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【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于基因工程,涉及引物对,具体涉及鉴定白榆与榔榆种质的引物对。
技术介绍
1、白榆(ulmus pumila l.)与榔榆(ulmus parvifolia)是榆科(ulmaceae)榆属(ulmus l.)乔木,是中国分布比较广泛的乡土阔叶树种。榆属有30多个种,产北半球。我国有25种6变种,分布遍及全国,以长江流域以北较多。
2、白榆与榔榆均为喜光树种,根系发达,抗性强,是生态环境恶劣区重要的保土固沙的优良树种;翅果可食(含油率为20%~40%),材质优良,是医药和轻、化工业的重要原料树种;枝叶耐修剪,观赏性高,被广泛用于园林植物造型。因此,白榆与榔榆是集生态、经济和观赏价值于一体的多功能树种。
3、在实现本专利技术过程中,专利技术人发现现有技术中至少存在如下技术问题中的一个问题:
4、我国白榆与榔榆种质资源丰富,白榆与榔榆除了开花时间有明显差异(白榆春季开花,榔榆秋季开花)外,其它表型性状相似,较难区分,这为种质早期鉴定带来困难。
技术实现思路
1、鉴于此,本专利技术目的在于提供一种利用转录组测序的ssr分子标记,以快速鉴定白榆与榔榆种质。
2、专利技术人通过长期的探索和尝试,以及多次的实验和努力,不断的改革创新,为解决以上技术问题,本专利技术提供的技术方案是,提供一种鉴定白榆或榔榆种质的引物对,所述引物对为下列引物对中的一对或多对:
3、ulmus_p104:
4、上游引物:5’-ccccat
5、下游引物:5’-cgccctttgacggttggata-3’;
6、ulmus_p40:
7、上游引物:5’-gccagttgggtggatcaaga-3’;
8、下游引物:5’-gtggggatgcgagagaacaa-3’。
9、本专利技术还提供了一种所述引物对的应用,用于鉴定白榆或榔榆种质;
10、所述引物对为ulmus_p104:
11、扩增产物片段大小为212bp的样本为榔榆;
12、扩增产物含有片段大小为209bp的样本为白榆;
13、所述引物对为ulmus_p40:
14、扩增产物片段大小为253bp的样本为榔榆;
15、扩增产物片段大小为241~251bp的样本为白榆。
16、本专利技术还公开了一种利用所述引物对鉴定白榆与榔榆种质的方法,鉴定步骤如下:
17、步骤s1:采集待测白榆或榔榆新鲜组织样本,提取组织样本dna;
18、步骤s2:以步骤s1提取的dna为模板,使用所述引物对进行pcr扩增;
19、步骤s3:电泳检测扩增产物;
20、步骤s4:根据检测结果判定待检样本为白榆或榔榆;
21、所述引物对为ulmus_p104:
22、扩增产物片段大小为212bp的样本为榔榆;
23、扩增产物含有片段大小为209bp的样本为白榆;
24、所述引物对为ulmus_p40:
25、扩增产物片段大小为253bp的样本为榔榆;
26、扩增产物片段大小为241~251bp的样本为白榆。
27、根据本专利技术方法的一个实施方式,所述组织样本为幼嫩叶片。
28、根据本专利技术方法的一个实施方式,所述电泳为毛细管电泳或凝胶电泳。
29、根据本专利技术方法的一个实施方式,所述毛细管电泳具体为:取步骤s2所述pcr产物0.1μl稀释至1μl,与甲酰胺与分子量内标100:1混合液15μl混匀后加入pcr板,95℃变性5min,4℃冷却后离心,之后上机检测。
30、根据本专利技术方法的一个实施方式,所述步骤s4中:对步骤s3所得原始数据进行分析,将各泳道内分子量内标的位置与各样品峰值的位置做比较分析,得到片段大小。
31、根据本专利技术方法的一个实施方式,所述步骤s4还包括根据原始位点数据,计算遗传距离矩阵,根据gs值矩阵,利用相似系数法构建系统发育树。
32、与现有技术相比,上述技术方案中的一个技术方案具有如下优点:
33、a)本专利技术利用转录组测序的ssr分子标记鉴定白榆与榔榆种质资源,有利于促进白榆与榔榆良种选育,加快优良种质的利用进程。
34、b)本专利技术特异性引物分别对榔榆和白榆组织进行扩增,两者产物长度差异显著,表明这些特异性引物能够有效鉴定白榆与榔榆种质。
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1.一种鉴定白榆或榔榆种质的引物对,其特征在于,所述引物对为下列引物对中的一对或多对:
2.一种权利要求1所述引物对的应用,其特征在于,用于鉴定白榆或榔榆种质;
3.一种利用权利要求1所述引物对鉴定白榆与榔榆种质的方法,其特征在于,鉴定步骤如下:
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述组织样本为幼嫩叶片。
5.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述电泳为毛细管电泳或凝胶电泳。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述毛细管电泳具体为:取步骤S2所述PCR产物0.1μL稀释至1μL,与甲酰胺与分子量内标100:1混合液15μL混匀后加入PCR板,95℃变性5min,4℃冷却后离心,之后上机检测。
7.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述步骤S4中:对步骤S3所得原始数据进行分析,将各泳道内分子量内标的位置与各样品峰值的位置做比较分析,得到片段大小。
8.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述步骤S4还包括根据原始位点数据,计算遗传距离矩阵,根据GS值矩阵,利用相似系数法构
...【技术特征摘要】
1.一种鉴定白榆或榔榆种质的引物对,其特征在于,所述引物对为下列引物对中的一对或多对:
2.一种权利要求1所述引物对的应用,其特征在于,用于鉴定白榆或榔榆种质;
3.一种利用权利要求1所述引物对鉴定白榆与榔榆种质的方法,其特征在于,鉴定步骤如下:
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述组织样本为幼嫩叶片。
5.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述电泳为毛细管电泳或凝胶电泳。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述毛细管...
【专利技术属性】
技术研发人员:代剑峰,郑聪慧,王玉忠,徐振华,张苗苗,徐文凯,孙然,王桂鑫,
申请(专利权)人:河北省林业和草原科学研究院,
类型:发明
国别省市:
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