【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于生物分子的，具体涉及一种用于判定鸡性别的nipbl基因和应用。
技术介绍
1、由于不同种禽在生产过程中具有明显的性别偏好性，开发简易、便捷的性别鉴定技术具有重要的意义。目前，在家禽生产中，主要通过羽色、羽速等伴性遗传的表型进行性别鉴定，但其应用范围较窄，仅限于特定的一些品种。翻肛鉴别必须在出雏1日龄进行，对鸡苗刺激较大，并且由于鉴定难度大，劳动强度高，准确程度不高，常常需要大量的人力和物力。因此，开发一种简易、便捷、低成本的鸡性别鉴定方法具有广泛的应用前景。
2、大多数哺乳动物的性染色体系统为xx/xy型，xy异型配子发育形成雄性，xx同型配子发育形成雌性。在这类动物中，位于y染色体的sry基因能够调控性别决定的过程，基于该基因在x和y染色体上的不同分布，有中国专利cn1664110a公开了一种利用pcr技术扩增sry基因序列来鉴别哺乳动物性别的方法。与哺乳动物不同，鸟类的性染色体系统为zz/zw型，zw异型配子发育形成雌性，而zz同型配子发育形成雄性，正好与哺乳动物的性染色体控制性别发育模式相反。目前对鸡的雌雄鉴定的分子方法主要是基于chd1基因序列，该基因在禽类z、w染色体上均有分布，并且因进化速率不同导致chd1-z和chd1-w长度不同，从pcr扩增的长度可以判断禽类雌雄性别。利用chd1基因，国内外已有研究针对包括鸡在内的珍稀禽类进行了性别分子检测探索，并且通过改进特异性引物序列，进一步利用该基因鉴定鸽子、鹌鹑和鹦鹉等禽类性别（中国专利cn101962677a）。因此，基于相同基因在不同性染色
技术实现思路
1、针对上述问题，本专利技术的目的在于提供一种用于判定鸡性别的nipbl基因和应用。
2、本专利技术的
技术实现思路
如下：
3、本专利技术提供了一种用于判定鸡性别的分子标记，所述分子标记为鸡z染色体与w染色体上的nipbl基因之间一段相差长606bp的核苷酸序列，其序列如seq id no.1所示；
4、存在缺失seq id no.1序列片段的为雌性个体，不存在缺失seq id no.1序列片段的为雄性个体；
5、所述z染色体上nipbl基因在ncbi数据库中的基因登录号（gene id）为427439，序列范围：11847125-12006549；
6、所述w染色体上nipbl基因在ncbi数据库中的基因登录号为427025，序列范围：5323305-5482338。
7、本专利技术还提供了一种用于判定鸡性别的分子标记的应用，所述分子标记的核苷酸序列如seq id no.1所示，通过基因序列测序，存在缺失seq id no.1序列片段的为雌性个体（zw型染色体），不存在缺失seq id no.1序列片段的为雄性个体（zz型染色体）。
8、本专利技术还提供了一种用于判定鸡性别的基因片段，所述基因片段位于鸡染色体的nipbl基因上，其在鸡z染色体上的核苷酸序列如seq id no.2所示，其在w染色体上核苷酸序列如seq id no.3所示。
9、本专利技术还提供了一种用于判定鸡性别的基因片段的应用，通过基因序列测序，测得序列仅含seq id no.2的判定为雄性个体，测得序列含有seq id no.2和seq id no.3的判定为雌性个体。
10、本专利技术还提供了一种用于判定鸡性别的分子标记的引物对，所述引物对的正向引物和反向引物，其核苷酸序列分别如seq id no.4和seq id no.5所示，用于扩增上述基因片段。
11、本专利技术还提供了一种判定鸡性别的方法，包括如下步骤：
12、1）提取待测鸡个体的基因组dna；
13、2）以待测的基因组dna为模板，采用上述引物对进行pcr扩增；
14、3）将pcr产物经琼脂糖凝胶电泳，根据带型判断性别，当为单一条带时，判定检测个体为雄性，当为双条带时，判定检测个体为雌性；
15、所述pcr的反应体系：2x pcr taq master mix 12.5 μl、正向、反向引物各0.5μl、dna模板 200ng、ddh2o加至25 μl；
16、所述pcr的反应程序：
17、94℃预变性30sec，98℃变性10sec、46-62℃退火30sec、72℃延伸1min、循环30次，72℃最终延伸2min。
18、所述单一条带的序列长度为1009bp，如seq id no.2所示；
19、所述双条带的序列长度分别为1009bp和403bp，分别如seq id no.2和seq idno.3所示。
20、本专利技术还提供了一种判定鸡性别的检测产品，所述检测产品包括检测试剂或试剂盒；
21、所述检测产品的组成包括上述引物对。
22、本专利技术的有益效果如下：
23、本专利技术的用于判定鸡性别的分子标记，其为nipbl基因在鸡z和w染色体上一段相差606bp的片段，也为w染色体上的缺失片段，通过检测序列情况，能够快速、有效地鉴定鸡性别，存在缺失该分子标记序列片段的为雌性个体，不存在缺失该分子标记序列片段的为雄性个体；本专利技术还提供了特异性引物，通过pcr扩增技术以及琼脂糖凝胶电泳，条带清晰，即可准确判定鸡性别，该方法技术难度小，操作简便，准确性高，可以有效鉴定雏鸡或外观上难于区分鸡的性别，对于雌雄外貌差异小的品种鉴定具有实际意义，本专利技术的技术应用性强、重复性好，可以准确鉴别禽类性别，具有广泛的应用前景，通过早期胚胎性别鉴定，实现不同性别家禽的专业化饲养，优化繁殖群体结构，提高养殖效率和经济效益。
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1.一种用于判定鸡性别的分子标记，其特征在于，所述分子标记为鸡Z染色体与W染色体上的NIPBL基因之间一段相差长606bp的核苷酸序列，其序列如SEQ ID NO.1所示。
2.根据权利要求1所述的用于判定鸡性别的分子标记，其特征在于，所述Z染色体上NIPBL基因在NCBI数据库中的基因登录号为427439，序列范围：11847125-12006549。
3.根据权利要求1所述的用于判定鸡性别的分子标记，其特征在于，所述W染色体上NIPBL基因在NCBI数据库中的基因登录号为427025，序列范围：5323305-5482338。
4.一种权利要求1所述的用于判定鸡性别的分子标记的应用，其特征在于，所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，通过对鸡染色体的基因序列测序，存在缺失SEQ IDNO.1序列片段的为雌性个体，不存在缺失SEQ ID NO.1序列片段的为雄性个体。
5.一种用于判定鸡性别的基因片段，其特征在于，所述基因片段位于鸡染色体的NIPBL基因上，其在鸡Z染色体上的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示，其
6.一种权利要求5所述的用于判定鸡性别的基因片段的应用，其特征在于，通过对鸡染色体的基因序列测序，测得序列仅含SEQ ID NO.2的判定为雄性个体，测得序列含有SEQ IDNO.2和SEQ ID NO.3的判定为雌性个体。
7.一种用于判定鸡性别的分子标记的引物对，其特征在于，所述引物对的正向引物和反向引物，其核苷酸序列分别如SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.5所示，用于扩增权利要求5所述基因片段。
8.一种判定鸡性别的方法，其特征在于，包括如下步骤：
9.根据权利要求8所述的判定鸡性别的方法，其特征在于，所述单一条带的序列长度为1009bp，如SEQ ID NO.2所示；
10.一种判定鸡性别的检测产品，其特征在于，所述检测产品包括检测试剂或试剂盒；
...【技术特征摘要】
1.一种用于判定鸡性别的分子标记，其特征在于，所述分子标记为鸡z染色体与w染色体上的nipbl基因之间一段相差长606bp的核苷酸序列，其序列如seq id no.1所示。
2.根据权利要求1所述的用于判定鸡性别的分子标记，其特征在于，所述z染色体上nipbl基因在ncbi数据库中的基因登录号为427439，序列范围：11847125-12006549。
3.根据权利要求1所述的用于判定鸡性别的分子标记，其特征在于，所述w染色体上nipbl基因在ncbi数据库中的基因登录号为427025，序列范围：5323305-5482338。
4.一种权利要求1所述的用于判定鸡性别的分子标记的应用，其特征在于，所述分子标记的核苷酸序列如seq id no.1所示，通过对鸡染色体的基因序列测序，存在缺失seq idno.1序列片段的为雌性个体，不存在缺失seq id no.1序列片段的为雄性个体。
5.一种用于判定鸡性别的基因片段，其特征在于，所...
【专利技术属性】
技术研发人员：郭晓莉，罗成龙，李建波，孙佳，舒鼎铭，刘子敬，邹娴，计坚，
申请(专利权)人：广东省农业科学院动物科学研究所，
类型：发明
国别省市：
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