【技术实现步骤摘要】
本专利技术实施例涉及分子动力学,尤其涉及一种粒子作用对的修正方法、装置、设备及存储介质。
技术介绍
1、在分子动力学模拟中,需要模拟出大量粒子的运动轨迹,而由于分子结构的复杂,其中粒子间的约束算法是一个复杂的算法。约束算法指用于限制粒子之间的相对运动,以保持特定的几何关系或约束条件。由于分子的键/角关系,粒子受到作用力的影响,在一定时间间隔内,粒子的位置和速度将会发生变化。具体表现为具有键/角粒子间的相对距离必须在一定范围内,不能过大或过小,破坏原子间的化学键,约束算法就是通过计算对原子的速度和位置进行修正,使得速度和位置在一定的约束区间内。
2、目前在分子动力学的仿真及实现中,对于约束算法的实现通常采用逐个粒子作用对,逐次迭代的方式进行计算。但约束算法对原子位置和速度的修正是反复多次的精细修正,需要相当大的计算量,且由于粒子的高速运动,对约束算法的实现性能要求更高。现有的方法效率低下,模拟性能低。
技术实现思路
1、本专利技术提供了一种粒子作用对的修正方法、装置、设备及存储介质,以解决现有技术在模拟粒子运行轨迹时,对粒子作用对的修正效率低导致模拟性能低的问题。
2、根据本专利技术的一方面,提供了一种粒子作用对的修正方法,所述方法包括:
3、获取包括多个分子动力学模拟的粒子作用对的作用对组合;
4、根据所述粒子作用对的粒子信息,并行计算每组粒子作用对的粒子相对距离;
5、根据所述粒子相对距离和距离约束条件确定每组粒子作用对
6、根据所述切换标志位对所述作用对组合进行更新,得到新的作用对组合;
7、通过粒子约束算法对所述新的作用对组合中的粒子作用对进行修正,重新计算修正后的粒子作用对的粒子相对距离并继续进行迭代,直至达到迭代终止条件。
8、根据本专利技术的另一方面,提供了一种粒子作用对的修正装置,所述装置包括:
9、获取模块,用于获取包括多个粒子作用对的作用对组合;
10、计算模块,用于根据所述粒子作用对的粒子信息,并行计算每组粒子作用对的粒子相对距离;
11、确定模块,用于根据所述粒子相对距离和距离约束条件确定每组粒子作用对的切换标志位;
12、更新模块,用于根据所述切换标志位对所述作用对组合进行更新,得到新的作用对组合;
13、修正模块,用于通过粒子约束算法对所述新的作用对组合中的粒子作用对进行修正,重新计算修正后的粒子作用对的粒子相对距离并继续进行迭代,直至达到迭代终止条件。
14、根据本专利技术的另一方面,提供了一种电子设备,所述电子设备包括:至少一个处理器;以及
15、与所述至少一个处理器通信连接的存储器;其中,
16、所述存储器存储有可被所述至少一个处理器执行的计算机程序,所述计算机程序被所述至少一个处理器执行,以使所述至少一个处理器能够执行本专利技术任一实施例所述的粒子作用对的修正方法。
17、根据本专利技术的另一方面,提供了一种计算机可读存储介质,所述计算机可读存储介质存储有计算机指令,所述计算机指令用于使处理器执行时实现本专利技术任一实施例所述的粒子作用对的修正方法。
18、本专利技术实施例的一种粒子作用对的修正方法、装置、设备及存储介质,方法包括:获取包括多个分子动力学模拟的粒子作用对的作用对组合;根据所述粒子作用对的粒子信息,并行计算每组粒子作用对的粒子相对距离;根据所述粒子相对距离和距离约束条件确定每组粒子作用对的切换标志位;根据所述切换标志位对所述作用对组合进行更新,得到新的作用对组合;通过粒子约束算法对所述新的作用对组合中的粒子作用对进行修正,重新计算修正后的粒子作用对的粒子相对距离并继续进行迭代,直至达到迭代终止条件。该方法通过并行对粒子作用对进行修正,能够提高修正效率,进一步提高模拟粒子的性能,解决了现有技术在模拟粒子运行轨迹时,对粒子作用对的修正效率低导致模拟性能低的问题。
19、应当理解,本部分所描述的内容并非旨在标识本专利技术的实施例的关键或重要特征,也不用于限制本专利技术的范围。本专利技术的其它特征将通过以下的说明书而变得容易理解。
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1.一种粒子作用对的修正方法,其特征在于,所述方法包括:
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述根据所述粒子作用对的粒子信息,并行计算每组粒子作用对的粒子相对距离,包括:
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述根据所述粒子相对距离和距离约束条件确定每组粒子作用对的切换标志位,包括:
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述根据所述切换标志位对所述作用对组合进行更新,得到新的作用对组合,包括:
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述基于所述切换标志位将所述作用对组合与未修正的粒子作用对进行交织,得到新的作用对组合,包括:
6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述通过粒子约束算法对所述新的作用对组合中的粒子作用对进行修正,包括:
7.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述迭代终止条件包括:
8.一种粒子作用对的修正装置,其特征在于,所述装置包括:
9.一种电子设备,其特征在于,所述设备包括:
10.一种计算机可读存储介质,其特征在于,所述
...【技术特征摘要】
1.一种粒子作用对的修正方法,其特征在于,所述方法包括:
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述根据所述粒子作用对的粒子信息,并行计算每组粒子作用对的粒子相对距离,包括:
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述根据所述粒子相对距离和距离约束条件确定每组粒子作用对的切换标志位,包括:
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述根据所述切换标志位对所述作用对组合进行更新,得到新的作用对组合,包括:
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述基于所述切换标志位将所述作用对组合与未修正的粒...
【专利技术属性】
技术研发人员:徐韡,
申请(专利权)人:上海思朗科技有限公司,
类型:发明
国别省市:
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