【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于生物，具体涉及一种猪2号染色体上与总乳头数性状相关的snp分子标记及应用。
技术介绍
1、猪的总乳头数性状是反映母猪哺乳能力的指标，属于重要的繁殖性状，对猪群的繁殖效率和经济效益有着直接影响。母猪总乳头数的多少直接关系到其在哺乳期仔猪的存活数量，从而影响仔猪的成活率和生长发育情况。总乳头数与母猪的繁殖性能和后代的生长表现具有较强的相关性，总乳头数越多，母猪的哺乳能力和仔猪成活率越高。因此，研究和改良猪的总乳头数性状，在提高繁殖效率和经济效益方面具有重要的研究和实践意义，其中，分子标记辅助选择是提高猪总乳头数性状的有效方法，但是哪个基因与猪的总乳头数性状相关，具体有何关系也并不清楚。
2、本专利技术基于申请人课题组培育的大白猪×通城猪高代横交资源群体，通过重测序获得全基因组遗传变异并进行总乳头数性状全基因组关联分析(genome wideassociation study，gwas)，在二号染色体上鉴定出一个影响猪乳头数性状的snp分子标记。目前上述部分发现成果尚未见报道。乳腺癌中ttc17基因表达呈负相关，其缺失或低表达是促进乳腺癌转移的关键因素(zhang et al.,2023)。因此本专利技术的一个snp标记辅助选择方法对猪繁殖性状的改良具有潜在的重要价值。
技术实现思路
1、本专利技术的目的在于提供一种与猪总乳头数性状相关的snp分子标记及其应用。
2、为实现上述目的，本专利技术采用以下的技术方案为：
3、一种与猪总乳头数性
4、进一步地，所述分子标记的核苷酸序列如seq id no.1，其中第501bp处的w是a或t，该突变导致分子标记的a/t多态性。
5、如上所述的snp分子标记在母猪辅助育种中的应用，多态性位点的基因型为aa或ta型的个体，其母猪的总乳头数显著高于基因型为tt型的个体。
6、一种用于检测如上所述与猪总乳头数性状相关snp分子标记的引物，其引物的核苷酸序列如seq id no.2-5所示。
7、一种用于检测如上所述与猪总乳头数性状相关snp分子标记的试剂盒，该试剂盒包括核苷酸序列如seq id no.2-5所示的引物。
8、一种用于检测如上所述与猪总乳头数性状相关snp分子标记的方法，其包括如下步骤：
9、1)使用seq id no.2-5所示的引物对母猪基因组dna进行pcr扩增；
10、2)对步骤1)获得的扩增产物的多态性位点进行分型鉴定。
11、如上所述的方法，优选地，在步骤1)中，所述母猪基因组dna可提取自母猪的血液dna或母猪的耳朵组织dna。
12、如上所述的方法，优选地，在步骤2)中，当扩增产物出现大小为744bp、499bp和299bp的三条条带时，判定其母猪的基因型为at型；
13、当扩增产物出现大小为744bp和499bp的两条条带时，判定其母猪的基因型为aa型；
14、当扩增产物出现大小为744bp和299bp的两条条带时，判定其母猪的基因型为tt型。
15、如上所述用于检测如上所述与猪总乳头数性状相关snp分子标记的引物、试剂盒或方法在母猪辅助育种中的应用，用于选育乳头数目较多的母猪品种；当多态性位点的基因型为aa或ta型时，其母猪的总乳头数显著高于tt型。
16、本专利技术的有益效果在于：
17、本专利技术提供的与猪总乳头数性状相关的snp分子标记，该位点多态性显著影响猪的总乳头数性状，通过测定该多态性的基因型能有效鉴别是否具有高繁殖潜力，为进行早期选育，提高育种效率提供了检测技术手段。本专利技术也为猪繁殖性状的遗传改良提供了可靠的分子标记的检测方法，对猪的遗传改良具有重要意义。
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1.一种与猪总乳头数性状相关的SNP分子标记，其特征在于，SNP分子标记分别位于猪基因组11.1版本参考序列的2号染色体第18782565位碱基，所述第18782565位碱基为A或T，该突变导致多态性。
2.一种与猪总乳头数性状相关的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1，其中第501bp处的W是A或T，该突变导致SNP分子标记的A/T多态性。
3.权利要求2所述的SNP分子标记在母猪辅助育种中的应用，其特征在于，多态性位点的基因型为AA或TA型的个体，其母猪的总乳头数显著高于基因型为TT型的个体。
4.一种用于检测如权利要求2所述与猪总乳头数性状相关SNP分子标记的引物，其特征在于，其引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2-5所示。
5.一种用于检测如权利要求2所述与猪总乳头数性状相关SNP分子标记的试剂盒，其特征在于，该试剂盒包括核苷酸序列如SEQ ID NO.2-5所示的引物。
6.一种用于检测如权利要求2所述与猪总乳头数性状相关SNP分子标记的方法，其特征在于，其包括
7.如权利要求6所述的方法，其特征在于，在步骤1)中，所述母猪基因组DNA可提取自母猪的血液DNA或母猪的耳朵组织DNA。
8.如权利要求6所述的方法，其特征在于，在步骤2)中，当扩增产物出现大小为744bp、499bp和299bp的三条条带时，判定其母猪的基因型为AT型；
9.如权利要求4所述用于检测如上所述与猪总乳头数性状相关SNP分子标记的引物、如权利要求5所述用于检测如上所述与猪总乳头数性状相关SNP分子标记的试剂盒或如权利要求6-8中任一项所述用于检测与猪总乳头数性状相关SNP分子标记的方法在母猪辅助育种中的应用。
10.如权利要求9所述的应用，其特征在于，用于选育乳头数目较多的母猪品种，当多态性位点的基因型为AA或TA型时，其母猪的总乳头数显著高于TT型。
...【技术特征摘要】
1.一种与猪总乳头数性状相关的snp分子标记，其特征在于，snp分子标记分别位于猪基因组11.1版本参考序列的2号染色体第18782565位碱基，所述第18782565位碱基为a或t，该突变导致多态性。
2.一种与猪总乳头数性状相关的snp分子标记，其特征在于，所述snp分子标记的核苷酸序列如seq id no.1，其中第501bp处的w是a或t，该突变导致snp分子标记的a/t多态性。
3.权利要求2所述的snp分子标记在母猪辅助育种中的应用，其特征在于，多态性位点的基因型为aa或ta型的个体，其母猪的总乳头数显著高于基因型为tt型的个体。
4.一种用于检测如权利要求2所述与猪总乳头数性状相关snp分子标记的引物，其特征在于，其引物的核苷酸序列如seq id no.2-5所示。
5.一种用于检测如权利要求2所述与猪总乳头数性状相关snp分子标记的试剂盒，其特征在于，该试剂盒包括核苷酸序列如seq id n...
【专利技术属性】
技术研发人员：周翔，杨清华，刘榜，马方，张巧丽，陈芷怡，
申请(专利权)人：华中农业大学，
类型：发明
国别省市：
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