一个环含有g-四链体适配体pw17互补序列,另一个环含有g-四链体适配体t30695的互补序列,所述茎部上设有切口,用于识别并结合检测基因的突变位点,所述rca扩增试剂包括phi29dna聚合酶和dntps和phi29dna聚合酶反应缓冲液,在dna连接酶与检测基因的介导下哑铃型探针的茎部打开,切口连接形成闭合环状结构,并作为rca的模板,产生g-四链体序列,g-四链体序列与血红素结合模仿辣根过氧化物酶。

3、进一步设置,所述哑铃型探针的序列为cagctccaactaccccaacccgccctacccaaagttggagctgtatggcgtaggcttaacccacccacccacccttgcctacgccat。

4、进一步设置,所述茎部是由反向互补配对的碱基对组成的互补链,分别为上链和下链,所述上链含有所述的切口。

5、进一步设置,所述哑铃型探针3’端的最后一个碱基为胸腺嘧啶核苷酸,可识别检测基因的突变位点腺嘌呤;当存在检测基因时,哑铃型探针的碱基t与突变位点的a完美配对;哑铃型探针的上链部分和下链部分得以分离,并在dna连接酶的作用下,分离末端连接环化,形成闭合环状结构;当哑铃型探针遇到野生型kras基因时,存在碱基错配,阻止了哑铃型探针茎部和靶标的完全杂交,导致茎部上链和下链无法有效分离。

6、进一步设置,所述rca反应过程会产生由交替的g-四链体序列组成的长串联重复序列;该长串联重复序列为gggtgggtgggtgggttaagcctacgccatacagctccaactttgggtagggcgggttggggtagttggagctgatggcgtaggcaagggtgggtgggtgggttaagcctacgccatacagctccaactttgggtagggcgggttggggtagttggagctgatggcgtaggcaa。

7、进一步设置,所述pw17互补序列为cccaacccgccctaccc;所述t30695互补序列为acccacccacccaccc。

8、进一步设置,所述茎部的长度为7~13nt。

9、进一步设置,所述哑铃型探针的浓度为5~15μm,dntps的浓度为5~15 mm。

10、本专利技术的另一目的上述检测产品在制备用于检测kras基因检测产品中的用途。

11、本专利技术的有益效果,哑铃型探针与滚环扩增(rca)结合,用于可视化检测krasg12d,检测结果可以直接肉眼进行判读,无需依赖精密仪器,降低检测门槛,适用于即时检测或资源有限的检测场景,可以大大助力病理医师快速精准判断,并且该产品具有高特异性,高灵感度。

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【技术保护点】

1.一种基于哑铃型探针与RCA相结合用于KRAS基因检测的产品,其特征在于,所述产品包括哑铃型探针、DNA连接酶以及RCA扩增试剂,所述哑铃型探针包括茎部和两环部,两环部的端部经茎部连接,所述哑铃型探针的其中一个环含有G-四链体适配体PW17互补序列,另一个环含有G-四链体适配体T30695的互补序列,所述茎部上设有切口,用于识别并结合检测基因的突变位点,所述RCA扩增试剂包括Phi29DNA聚合酶和dNTPs和Phi29DNA聚合酶反应缓冲液,在DNA连接酶与检测基因的介导下哑铃型探针的茎部打开,切口连接形成闭合环状结构,并作为RCA的模板,产生G-四链体序列,G-四链体序列与血红素结合模仿辣根过氧化物酶。

2.根据权利要求1所述的基于哑铃型探针与RCA相结合用于KRAS基因检测的产品,其特征在于,所述哑铃型探针的序列为CAGCTCCAACTACCCCAACCCGCCCTACCCAAAGTTGGAGCTGTATGGCGTAGGCTTAACCCACCCACCCACCCTTGCCTACGCCAT。

3.根据权利要求1或2所述的基于哑铃型探针与RCA相结合用于KRAS基因检测的产品,其特征在于,所述茎部是由反向互补配对的碱基对组成的互补链,分别为上链和下链,所述上链含有所述的切口。

4.根据权利要求3所述的基于哑铃型探针与RCA相结合用于KRAS基因检测的产品,其特征在于,所述哑铃型探针3’端的最后一个碱基为胸腺嘧啶核苷酸,可识别检测基因的突变位点腺嘌呤;当存在检测基因时,哑铃型探针的碱基T与突变位点的A完美配对;哑铃型探针的上链部分和下链部分得以分离,并在DNA连接酶的作用下,分离末端连接环化,形成闭合环状结构;当哑铃型探针遇到野生型KRAS基因时,存在碱基错配,阻止了哑铃型探针茎部和靶标的完全杂交,导致茎部上链和下链无法有效分离。

5.根据权利要求1或2所述的基于哑铃型探针与RCA相结合用于KRAS基因检测的产品,其特征在于,所述RCA反应过程会产生由交替的G-四链体序列组成的长串联重复序列;该长串联重复序列为GGGTGGGTGGGTGGGTTAAGCCTACGCCATACAGCTCCAACTTTGGGTAGGGCGGGTTGGGGTAGTTGGAGCTGATGGCGTAGGCAAGGGTGGGTGGGTGGGTTAAGCCTACGCCATACAGCTCCAACTTTGGGTAGGGCGGGTTGGGGTAGTTGGAGCTGATGGCGTAGGCAA。

6.根据权利要求1或2所述的基于哑铃型探针与RCA相结合用于KRAS基因检测的产品,其特征在于,所述PW17互补序列为CCCAACCCGCCCTACCC;所述T30695互补序列为ACCCACCCACCCACCC。

7.根据权利要求1或2所述的基于哑铃型探针与RCA相结合用于KRAS基因检测的产品,其特征在于,所述茎部的长度为7~13nt。

8.根据权利要求1或2所述的基于哑铃型探针与RCA相结合用于KRAS基因检测的产品,其特征在于,所述哑铃型探针的浓度为5~15μM,dNTPs的浓度为5~15 mM。

9.一种如根据权利要求1-8任一所述的产品在制备用于检测KRAS基因检测产品中的用途。

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【技术特征摘要】

1.一种基于哑铃型探针与rca相结合用于kras基因检测的产品,其特征在于,所述产品包括哑铃型探针、dna连接酶以及rca扩增试剂,所述哑铃型探针包括茎部和两环部,两环部的端部经茎部连接,所述哑铃型探针的其中一个环含有g-四链体适配体pw17互补序列,另一个环含有g-四链体适配体t30695的互补序列,所述茎部上设有切口,用于识别并结合检测基因的突变位点,所述rca扩增试剂包括phi29dna聚合酶和dntps和phi29dna聚合酶反应缓冲液,在dna连接酶与检测基因的介导下哑铃型探针的茎部打开,切口连接形成闭合环状结构,并作为rca的模板,产生g-四链体序列,g-四链体序列与血红素结合模仿辣根过氧化物酶。

2.根据权利要求1所述的基于哑铃型探针与rca相结合用于kras基因检测的产品,其特征在于,所述哑铃型探针的序列为cagctccaactaccccaacccgccctacccaaagttggagctgtatggcgtaggcttaacccacccacccacccttgcctacgccat。

3.根据权利要求1或2所述的基于哑铃型探针与rca相结合用于kras基因检测的产品,其特征在于,所述茎部是由反向互补配对的碱基对组成的互补链,分别为上链和下链,所述上链含有所述的切口。

4.根据权利要求3所述的基于哑铃型探针与rca相结合用于kras基因检测的产品,其特征在于,所述哑铃型探针3’端的最后一个碱基为胸腺嘧啶核苷酸,可识别检测基因的突变位点腺嘌呤;当存在检测基因时,哑铃型探针的碱基t与突变位点的a完美配对;哑铃型探针的上链部分和下链...

【专利技术属性】
技术研发人员:薛昌黄文彬申志发
申请(专利权)人:温州医科大学
类型:发明
国别省市:

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