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【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及基因工程,具体涉及一种可以提高cas9碱基编辑器和先导编辑器效率的蛋白及应用。
技术介绍
1、基于crispr/cas系统的碱基编辑(base-editor,be)和先导编辑(prime editor,pe)等基因编辑技术已经在基因编辑、表达调控、疾病治疗等方面展现了极大的应用价值。其中,cas9蛋白是非常关键的组成部分,与目前基因编辑技术面临的编辑效率、脱靶率等问题密切相关。
2、为了提高碱基编辑效率,现有方法:例如通过融合不同的脱氨酶和cas蛋白,可以构建出具有更高编辑效率的碱基编辑器。比如将高效的cas12a变体hypercas12a与高效单链dna脱氨酶结合,再引入双链dna脱氨酶ddda的无毒突变体ddda-gsvg,可以显著提高水稻中的碱基编辑效率;此外,通过人工智能(ai)技术,如卷积神经网络(cnn),可以对碱基编辑器的编辑效率进行预测和优化;也可以结合多种碱基编辑器进行多位点编辑。而提高先导编辑器的优化方法目前主要集中在以下几个方面:rt逆转录酶的优化、nls序列、ncas9的改造以及ncas9的核酸酶活性优化。但是目前提高碱基编辑和先导编辑效率的方法都不是很理想。
技术实现思路
1、本专利技术针对现有技术存在的问题提供一种可以提高cas9碱基编辑器和先导编辑器效率的蛋白及应用。
2、本专利技术采用的技术方案是:
3、一种蛋白,所述蛋白由融合蛋白截掉蛋白序列c端n个氨基酸得到;所述融合蛋白为spcas9和smacc
4、进一步的,所述融合蛋白为spsmac cas9-d3.
5、进一步的,所述spsmac cas9-d3为spcas9的非pid结构域和smaccas9的pid结构域融合得到。
6、进一步的,所述n为3。
7、进一步的,所述融合蛋白spsmaccas9-d3的序列为seq id no.1;所述蛋白序列为seq id no.2。
8、一种蛋白的应用,所述蛋白用于基因编辑中。
9、进一步的,所述蛋白用于制备cas9碱基编辑或先导编辑器。
10、一种蛋白构建的碱基编辑器,采用abe-ng和蛋白作为模板构建得到。
11、一种蛋白构建的先导编辑器,采用pe2和蛋白作为模板构建得到。
12、一种提高cas9碱基编辑器和先导编辑器效率的方法,采用蛋白构建cas9碱基编辑器或先导编辑器进行基因编辑。
13、本专利技术的有益效果是:
14、本专利技术将融合蛋白的c端部分氨基酸去除后,大大提高了其碱基编辑和先导编辑的效率。采用本专利技术的蛋白制备得到碱基编辑器和先导编辑器,为crispr/cas基因编辑技术的进一步完善和发展提供新思路,为基因编辑技术在临床和生物技术等领域的应用提供理论基础。
本文档来自技高网...【技术保护点】
1.一种蛋白,其特征在于,所述蛋白由融合蛋白截掉蛋白序列C端N个氨基酸得到;
2.根据权利要求1所述的一种蛋白,其特征在于,所述融合蛋白为SpSmac Cas9-D3。
3.根据权利要求2所述的一种蛋白,其特征在于,所述SpSmac Cas9-D3为SpCas9的非PID结构域和SmacCas9的PID结构域融合得到。
4.根据权利要求3所述的一种蛋白,其特征在于,所述N为3。
5.根据权利要求3所述的一种蛋白,其特征在于,所述融合蛋白SpSmac Cas9-D3的序列为SEQ ID NO.1;所述蛋白序列为SEQ ID NO.2。
6.如权利要求1~5所述任一蛋白的应用,其特征在于,所述蛋白用于基因编辑中。
7.根据权利要求6所述的应用,其特征在于,所述蛋白用于制备Cas9碱基编辑或先导编辑器。
8.采用如权利要求1~5任一种蛋白构建的碱基编辑器,其特征在于,采用ABE-NG和蛋白作为模板构建得到。
9.采用如权利要求1~5任一种蛋白构建的先导编辑器,其特征在于,采用PE2和蛋白作为
10.一种提高Cas9碱基编辑器和先导编辑器效率的方法,其特征在于,采用蛋白构建Cas9碱基编辑器或先导编辑器进行基因编辑;
...【技术特征摘要】
1.一种蛋白,其特征在于,所述蛋白由融合蛋白截掉蛋白序列c端n个氨基酸得到;
2.根据权利要求1所述的一种蛋白,其特征在于,所述融合蛋白为spsmac cas9-d3。
3.根据权利要求2所述的一种蛋白,其特征在于,所述spsmac cas9-d3为spcas9的非pid结构域和smaccas9的pid结构域融合得到。
4.根据权利要求3所述的一种蛋白,其特征在于,所述n为3。
5.根据权利要求3所述的一种蛋白,其特征在于,所述融合蛋白spsmac cas9-d3的序列为seq id no.1;所述蛋白序列为seq id...
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