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【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于生物,具体涉及一种靶向生殖道感染病原体高通量测序的引物组、试剂盒及其应用。
技术介绍
1、女性下生殖道感染是妇科常见疾病,以阴道炎和子宫颈炎较为常见,包括但不限于:细菌性阴道病、需氧菌性阴道炎、外阴阴道假丝酵母菌病、阴道毛滴虫病以及由淋病奈瑟菌、衣原体、支原体等引起的子宫颈炎等等。下生殖道感染与多种妇科、产科疾病息息相关,可以导致不孕不育、女性生殖道癌症等。
2、与女性下生殖道感染相关的微生物包括:细菌、真菌、病毒和特殊病原体。目前临床上常见的检测方法为:培养法、形态学检测法、以胶体金/酶联免疫为代表的免疫学检测法和常见的核酸检测法。其中,培养法主要聚焦于细菌,对其他类型病原体的检测能力弱,因为有大量的病原体不易在体外人工培养的环境中存活;形态学检测法主要依据常见病原体的典型生物学形态进行鉴定,尽管检测迅速,但准确性和稳定性欠佳;免疫学检测法方便快捷,对专业仪器设备和人员的依赖性较低,但准确性较低,假阴性问题突出。相比之下,核酸检测较好地兼顾了成本、检测速度和检测性能,成为主流的检测手段。然而,传统的核酸检测技术也逐渐无法满足临床对复杂感染的检测需求,暴露出严重缺点,包括但不限于:检测病原体的种类和数量少,无法应对复杂的临床感染。容易漏检;较难同时检测多种病原体和相应的耐药基因/突变,不易提供连贯的诊断和用药指导;
3、为了更好地满足临床检测需求,靶向生殖道感染病原体的高通量测序技术应运而生。病原靶向测序(tngs)是基于超多重pcr扩增(或靶向捕获)与高通量测序两种技术的新一代测序技术,不
4、与前述的传统检测方法相比,有诸多优点和特色:⑴ 能检测上百种不同类型的病原体。⑵ 检测速度快,从接收到样本,到最终导出正式检测报告,一般小于24h。⑶ 换算到单个病原体的成本低。⑷ 能够同时检测大量病原体和耐药基因,提供更连贯的诊断和用药指导。
5、但是当前靶向病原体的高通量测序技术主要聚焦于人类呼吸道相关的病原体感染,缺乏针对生殖道病原体的检测技术,特别是缺乏适用于生殖道病原体全面筛查的引物。
技术实现思路
1、为了克服现有的靶向病原体的高通量测序技术,对生殖道病原体的检测能力欠佳的不足,本专利技术提供一种靶向生殖道感染病原体高通量测序的引物组、试剂盒及其应用。本专利技术是采用如下的技术方案实现的:
2、一种靶向生殖道感染病原体高通量测序的引物组,包括:
3、hpv16 e6/e7 mrna 检测引物,前引物序列为seq id no.253所示,后引物序列为seq id no.254所示;
4、hpv18 e6/e7 mrna 检测引物,前引物序列为seq id no.255所示,后引物序列为seq id no.256所示;
5、hpv26 e6/e7 mrna 检测引物,前引物序列为seq id no.257所示,后引物序列为seq id no.258所示;
6、hpv31 e6/e7 mrna 检测引物,前引物序列为seq id no.259所示,后引物序列为seq id no.260所示;
7、hpv33 e6/e7 mrna 检测引物,前引物序列为seq id no.261所示,后引物序列为seq id no.262所示;
8、hpv35 e6/e7 mrna 检测引物,前引物序列为seq id no.263所示,后引物序列为seq id no.264所示;
9、hpv39 e6/e7 mrna 检测引物,前引物序列为seq id no.265所示,后引物序列为seq id no.266所示;
10、hpv45 e6/e7 mrna 检测引物,前引物序列为seq id no.267所示,后引物序列为seq id no.268所示;
11、hpv51 e6/e7 mrna 检测引物,前引物序列为seq id no.269所示,后引物序列为seq id no.2700所示;
12、hpv52 e6/e7 mrna 检测引物,前引物序列为seq id no.271所示,后引物序列为seq id no.272所示;
13、hpv53 e6/e7 mrna 检测引物,前引物序列为seq id no.273所示,后引物序列为seq id no.274所示;
14、hpv56 e6/e7 mrna 检测引物,前引物序列为seq id no.275所示,后引物序列为seq id no.276所示;
15、hpv58 e6/e7 mrna 检测引物,前引物序列为seq id no.277所示,后引物序列为seq id no.278所示;
16、hpv59 e6/e7 mrna 检测引物,前引物序列为seq id no.279所示,后引物序列为seq id no.280所示;
17、hpv66 e6/e7 mrna 检测引物,前引物序列为seq id no.281所示,后引物序列为seq id no.282所示;
18、hpv67 e6/e7 mrna 检测引物,前引物序列为seq id no.283所示,后引物序列为seq id no.284所示;
19、hpv68 e6/e7 mrna 检测引物,前引物序列为seq id no.285所示,后引物序列为seq id no.286所示;
20、hpv73 e6/e7 mrna 检测引物,前引物序列为seq id no.287所示,后引物序列为seq id no.288所示;
21、hpv82 e6/e7 mrna 检测引物,前引物序列为seq id no.289所示,后引物序列为seq id no.290所示。
22、可选的,还包括如下检测引物中的至少一种:
23、hpv6 e6/e7 mrna 检测引物,前引物序列为seq id no.291所示,后引物序列为seq id no.292所示;
24、hpv11 e6/e7 mrna 检测引物,前引物序列为seq id no.293所示,后引物序列为seq id no.294所示;
25、hpv40 e6/e7 mrna 检测引物,前引物序列为seq id no.295所示,后引物序列为seq id no.296所示;
26、hpv42 e6/e7 mrna 检测引物,前引物序列为seq id no.297所示,后引物序列为seq id no.298所示本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种靶向生殖道感染病原体高通量测序的引物组,其特征在于,包括:
2.根据权利要求1所述的靶向生殖道感染病原体高通量测序的引物组,其特征在于,还包括如下检测引物中的至少一种:
3.根据权利要求1所述的靶向生殖道感染病原体高通量测序的引物组,其特征在于,还包括有益共生菌检测引物、厌氧/兼性厌氧菌检测引物、需氧菌检测引物、STDs细菌检测引物、分枝杆菌检测引物、高危/疑似高危型人类乳头瘤病毒检测引物、低危型人类乳头瘤病毒检测引物、其他DNA病毒检测引物、RNA病毒检测引物、真菌检测引物、寄生虫检测引物中的至少一种;和/或
4.根据权利要求1所述的靶向生殖道感染病原体高通量测序的引物组,其特征在于,还包括:
5.根据权利要求1所述的靶向生殖道感染病原体高通量测序的引物组,其特征在于,还包括如下病原检测引物中的至少一种:
6. 根据权利要求1所述的靶向生殖道感染病原体高通量测序的引物组,其特征在于,还包括内标序列,所述内标序列的核酸序列前引物序列为seq ID No.251所示,后引物序列为seq ID No.252所示。
...【技术特征摘要】
1.一种靶向生殖道感染病原体高通量测序的引物组,其特征在于,包括:
2.根据权利要求1所述的靶向生殖道感染病原体高通量测序的引物组,其特征在于,还包括如下检测引物中的至少一种:
3.根据权利要求1所述的靶向生殖道感染病原体高通量测序的引物组,其特征在于,还包括有益共生菌检测引物、厌氧/兼性厌氧菌检测引物、需氧菌检测引物、stds细菌检测引物、分枝杆菌检测引物、高危/疑似高危型人类乳头瘤病毒检测引物、低危型人类乳头瘤病毒检测引物、其他dna病毒检测引物、rna病毒检测引物、真菌检测引物、寄生虫检测引物中的至少一种;和/或
4.根据权利要求1所述的靶向生殖道感染病原体高通量测序的引物组,其特征在于,还包括:
5.根据权利要求1所述的靶向生殖道感染病原体高通量测序的引物组,其特征在于,还包括如下病原检测引物中的至少一种:
6. 根据权利要求1所述的靶向生殖...
【专利技术属性】
技术研发人员:陈佩璇,袁静蕾,何均泽,司徒屏,叶辉,梁家豪,容敏靖,马伟原,梁志坤,万锈琳,郑焱,
申请(专利权)人:广州凯普医学检验所有限公司,
类型:发明
国别省市:
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