System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 一种急性髓系白血病预后评估的生物标志物、模型、系统及其应用技术方案_技高网

一种急性髓系白血病预后评估的生物标志物、模型、系统及其应用技术方案

技术编号:44389660 阅读:2 留言:0更新日期:2025-02-25 10:05
本发明专利技术提供了一种急性髓系白血病预后评估的生物标志物、模型、系统及其应用。本发明专利技术以GZMB、OPTN、DNM1、MPO和GZMH基因组成的生物标志物构建了评估急性髓系白血病风险预后模型。本发明专利技术提取急性髓系白血病患者的骨髓液有核细胞RNA,通过定量检测的方式检测上述5种基因的相对表达量,代入构建的风险预测模型,根据得分高低进行风险预后评估。本发明专利技术检测成本低、技术门槛低、预测表现更优、具有独立预后评估价值。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于基因技术及生物医学,尤其涉及一种急性髓系白血病预后评估的生物标志物、模型、系统及其应用


技术介绍

1、急性髓系白血病(acute myeloidleukemia,aml),是一种高度侵袭性且具有高度异质性的血液系统恶性肿瘤,其病因在于骨髓祖细胞的克隆性恶性增殖。由于其快速进展及复杂的分子病理机制,aml的治疗和管理一直面临巨大挑战。大多数aml患者在早期缺乏明显症状,通常以骨髓衰竭等急性并发症为主要表现,预后较差。目前,化疗和干细胞移植仍然是aml的主要治疗手段。尽管近年来随着靶向治疗、免疫治疗(包括激酶抑制剂、单克隆抗体、嵌合抗原受体t细胞(car-t)等)的发展,aml的治疗取得了显著进步,但肿瘤的高度异质性及复杂的分子病理背景仍导致其复发、耐药以及治疗相关毒性,严重影响了患者的长期生存。因此,改进aml患者的预后评估和风险分层对于优化治疗决策至关重要。

2、传统的aml预后评估多依赖于患者的免疫表型、细胞遗传学和分子特征等因素。其中,细胞遗传学和分子标志物的异常是目前最重要的预后评估手段。随着高通量测序(如新一代测序,ngs)的普及,aml的分子特征得到了更为深入的研究,常见的基因突变包括flt3、npm1、dnmt3a、tet2、idh1/2、cebpa、runx1和tp53等。一些分子异常已显示出明确的预后价值,如cebpa双等位基因突变、npm1突变且flt3-itd阴性或低水平提示良好预后,而flt3-itd阳性、tp53突变等提示预后不良。然而,这些预后模型通常依赖复杂的分子检测技术,如ngs,但这些技术的广泛应用受到成本和技术普及度的限制,尤其在经济条件有限的地区,难以成为常规检测手段。

3、在临床实践中,有部分aml患者尽管在常规分子遗传学检测中未发现显著的突变或异常,但预后仍然较差。这提示除了已知的分子遗传学改变外,可能还存在其他尚未明确的预后相关因素。目前的分子预后模型大多基于明确的基因突变或染色体畸变,而对那些未表现出常规分子遗传学改变的患者,缺乏有效的风险分层手段。本模型尤其关注在没有明显分子遗传学改变的患者中pf4相关的5个基因的表达模式与预后的关系。因此,该模型不仅能够为那些具有已知基因突变的患者提供预后评估,还能对那些无常规分子遗传学改变的患者提供更具指导意义的预后预测。通过这种基因表达水平的分析,能够进一步细化aml患者的风险分层,弥补传统分子遗传学检测的局限性。


技术实现思路

1、有鉴于此,本专利技术的目的在于提供一种急性髓系白血病预后评估的生物标志物、模型、系统及其应用,该生物标志物构建的预测模型可精准预测患者预后,指导临床治疗。

2、为了实现上述专利技术目的,本专利技术提供了以下技术方案:

3、本专利技术提供了一种用于急性髓系白血病风险预后评估的生物标志物,所述生物标志物由gzmb、optn、dnm1、mpo和gzmh基因组成。

4、本专利技术还提供了所述的生物标志物在制备急性髓系白血病风险预后评估产品中的应用。

5、本专利技术还提供一种急性髓系白血病预后评估模型,所述急性髓系白血病预后评估模型以所述生物标志物的表达水平为输入变量,按以下公式计算风险评分:风险评分=e^((-0.08062789)*log2(mpo相对表达量)+(0.05275965)*log2(opt n相对表达量)+(0.14933799)*log2(gzmb相对表达量)+(0.04348332)*log2(gzmh相对表达量)+(-0.13506054)*log2(dnm1相对表达量)+0.6812835)。

6、本专利技术还提供了一种急性髓系白血病预后风险评估的系统,所述系统包括计算单元,所述计算单元以所述急性髓系白血病预后评估模型计算风险评分;所述系统还包括检测单元、信息获取单元和评估单元;所述检测单元用于检测所述生物标志物的表达水平;所述信息获取单元用于执行获取受试者检测信息的操作,所述检测信息包括所述生物标志物的表达水平;所述评估单元用于执行根据所述计算单元的计算结果判断受试者前列腺癌预后的风险概率,给出合理化预防和治疗建议。

7、优选的,所述生物标志物的表达水平采用荧光定量pcr测定。

8、优选的,所述荧光定量pcr测定涉及的引物包括gzmb基因的正反向引物,optn基因的正反向引物,dnm1基因的正反向引物,mpo基因的正反向引物,gzmh基因的正反向引物,gapdh基因的正反向引物。

9、优选的,所述荧光定量pcr测定涉及pcr扩增体系为:2×quantinova sybr greenpcr mastermix 10μl,正向引物0.7pmol,反向引物0.7pmol,模版cdna 10ng,rnaase-free水2μl。

10、优选的,所述荧光定量pcr测定涉及pcr扩增程序为:95℃×2min;95℃×5s,60℃×10s,循环40次;40次循环后进入4℃状态。

11、本专利技术还提供所述的急性髓系白血病预后评估模型或所述的急性髓系白血病预后评估的系统在制备急性髓系白血病风险预后评估产品中的应用。

12、与现有技术相比,本专利技术具有如下有益效果:

13、本专利技术构建的风险预后评估模型具有3个优点:(1)检测成本低、技术门槛低:只需要针对gzmb、optn、dnm1、mpo和gzmh这5个基因进行定量检测,显著降低检测成本。对于不具备细胞遗传学检测体系的基层医院,只需具备定量pcr技术即可应用该模型进行风险评估,具有广泛的临床应用性和推广价值。(2)预测表现更优:用该预测模型计算的风险评分同calgb细胞遗传学风险等级采用决策曲线分析法(decision curveanalysis,dca)进行了比较,结果提示利用本模型进行预后评估后相较于使用细胞遗传学风险水平有着更优的预测表现。(3)具有独立预后评估价值:基于tcga-aml数据集,通过多因素cox回归分析,发现患者风险评分是独立于患者细胞遗传学风险等级、年龄以及是否进行化疗以外的独立危险因素。

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【技术保护点】

1.一种急性髓系白血病预后评估的生物标志物,其特征在于,所述生物标志物由GZMB、OPTN、DNM1、MPO和GZMH基因组成。

2.如权利要求1所述的生物标志物在制备急性髓系白血病风险预后评估产品中的应用。

3.一种急性髓系白血病预后评估模型,其特征在于,所述急性髓系白血病预后评估模型以权利要求1所述生物标志物的表达水平为输入变量,按以下公式计算风险评分:风险评分=e^((-0.08062789)*log2(MPO相对表达量)+(0.05275965)*log2(OPTN相对表达量)+(0.14933799)*log2(GZMB相对表达量)+(0.04348332)*log2(GZMH相对表达量)+(-0.13506054)*log2(DNM1相对表达量)+0.6812835)。

4.一种急性髓系白血病预后评估的系统,其特征在于,所述系统包括计算单元,所述计算单元利用权利要求3所述急性髓系白血病预后评估模型计算风险评分;

5.如权利要求4所述的系统,其特征在于,所述生物标志物的表达水平采用荧光定量PCR测定。

6.如权利要求5所述的系统,其特征在于,所述荧光定量PCR测定涉及的引物包括GZMB基因的正反向引物、OPTN基因的正反向引物、DNM1基因的正反向引物、MPO基因的正反向引物、GZMH基因的正反向引物和GAPDH基因的正反向引物。

7.如权利要求5所述的系统,其特征在于,所述荧光定量PCR测定涉及PCR扩增体系为:2×QuantiNova SYBR Green PCR master Mix 10μl,正向引物0.7pmol,反向引物0.7pmol,模版cDNA 10ng,RNAase-Free水2μl。

8.如权利要求5所述的系统,其特征在于,所述荧光定量PCR测定涉及PCR扩增程序为:95℃×2min;95℃×5s,60℃×10s,循环40次;40次循环后进入4℃状态。

9.如权利要求3所述的急性髓系白血病预后评估模型或权利要求4-8任一项所述的急性髓系白血病预后评估的系统在制备急性髓系白血病风险预后评估产品中的应用。

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【技术特征摘要】

1.一种急性髓系白血病预后评估的生物标志物,其特征在于,所述生物标志物由gzmb、optn、dnm1、mpo和gzmh基因组成。

2.如权利要求1所述的生物标志物在制备急性髓系白血病风险预后评估产品中的应用。

3.一种急性髓系白血病预后评估模型,其特征在于,所述急性髓系白血病预后评估模型以权利要求1所述生物标志物的表达水平为输入变量,按以下公式计算风险评分:风险评分=e^((-0.08062789)*log2(mpo相对表达量)+(0.05275965)*log2(optn相对表达量)+(0.14933799)*log2(gzmb相对表达量)+(0.04348332)*log2(gzmh相对表达量)+(-0.13506054)*log2(dnm1相对表达量)+0.6812835)。

4.一种急性髓系白血病预后评估的系统,其特征在于,所述系统包括计算单元,所述计算单元利用权利要求3所述急性髓系白血病预后评估模型计算风险评分;

5.如权利要求4所述的系统,其特征在于,所述...

【专利技术属性】
技术研发人员:闵亚楠郝龙
申请(专利权)人:济宁医学院附属医院
类型:发明
国别省市:

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