【技术实现步骤摘要】
本申请涉及猪眼肌面积的，具体涉及一种与猪眼肌面积关联的分子标记。
技术介绍
1、眼肌面积(loinmusclearea,lma)是指家畜倒数第一、二胸椎之间背腰最长肌的横断面面积，在猪、牛、羊等家畜研究中具有重要意义。猪的眼肌面积是指猪最后肋骨处背最长肌横截面的面积，用求积仪测出，眼肌面积的计算公式一般为眼肌高(cm)×眼肌宽(cm)×0.7。眼肌面积是衡量猪生长性能和胴体产肉能力的重要指标，它直接关联到瘦肉率和背膘厚，这些性状对于养猪业来说至关重要。瘦肉型猪在猪肉消费市场中占有很大的份额，胴体瘦肉率在评价胴体品质方面是一个非常重要的指标。研究发现，瘦肉率与眼肌面积之间呈强相关，通过眼肌面积来估测瘦肉率可以显著降低成本，所以在瘦肉猪的生产及选育工作中眼肌面积也是非常重要的指标。
2、育种实践中，眼肌面积的测定对于选择优良遗传特性的猪只进行繁育，从而提高猪群的整体肉质和性能具有重要作用。通过测定眼肌面积结果，养殖户可以选择具有较大眼肌面积的猪只进行繁育，进而达到提高猪的生产效率的目的。因此，眼肌面积不仅是一个重要的肉质指标，也是养猪业中遗传改良和选育工作的一个关键参数。
技术实现思路
1、本申请专利技术人利用全基因组关联分析(gwas)筛选得到与猪眼肌面积关联的分子标记，其位于猪10号染色体第3593429nt位置发生a/g的单核苷酸多态性位点(ensembl数据库编号rs81425149)，其中，该位点为aa基因型的个体眼肌面积高于其他个体，由此表明该位点为a型核苷酸能
2、为此，本申请实施例至少公开了以下技术方案：
3、第一方面，实施例公开了与猪眼肌面积关联的分子标记，包括猪国际猪参考基因组11.1版本10号染色体第3593429nt位置发生a/g的单核苷酸多态性形成的核苷酸序列。
4、第二方面，实施例公开了一种用于检测第一方面所述的分子标记的引物对，所述引物对的核苷酸序列如seq id no:1和seq id no:2所示。
5、第三方面，实施例公开了一种试剂盒，包括第二方面所述的引物对及pcr扩增所需试剂。
6、第四方面，实施例公开了一种检测第一方面所述的分子标记的方法，所述方法包括以下步骤：提取待测猪的基因组dna；将所述待测猪的基因组dna进行pcr扩增，以便获得pcr扩增产物；对所述pcr扩增产物进行测序，以便获得测序结果；基于所述测序结果，判读猪国际猪参考基因组11.1版本10号染色体第3593429nt位点的多态性。
7、第五方面，实施例公开了与猪眼肌面积关联的分子标记，包括如seq id no:3和seq id no:4所示的核苷酸序列。
8、第六方面，实施例公开了一种选育大眼肌面积猪品系的方法，所述方法包括以下步骤：检测猪国际猪参考基因组11.1版本猪10号染色体第3593429个核苷酸位点的基因型，选择第3593429个核苷酸位点的aa型个体作为种猪。
9、第七方面，实施例公开了一种选育大眼肌面积猪品系的方法，包括若检测到猪基因组dna中含如seq id no:3所示的核苷酸序列，将其对应的纯合基因型个体作为种猪。
10、第八方面，实施例公开了与大白猪肌内脂肪含量相关联的snp位点或引物对在筛选大眼肌面积的猪品系中的应用，所述snp位点为为国际猪基因组11.1版本参考序列猪10号染色体第3593429个核苷酸位点，且具有a/g多态性。所述引物对的核苷酸序列如seq idno:1和seq id no:2所示。
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1.与猪眼肌面积关联的分子标记，包括猪国际猪参考基因组11.1版本10号染色体第3593429nt位置发生A/G的单核苷酸多态性形成的核苷酸序列。
2.一种用于检测如权利要求1所述的分子标记的引物对，所述引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示。
3.一种试剂盒，包括权利要求2所述的引物对及PCR扩增所需试剂。
4.一种检测如权利要求1所述的分子标记的方法，包括：
5.与猪眼肌面积关联的分子标记，包括如SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示的核苷酸序列。
6.一种选育大眼肌面积猪品系的方法，包括：
7.一种选育大眼肌面积猪品系的方法，包括：
8.与大白猪肌内脂肪含量相关联的SNP位点或引物对在筛选大眼肌面积的猪品系中的应用，所述SNP位点为为国际猪基因组11.1版本参考序列猪10号染色体第3593429个核苷酸位点，且具有A/G多态性，所述引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示。
【技术特征摘要】
1.与猪眼肌面积关联的分子标记，包括猪国际猪参考基因组11.1版本10号染色体第3593429nt位置发生a/g的单核苷酸多态性形成的核苷酸序列。
2.一种用于检测如权利要求1所述的分子标记的引物对，所述引物对的核苷酸序列如seq id no:1和seq id no:2所示。
3.一种试剂盒，包括权利要求2所述的引物对及pcr扩增所需试剂。
4.一种检测如权利要求1所述的分子标记的方法，包括：
5.与猪眼肌面积关联的分子标...
【专利技术属性】
技术研发人员：曹建华，郭培华，李小龙，胡怡轩，康新婉，
申请(专利权)人：华中农业大学，
类型：发明
国别省市：
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