System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 分析RNA降解的方法技术_技高网

分析RNA降解的方法技术

技术编号:44902310 阅读:3 留言:0更新日期:2025-04-08 18:49
本发明专利技术总体上涉及分析核糖核酸(RNA)的方法。特别地,本发明专利技术涉及分析RNA以评估RNA样品中RNA分子降解水平的方法。该方法使用核酸外切酶和用于检测核苷酸和/或核苷的手段。本发明专利技术提供了一种分析样品中ssRNA的方法,所述方法包括:(a)将所述样品与探针接触,其中所述探针与所述样品中ssRNA的靶标区域结合;(b)将所述样品与单链特异性核糖核酸外切酶一起温育;以及(c)检测通过步骤(b)生成的核苷酸和/或核苷,其中所述核苷酸和/或核苷源自位于所述样品中ssRNA的所述靶标区域外部的一个或多个RNA区域。本发明专利技术还提供了用于进行所述方法的试剂盒。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】


技术介绍


技术实现思路

【技术保护点】

1.一种分析样品中ssRNA的方法,所述方法包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其中,所述核苷酸和/或核苷是腺苷、腺苷一磷酸、腺苷二磷酸或其组合,优选腺苷一磷酸、腺苷二磷酸或其组合。

3.根据权利要求1或权利要求2所述的方法,其中,检测步骤依赖于光输出。

4.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中,所述检测步骤使用酶-试剂混合物,优选地,其中所述酶-试剂混合物包括荧光素酶,更优选地还包括丙酮酸磷酸双激酶和/或丙酮酸激酶。

5.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中,所述探针是寡核苷酸探针,优选地是DNA或RNA寡核苷酸探针,更优选地是DNA寡核苷酸探针。

6.根据权利要求5所述的方法,其中,所述寡核苷酸具有的长度为15至100个核苷酸,优选地为20至60个核苷酸。

7.根据权利要求1至4中任一项所述的方法,其中,所述探针是RNA结合蛋白。

8.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中,所述核糖核酸外切酶是3'->5'核糖核酸外切酶。

9.根据权利要求8所述的方法,其中,所述ssRNA包括多聚(A)尾,并且ssRNA的靶标区域是所述多聚(A)尾。

10.根据权利要求8所述的方法,其中,所述ssRNA包括多聚(A)尾,并且ssRNA的靶标区域紧邻所述多聚(A)尾的上游或跨越所述多聚(A)尾的5'端。

11.根据权利要求1至7中任一项所述的方法,其中,所述核糖核酸外切酶是5'->3'核糖核酸外切酶。

12.根据权利要求11所述的方法,其中,ssRNA的靶标区域位于所述ssRNA的5'端处或附近。

13.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中,所述核糖核酸外切酶是水解核糖核酸外切酶或磷酸解核糖核酸外切酶。

14.根据前述权利要求中任一项所述的方法,包括对相同样品材料进行其他方法,其中,不进行根据前述权利要求中任一项所限定的步骤(a),但进行根据前述权利要求中任一项所限定的步骤(b)和(c)。

15.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中,所述方法用于测量所述探针与所述ssRNA的结合效率。

16.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中,所述方法用于分析所述ssRNA内的二级结构,优选所述ssRNA中的茎环或发夹形成。

17.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中,所述ssRNA包括一个或多个修饰的核苷酸,优选其中所述一个或多个修饰的核苷酸包括N1-甲基假尿苷。

18.一种用于进行根据前述权利要求中任一项所述的ssRNA分析方法的试剂盒,所述试剂盒包括根据前述权利要求中任一项所限定的探针和根据前述权利要求中任一项所限定的核糖核酸外切酶,任选地以及用于检测核苷酸和/或核苷的酶-试剂混合物。

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【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】

1.一种分析样品中ssrna的方法,所述方法包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其中,所述核苷酸和/或核苷是腺苷、腺苷一磷酸、腺苷二磷酸或其组合,优选腺苷一磷酸、腺苷二磷酸或其组合。

3.根据权利要求1或权利要求2所述的方法,其中,检测步骤依赖于光输出。

4.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中,所述检测步骤使用酶-试剂混合物,优选地,其中所述酶-试剂混合物包括荧光素酶,更优选地还包括丙酮酸磷酸双激酶和/或丙酮酸激酶。

5.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中,所述探针是寡核苷酸探针,优选地是dna或rna寡核苷酸探针,更优选地是dna寡核苷酸探针。

6.根据权利要求5所述的方法,其中,所述寡核苷酸具有的长度为15至100个核苷酸,优选地为20至60个核苷酸。

7.根据权利要求1至4中任一项所述的方法,其中,所述探针是rna结合蛋白。

8.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中,所述核糖核酸外切酶是3'->5'核糖核酸外切酶。

9.根据权利要求8所述的方法,其中,所述ssrna包括多聚(a)尾,并且ssrna的靶标区域是所述多聚(a)尾。

10.根据权利要求8所述的方法,其中,所述ssrna包括多聚(a)尾,并且ssrna的靶标区域紧邻所述多聚(a)尾的上游或跨越所述多聚(a)尾的...

【专利技术属性】
技术研发人员:F·孔贝斯
申请(专利权)人:斯特凡TTO有限公司
类型:发明
国别省市:

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