【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于分子生物，涉及一种与猪胸围和腰围相关的snp分子标记及其应用。
技术介绍
1、生长性状的改良一直是养猪业提高经济效益和生产力的重要目标。胸围和腰围作为衡量猪只生长状况的重要表型指标，与背膘厚度、体重等关键生长性状密切相关。猪只的胸围和腰围不仅反映了猪只的体型特征，同时也是猪产肉能力、饲料转化效率等生产性状的间接体现。因此，优化这两个性状对于提高肉猪的生产性能和市场竞争力具有重要意义。通过传统的选育方法可以使得猪的胸围和腰围两个性状得到一定程度的改良。但胸围和腰围作为复杂数量性状，受多基因调控。因此，通过传统的选育方法来改良这两个性状，耗时长且收效甚微。
技术实现思路
1、本专利技术的目的在于提供一种与猪胸围和腰围相关的snp分子标记及其应用。
2、根据本专利技术的一个方面，提供了一种与猪胸围和腰围相关的snp分子标记，其位点位于seq id no:1所示核苷酸序列从5’端起的第62位，对应于国际猪参考基因组11.1版本1号染色体上第167553481bp处，该位点存在t>g突变，其核苷酸类型为t或g，snp分子标记的基因型为tt、tg或gg。
3、本专利技术提供的snp分子标记与猪的胸围和腰围性状显著相关，主要体现在：基因型为gg的猪的胸围和腰围均大于基因型为tt和基因型为tg的猪的胸围和腰围，基因型为tg的猪的胸围小于基因型为tt的猪的胸围或与基因型为tt的猪的胸围相当、腰围大于基因型为tt的腰围。通过鉴定该snp分子标记单核苷酸多态性
4、由此，本专利技术提供的与猪胸围和腰围相关的snp分子标记，可以应用于：
5、(1)鉴定猪胸围和/或腰围性状；
6、(2)制备鉴定猪胸围和/或腰围性状的产品；
7、(3)猪遗传改良，基于选育snp分子标记基因型为gg的猪实现猪的遗传改良；
8、(4)制备用于辅助进行猪遗传改良的产品，所述产品基于鉴定猪snp分子标记基因型实现辅助进行猪遗传改良。
9、猪的胸围和腰围是猪产肉能力、饲料转化效率等生产性状的间接体现，猪的胸围和腰围越大，猪的产肉能力、对饲料的转化效率越高；因此，通过鉴定猪胸围和/或腰围性状，可以辅助鉴定猪产肉能力和猪对饲料的转化效率。由此，本专利技术提供的与猪胸围和腰围相关的snp分子标记还可以应用于辅助鉴定猪产肉能力和/或猪对饲料的转化效率，以及应用于制备辅助鉴定猪产肉能力和/或猪对饲料的转化效率的产品。
10、在一些实施方式中，猪胸围和/或腰围性状为猪100kg体重时的胸围和/或腰围。
11、在一些实施方式中，猪优选为加系杜洛克及其合成系。
12、根据本专利技术的另一个方面，提供了一种引物对，该引物对可以特异性扩增出含seqid no:1所示核苷酸序列中从5’端起的第62位单核苷酸多态性的扩增片段，上游引物的核苷酸序列如seq id no:2所示，下游引物的核苷酸序列如seq id no:3所示。
13、本专利技术提供的引物对可以扩增出含本专利技术提供的与猪胸围和腰围相关的snp分子标记的扩增片段，可应用于鉴定seq id no:1所示核苷酸序列中从5’端起的第62位单核苷酸是t还是g。因此，本专利技术提供的引物对可应用于鉴定与猪胸围和腰围相关的snp分子标记的基因型和/或制备鉴定与猪胸围和腰围相关的snp分子标记的基因型的产品。
14、根据本专利技术的第三个方面，提供了一种试剂盒，该试剂盒的组成包括核苷酸序列如seq id no:2和seq id no:3所示的引物对。
15、本专利技术提供的引物对和试剂盒的应用包括但不限于：
16、(1)鉴定与猪胸围和腰围相关的snp分子标记的基因型；
17、(2)制备鉴定与猪胸围和腰围相关的snp分子标记的基因型的产品；
18、(3)鉴定猪胸围和/或腰围性状，基于鉴定与猪胸围和腰围相关的snp分子标记的基因型实现猪胸围和/或腰围性状的鉴定；
19、(4)制备鉴定猪胸围和/或腰围性状的产品，所述产品基于鉴定与猪胸围和腰围相关的snp分子标记的基因型实现猪胸围和/或腰围性状的鉴定；
20、(5)辅助鉴定猪产肉能力，基于鉴定猪胸围和/或腰围性状实现猪产肉能力的辅助鉴定；
21、(6)制备辅助鉴定猪产肉能力的产品，所述产品基于鉴定猪胸围和/或腰围性状实现猪产肉能力的辅助鉴定；
22、(7)辅助鉴定猪对饲料的转化效率，基于鉴定猪胸围和/或腰围性状实现猪对饲料的转化效率的辅助鉴定；
23、(8)制备辅助鉴定猪对饲料的转化效率的产品，所述产品基于鉴定猪胸围和/或腰围性状实现猪对饲料的转化效率的辅助鉴定；
24、(9)猪遗传改良，基于选育snp分子标记基因型为gg的猪实现猪的遗传改良；
25、(10)制备用于辅助进行猪遗传改良的产品，所述产品基于鉴定猪snp分子标记基因型实现辅助进行猪遗传改良。
26、在一些实施方式中，本专利技术提供的试剂盒的组成还可以包括：dntps、dna聚合酶、mg2+和pcr反应缓冲液等常规pcr反应体系的组成成分。
27、根据本专利技术的第四个方面，提供了一种猪的遗传改良方法，包括如下步骤：
28、(1)确定猪的与猪胸围和腰围相关的snp分子标记的基因型；
29、(2)选育snp分子标记基因型为gg的个体，淘汰基因型为tg和tt的个体，逐代提高该位点的等位基因g的频率；从而改良后代猪胸围和腰围以及提高后代猪产肉量。
30、在一些实施方式中，步骤(1)中，确定猪的与猪胸围和腰围相关的snp分子标记的基因型的方法包括如下步骤：
31、提取猪的全基因组dna，利用核苷酸序列如seq id no:2和seq id no:3所示的引物对进行pcr扩增，对扩增产物进行测序，基于测序结果确定猪的与猪胸围和腰围相关的snp分子标记的基因型。
32、在一些实施方式中，猪为加系杜洛克及其合成系。杜长大(杜洛克猪×长白猪×大白猪)是全球最受欢迎的商业猪品种，杜洛克猪被广泛用作杜长大商品猪的终端父本。杜洛克作为终端父本直接影响杜长大的生产性能，而商品猪的生产性能直接影响到养殖场的经济效益。因此，对核心群杜洛克猪的胸围和腰围进行改良，能够较大程度的将改良得到的优势遗传给商品猪后代，增强商品猪的生产竞争力，从而提高养殖场的经济效益。
33、与现有技术相比，本专利技术的有益效果包括：
34、(1)本专利技术提供了一种位于猪1号染色体的核苷酸序列上的、与猪胸围和腰围相关的snp分子标记，并验证了其对猪胸围和腰围性状的影响效应，有助于建立对猪胸围和腰围性状进行快速改良的分子标记辅助选择育种技术，改善杜洛克及其合成系的选育进程。
35、(2本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.与猪胸围和腰围相关的SNP分子标记的应用，其特征在于，所述应用包括：
2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述猪胸围和/或腰围性状为猪100kg体重时的胸围和/或腰围。
3.根据权利要求1或2所述的应用，其特征在于，所述猪为加系杜洛克及其合成系。
4.引物对，其特征在于，所述引物对特异性扩增出含SEQ ID NO:1所示核苷酸序列中从5’端起的第62位单核苷酸多态性的扩增片段；其中，
5.根据权利要求4所述的引物对的应用，其特征在于，所述应用包括：
6.试剂盒，其特征在于，其组成包括权利要求4所述的引物对。
7.根据权利要求6所述的试剂盒的应用，其特征在于，所述应用包括：
8.一种猪的遗传改良方法，其特征在于，包括如下步骤：
9.根据权利要求8所述的猪的遗传改良方法，其特征在于，步骤(1)中，所述确定猪的与猪胸围和腰围相关的SNP分子标记的基因型的方法包括如下步骤：
10.根据权利要求8或9所述的猪的遗传改良方法，其特征在于，所述猪为加系杜洛克及其合成系。
【技术特征摘要】
1.与猪胸围和腰围相关的snp分子标记的应用，其特征在于，所述应用包括：
2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述猪胸围和/或腰围性状为猪100kg体重时的胸围和/或腰围。
3.根据权利要求1或2所述的应用，其特征在于，所述猪为加系杜洛克及其合成系。
4.引物对，其特征在于，所述引物对特异性扩增出含seq id no:1所示核苷酸序列中从5’端起的第62位单核苷酸多态性的扩增片段；其中，
5.根据权利要求4所述的引物对的应用，其特征在于...
【专利技术属性】
技术研发人员：杨杰，吴珍芳，姚泽锴，左建军，郑恩琴，蔡更元，刘珍云，刘琅青，张泽宾，杨化强，
申请(专利权)人：华南农业大学，
类型：发明
国别省市：
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