【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及大麦分子遗传育种，特别是涉及与大麦地上部干物质氮素生产效率qtl紧密连锁的分子标记及其应用。
技术介绍
1、氮是作物生长发育中最重要的营养元素之一。土壤中的氮素可用性对植物的生长发育和生产至关重要，与其他元素不同，氮不能从岩石直接释放到土壤中，氮的合成生产需要大量能源，到本世纪中叶，预计将消耗全球能源供应的2％左右。维持农作物高产在很大程度上仍依赖于长期大量施氮，不幸的是，并非施加的所有氮肥都能被植物吸收利用，多数未被吸收的氮肥会沉积在田间土壤中，通过淋容而损失掉。不合理施用氮肥，尤其是过量施用会导致许多环境问题，比如水污染、土壤污染，温室气体排放等。随着全球粮食需求的增加和种植面积的减少，人类主张以更低的环境成本生产更多的粮食，而作物氮效率的改良与提高则是一个重点研究领域。
2、大麦(hordeum vulgarel.)是全球第四大最重要的谷物，是人类生命中碳水化合物和蛋白质的重要来源。大麦产量的提高依赖于氮的利用效率和氮从营养器官向籽粒的转移。在现代农业育种过程中，由于大量优势等位基因的丢失，栽培大麦的抗逆性下降。然而，野生大麦具有丰富的遗传多样性，对生物和非生物胁迫的抗逆性更强。从野生大麦中鉴定地上部干物质氮素生产效率的基因资源对于培育高产大麦和减少氮肥施用来说是至关重要的。
3、单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，snp)标记指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的dna序列多态性，具有数量多、分布广泛、在单个基因和整个基因组中分布不均匀以
4、竞争性等位基因特异性pcr技术(kompetitive allele specific pcr，kasp)是由lgc公司(laboratory ofthe government chemist)研发的具有低成本、高通量特点的新型基因分型技术，通过引物末端碱基的特异匹配来对snp以及in del位点进行精准的双等位基因分型，在水稻、小麦、大麦、大豆等作物的分子标记辅助选择中得到广泛应用。
5、近年来，已有关于大麦氮素相关性状qtl定位的相关报道。目前与地上部干物质氮素生产效率性状相关且可用于实际分子育种的紧密连锁的分子标记较少，因此进一步鉴定到更具实用价值的地上部干物质氮素生产效率qtl或基因，利用分子生物学技术，选择适宜地上部干物质氮素生产效率的大麦株系以及利用分子生物学技术进行大麦育种具有重要的指导意义。
技术实现思路
1、本专利技术的目的是提供与大麦地上部干物质氮素生产效率qtl紧密连锁的分子标记及其应用，以解决上述现有技术存在的问题。本专利技术的大麦地上部干物质氮素生产效率qtl为qanutedm.sau-3h，位于3h染色体上，具有显著提高大麦地上部干物质氮素生产效率的作用，该分子标记与该qtl紧密连锁，能够用于分子标记辅助检测qtl和分子育种，提高检测效率和育种效率。
2、为实现上述目的，本专利技术提供了如下方案：
3、本专利技术提供与大麦地上部干物质氮素生产效率qtl qanutedm.sau-3h紧密连锁的分子标记，所述分子标记与所述大麦地上部干物质氮素生产效率qtl qanutedm.sau-3h共定位于大麦基因组的3h染色体长臂上；
4、所述分子标记位于如seq id no.1所示核苷酸序列的第121位碱基处，存在a/g突变。
5、优选的，所述大麦地上部干物质氮素生产效率qtl qanutedm.sau-3h位于3h染色体上624.10-637.56mbp区域。
6、本专利技术还提供一种上述分子标记在如下任一项中的应用：
7、a1.检测大麦地上部干物质氮素生产效率qtl qanutedm.sau-3h；
8、a2.早期鉴定或筛选地上部干物质氮素生产效率高的大麦品种；
9、a3.大麦分子遗传育种；
10、a4.大麦种质资源改良；
11、a5.对大麦地上部干物质氮素生产效率相关基因进行遗传分析和精细定位；
12、所述大麦地上部干物质氮素生产效率qtl qanutedm.sau-3h位于3h染色体上624.10-637.56mbp区域。
13、本专利技术还提供一种针对上述分子标记的kasp引物组，所述kasp引物组包括如seqid no.2-4所示的引物。
14、本专利技术还提供一种上述kasp引物组在如下任一项中的应用：
15、b1.检测大麦地上部干物质氮素生产效率qtl qanutedm.sau-3h；
16、b2.早期鉴定或筛选高地上部干物质氮素生产效率的大麦品种；
17、b3.大麦分子遗传育种；
18、b4.大麦种质资源改良；
19、b5.对大麦地上部干物质氮素生产效率相关基因进行遗传分析和精细定位；
20、b6.制备检测大麦地上部干物质氮素生产效率qtl qanutedm.sau-3h的试剂、试剂盒或芯片；
21、所述大麦地上部干物质氮素生产效率qtl qanutedm.sau-3h位于3h染色体上624.10-637.56mbp区域。
22、本专利技术还提供一种检测大麦地上部干物质氮素生产效率qtl qanutedm.sau-3h的试剂盒，所述试剂盒中包含上述kasp引物组；所述大麦地上部干物质氮素生产效率qtlqanutedm.sau-3h位于3h染色体上624.10-637.56mbp区域。
23、本专利技术还提供一种检测大麦地上部干物质氮素生产效率qtl qanutedm.sau-3h的方法，包括如下步骤：
24、以待测植株的基因组dna作为模板，利用上述kasp引物组进行荧光定量pcr扩增，根据荧光读值结果进行判定；
25、将读取到seq id no.2所标记的荧光基团的植株鉴定为含有大麦地上部干物质氮素生产效率qtl qanutedm.sau-3h的植株；将读取到seq id no.3所标记的荧光基团的植株鉴定为不含有大麦地上部干物质氮素生产效率qtl qanutedm.sau-3h的植株；
26、所述大麦地上部干物质氮素生产效率qtl qanutedm.sau-3h位于3h染色体上624.10-637.56mbp区域。
27、优选的，所述荧光定量pcr的反应体系为：5μl master mix，5ng模板dna，1.4μl混合引物，ddh2o加至总量为10μl；
28、所述混合引物由10ng/μl seq id no.2所示的引物、10ng/μl seq id no.3所示的引物、10ng/μl seq id no.4所示的引物与ddh2o按照体积比6:6:15:23混本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.与大麦地上部干物质氮素生产效率QTL Qanutedm.sau-3H紧密连锁的分子标记，其特征在于，所述分子标记与所述大麦地上部干物质氮素生产效率QTL Qanutedm.sau-3H共定位于大麦基因组的3H染色体长臂上；
2.根据权利要求1所述的分子标记，其特征在于，所述大麦地上部干物质氮素生产效率QTL Qanutedm.sau-3H位于3H染色体上624.10-637.56Mbp区域。
3.一种权利要求1或2所述的分子标记在如下任一项中的应用：
4.一种针对权利要求1或2所述分子标记的KASP引物组，其特征在于，所述KASP引物组包括如SEQ ID NO.2-4所示的引物。
5.一种权利要求4所述的KASP引物组在如下任一项中的应用：
6.一种检测大麦地上部干物质氮素生产效率QTL Qanutedm.sau-3H的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒中包含权利要求4所述的KASP引物组；所述大麦地上部干物质氮素生产效率QTL Qanutedm.sau-3H位于3H染色体上624.10-637.56Mbp区域。
...【技术特征摘要】
1.与大麦地上部干物质氮素生产效率qtl qanutedm.sau-3h紧密连锁的分子标记，其特征在于，所述分子标记与所述大麦地上部干物质氮素生产效率qtl qanutedm.sau-3h共定位于大麦基因组的3h染色体长臂上；
2.根据权利要求1所述的分子标记，其特征在于，所述大麦地上部干物质氮素生产效率qtl qanutedm.sau-3h位于3h染色体上624.10-637.56mbp区域。
3.一种权利要求1或2所述的分子标记在如下任一项中的应用：
4.一种针对权利要求1或2所述分子标记的kasp引物组，其特征在于，所述kasp引物组包括如seq id no.2-4所示的引物。
5.一种权利要求4所述的kasp引物组在如下任一项中的应用：
6.一种检测大麦地上部干物质氮素生产效率qtl...
【专利技术属性】
技术研发人员：陈光登，曾照勇，许迎港，马建，高雪松，韩春晓，谷涛，陈亮，侯建华，杨玉明，
申请(专利权)人：四川农业大学，
类型：发明
国别省市：
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