System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 农田土壤游离病毒显微计数的优化方法技术_技高网

农田土壤游离病毒显微计数的优化方法技术

技术编号:44261110 阅读:5 留言:0更新日期:2025-02-14 22:06
本发明专利技术公开了一种农田土壤游离病毒显微计数的优化方法,属于生物试验技术领域。该方法从土壤病毒提取试验中的仪器选择、参数设置、土壤样品使用量以及显微观察关键影响因子这几个方面进行试验,分析农田土壤样品与病毒浸提液的比例、不同振荡仪器及参数设置、以及显微观察中防荧光淬灭剂和防褪色液对土壤病毒提取效率和显微计数的影响,根据分析结果优化农田土壤游离病毒显微计数的过程。本发明专利技术可以从土壤病毒提取中仪器选择与参数设置、土壤样品使用量以及显微观察中关键影响因子控制入手,提出一种适宜农田土壤病毒荧光染色‑显微计数法的操作流程,可为后续土壤病毒的定量分析和侵染方式研究提供可行的技术参考。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于生物试验,具体涉及一种农田土壤游离病毒显微计数的优化方法


技术介绍

1、病毒是地球上丰度最高、种类最丰富的生物实体,由蛋白质外壳和核酸组成,细胞内寄生,可侵染生物界三域系统(细菌、古菌和真核生物域)中所有生物体。做为土壤微生物存亡的重要驱动者,病毒在调控宿主微生物参与的土壤生态功能中发挥着重要作用。当宿主细胞被病毒侵染后,土壤微生物生理代谢、基因表达和死亡速率发生变化,引起微生物数量、种群组成与功能发生改变同时宿主细胞释放出的大量有机物质,成为土壤生境中碳、氮等元素循环的有效底物与能量;最终影响土壤的物质循环以及能量流动。

2、随着测序技术的飞速发展,基于基因层面的土壤病毒研究被不断报导,然而,受病毒变异率影响,难以设计其通用引物,进而限制了土壤中病毒数量的定量观察和检测。尽管采用透射电子显微镜(tem)观察计数能够定量病毒数量,但检测区域小、高成本、准备工作复杂等缺点则限制着土壤病毒的计数研究。因此,采用荧光染料对土壤病毒核酸进行染色,结合荧光显微镜对其进行计数已成为定量分析土壤病毒的主要方法。

3、至目前为止,国内外采用荧光染色-显微计数法分析环境中病毒数量已有多篇报道,并初步建立了相应的试验流程,然而,这些研究方法多数为海洋生态系统中病毒的研究。关于农田土壤中病毒的研究方法多表现为因研究者而各异,且适应范围有限,研究结果缺乏进一步的验证与评估。


技术实现思路

1、本专利技术旨在至少在一定程度上解决上述相关技术中的技术问题之一。

<p>2、为此,本专利技术的目的在于提供一种农田土壤游离病毒显微计数的优化方法,从土壤病毒提取中仪器选择与参数设置、土壤样品使用量以及显微观察中关键影响因子控制入手,通过研究农田土壤样品与病毒浸提液的比例、不同振荡仪器及参数设置,以及显微观察中防荧光淬灭试剂对土壤病毒提取效率和显微计数的影响,提出了一种适宜农田土壤病毒荧光染色-显微计数法的操作流程,可为后续土壤病毒的定量分析和侵染方式研究提供可行的技术参考。

3、为了解决上述技术问题,本专利技术是这样实现的:

4、本专利技术实施例提供了一种农田土壤游离病毒显微计数的优化方法,所述方法从土壤病毒提取试验中的仪器选择、参数设置、土壤样品使用量以及显微观察关键影响因子这几个方面进行试验,分析农田土壤样品与病毒浸提液的比例、不同振荡仪器及参数设置、以及显微观察中防荧光淬灭剂和防褪色液对土壤病毒提取效率和显微计数的影响,根据分析结果优化农田土壤游离病毒显微计数的过程。

5、另外,根据本专利技术的农田土壤游离病毒显微计数的优化方法,还可以具有如下附加的技术特征:

6、在其中的一些实施方式中,所述农田土壤样品与病毒浸提液的比例为100体积份病毒浸提液中加入不低于50质量份的农田土壤样品。

7、在其中的一些实施方式中,振荡仪器及参数设置为:使用手持搅拌棒在650w、50hz条件下振荡3分钟实现土壤悬液的破碎。

8、在其中的一些实施方式中,所述防荧光淬灭剂为水溶性的抗荧光淬灭封片剂。

9、在其中的一些实施方式中,所述防褪色剂的制备方式为:将无水乙醇和(s)-(-)-α-甲基苄胺按体积比1000:1混合均匀制成防褪色原液,将所述防褪色原液和甘油-磷酸盐缓冲液按体积比100:1混合均匀,通过微孔滤膜过滤,得到所述防褪色剂。

10、在其中的一些实施方式中,所述病毒浸提液为ph=7.0的柠檬酸钾磷酸盐缓冲液。

11、在其中的一些实施方式中,所述柠檬酸钾磷酸盐缓冲液的制备方式为:将1.44份磷酸氢二钠、0.24份磷酸氢二钾和10.0份柠檬酸钾溶于hplc水,加入磷酸调节ph至7.0后定容,将配制好的缓冲液通过微孔滤膜过滤,再进行灭菌操作,得到所述柠檬酸钾磷酸盐缓冲液。

12、在其中的一些实施方式中,根据分析结果优化后的农田土壤游离病毒显微计数的过程包括:

13、s1、称取50g农田土壤样品,置于含100ml 1%柠檬酸钾溶液中,使用手持搅拌棒搅拌3min,设置参数为650w、50hz;

14、s2、对s1获得土壤浸提液进行离心处理;

15、s3、获取离心后的上清液并经针孔滤膜进行过滤;

16、s4、向过滤后溶液中加入优化液和dnase1,再进行特定温度的水浴反应;

17、s5、向s4水浴后溶液中加入edta溶液,再进行特定温度的水浴反应;

18、s6、室温冷却;

19、s7、滤泵处理:在滤泵上放置滤膜,加入hplc水进行抽滤、平衡滤泵气压,然后在滤膜上加入s6的溶液进行抽滤、平衡滤泵气压;

20、s8、在滤膜上加入核酸荧光染料,避光染色;然后抽滤、平衡滤泵气压,再用无菌hplc水冲洗;

21、s9、取出滤膜,避光晾干;

22、s10、载玻片上滴加无菌hplc水,其上放置晾干的滤膜,滤膜上滴加防荧光淬灭剂,盖上盖玻片;

23、s11、使用荧光显微镜进行游离病毒观察并计数。

24、在其中的一些实施方式中,步骤s4中水浴反应的温度为37℃;

25、步骤s5中水浴反应的温度为65℃。

26、在其中的一些实施方式中,步骤s3中针孔滤膜为0.22μm针孔滤膜;

27、步骤s7中滤泵上的滤膜为0.02μm滤膜。

28、与现有技术相比,本专利技术至少具有以下有益效果:

29、本专利技术实施例中,所提供的农田土壤游离病毒显微计数的优化方法,使用手持搅拌棒破碎土壤悬液可有效提高土壤病毒提取数量;相较于传统使用的破碎方式,本专利技术手持搅拌棒的方式,能够使土壤病毒数量至少提升一个数量级;

30、本专利技术实施例中,所提供的农田土壤游离病毒显微计数的优化方法,通过增加土壤样品与提取液比例,显著提高了病毒计数结果;相较于传统土壤与提取液比例为30:100(每100体积份的提取液中加入30质量份的土壤),提高新鲜土壤含量,即土壤与提取液比例为50:100(每100体积份的提取液中加入50质量份的土壤)时,每克土壤病毒丰度可明显提高一个数量级;

31、本专利技术实施例中,所提供的农田土壤游离病毒显微计数的优化方法,通过使用防荧光淬灭剂和/或防褪色液有效延长了土壤病毒观察时间,增加了病毒检测数量;不使用防褪色液和防荧光淬灭剂时,病毒在短时间内发生淬灭现象,放大倍数为1000倍时,视野中无法观察到土壤病毒颗粒的存在,使用防褪色液和防荧光淬灭剂均能有效防止荧光淬灭,但使用防荧光淬灭剂后土壤病毒颗粒数量较使用防褪色剂可高出一个数量级。

32、本专利技术的附加方面和优点将在下面的描述中部分给出,部分将从下面的描述中变得明显,或通过本专利技术的实践了解到。

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【技术保护点】

1.一种农田土壤游离病毒显微计数的优化方法,其特征在于,所述方法从土壤病毒提取试验中的仪器选择、参数设置、土壤样品使用量以及显微观察关键影响因子这几个方面进行试验,分析农田土壤样品与病毒浸提液的比例、不同振荡仪器及参数设置、以及显微观察中防荧光淬灭剂和防褪色液对土壤病毒提取效率和显微计数的影响,根据分析结果优化农田土壤游离病毒显微计数的过程。

2.根据权利要求1所述的农田土壤游离病毒显微计数的优化方法,其特征在于,所述农田土壤样品与病毒浸提液的比例为100体积份病毒浸提液中加入不低于50质量份的农田土壤样品。

3.根据权利要求1所述的农田土壤游离病毒显微计数的优化方法,其特征在于,振荡仪器及参数设置为:使用手持搅拌棒在650 w、50 Hz条件下振荡3分钟实现土壤悬液的破碎。

4.根据权利要求1所述的农田土壤游离病毒显微计数的优化方法,其特征在于,所述防荧光淬灭剂为水溶性的抗荧光淬灭封片剂。

5.根据权利要求1所述的农田土壤游离病毒显微计数的优化方法,其特征在于,所述防褪色剂的制备方式为:将无水乙醇和(S)-(-)-α-甲基苄胺按体积比1000:1混合均匀制成防褪色原液,将所述防褪色原液和甘油-磷酸盐缓冲液按体积比100:1混合均匀,通过微孔滤膜过滤,得到所述防褪色剂。

6.根据权利要求2所述的农田土壤游离病毒显微计数的优化方法,其特征在于,所述病毒浸提液为pH=7.0的柠檬酸钾磷酸盐缓冲液。

7.根据权利要求6所述的农田土壤游离病毒显微计数的优化方法,其特征在于,所述柠檬酸钾磷酸盐缓冲液的制备方式为:将1.44份磷酸氢二钠、0.24份磷酸氢二钾和10.0份柠檬酸钾溶于HPLC水,加入磷酸调节pH至7.0后定容,将配制好的缓冲液通过微孔滤膜过滤,再进行灭菌操作,得到所述柠檬酸钾磷酸盐缓冲液。

8.根据权利要求1所述的农田土壤游离病毒显微计数的优化方法,其特征在于,根据分析结果优化后的农田土壤游离病毒显微计数的过程包括:

9.根据权利要求8所述的农田土壤游离病毒显微计数的优化方法,其特征在于,步骤S4中水浴反应的温度为37℃;

10.根据权利要求8所述的农田土壤游离病毒显微计数的优化方法,其特征在于,步骤S3中针孔滤膜为0.22μm针孔滤膜;

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【技术特征摘要】

1.一种农田土壤游离病毒显微计数的优化方法,其特征在于,所述方法从土壤病毒提取试验中的仪器选择、参数设置、土壤样品使用量以及显微观察关键影响因子这几个方面进行试验,分析农田土壤样品与病毒浸提液的比例、不同振荡仪器及参数设置、以及显微观察中防荧光淬灭剂和防褪色液对土壤病毒提取效率和显微计数的影响,根据分析结果优化农田土壤游离病毒显微计数的过程。

2.根据权利要求1所述的农田土壤游离病毒显微计数的优化方法,其特征在于,所述农田土壤样品与病毒浸提液的比例为100体积份病毒浸提液中加入不低于50质量份的农田土壤样品。

3.根据权利要求1所述的农田土壤游离病毒显微计数的优化方法,其特征在于,振荡仪器及参数设置为:使用手持搅拌棒在650 w、50 hz条件下振荡3分钟实现土壤悬液的破碎。

4.根据权利要求1所述的农田土壤游离病毒显微计数的优化方法,其特征在于,所述防荧光淬灭剂为水溶性的抗荧光淬灭封片剂。

5.根据权利要求1所述的农田土壤游离病毒显微计数的优化方法,其特征在于,所述防褪色剂的制备方式为:将无水乙醇和(s)-(-)-α-甲基苄胺...

【专利技术属性】
技术研发人员:刘灵芝王丰梁敏杰刘蕊汪景宽
申请(专利权)人:沈阳农业大学
类型:发明
国别省市:

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