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【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及基因克隆和蛋白生物信息学分析,尤其是涉及绵羊 cyp17a1基因的序列和其蛋白的生物信息学特征。
技术介绍
1、cyp17a1基因编码的蛋白是一种多功能的酶,称为细胞色素p450 17a1,也被称为17α-羟化酶,目前已知该酶在人体内的主要功能涉及甾体激素的生物合成,具体来说,它参与了以下几个重要步骤:
2、1)17α-羟化作用:cyp17a1催化孕烯醇酮和孕酮转化为17α-羟基孕烯醇酮和17α-羟基孕酮,这是肾上腺皮质激素和性激素合成路径中的关键步骤。
3、2)具有17,20-裂解酶活性:催化17α-羟基孕酮转化为雄烯二酮,以及17α-羟基孕烯醇酮转化为脱氢表雄酮(dhea),雄烯二酮和脱氢表雄酮都是雄激素的前体。
4、cyp17a1酶在肾上腺和生殖腺中起着至关重要的作用,因为它参与了盐皮质激素、糖皮质激素、雄激素和雌激素的合成。如果 cyp17a1基因发生突变,导致酶的活性降低或丧失,可能引起多种疾病,包括17α-羟化酶缺陷型先天性肾上腺增生症,这会导致激素合成障碍,影响正常的生理功能,如血压调控、性征发育等。
5、此外, cyp17a1也是某些药物的作用靶点,例如阿比特龙(abiraterone),这是一种用于治疗前列腺癌的药物,通过抑制cyp17a1酶来减少雄激素的产生,从而达到治疗效果。
6、在很多
技术实现思路
1、本专利技术的目的是提供绵羊 cyp17a1基因的序列和其蛋白的生物信息学特征,以为绵羊体内性激素的合成过程和机制研究、优化绵羊繁殖性能和适应性育种提供准确的基因信息。
2、为实现上述目的,本专利技术提供绵羊 cyp17a1基因, cyp17a1基因的cds序列如seq idno.1所示,氨基酸序列如seq id no.2所示。
3、克隆上述绵羊 cyp17a1基因的巢式pcr引物,包括p1-p6共6组引物,p1组引物包括rt1793-p1-f、rt1793-p1-r'、rt1793-p1-r,p2组引物包括rt1793-p2-f、rt1793-p2-f'、rt1793-p2-r、rt1793-p2-r',p3组引物包括rt1793-p3-f、rt1793-p3-f'、rt1793-p3-r、rt1793-p3-r',p4组引物包括rt1793-p4-f、rt1793-p4-f'、rt1793-p4-r'、rt1793-p4-r,p5组引物包括rt1793-p5-f、rt1793-p5-f'、rt1793-p5-r'、rt1793-p5-r,p6组引物包括rt1793-p6-f、rt1793-p6-f'、rt1793-p6-r。
4、优选地,rt1793-p1-f序列如seq id no.3所示,rt1793-p1-r'序列如seq id no.4所示,rt1793-p1-r序列如seq id no.5所示,rt1793-p2-f序列如seq id no.6所示,rt1793-p2-f'序列如seq id no.7所示,rt1793-p2-r序列如seq id no.9所示,rt1793-p2-r'序列如seq id no.8所示,rt1793-p3-f序列如seq id no.10所示,rt1793-p3-f'序列如seq id no.11所示,rt1793-p3-r序列如seq id no.13所示,rt1793-p3-r'序列如seq idno.12所示,rt1793-p4-f序列如seq id no.14所示,rt1793-p4-f'序列如seq id no.15所示,rt1793-p4-r'序列如seq id no.16所示,rt1793-p4-r序列如seq id no.17所示,rt1793-p5-f序列如seq id no.18所示,rt1793-p5-f'序列如seq id no.19所示,rt1793-p5-r'序列如seq id no.20所示,rt1793-p5-r序列如seq id no.21所示,rt1793-p6-f序列如seq id no.22所示,rt1793-p6-f'序列如seq id no.23所示,rt1793-p6-r序列如seq idno.24所示。
5、克隆上述绵羊 cyp17a1基因的巢式pcr的体系,为50µl体系,包括2 µl one stepenzyme mix、2µl浓度为10µm的上游引物、2µl浓度为10µm的下游引物、1µl总rna、25µl 2×one-step reaction solution a或b、rnase free水补齐50µl。
6、克隆上述绵羊 cyp17a1基因的巢式pcr的扩增条件为:反转录50℃、30min;预变性94℃、2min;变性94℃、30s,退火58℃、30s,延伸72℃、1min,33个循环;最终延伸72℃ 5min。
7、一种如上所述的绵羊 cyp17a1基因在优化绵羊繁殖性能和适应性育种中的应用。
8、因此,本专利技术提供的绵羊 cyp17a1基因的序列和其蛋白的生物信息学特征,其具体技术效果如下:
9、本专利技术首次公开绵羊 cyp17a1基因的cds序列和蛋白序列,以及绵羊cyp17a1蛋白的理化性质、结构域、功能域、二级和三级结构、磷酸化和糖基化修饰位点信息、密码子偏好、信号肽有无和位置;这些公开信息对于解析绵羊体内性激素的合成过程和机制具有重要作用,还可以通过比较不同羊品种间的基因序列差异评估遗传多样性,对于动物遗传资源的保护、利用和进化研究至关重要,此外,这些信息的公开还有助于优化绵羊繁殖性能和适应性,指导绵羊育种等。
10、下面通过附图和实施例,本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.绵羊CYP17A1基因,其特征在于:CYP17A1基因的CDS序列如SEQ ID NO.1所示,氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。
2.克隆权利要求1所述的绵羊CYP17A1基因的巢式PCR引物,其特征在于:包括P1-P6共6组引物,P1组引物包括RT1793-P1-F、RT1793-P1-R'、RT1793-P1-R,P2组引物包括RT1793-P2-F、RT1793-P2-F'、RT1793-P2-R、RT1793-P2-R',P3组引物包括RT1793-P3-F、RT1793-P3-F'、RT1793-P3-R、RT1793-P3-R',P4组引物包括RT1793-P4-F、RT1793-P4-F'、RT1793-P4-R'、RT1793-P4-R,P5组引物包括RT1793-P5-F、RT1793-P5-F'、RT1793-P5-R'、RT1793-P5-R,P6组引物包括RT1793-P6-F、RT1793-P6-F'、RT1793-P6-R。
3.根据权利要求2所述的克隆权利要求1所述的绵羊CYP17A1基因的巢式PCR引物,其特征在
4.克隆权利要求1所述的绵羊CYP17A1基因的巢式PCR的体系,其特征在于:为50µL体系,包括2µL One Step Enzyme Mix、2µL浓度为10µM的上游引物、2µL浓度为10µM的下游引物、1µL总RNA、25µL 2× One-Step Reaction Solution A或B、Rnase free水补齐50µL。
5.克隆权利要求1所述的绵羊CYP17A1基因的巢式PCR的扩增条件,其特征在于:反转录50℃、30min;预变性94℃、2min;变性94℃、30s,退火58℃、30s,延伸72℃、1min,33个循环;最终延伸72℃ 5min。
6.一种如权利要求1所述的绵羊CYP17A1基因在优化绵羊繁殖性能和适应性育种中的应用。
...【技术特征摘要】
1.绵羊cyp17a1基因,其特征在于:cyp17a1基因的cds序列如seq id no.1所示,氨基酸序列如seq id no.2所示。
2.克隆权利要求1所述的绵羊cyp17a1基因的巢式pcr引物,其特征在于:包括p1-p6共6组引物,p1组引物包括rt1793-p1-f、rt1793-p1-r'、rt1793-p1-r,p2组引物包括rt1793-p2-f、rt1793-p2-f'、rt1793-p2-r、rt1793-p2-r',p3组引物包括rt1793-p3-f、rt1793-p3-f'、rt1793-p3-r、rt1793-p3-r',p4组引物包括rt1793-p4-f、rt1793-p4-f'、rt1793-p4-r'、rt1793-p4-r,p5组引物包括rt1793-p5-f、rt1793-p5-f'、rt1793-p5-r'、rt1793-p5-r,p6组引物包括rt1793-p6-f、rt1793-p6-f'、rt1793-p6-r。
3.根据权利要求2所述的克隆权利要求1所述的绵羊cyp17a1基因的巢式pcr引物,其特征在于:rt1793-p1-f序列如seq id no.3所示,rt1793-p1-r'序列如seq id no.4所示,rt1793-p1-r序列如seq id no.5所示,rt1793-p2-f序列如seq id no.6所示,rt1793-p2-f'序列如seq id no.7所示,rt1793-p2-r序列如seq id no.9所示,rt1793-p2-r'序列如seq id no.8所示,rt1793-p3-f序列如seq id no.10所示,rt1793-p3-f'序列如seq...
【专利技术属性】
技术研发人员:柳杭,陈洋,李佳蓉,孙丽敏,王皎皎,姜怀志,
申请(专利权)人:吉林农业大学,
类型:发明
国别省市:
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