【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于分子生物学，涉及一种与猪肉ph24相关的snp标记引物对及其应用。
技术介绍
1、猪肉质(meat quality)性状是一个多指标而又复杂的经济性状，包括肉色、ph值、剪切力、滴水损失、肌内脂肪含量等性状。ph24是指在屠宰后24小时测量的肌肉ph值，这是评估猪肉品质的一个重要指标。这个指标主要反映了肌肉中糖原代谢后酸性物质(主要是乳酸)的积累程度，ph在下降的过程中，造成肌蛋白变性，从而产生浅色的外观，进而影响肉色、水分保持能力、软硬度和风味，这是评判正常肉质和异常肉质的一个重要指标。已有研究表明，超过40％的消费者是利用肉色来判断肉新鲜程度。低ph值的猪肉倾向于呈现较浅的颜色，这种情况通常被称为pse肉；而高ph值的猪肉颜色较深，肉质较硬，这种情况被称为dfd肉，消费者更愿意购买呈现颜色鲜红，具有良好的水分保持能力和质地的猪肉。
2、猪肉ph值的变化是由多种因素共同作用的结果，涉及到遗传、营养、管理、应激以及屠宰加工等多个方面。因此，提高猪肉色的品质需要从多方面进行综合管理和控制。猪屠宰后，由于机体血液供应与呼吸作用的终止，氧气也随之耗竭，而一系列物理、化学和生物化学变化仍持续进行，细胞的能量代谢由有氧呼吸开始转变为无氧呼吸，糖原酵解成为宰后能量代谢的主要途径，随着糖酵解的进行，糖原经过一系列的酶促反应分解成乳酸并产生能量，随着乳酸的不断累积，ph逐渐下降，肌肉的ph由活体肌肉的7.0最终降到5.7左右。肌肉ph变化的速率和程度将直接影响着其他肉品质性状。
3、猪肉品质是包含多指标的复
技术实现思路
1、本专利技术的目的在于针对猪肉ph24性状选育耗时费力、选育效果不佳的实际情况，提供与猪肉ph24性状相关的snp标记并将其开发为分子标记。
2、本专利技术的另一个目的在于提供用于检测上述snp标记的引物对和检测方法。
3、本专利技术的另一个目的在于提供上述snp标记的用途。
4、一种开发与猪肉ph24性状相关的分子标记的方法，所述猪肉ph24性状指屠宰后24小时猪肉的ph值，以含有国际猪基因组11.1版本参考序列猪14号染色体rs342386773核苷酸位点的核苷酸序列为基础序列，设计引物对，以猪基因组dna为模板进行pcr扩增，使国际猪基因组11.1版本参考序列猪14号染色体rs342386773核苷酸位点转化为分子标记。
5、所述的引物对序列为上游引物：seq id no：2，下游引物：seq id no：3。
6、按照上述的方法得到的分子标记。
7、所述的分子标记序列优选如seq id no：1所示，所述的国际猪基因组11.1版本参考序列猪14号染色体rs342386773核苷酸位点在seq id no：1中位于第182位，存在a/c多态性，该位点aa基因型的猪个体屠宰后24小时测量的肌肉ph值显著高于劣势基因型cc型个体，也高于杂合型ac型个体屠宰后猪肉ph24。
8、一种用于检测与猪肉ph24性状相关的snp标记的引物对，上游引物为：seq id no：2，下游引物为：seq id no：3；所述的与猪肉色性状相关的snp标记位于猪14号染色体上的frmd4a基因的核苷酸序列上，所述snp标记的位点为国际猪基因组11.1版本参考序列猪14号染色体rs342386773核苷酸位点的分子标记，且具有a/c多态性。
9、一种检测与所述的猪肉ph24性状相关的snp标记的方法，包含pcr扩增国际猪基因组11.1版本参考序列猪14号染色体rs342386773核苷酸位点的一段序列，对扩增产物进行测序，判读该位点的a/c多态性。
10、具体判读方法，根据权利要求6所述的方法，其特征在于包括以下步骤：
11、(1)取猪组织样品提取总dna；
12、(2)用已提取的猪基因组dna为模板，使用权利要求5所述的引物对进行pcr扩增；
13、(3)扩增产物进行测序，分析测序结果，判读在seq id no：1第182位的a/c多态性。
14、本专利技术所述的分子标记、所述的引物对在筛选猪肉ph24性状更优猪群体中的应用。
15、一种筛选猪肉ph24性状更优猪群体的方法，包括检测国际猪基因组11.1版本参考序列猪14号染色体rs342386773核苷酸位点的基因型，选育rs342386773核苷酸位点的aa型个体优先作为种猪。
16、有益效果：
17、本专利技术提供的snp标记与猪肉ph24性状相关，基于该snp开发的分子标记及引物可用于snp的检测。因此，可以通过鉴定该snp标记来筛选猪肉ph性状较好的品系，所得的肉质性状较好的猪品系具有重要的经济效益与社会价值。
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1.一种开发与猪肉pH24性状相关的分子标记的方法，所述猪肉pH24性状指屠宰后24小时猪肉的pH值，其特征在于以含有国际猪基因组11.1版本参考序列猪14号染色体rs342386773核苷酸位点的核苷酸序列为基础序列，设计引物对，以猪基因组DNA为模板进行PCR扩增，使国际猪基因组11.1版本参考序列猪14号染色体rs342386773核苷酸位点转化为分子标记。
2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于所述的引物对序列为上游引物：SEQ ID NO：2，下游引物：SEQ ID NO：3。
3.按照权利要求1或2所述的方法得到的分子标记。
4.根据权利要求3所述分子标记，其特征在于所述的分子标记序列如SEQ ID NO：1所示，所述的国际猪基因组11.1版本参考序列猪14号染色体rs342386773核苷酸位点在SEQID NO：1中位于第182位，存在A/C多态性，该位点AA基因型的猪个体屠宰后24小时测量的肌肉pH值显著高于劣势基因型CC型个体，也高于杂合型AC型个体屠宰后猪肉pH24。
5.一种用于检测与猪肉pH24性状相关的
6.一种检测权利要求5中所述的与猪肉pH性状相关的SNP标记的方法，其特征在于包含PCR扩增猪国际猪基因组11.1版本参考序列猪14号染色体rs342386773核苷酸位点的一段序列，对扩增产物进行测序，判读该位点的A/C多态性。
7.根据权利要求6所述的方法，其特征在于包括以下步骤：
8.权利要求3或4所述的分子标记、权利要求5所述的引物对在筛选猪肉pH24性状较好猪群体中的应用。
9.一种筛选猪肉pH24性状较高的群体用于辅助猪肉pH值选育的方法，其特征在于包括检测猪国际猪基因组11.1版本参考序列猪14号染色体rs342386773核苷酸位点的基因型，选育rs342386773核苷酸位点的AA型个体优先作为种猪。
...【技术特征摘要】
1.一种开发与猪肉ph24性状相关的分子标记的方法，所述猪肉ph24性状指屠宰后24小时猪肉的ph值，其特征在于以含有国际猪基因组11.1版本参考序列猪14号染色体rs342386773核苷酸位点的核苷酸序列为基础序列，设计引物对，以猪基因组dna为模板进行pcr扩增，使国际猪基因组11.1版本参考序列猪14号染色体rs342386773核苷酸位点转化为分子标记。
2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于所述的引物对序列为上游引物：seq id no：2，下游引物：seq id no：3。
3.按照权利要求1或2所述的方法得到的分子标记。
4.根据权利要求3所述分子标记，其特征在于所述的分子标记序列如seq id no：1所示，所述的国际猪基因组11.1版本参考序列猪14号染色体rs342386773核苷酸位点在seqid no：1中位于第182位，存在a/c多态性，该位点aa基因型的猪个体屠宰后24小时测量的肌肉ph值显著高于劣势基因型cc型个体，也高于杂合型ac型个体屠宰后猪肉ph24。
5.一种用于检测与猪肉ph2...
【专利技术属性】
技术研发人员：李平华，张珺抒，黄瑞华，侯黎明，吴望军，杜陶然，赵清波，于江辉，刘倩，马金凤，杨辉龙，
申请(专利权)人：南京农业大学，
类型：发明
国别省市：
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