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HPV分型引物探针组合物及其应用制造技术

技术编号:44503019 阅读:1 留言:0更新日期:2025-03-07 13:02
本发明专利技术提供了一种HPV分型引物探针组合物及其应用,涉及生物技术领域。该HPV分型引物探针组合物包含针对以下23种HPV型别的特异性引物对:HPV6、HPV11、HPV16、HPV18、HPV26、HPV31、HPV33、HPV35、HPV39、HPV42、HPV43、HPV45、HPV51、HPV52、HPV53、HPV56、HPV58、HPV59、HPV66、HPV68、HPV73、HPV81和HPV82,核苷酸序列如SEQ ID NO.1~15、18~40所示。该HPV分型引物探针组合物缓解了现有的HPV分型产品对HPV型别区分能力有限且操作繁琐的缺陷。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物,尤其是涉及一种hpv分型引物探针组合物及其应用。


技术介绍

1、如下陈述仅提供与本专利技术有关的背景信息,而不必然地构成现有技术。

2、人乳头瘤病毒(human papilloma virus,hpv)是一种小分子的、无被膜包被的环状双链dna病毒,基因组长约8000碱基对(bp),广泛存在于自然界中。对于感染生殖道和肛门的hpv,根据各基因型别致病力大小或致癌危险性大小可分为低危型和高危型两大类。而持续性的高危型hpv感染则是导致宫颈上皮内瘤变及宫颈癌的主要原因。研究已表明在99.7%的宫颈癌患者体内检测到高危型hpv dna的存在,低危型hpv一般与尖锐湿疣或低度鳞状上皮内病变相关,极少引起浸润癌。

3、依据who国际癌症研究机构(iarc)及其他国际组织的研究成果,人乳头瘤病毒(hpv)核酸检测及基因分型、试剂技术审查指导原则建议将hpv16、18、31、33、35、39、45、51、52、56、58、59、68等13种基因型列为高危型别,26、53、66、73、82等5种基因型列为中等风险型别。

4、检测hpv的方法主要有巴氏涂片、原位杂交、细胞学检测、hpv核酸检测等。hpv核酸检测是宫颈癌筛查的主要检测方法,相比细胞学筛查方法,hpv检测可以最大限度地筛查出高风险人群,从而早期发现癌前病变,避免子宫颈癌的发生,同时可以延长筛查间隔,提高筛查效率。因此,对于hpv分型产品的需求也越来越多。但现有分型方法还存在如下缺陷:灵敏度低;分型有限,大部分hpv分型试剂采用分多管检测的形式,成本较高;和分型采用多管检测,实验操作较复杂。因此如何改进hpv分型产品是目前有待解决的问题。

5、有鉴于此,特提出本专利技术。


技术实现思路

1、本专利技术的目的在于提供一种hpv分型引物探针组合物,以缓解现有的hpv分型产品对hpv型别区分能力有限且操作繁琐的缺陷。

2、为解决上述技术问题,本专利技术特采用如下技术方案:

3、第一方面,提供了一种hpv分型引物探针组合物,包括如下引物对中的至少一对:hpv6分型引物对:上游引物和下游引物的核苷酸序列分别如seq id no.1和7所示,探针的核苷酸序列如seq id no.18所示;hpv53分型引物对:上游引物和下游引物的核苷酸序列分别如seq id no.1和7所示,探针的核苷酸序列如seq id no.32所示;hpv58分型引物对:上游引物和下游引物的核苷酸序列分别如seq id no.1和7所示,探针的核苷酸序列如seq idno.34所示;hpv66分型引物对:上游引物和下游引物的核苷酸序列分别如seq id no.1和8所示,探针的核苷酸序列如seq id no.36所示;hpv33分型引物对:上游引物和下游引物的核苷酸序列分别如seq id no.1和10所示,探针的核苷酸序列如seq id no.24所示;hpv56分型引物对:上游引物和下游引物的核苷酸序列分别如seq id no.1和10所示,探针的核苷酸序列如seq id no.33所示;hpv45分型引物对:上游引物和下游引物的核苷酸序列分别如seq id no.1和11所示,探针的核苷酸序列如seq id no.29所示;hpv11分型引物对:上游引物和下游引物的核苷酸序列分别如seq id no.2和8所示,探针的核苷酸序列如seq idno.19所示;hpv35分型引物对:上游引物和下游引物的核苷酸序列分别如seq id no.2和9所示,探针的核苷酸序列如seq id no.25所示;hpv18分型引物对:上游引物和下游引物的核苷酸序列分别如seq id no.2和10所示,探针的核苷酸序列如seq id no.21所示;hpv31分型引物对:上游引物和下游引物的核苷酸序列分别如seq id no.2和11所示,探针的核苷酸序列如seq id no.23所示;hpv52分型引物对:上游引物和下游引物的核苷酸序列分别如seq id no.2和12所示,探针的核苷酸序列如seq id no.31所示;hpv39分型引物对:上游引物和下游引物的核苷酸序列分别如seq id no.2和13所示,探针的核苷酸序列如seq idno.26所示;hpv42分型引物对:上游引物和下游引物的核苷酸序列分别如seq id no.2和13所示,探针的核苷酸序列如seq id no.27所示;hpv16分型引物对:上游引物和下游引物的核苷酸序列分别如seq id no.3和9所示,探针的核苷酸序列如seq id no.20所示;hpv26分型引物对:上游引物和下游引物的核苷酸序列分别如seq id no.3和10所示,探针的核苷酸序列如seq id no.22所示;hpv82分型引物对:上游引物和下游引物的核苷酸序列分别如seq id no.3和10所示,探针的核苷酸序列如seq id no.40所示;hpv51分型引物对:上游引物和下游引物的核苷酸序列分别如seq id no.3和12所示,探针的核苷酸序列如seq idno.30所示;hpv68分型引物对:上游引物和下游引物的核苷酸序列分别如seq id no.3和15所示,探针的核苷酸序列如seq id no.37所示;hpv81分型引物对:上游引物和下游引物的核苷酸序列分别如seq id no.4和7所示,探针的核苷酸序列如seq id no.39所示;hpv73分型引物对:上游引物和下游引物的核苷酸序列分别如seq id no.4和13所示,探针的核苷酸序列如seq id no.38所示;hpv59分型引物对:上游引物和下游引物的核苷酸序列分别如seq id no.5和14所示,探针的核苷酸序列如seq id no.35所示;和,hpv43分型引物对:上游引物和下游引物的核苷酸序列分别如seq id no.6和11所示,探针的核苷酸序列如seqid no.28所示。

4、第二方面,还提供了第一方面所述的hpv分型引物探针组合物在制备hpv分型检测产品或非诊断和治疗目的地hpv分型中的应用。

5、第三方面,还提供了一种用于hpv分型检测的试剂盒,该试剂盒包含第一方面所述的hpv分型引物探针组合物。

6、第四方面,还提供了一种非诊断和治疗目的地hpv分型方法,所述hpv分型包括区分hpv的如下型别:hpv6、hpv11、hpv16、hpv18、hpv26、hpv31、hpv33、hpv35、hpv39、hpv42、hpv43、hpv45、hpv51、hpv52、hpv53、hpv56、hpv58、hpv59、hpv66、hpv68、hpv73、hpv81和hpv82,所述hpv分型方法包括:

7、(a)获取第一方面中所述的hpv分型引物探针组合物中各引物对扩增对应型别hpv的tm值温度范围。

8、(b)使用第一方面所述的hpv分型引物探针组合物或第三方面所述的试剂盒扩增待测样本,且对应型别的tm值范围重合的引物对分配至不同的荧光本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种HPV分型引物探针组合物,其特征在于,包括如下引物对中的至少一对:

2.根据权利要求1所述的HPV分型引物探针组合物,其特征在于,每个探针分别独立的修饰有发光基团和淬灭基团;

3.根据权利要求1所述的HPV分型引物探针组合物,其特征在于,至少一个引物对中的探针,存在至少一个修饰的脱氧核苷酸;

4.根据权利要求1所述的HPV分型引物探针组合物,其特征在于,还包括用于检测内标的引物对;

5.根据权利要求1所述的HPV分型引物探针组合物,其特征在于,上游引物为限制性引物,下游引物为非限制性引物;

6.根据权利要求1~5任一项所述的HPV分型引物探针组合物,其特征在于,包括第一引物探针组合物和/或第二引物探针组合物;

7.权利要求1~6任一项所述的HPV分型引物探针组合物在制备HPV分型检测产品或非诊断和治疗目的地HPV分型中的应用。

8.用于HPV分型检测的试剂盒,其特征在于,包含权利要求1~6任一项所述的HPV分型引物探针组合物;

9.非诊断和治疗目的地HPV分型方法,其特征在于,所述HPV分型包括区分HPV的如下型别:HPV6、HPV11、HPV16、HPV18、HPV26、HPV31、HPV33、HPV35、HPV39、HPV42、HPV43、HPV45、HPV51、HPV52、HPV53、HPV56、HPV58、HPV59、HPV66、HPV68、HPV73、HPV81和HPV82,所述HPV分型方法包括:

10.根据权利要求9所述的HPV分型方法,其特征在于,HPV18分型引物对对应的Tm值范围是54.5~57.5℃;和/或,HPV66分型引物对对应的Tm值范围是60.5~63.5℃;和/或,HPV53分型引物对对应的Tm值范围是56.5~59.5℃;和/或,HPV35分型引物对对应的Tm值范围是62.5~65.5℃;和/或,HPV26分型引物对对应的Tm值范围是67.5~70.5℃;和/或,HPV52分型引物对对应的Tm值范围是44.5~47.5℃;和/或,HPV11分型引物对对应的Tm值范围是52.5~55.5℃;和/或,HPV81分型引物对对应的Tm值范围是60.5~63.5℃;和/或,HPV59分型引物对对应的Tm值范围是66.5~69.5℃;和/或,HPV43分型引物对对应的Tm值范围是43.5~48.5℃;和/或,HPV16分型引物对对应的Tm值范围是64.0~70.0℃;和/或,HPV33分型引物对对应的Tm值范围是52.5~55.5℃;和/或,HPV51分型引物对对应的Tm值范围是58.5~61.5℃;和/或,HPV68分型引物对对应的Tm值范围是41.5~44.5℃;和/或,HPV73分型引物对对应的Tm值范围是53.5~56.5℃;和/或,HPV31分型引物对对应的Tm值范围是62.5~67.5℃;和/或,HPV45分型引物对对应的Tm值范围是43.5~46.5℃;和/或,HPV58分型引物对对应的Tm值范围是50.5~53.5℃;和/或,HPV82分型引物对对应的Tm值范围是57.5~60.5℃;和/或,HPV39分型引物对对应的Tm值范围是64.5~69.5℃;和/或,HPV6分型引物对对应的Tm值范围是51.5~56.5℃;和/或,HPV56分型引物对对应的Tm值范围是58.5~61.5℃;和/或,HPV42分型引物对对应的Tm值范围是67.5~72.5℃。

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【技术特征摘要】

1.一种hpv分型引物探针组合物,其特征在于,包括如下引物对中的至少一对:

2.根据权利要求1所述的hpv分型引物探针组合物,其特征在于,每个探针分别独立的修饰有发光基团和淬灭基团;

3.根据权利要求1所述的hpv分型引物探针组合物,其特征在于,至少一个引物对中的探针,存在至少一个修饰的脱氧核苷酸;

4.根据权利要求1所述的hpv分型引物探针组合物,其特征在于,还包括用于检测内标的引物对;

5.根据权利要求1所述的hpv分型引物探针组合物,其特征在于,上游引物为限制性引物,下游引物为非限制性引物;

6.根据权利要求1~5任一项所述的hpv分型引物探针组合物,其特征在于,包括第一引物探针组合物和/或第二引物探针组合物;

7.权利要求1~6任一项所述的hpv分型引物探针组合物在制备hpv分型检测产品或非诊断和治疗目的地hpv分型中的应用。

8.用于hpv分型检测的试剂盒,其特征在于,包含权利要求1~6任一项所述的hpv分型引物探针组合物;

9.非诊断和治疗目的地hpv分型方法,其特征在于,所述hpv分型包括区分hpv的如下型别:hpv6、hpv11、hpv16、hpv18、hpv26、hpv31、hpv33、hpv35、hpv39、hpv42、hpv43、hpv45、hpv51、hpv52、hpv53、hpv56、hpv58、hpv59、hpv66、hpv68、hpv73、hpv81和hpv82,所述hpv分型方法包括:

10.根据权利要求9所述的hpv分型方法,其特征在于,hpv18分型引物对对应的tm值范围是54.5~57.5℃;和/或,hpv66...

【专利技术属性】
技术研发人员:郑业焕曹雅倩高歌董垚欣付光宇吴学炜
申请(专利权)人:郑州安图生物工程股份有限公司
类型:发明
国别省市:

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