【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于生物，具体涉及一种用于评价黄精质量的微生物标志物组合物及应用。
技术介绍
1、黄精是多年生草本植物，属于百合科黄精属，其干燥根茎广泛应用于中医临床，具有补益脾胃、润肺止咳、生津止渴等功效。其主要有效成分黄精多糖是黄精药理作用的关键成分，也是药典中规定的含量测定标准，决定了黄精的质量。
2、当前，依据中国药典，黄精的质量评价是通过使用紫外分光光度法(uv-vis)来测定黄精多糖的含量。尽管uv-vis是目前测定黄精有效成分的金标准，但该方法存在一定局限性，包括设备成本高、操作复杂、试剂毒性大、分析过程耗时长等问题，且对于某些化合物的灵敏度较低，可能导致无法准确检测某些成分。因此，迫切需要一种更高效、快捷且安全的替代技术来评估黄精的质量。
3、此外，黄精中的内生菌对其质量可能具有重要的潜在影响。研究表明，黄精中的内生菌种类繁多，代谢活性丰富，这些内生菌通过与宿主植物的相互作用，可能在多个方面对黄精的生长和有效成分的积累产生影响。例如，某些内生菌能够促进黄精的抗病性或改善其对环境的适应能力，从而影响植物的整体健康与生长速度；另外，一些内生菌可能通过合成次生代谢产物，间接参与黄精中有效成分的合成与积累，影响其药理活性和品质稳定性。由于内生菌在植物生长发育中的重要作用，进一步研究其与黄精有效成分积累的关系，对黄精质量控制具有潜在的指导意义。然而，尽管这一领域逐渐受到关注，但目前尚缺乏通过检测内生菌来系统评估黄精质量的研究。
4、本专利技术筛选了特定的黄精微生物作为用于评价黄精质量的微生物标
技术实现思路
1、针对上述技术问题，本专利技术的目的在于提供一种用于评价黄精质量的微生物标志物组合及应用，具体包括以下内容：
2、第一方面，本专利技术提供了一种用于评价黄精质量的微生物标志物组合，所述的微生物标志物组合包括aspergillus，cercophora，escherichia.shigella，mycoplasma，muribaculaceae，pseudomonas，colletotrichum和asaia中的一种或几种。
3、优选地，所述的微生物标志物组合由aspergillus，cercophora，escherichia.shigella，my coplasma，muribaculaceae，pseudomonas，colletotrichum和asaia组成。
4、第二方面，本专利技术提供了上述第一方面所述的微生物标志物组合在评价黄精质量中的应用。
5、第三方面，本专利技术提供了一种上述第一方面所述的微生物标志物组合在制备评价黄精质量的试剂、试剂盒、芯片中的应用。
6、第四方面，本专利技术提供了一种上述第一方面所述的微生物标志物组合在构建评价黄精质量的模型中的应用。
7、第五方面，本专利技术提供了检测上述第一方面所述的微生物标志物组合的试剂在制备评价黄精质量的试剂、试剂盒、芯片中的应用。
8、第六方面，本专利技术提供了检测上述第一方面所述的微生物标志物组合在构建评价黄精质量的模型中的应用。
9、第六方面，本专利技术提供了一种用于评价黄精质量的模型，所述模型构建方法包括：
10、(1)采集黄精样本，按多糖含量划分为质量一般组和质量优质组；其中质量一般组的黄精多糖含量介于药典标准7.0％与14.0％之间；质量优质组的黄精多糖含量则高于14.0％；
11、(2)黄精样本预处理后，提取样本中权利要求1或2所述的微生物标志物组合的基因组dna，检测所述微生物的物种丰度；
12、(3)以不同分组的样本物种丰度矩阵构建随机森林模型进步预测，其中判定质量一般组预测值为0，质量优质组预测值为1，获得评价模型。
13、优选地，所述预处理包括：将黄精样本依次经过清洗、截断、75％乙醇浸泡、5％次氯酸钠浸泡消毒、吸干水分、切小块、于-80℃保存处理。
14、优选地，所述步骤(2)包括：
15、①基因组dna提取；
16、②目的片段pcr扩增：以步骤①提取的基因组dna为模板，根据测序区域的选择，使用带barcode的特异引物，tks gflex dna polymerase进行pcr；进行两轮pcr扩增，电泳检测，磁珠纯化；
17、③文库构建和测序：取纯化过的pcr产物进行qubit定量，调整浓度，使用illuminanovaseq 6000测序平台进行测序，并生成250bp双端reads；
18、④生物信息学分析：数据下机后，首先使用cutadapt软件，将rawdata序列剪切掉引物序列，使用dada2，将上一步合格的双端rawdata进行质量过滤，降噪，拼接及去嵌合体等质控分析，得到代表序列及asv丰度表格；使用qiime 2软件包挑选出各个asv的代表序列后，并将所有16s代表序列与silva(version138)数据库进行比对注释，所有its代表序列与unite数据库进行比对注释。
19、优选地，步骤①所述的基因组dna提取按照常规方法提取。
20、优选地，步骤④所述的质量过滤按照qiime 2(2020.11)默认参数进行，比对注释使用q2-feature-classifier软件默认参数进行分析。
21、优选的，步骤②所述的测序区域包括细菌多样性鉴定对应区域和真菌its多样性鉴定对应区域；所述的细菌多样性鉴定对应区域：16s v3-v4区[引物343f(5’-tacggraggcag cag-3’)和798r(5’-agggtatctaatcct-3’)]，真菌its多样性鉴定对应区域：its[引物its1f(5’-cttggtcatttagaggaagtaa-3’)和its2r(5’-gctgcgttcttcatcgatgc-3’)]。
22、第七方面，本专利技术提供了一种上述第一方面所述的微生物标志物组合的筛选方法，所述方法包括：
23、(1)采集黄精样本，按多糖含量划分为质量一般组和质量优质组；其中质量一般组的黄精多糖含量介于药典标准7.0％与14.0％之间；质量优质组的黄精多糖含量则高于14.0％；
24、(2)黄精样本处理：取步骤(1)得到的样本，经洗净，截断，75％乙醇浸泡及5％次氯酸钠浸泡消毒，吸干水分，切小块，于-80℃保存；
25、(本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种用于评价黄精质量的微生物标志物组合，其特征在于，所述的微生物标志物组合包括Aspergillus，Cercophora，Escherichia.Shigella，Mycoplasma，Muribaculaceae，Pseudom onas，Colletotrichum和Asaia中的一种或几种。
2.如权利要求1所述的微生物标志物组合，其特征在于，所述的微生物标志物组合由Aspergillus，Cercophora，Escherichia.Shigella，Mycoplasma，Muribaculaceae，Pseudomonas，Colletotrichum和Asaia组成。
3.如权利要求1或2所述的微生物标志物组合在评价黄精质量中的应用。
4.如权利要求1或2所述的微生物标志物组合或检测权利要求1或2所述的微生物标志物组合的试剂在制备评价黄精质量的试剂、试剂盒、芯片中的应用，或在构建评价黄精质量的模型中的应用。
5.一种用于评价黄精质量的模型，其特征在于，所述模型构建方法包括：
6.如权利要求5所述的模型，
7.一种用于评价黄精质量的方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：
8.一种用于黄精质量评价的系统，其特征在于，包括：
9.一种计算机设备，包括存储器、处理器及存储在存储器上并可在处理器上运行的计算机程序，其特征在于，所述处理器执行所述程序时使权利要求8所述的系统实现以下步骤，包括：
10.一种计算机可读存储介质，其上存储有如权利要求9所述的计算机设备。
...【技术特征摘要】
1.一种用于评价黄精质量的微生物标志物组合，其特征在于，所述的微生物标志物组合包括aspergillus，cercophora，escherichia.shigella，mycoplasma，muribaculaceae，pseudom onas，colletotrichum和asaia中的一种或几种。
2.如权利要求1所述的微生物标志物组合，其特征在于，所述的微生物标志物组合由aspergillus，cercophora，escherichia.shigella，mycoplasma，muribaculaceae，pseudomonas，colletotrichum和asaia组成。
3.如权利要求1或2所述的微生物标志物组合在评价黄精质量中的应用。
4.如权利要求1或2所述的微生物标志物组合或检测权利要求1或2所述的微...
【专利技术属性】
技术研发人员：陈朋，刘英杰，徐宁，周忠坤，马云浩，赵璠婷，
申请(专利权)人：兰州大学，
类型：发明
国别省市：
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。