System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 一种澳洲坚果SNP分子标记组合及其应用制造技术_技高网

一种澳洲坚果SNP分子标记组合及其应用制造技术

技术编号:44543240 阅读:13 留言:0更新日期:2025-03-11 14:09
本发明专利技术属于分子生物学技术领域,具体涉及一种澳洲坚果SNP分子标记组合及其应用。本发明专利技术所述SNP分子标记组合包括284个SNP位点,所述284个SNP位点能够较为均匀地覆盖澳洲坚果基因组,多态信息含量较高,可以用于澳洲坚果DNA指纹图谱的构建,在DNA指纹图谱的基础上进一步用于澳洲坚果种质资源的鉴定,可解决资源中种质混杂、保存管理重复以及知识产权纠纷等问题;同时,应用所述284个SNP位点筛选澳洲坚果核心种质,以最少的种质数量和最低的遗传冗余度最大限度地代表物种最丰富的遗传多样性,提高种质资源的管理和利用效率,为有效保护和利用遗传资源,以及为澳洲坚果育种计划选择有用的遗传资源奠定了基础。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于分子生物学,具体涉及一种澳洲坚果snp分子标记组合及其应用。


技术介绍

1、澳洲坚果(macadamia spp.)原产澳大利亚东海岸新南威尔士州北部和昆士兰州南部的亚热带雨林地区,系山龙眼科(proteaceae)澳洲坚果属(macadamia f.muell.)多年生常绿乔木果树,人工栽培历史仅160多年,因其具有较高的营养及经济价值且市场需求量大,世界各宜植区正积极引种或扩大种植面积。经过40多年的发展,我国已成为世界上种植澳洲坚果面积最大的国家,种植面积占世界种植面积的60%以上,位居世界第一。然而,我国澳洲坚果种质资源由不同科研机构独立收集和命名,产生了种质资源的重复引进和种质资源间的遗传关系不清晰等问题。这些问题不利于澳洲坚果种质资源的鉴定、育种亲本的选择。

2、目前,我国澳洲坚果种质的鉴定方法主要通过形态特征,但形态特征对外界环境敏感,容易出现误判。dna指纹图谱是鉴定植物种质资源的有力工具。ssr和snp标记是国际植物新品种保护联盟(upov)推荐用于构建dna指纹图谱的首选标记。迄今为止,还没有基于snp标记构建澳洲坚果dna指纹图谱的报道。


技术实现思路

1、本专利技术的目的在于提供一种澳洲坚果snp分子标记组合及其应用,所述snp分子标记组合能够较为均匀地覆盖澳洲坚果基因组,多态信息含量较高,可用于澳洲坚果指纹图谱构建和核心种质筛选。

2、有益效果:

3、本专利技术提供了一种澳洲坚果snp分子标记组合,所述snp分子标记组合包括284个snp位点,所述284个snp位点能够较为均匀地覆盖澳洲坚果基因组,多态信息含量较高,可以用于澳洲坚果dna指纹图谱的构建,在dna指纹图谱的基础上进一步用于澳洲坚果种质资源的鉴定,可解决资源中种质混杂、保存管理重复以及知识产权纠纷等问题;同时,应用所述284个snp位点筛选澳洲坚果核心种质,以最少的种质数量和最低的遗传冗余度最大限度地代表物种最丰富的遗传多样性,提高种质资源的管理和利用效率。再者,本专利技术提供的snp标记组合也能够用于澳洲坚果的遗传育种、遗传多样性分析以及群体结构分析中,为有效保护和利用遗传资源,以及为澳洲坚果育种计划选择有用的遗传资源奠定了基础。

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【技术保护点】

1.一种澳洲坚果SNP分子标记组合,其特征在于,所述SNP分子标记组合包括284个SNP位点,所述284个SNP位点的染色体、物理位置、参考基因型和变异基因型的信息如下表所示,其中下表中Ref表示参考基因型,Alt表示变异基因型:

2.权利要求1所述澳洲坚果SNP分子标记组合在澳洲坚果的遗传育种、遗传多样性分析、群体结构分析中的一项或多项中的应用。

3.权利要求1所述澳洲坚果SNP分子标记组合在澳洲坚果DNA指纹图谱构建和/或核心种质筛选中的应用。

4.一种基于权利要求1所述澳洲坚果SNP分子标记组合构建澳洲坚果的SNP指纹序列,其特征在于,包括187份澳洲坚果种质的SNP指纹序列的任意一种,所述187份澳洲坚果种质名称和SNP指纹序列如下:

5.根据权利要求4所述的SNP指纹序列,其特征在于,所述SNP指纹序列以二维码图形的形式展示,所述二维码图形通过二维码技术转化而成。

6.一种澳洲坚果DNA指纹图谱,其特征在于,所述澳洲坚果DNA指纹图谱基于权利要求4或5所述187份澳洲坚果种质的SNP指纹序列构建得到。

<p>7.权利要求6所述澳洲坚果DNA指纹图谱的构建方法,其特征在于,包括如下步骤:

8.权利要求4或5所述的SNP指纹序列、权利要求6所述的澳洲坚果DNA指纹图谱或权利要求7所述构建方法构建得到的澳洲坚果DNA指纹图谱在澳洲坚果种质鉴定中的应用。

9.一种基于权利要求1所述澳洲坚果SNP分子标记组合筛选澳洲坚果核心种质的方法,其特征在于,包括如下步骤:

10.根据权利要求9所述的方法,其特征在于,所述核心种质的筛选软件包括CoreHunter II。

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【技术特征摘要】

1.一种澳洲坚果snp分子标记组合,其特征在于,所述snp分子标记组合包括284个snp位点,所述284个snp位点的染色体、物理位置、参考基因型和变异基因型的信息如下表所示,其中下表中ref表示参考基因型,alt表示变异基因型:

2.权利要求1所述澳洲坚果snp分子标记组合在澳洲坚果的遗传育种、遗传多样性分析、群体结构分析中的一项或多项中的应用。

3.权利要求1所述澳洲坚果snp分子标记组合在澳洲坚果dna指纹图谱构建和/或核心种质筛选中的应用。

4.一种基于权利要求1所述澳洲坚果snp分子标记组合构建澳洲坚果的snp指纹序列,其特征在于,包括187份澳洲坚果种质的snp指纹序列的任意一种,所述187份澳洲坚果种质名称和snp指纹序列如下:

5.根据权利要求4所述的snp指纹序列,其...

【专利技术属性】
技术研发人员:万继锋曾辉杜丽清宋喜梅邹明宏杨倩王照罗炼芳
申请(专利权)人:中国热带农业科学院南亚热带作物研究所
类型:发明
国别省市:

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