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能特异性识别和检测十足目虹彩病毒1的DNAzyme及其应用制造技术

技术编号:44288965 阅读:1 留言:0更新日期:2025-02-14 22:23
本发明专利技术涉及病原性微生物检测技术领域,具体公开了能特异性识别和检测十足目虹彩病毒1的DNAzyme及其应用,包括DNAzyme MCP‑1的脱氧核糖核苷酸序列,本发明专利技术通过SELEX技术筛选得到的DNAzyme MCP‑1,并加入SYBR Green进行荧光信号的放大,制作能高特异性、高灵敏度识别十足目虹彩病毒1的生物传感器,并且DNAzyme的热化学稳定性高、易于合成和修饰、成本低廉,不仅方便与核酸扩增等信号放大手段配合,也易使用各种信号转导机制集成到荧光等分析报告系统中。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及病源性微生物检测,具体为能特异性识别和检测十足目虹彩病毒1的dnazyme及其应用。


技术介绍

1、近年来虾类养殖过程中病害频发,导致产量下降,经济损失大。其中,病毒病是对虾养殖业中的主要病害,是影响对虾养殖业发展的主要因素之一。

2、十足目虹彩病毒1(decapod iridescentvirus 1,div1)属于虹彩病毒科,是一种呈二十面体对称结构的双链dna病毒,它在十足目甲壳类动物中传播速度快、宿主范围广,主要分布于沿海虾蟹养殖区。感染div1的对虾死亡率极高,临床症状包括:肝胰腺和肌肉组织中出现嗜碱性包涵体和核固缩,对虾会出现游水、趴边、身体微红及空胃的症状。目前,对于div1尚无可用的药物治疗,国内外对div1的治理以综合预防为主,即尽早发现疾病并采取相应措施是控制该病毒扩散的重要途径。

3、传统检测对虾是否感染div1的方法主要包括:病理学显微镜观察、生化测定、免疫学试验、细胞培养等。这些方法耗时、操作复杂,很难适应现场快速检测的需要。

4、脱氧核酶(deoxyribozymes,dnazymes)是通过指数富集的配体进化技术(selex)体外筛选被分离出来的,通常由一条底物链和一条酶链组成,这两条dna链通过碱基配对进行部分互补杂交,形成一个双链系统。目的靶标的存在激活了dna酶的活性,底物链上的核苷酸(ra)被裂解,dnazyme可以通过构象变化和级联反应完成信号的传导和放大,使其在作为生物传感器时可以进行高灵敏的检测。此外,dnazyme还具有良好的稳定性、易于修饰和制备等优势,为开发灵敏、高效的现场检测方法提供了理想的分子工具。

5、本专利技术利用selex技术筛选出能特异性识别div1的dnazyme,并设计了一种基于dnazyme特异性识别div1的生物传感器。通过优化其反应条件,获得了特异性高、灵敏度好的检测div1生物传感器,可以快速检测水产致病微生物div1。


技术实现思路

1、本专利技术的目的是针对现有技术的缺陷,提供能特异性识别和检测十足目虹彩病毒1的dnazyme及其应用,以解决上述
技术介绍
提出的问题。

2、为实现上述目的,本专利技术提供如下技术方案:能特异性识别和检测十足目虹彩病毒1的dnazyme,包括一条dnazyme mcp-1的脱氧核糖核苷酸序列:

3、所述mcp-1为:5’-gaaaagtgttatccggggaaagatcatcgtactgtt atctccgagccggtcgaccagcatcggtaggcgtatct-3’。

4、作为本专利技术的一种优选技术方案,所述dnazyme序列的在3’端上有标记淬灭集团。

5、一种能特异性识别和检测十足目虹彩病毒1的dnazyme的筛选方法,采用磁珠selex法筛选dnazyme。

6、作为本专利技术的一种优选技术方案,具体步骤如下:

7、步骤1:实验所用的文库、引物、质粒由自己设计并于上海生工合成;

8、步骤2:将包含十足目虹彩病毒1的衣壳蛋白序列的质粒转入工程菌中,诱导表达并纯化回收,使用同样的方法从空载工程菌中得到反筛粗蛋白;

9、步骤3:将步骤2所得粗蛋白进行粗蛋白浓度的检测,分装于1.5ml无菌ep管,-20℃储存备用;

10、步骤4:将中心区域含有40个随机碱基和两端分别有20个固定碱基数的初始文库与引物通过pcr反应进行连接,引入ra切割位点和生物素标签,切胶回收dna;

11、步骤5:将步骤4所得pcr产物和链霉亲和素包被的磁珠在30℃下连接30min;

12、步骤6:连接结束后磁性分离弃去上清,磁珠用亲和素反应缓冲液清洗三次;

13、步骤7:用0.2m的naoh洗涤磁珠2次,磁性分离以制备单链;

14、步骤8:超纯水清洗磁珠3次,使ph值接近于中性;

15、步骤9:将10μg的十足目虹彩病毒1的衣壳蛋白(溶于50mm的pbs缓冲液,ph8.0)与等体积的2×筛选缓冲液混合,30℃孵育1h,发生切割反应,磁性分离,醇沉法回收上清液;

16、步骤10:以步骤9所得产物为模板,加入带有生物素的引物进行pcr扩增,用于下一轮筛选;

17、步骤11:将第九轮所得的pcr产物高通量测序并进行dna序列分析;

18、步骤12:候选dnazyme活性及性质检测;

19、步骤13:用海藻糖及普鲁兰多糖固定dnazyme复合物在聚乙烯96孔板中。

20、作为本专利技术的一种优选技术方案,在dna序列的5’端标记生物素;dna与磁珠结合,切割反应,醇沉回收均在1.5ml无菌ep管中进行;

21、使用超微量紫外分光光度计检测dna浓度。

22、作为本专利技术的一种优选技术方案,使用荧光信号检测仪检测dnazyme切割荧光的强度。

23、作为本专利技术的一种优选技术方案,dnazyme筛选过程中使用的磁珠直径为0.5μm。

24、一种能特异性识别和检测十足目虹彩病毒1的dnazyme体系在水产品检测中的应用。

25、一种能特异性识别和检测十足目虹彩病毒1的dnazyme在制备能够快速检测十足目虹彩病毒1的生物传感器中的应用。

26、一种能特异性识别和检测十足目虹彩病毒1的试剂盒,所述试剂盒含有dnazyme。

27、与现有技术相比,本专利技术的有益效果是:本专利技术通过selex技术筛选得到的dnazyme制备成dnazyme体系从而能更高特异性、高灵敏度识别div1,并且dnazyme的热化学稳定性高、易于合成和修饰、成本低廉,不仅方便与核酸扩增等信号放大手段配合,也易使用各种信号转导机制集成到荧光等分析报告系统中。采用本专利技术的一种基于dnazyme的生物传感器来快速检测水产品的div1,方法简单,便于操作。因此,本专利技术在div1的检测中具有良好的应用前景。

本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种能特异性识别和检测十足目虹彩病毒1的DNAzyme,其特征在于:包括一条DNAzyme MCP-1的脱氧核糖核苷酸序列:

2.根据权利要求1所述的能特异性识别和检测十足目虹彩病毒1的DNAzyme,其特征在于:所述DNAzyme序列的在3’端上有标记淬灭集团。

3.一种如权利要求1-2任一项所述的能特异性识别和检测十足目虹彩病毒1的DNAzyme的筛选方法,其特征在于:采用磁珠SELEX法筛选DNAzyme。

4.根据权利要求3所述的筛选方法,其特征在于:具体步骤如下:

5.根据权利要求4所述的筛选方法,其特征在于:在DNA序列的5’端标记生物素;DNA与磁珠结合,切割反应,醇沉回收均在1.5mL无菌EP管中进行;使用超微量紫外分光光度计检测DNA浓度。

6.根据权利要求4所述的筛选方法,其特征在于:使用荧光信号检测仪检测DNAzyme切割荧光的强度。

7.根据权利要求4所述筛选方法,其特征在于:DNAzyme筛选过程中使用的磁珠直径为0.5μm。

8.一种如权利要求1-2任一项所述的能特异性识别和检测十足目虹彩病毒1的DNAzyme体系在水产品检测中的应用。

9.一种如权利要求1-2任一项所述的能特异性识别和检测十足目虹彩病毒1的DNAzyme在制备能够快速检测十足目虹彩病毒1的生物传感器中的应用。

10.一种能特异性识别和检测十足目虹彩病毒1的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒含有权利要求1-2任一项所述的DNAzyme。

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【技术特征摘要】

1.一种能特异性识别和检测十足目虹彩病毒1的dnazyme,其特征在于:包括一条dnazyme mcp-1的脱氧核糖核苷酸序列:

2.根据权利要求1所述的能特异性识别和检测十足目虹彩病毒1的dnazyme,其特征在于:所述dnazyme序列的在3’端上有标记淬灭集团。

3.一种如权利要求1-2任一项所述的能特异性识别和检测十足目虹彩病毒1的dnazyme的筛选方法,其特征在于:采用磁珠selex法筛选dnazyme。

4.根据权利要求3所述的筛选方法,其特征在于:具体步骤如下:

5.根据权利要求4所述的筛选方法,其特征在于:在dna序列的5’端标记生物素;dna与磁珠结合,切割反应,醇沉回收均在1.5ml无菌ep管中进行;使...

【专利技术属性】
技术研发人员:王淑军张帅江君张磊吕明生李思盈
申请(专利权)人:江苏海洋大学
类型:发明
国别省市:

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