【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及家禽育种的，具体地，涉及一种用于鉴定鸡的羽毛性状的检测试剂、方法及应用。
技术介绍
1、粤西卷羽鸡，又称为麒麟鸡，是一种源自中国广东省粤西地区的优质土鸡品种，至今已有840多年历史。该鸡种因其独特的羽毛卷曲而得名，皮肤部分裸露，散热性能佳，具有较强的适应性和良好的生长性能。卷羽鸡的独特卷羽性状，有利于其体表的散热，适合在粤西地区的高温高湿环境气候条件下生长，抗逆性较强，对于培育抗热应激的鸡种具有重要意义。此外，作为地方优良品种，粤西卷羽鸡不仅是当地的重要经济动物，也是文化和饮食的一部分，深受人们喜爱。粤西卷羽鸡的保护和繁育工作正在进行中，以防止遗传资源的流失。因此，有必要建立起能够快速简便鉴定卷羽性状的分子技术。
2、snp是指dna序列中某个单核苷酸的碱基发生变化，而indel则是指dna序列中插入或缺失一个或多个碱基，这些变异可能影响基因功能和表达的调控机制。indel和snp是生物中最常见的基因变异，也是最常用的分子标记，其数量巨大，全基因组覆盖程度高，具有多样性高和遗传稳定性强的特点，因此广泛用于分子育种的标记辅助选择当中。但是，关于鸡的卷羽性状方面的相关位点和鉴定技术，仍然较少，难以满足养殖行业的需求。
技术实现思路
1、为克服现有技术中存在的上述缺陷与不足，本专利技术提供一种用于鉴定鸡的羽毛性状的检测试剂、方法及应用。
2、本专利技术的第一个目的是提供一种组合物在鉴定鸡的羽毛性状中的应用。
3、本专利技术的第二个目的是提
4、本专利技术的第三个目的是提供一种试剂盒。
5、本专利技术的第四个目的是提供上述的检测试剂和/或试剂盒在鉴定鸡的羽毛性状中的应用。
6、本专利技术的第五个目的是提供上述的检测试剂和/或试剂盒在制备鸡的育种产品中的应用。
7、本专利技术的第六个目的是提供一种鉴定鸡的羽毛性状的方法。
8、本专利技术要求保护以下内容：
9、一种组合物在鉴定鸡的羽毛性状中的应用，所述组合物为indel位点和snp位点；
10、所述indel位点位于鸡基因组34号染色体2040242～2040255bp处，缺失的核苷酸序列如seq id no：1所示；
11、所述snp位点位于鸡基因组34号染色体上第2040608位，为g或a多态，其存在gg和aa基因型；
12、所述鸡基因组为ensembl数据库crcg7b版本；
13、所述indel位点为纯合缺失型，且所述snp位点的基因型为aa的个体的羽毛表型为卷羽；
14、所述indel位点为纯合缺失型，且所述snp位点的基因型为gg的个体的羽毛表型为片羽；
15、所述indel位点为纯合野生型或杂合型的个体的羽毛表型为片羽。
16、上述的组合物的检测试剂，所述indel位点的检测试剂为核苷酸序列如seq idno：2～3所示的引物，所述snp位点的检测试剂为核苷酸序列如seq id no：4～5所示的引物。
17、一种试剂盒，所述试剂盒包含上述的检测试剂。
18、优选地，所述试剂盒还含有pcr扩增试剂和ddh2o。
19、上述的检测试剂和/或试剂盒在鉴定鸡的羽毛性状中的应用。
20、上述的检测试剂和/或试剂盒制备鸡的育种产品中的应用。
21、一种鉴定鸡的羽毛性状的方法，用上述的检测试剂检测上述的组合物。
22、作为一种可实施的方式，所述方法包括以下步骤：
23、s1.提取待测样本的基因组dna；
24、s2.用上述的检测试剂对步骤s1得到的基因组dna进行pcr扩增，然后对pcr扩增产物进行测序，得到测序数据；
25、s3.分析步骤s2获得的测序数据，根据上述的组合物，判定待测鸡的羽毛性状。
26、优选地，步骤s1中，所述鸡为粤西卷羽鸡、矮小卷羽鸡、七百弄鸡、矮小鸡、文昌鸡、怀乡鸡、清远麻鸡、胡须鸡，或所述粤西卷羽鸡、矮小卷羽鸡、七百弄鸡、矮小鸡、文昌鸡、怀乡鸡、清远麻鸡、胡须鸡作为亲本的杂交后代。
27、所述indel位点为纯合缺失型，且所述snp位点的基因型为aa，鸡的羽毛表型为卷羽；
28、所述indel位点为纯合缺失型，且所述snp位点的基因型为gg，鸡的羽毛表型为片羽；
29、所述indel位点为纯合野生型或杂合型，鸡的羽毛表型为片羽。
30、作为一种可实施的方式，步骤s2中，所述测序为sanger测序。
31、与现有技术相比，本专利技术具有如下有益效果：
32、本专利技术公开了一种用于鉴定鸡的羽毛性状的检测试剂、方法及应用。本专利技术发现，在ensembl鸡参考基因组crcg7b版本34号染色体的2040242～2040255bp处存在一个indel位点，缺失的核苷酸序列如seq id no：1所示，当该indel位点为纯合野生型或杂合型时，鸡的羽毛表型为片羽；当该indel位点为纯合缺失型时，snp位点g.2040608g>a的基因型为aa型的个体的羽毛表型为卷羽，snp位点g.2040608g>a的基因型为gg的个体的羽毛表型为片羽。这两个位点结合使用可应用于卷羽鸡的早期辅助选择。使用本专利技术的检测试剂对这两个位点进行检测，可以快速、有效和准确地预测出鸡的羽毛表型，从而缩短育种时间和加快育种进程。
本文档来自技高网...【技术保护点】
1.一种组合物在鉴定鸡的羽毛性状中的应用，其特征在于，所述组合物为InDel位点和SNP位点；
2.权利要求1中所述的组合物的检测试剂，其特征在于，所述InDel位点的检测试剂为核苷酸序列如SEQ ID NO：2～3所示的引物，所述SNP位点的检测试剂为核苷酸序列如SEQID NO：4～5所示的引物。
3.一种试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包含权利要求2所述的检测试剂。
4.根据权利要求3所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还含有PCR扩增试剂和ddH2O。
5.权利要求2所述的检测试剂和/或权利要求3～4任一所述的试剂盒在鉴定鸡的羽毛性状中的应用。
6.权利要求2所述的检测试剂和/或权利要求3～4任一所述的试剂盒在制备鸡的育种产品中的应用，其特征在于，所述育种为羽毛性状的分子育种。
7.一种鉴定鸡的羽毛性状的方法，其特征在于，用权利要求2所述的检测试剂检测权利要求1中所述的组合物。
8.根据权利要求7所述的方法，其特征在于，包括以下步骤：
9.根据权利要求8所述的方法，其特征在于，所
10.根据权利要求8所述的方法，其特征在于，步骤S2中，所述测序为Sanger测序。
...【技术特征摘要】
1.一种组合物在鉴定鸡的羽毛性状中的应用，其特征在于，所述组合物为indel位点和snp位点；
2.权利要求1中所述的组合物的检测试剂，其特征在于，所述indel位点的检测试剂为核苷酸序列如seq id no：2～3所示的引物，所述snp位点的检测试剂为核苷酸序列如seqid no：4～5所示的引物。
3.一种试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包含权利要求2所述的检测试剂。
4.根据权利要求3所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还含有pcr扩增试剂和ddh2o。
5.权利要求2所述的检测试剂和/或权利要求3～4任一所述的试剂盒在鉴定鸡的羽毛性状中的应用。
6.权利要求2所述的...
【专利技术属性】
技术研发人员：张梓豪，彭苏城，张丽，林树带，谢婷婷，廖增广，
申请(专利权)人：广东海洋大学，
类型：发明
国别省市：
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