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【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及动物分子遗传学领域,尤其涉及一种鉴定大眼鳜亲缘关系的微卫星引物及鉴定方法。
技术介绍
1、大眼鳜隶属于鳜属,俗称桂花鱼、白桂等,广泛分布于中国长江及其以南水系,为中国南方特有种。大眼鳜主要是以鱼为主,次为虾类,生长较鳜鱼慢,更喜栖息干流水环境中。体重1.5kg亲鱼,怀卵量可达10万余粒。大眼鳜于 20 世纪初被描述并划分为种,之后科研工作者对其形态特征及分类、生物学和养殖等作了相关的研究。
2、近年来,由于人类的影响使大眼鳜等鳜类野生类资源急剧下降。大眼鳜的人工养殖也面临巨大问题:随着大眼鳜的养殖量越来越大,近亲繁殖的现象也越来越明显,由此导致的种质退化,大眼鳜的生长性能、抗逆抗病性能受到影响,因此,如何有效避免大眼鳜的近亲繁殖成为了亟待解决的问题。
技术实现思路
1、为了有效避免大眼鳜的近亲繁殖,本专利技术提供了一种鉴定大眼鳜亲缘关系的微卫星引物及鉴定方法。
2、实现本专利技术第一专利技术目的采用的技术方案是:一种鉴定大眼鳜亲缘关系的微卫星引物,包括:seq id no.1-20所示的核苷酸序列。
3、实现本专利技术第二专利技术目的采用的技术方案是:一种鉴定大眼鳜亲缘关系的方法,包括以下步骤:
4、s1、提取待鉴定样品的dna;
5、s2、利用以上技术方案所述的微卫星引物对步骤s1提取到的样品dna进行pcr扩增,得到扩增产物;
6、s3、将步骤s2得到的扩增产物在10%聚丙烯酰胺凝胶上进行电泳
7、s4、根据步骤s3得到的电泳分离结果统计待鉴定样品的pcr扩增产物的基因型,得到待鉴定样品的基因型结果;
8、s5、通过遗传分析软件对步骤s4得到的基因型结果进行聚类分析,得到大眼鳜的亲缘关系鉴定结果:汇聚在同一分支的样品个体之间亲缘关系近,汇聚在不同分支的样品个体之间亲缘关系远。
9、本专利技术的有益效果是:(1)本专利技术通过分子手段对大眼鳜的亲缘关系进行鉴定,根据鉴定结果指导大眼鳜的人工繁殖,可有效避免大眼鳜出现近亲繁殖的现象;
10、(2)本专利技术的pcr扩增体系较传统pcr体系节省了一半的费用;
11、(3)利用本专利技术的鉴定大眼鳜亲缘关系的方法指导大眼鳜的人工繁殖,可用于大眼鳜的家系鉴定和亲子鉴定,比传统的进行大眼鳜的标记(打标法)更省力。
12、下面结合附图与具体实施方式对本专利技术作进一步的描述。
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1.一种鉴定大眼鳜亲缘关系的微卫星引物,其特征在于,
2.根据权利要求1所述的一种鉴定大眼鳜亲缘关系的微卫星引物,其特征在于,
3.一种鉴定大眼鳜亲缘关系的方法,其特征在于,所述的鉴定方法包括以下步骤:
4.根据权利要求3所述的一种鉴定大眼鳜亲缘关系的方法,其特征在于,所述的步骤S2中, PCR扩增的反应体系为25ul:10×PCR Buffer 3ul,2.5mmol/L dNTP 1ul,MgCl2 3ul,两对引物的上下游引物各1ul,Taq酶1ul,DNA模板2ul,超纯水12ul。
5.根据权利要求3所述的一种鉴定大眼鳜亲缘关系的方法,其特征在于,所述的步骤S2中,PCR扩增的反应程序为:94℃预变性3分钟; 然后94℃变性30秒,58℃退火30秒,72℃延伸45秒,共35个循环;最后72℃延伸10分钟,4℃保存。
6.根据权利要求3所述的一种鉴定大眼鳜亲缘关系的方法,其特征在于,所述的步骤S5中,应用的遗传分析软件为MEGA软件。
【技术特征摘要】
1.一种鉴定大眼鳜亲缘关系的微卫星引物,其特征在于,
2.根据权利要求1所述的一种鉴定大眼鳜亲缘关系的微卫星引物,其特征在于,
3.一种鉴定大眼鳜亲缘关系的方法,其特征在于,所述的鉴定方法包括以下步骤:
4.根据权利要求3所述的一种鉴定大眼鳜亲缘关系的方法,其特征在于,所述的步骤s2中, pcr扩增的反应体系为25ul:10×pcr buffer 3ul,2.5mmol/l dntp 1ul,mgcl2 3ul,两对引...
【专利技术属性】
技术研发人员:孙滔滔,宋江腾,张华怡乐,冯杰,王利平,谢林伸,田勇,赵仁竹,
申请(专利权)人:深圳市环境科学研究院,
类型:发明
国别省市:
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