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【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于细胞工程和基因工程,具体涉及一种影响猪性成熟的分子遗传标记及其应用。
技术介绍
1、养猪业作为我国畜牧业中的重要组成部分,对保障猪肉的供应和农村经济发展起着重要作用。实际生产过程中,后备母猪只产一胎的发生率较高,然而对于猪场而言,若后备母猪无法连续产三胎,则会对生产效益造成巨大的损失。因此,通过选育高繁殖性能的后备母猪对提高猪场的生产率至关重要。
2、性成熟是指动物达到能够进行性生殖的生理状态,通常表现为性腺发育成熟、性激素水平升高以及性行为表现的出现。初情期是性成熟的明显体现之一,表示动物首次表现出发情现象或排卵的时间段。研究发现,性成熟越早产多胎的可能性越高,母猪利用年限越长。
3、视黄醇结合蛋白1(retinol-binding protein 1,rbp1)属于rbps家族,能与视黄醇和视黄醛高亲和力结合,促进视黄酸的生物合成。前人研究发现,rbp1可以驱动颗粒细胞的分化并在三磷酸腺苷依赖的活性调节途径中富集。研究发现,在牛大卵泡中rbp1蛋白表达量显著高于小卵泡,且卵泡液中rbp1的蛋白水平、e2浓度和视黄酸浓度三者呈正相关。水牛处于初情期时卵巢中rbp1的蛋白表达量显著高于初情启动前。这提示着rbp1在性成熟中发挥着重要的作用。
4、启动子是基因表达调控的重要组成部分,能够招募转录复合物到基因的起始转录位点,启动基因的转录过程。启动子区单核苷酸多态性(snp)可能影响相关基因的表达水平,从而影响性成熟。
5、铁死亡是一种铁和氧化应激依赖的非凋亡调节的细胞死
技术实现思路
1、为了克服现有技术的缺点与不足,本专利技术的目的之一在于提供一种影响猪性成熟的分子遗传标记。
2、本专利技术的目的之二在于提供上述影响猪性成熟的分子遗传标记的应用。
3、本专利技术的目的通过下述技术方案实现:
4、一种影响猪性成熟的分子遗传标记,包括如下snp分子标记中的至少一种:
5、(1)对应于猪参考基因组sscrofa11.1第13号染色体上g.80408109位点(即视黄醇结合蛋白1(rbp1)基因启动子区-782bp)t>c突变的snp位点;
6、(2)对应于猪参考基因组sscrofa11.1第13号染色体上g.80408854位点(即视黄醇结合蛋白1(rbp1)基因启动子区-1527bp)t>c突变的snp位点;
7、(3)对应于猪参考基因组sscrofa11.1第13号染色体上g.80408992位点(即视黄醇结合蛋白1(rbp1)基因启动子区-1665bp)g>a突变的snp位点;
8、(4)对应于猪参考基因组sscrofa11.1第13号染色体上g.80409145位点(即视黄醇结合蛋白1(rbp1)基因启动子区-1818bp)c>t突变的snp位点;
9、(5)对应于猪参考基因组sscrofa11.1第13号染色体上g.80409353位点(即视黄醇结合蛋白1(rbp1)基因启动子区-2026bp)a>g突变的snp位点;
10、(6)对应于猪参考基因组sscrofa11.1第13号染色体上g.80409632位点(即视黄醇结合蛋白1(rbp1)基因启动子区-2305bp)a>g突变的snp位点;
11、(7)对应于猪参考基因组sscrofa11.1第13号染色体上g.80409169位点(即视黄醇结合蛋白1(rbp1)基因启动子区-1842bp)a>g突变的snp位点。
12、进一步地,所述的影响猪性成熟的分子遗传标记优选为snp分子标记(1)、snp分子标记(6)中的至少一种。
13、上述影响猪性成熟的分子遗传标记的应用,包括如下应用中的至少一种:
14、a.在评估猪初情期日龄中的应用;
15、b.在判断猪初情启动中的应用;
16、c.在选育高产种猪中的应用。
17、进一步地,在所述的应用a中,检测g.80408109位点的基因型,基因型为cc的个体初情期日龄短于tc和tt个体;和/或,检测g.80408854位点的基因型,基因型为cc的个体初情期日龄短于tc和tt个体;和/或,检测g.80408992位点的基因型,基因型为aa的个体初情期日龄短于ga和gg个体;和/或,检测g.80409145位点的基因型,基因型为tt的个体初情期日龄短于ct和cc个体;和/或,检测g.80409353位点的基因型,基因型为gg的个体初情期日龄短于ag和aa个体;和/或,检测g.80409632位点的基因型,基因型为aa的个体初情期日龄短于ga和gg个体;和/或,检测g.80409169位点的基因型,基因型为gg的个体初情期日龄短于ag和aa个体。
18、进一步地,在所述的应用b中,检测g.80408109位点的基因型,基因型为cc的个体初情启动快于tc和tt个体;和/或,检测g.80408854位点的基因型,基因型为cc的个体初情启动快于tc和tt个体;和/或,检测g.80408992位点的基因型,基因型为aa的个体初情启动快于ga和gg个体;和/或,检测g.80409145位点的基因型,基因型为tt的个体初情启动快于ct和cc个体;和/或,检测g.80409353位点的基因型,基因型为gg的个体初情启动快于ag和aa个体;和/或,检测g.80409632位点的基因型,基因型为aa的个体初情启动快于ga和gg个体;和/或,检测g.80409169位点的基因型,基因型为gg的个体初情启动快于ag和aa个体。
19、进一步地,在所述的应用c中,检测g.30088284位点的基因型,选择基因型为ga和aa的个体作为种猪;和/或,检测g.30088004位点的基因型,选择基因型为tt的个体作为种猪;检测g.80408109位点的基因型,选择基因型为cc的个体作为种猪;和/或,检测g.80408854位点的基因型,选择基因型为cc的个体作为种猪;和/或,检测g.80408992位点的基因型,选择基因型为aa的个体作为种猪;和/或,检测g.80409145位点的基因型,选择基因型为tt的个体作为种猪;和/或,检测g.80409353位点的基因型,选择基因型为gg的个体作为种猪;和/或,检测g.80409632位点的基因型,选择基因型为aa的个体作为种猪;和/或,检测g.80409169位点的基因型,选择基因型为gg的个体作为种猪。
20、进一步地,所述的猪包括杜洛克和其合成系中的任意一种。
21、上述应用为非诊断目的的用途。
22、一种用于鉴定上述影响猪性成熟的分子遗传标记的引物,包括:
23、f:5′-acacagatcccctctctc-3本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种影响猪性成熟的分子遗传标记,其特征在于:包括如下SNP分子标记中的至少一种:
2.权利要求1中所述的影响猪性成熟的分子遗传标记的应用,其特征在于:包括如下应用中的至少一种:
3.根据权利要求2所述的影响猪性成熟的分子遗传标记的应用,其特征在于:
4.根据权利要求2所述的影响猪性成熟的分子遗传标记的应用,其特征在于:
5.根据权利要求2所述的影响猪性成熟的分子遗传标记的应用,其特征在于:
6.根据权利要求2-5任一项所述的影响猪性成熟的分子遗传标记的应用,其特征在于:
7.一种用于鉴定影响猪性成熟的分子遗传标记的引物,其特征在于:包括:
8.RBP1基因在调控猪卵巢颗粒细胞铁死亡中的应用,其特征在于:所述的应用为如下应用中的任意一种或多种:
9.根据权利要求8所述的RBP1基因在调控猪卵巢颗粒细胞铁死亡中的应用,其特征在于:
10.根据权利要求8所述的RBP1基因在调控猪卵巢颗粒细胞铁死亡中的应用,其特征在于:
【技术特征摘要】
1.一种影响猪性成熟的分子遗传标记,其特征在于:包括如下snp分子标记中的至少一种:
2.权利要求1中所述的影响猪性成熟的分子遗传标记的应用,其特征在于:包括如下应用中的至少一种:
3.根据权利要求2所述的影响猪性成熟的分子遗传标记的应用,其特征在于:
4.根据权利要求2所述的影响猪性成熟的分子遗传标记的应用,其特征在于:
5.根据权利要求2所述的影响猪性成熟的分子遗传标记的应用,其特征在于:
6.根据权...
【专利技术属性】
技术研发人员:李加琪,张哲,袁晓龙,李硕,何颖婷,周菁钰,杨甜甜,缪汾,
申请(专利权)人:华南农业大学,
类型:发明
国别省市:
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