【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物，尤其涉及一种用于检测结直肠癌的甲基化标志物、探针组合物及其应用。
技术介绍
1、结直肠癌是一种常见的癌症，也是世界范围内的一大健康问题。据统计，全球每年约有90万人死于结直肠癌，是第四大致命癌症。目前，结直肠癌发病率和死亡率呈上升趋势，发病人数达到41万人，死亡人数高达16万人。结直肠癌的高发生率和死亡率与其常在无症状状态下进行进展有关。i期患者接受及时治疗，5年生存期超过90％。因此，早期诊断和治疗对于结直肠癌的预后至关重要。
2、目前，结肠镜是确诊结直肠癌的金标准。但由于高昂的费用、较差的可依从性以及可能的手术风险，使得结肠镜难以大规模应用于无症状人群的筛查。另外，粪便隐血试验(fobt)和外周血癌胚抗原(cea)虽然易于接受，但其较差的灵敏度和特异度也给结直肠癌早期诊治带来了挑战。
3、因此，发现一种新的结直肠癌生物标志物，既可以提高结直肠癌的诊断效率，又可以方便患者的诊治，有着重要的临床意义。寻找结直肠癌生物标志物的研究不断进行，目前已经有很多标志物被发现，并被证明可以在结直肠癌的早期诊断和治疗中发挥重要的作用。这些结直肠癌生物标志物可以是蛋白质、dna、rna等分子，通过其在结直肠癌组织或体液中的特异性表达或改变来实现结直肠癌的检测和诊断。因此，发掘和研究结直肠癌生物标志物，对于结直肠癌的早期诊断和治疗具有重要的意义。
技术实现思路
1、现有技术中一般常用肠镜、粪便隐血试验(fobt)和外周血癌胚抗原(cea)进行筛查或者诊断，
2、例如，对于肠镜检查，其是一种常见的筛查结直肠癌和息肉的方法，但是它也存在一些缺点，这些缺点可能会影响其在筛查中的应用。以下是几个结直肠镜检查的缺点：
3、1.不适用于所有人群：结直肠镜检查需要患者进行肠道准备，并且需要使用一根灵活的探头穿过肛门，这可能会对某些患者造成不适或痛苦。此外，对于某些高龄或身体虚弱的患者，结直肠镜检查可能会有风险。
4、2.无法全面评估结直肠：尽管结直肠镜检查可以直接观察结直肠黏膜表面，但它只能观察到镜头能够到达的区域。由于结直肠弯曲和狭窄，有些结直肠区域可能无法被检查到，这可能会导致错过某些息肉或肿瘤。
5、3.对于小型息肉检测不敏感：由于结直肠镜检查的限制，一些小型息肉可能会被错过。尽管这些小型息肉可能并不具有癌变的风险，但如果不及时发现和切除，它们可能会逐渐生长，并最终导致癌症。
6、4.需要专业技术支持：结直肠镜检查需要经过专业的医生培训和资质认证才能进行。此外，对于检查结果的解读也需要专业知识和经验，这可能会导致一些误诊或漏诊的情况。
7、这些缺点表明，结直肠镜检查并不是一种完美的筛查方法。因此，在开发结直肠癌的诊断和筛查技术时，需要考虑这些缺点，并尝试解决它们，从而提高结直肠癌的诊断准确性和筛查效率。
8、对于粪便隐血试验(fobt)，其是一种简便易行、非侵入性的结直肠癌筛查方法，但也存在一些缺点：
9、1.敏感性和特异性有限：粪便隐血试验对结直肠癌的敏感性和特异性都不是非常高，可能会存在假阴性或假阳性的情况，影响筛查效果。
10、2.需要连续采集样本：为了提高检测准确率，需要连续采集三天的粪便样本，不方便且容易引起患者不适。
11、3.无法区分出血源：粪便隐血试验只能检测出存在隐血，但无法确定血液来自哪个部位，不能准确定位肿瘤位置。
12、4.无法发现早期肿瘤：结直肠癌早期肿瘤出血量很少，可能无法被检测出来，因此粪便隐血试验的早期筛查效果有限。
13、总之，虽然粪便隐血试验是一种简单易行的结直肠癌筛查方法，但是其敏感性和特异性有限，无法确定肿瘤位置和发现早期肿瘤，需要结合其他检查方法进行综合筛查。
14、对于外周血癌胚抗原(cea)，其在结直肠癌早期筛查中存在以下缺点和不足：
15、1.缺乏特异性：cea不仅在结直肠癌患者中升高，还可能在其他癌症、炎症和某些疾病中升高，因此cea的升高并不能完全确定是否患有结直肠癌。
16、2.缺乏敏感性：在早期结直肠癌患者中，cea的水平并不一定升高，因此cea测试可能会漏诊早期结直肠癌。
17、3.没有统一标准：cea的正常值范围因年龄、性别、吸烟史等因素而异，缺乏统一标准。
18、4.无法替代肠镜检查：虽然cea可以作为结直肠癌筛查的辅助手段，但它不能替代肠镜检查，因为肠镜检查可以直接观察肠道内部的情况，更加准确地诊断早期结直肠癌。
19、综上所述，cea在结直肠癌早期筛查中具有一定的缺点和不足，需要结合其他检查方法综合判断。
20、基于此，本申请提供了一种用于检测结直肠癌的标志物、探针组合物以及应用，可以用于结直肠癌的筛查，所述的标志物以非侵入性的方式用于无症状人群的筛查，以及癌症患者的预后检测，降低了侵入性检测造成的危害，并且具有更高的灵敏度和准确性，能够实现实时监测。
21、本申请具体技术方案如下：
22、1.一种用于检测结直肠癌的甲基化标志物，其中，所述甲基化标志物为chga基因或skor2基因。
23、2.根据项1所述的甲基化标志物，其中，所述甲基化标志物的靶序列如seq idnos:1-12中任一项所示或者包含如seq id nos:1-12中任一项所示的序列。
24、3.一种探针组合物，其中，所述探针组合物包含靶向项1或2所述甲基化标志物靶序列甲基化的探针。
25、4.根据项3所述的探针组合物，其中，所述探针组合物包含高甲基化的第一探针组合物和低甲基化的第二探针组合物，所述第一探针组合物用于与经重亚硫酸盐转化的cg高甲基化的区域杂交，所述第二探针组合物用于与经重亚硫酸盐转化的cg低甲基化的区域杂交；
26、优选的，所述第一探针组合物包括n个探针，所述n个探针与经重亚硫酸盐转化的cg高甲基化的区域的正义链和/或反义链的每个核苷酸杂交，优选的，所述第二探针组合物包括m个探针，所述m个探针与经重亚硫酸盐转化的cg低甲基化的区域的正义链和/反义链的每个核苷酸杂交，进一步优选的，n和m均是1-10中的任意整数；
27、优选的，第n-1个探针和第n个探针之间有x1个核苷酸重叠，优选的，x1为0-100中的任意整数；
28、优选的，第m-1个探针和第m个探针之间有x2个核苷酸重叠，优选的，x2为0-100中的任意整数；
29、进一步优选的，所述第一探针组合物包括如seq id no:13-16所示的核苷酸序列；所述第二探针组合物包括如seq id no:17-20所示的核苷酸序列。
30、5.用于检测甲基化标志物靶序列的核酸在制备用于检测结直肠癌的试剂盒中的用途，其中，所述甲基化标志物为chga基因或skor2基因。
31、6.根据项5所述的用途，其中，所述甲基化标志物的靶序列本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种用于检测结直肠癌的甲基化标志物，其中，所述甲基化标志物为CHGA基因或SKOR2基因。
2.根据权利要求1所述的甲基化标志物，其中，所述甲基化标志物的靶序列如SEQ IDNOs:1-12中任一项所示或者包含如SEQ ID NOs:1-12中任一项所示的序列。
3.一种探针组合物，其中，所述探针组合物包含靶向权利要求1或2所述甲基化标志物靶序列甲基化的探针。
4.根据权利要求3所述的探针组合物，其中，所述探针组合物包含高甲基化的第一探针组合物和低甲基化的第二探针组合物，所述第一探针组合物用于与经重亚硫酸盐转化的CG高甲基化的区域杂交，所述第二探针组合物用于与经重亚硫酸盐转化的CG低甲基化的区域杂交；
5.用于检测甲基化标志物靶序列的核酸在制备用于检测结直肠癌的试剂盒中的用途，其中，所述甲基化标志物为CHGA基因或SKOR2基因。
6.根据权利要求5所述的用途，其中，所述甲基化标志物的靶序列如SEQ ID NOs:1-12中任一项所示或者包含如SEQ ID NOs:1-12中任一项所示的序列；
7.根据权
8.一种用于结直肠癌检测的组合物，其中，所述组合物包含用于检测CHGA基因或SKOR2基因甲基化的核酸。
9.根据权利要求8所述的组合物，其中，所述CHGA基因或SKOR2基因的靶序列如SEQ IDNOs:1-12中任一项所示或者包含如SEQ ID NOs:1-12中任一项所示的序列；
10.根据权利要求8或9所述的组合物，其中，所述核酸包括：
...【技术特征摘要】
1.一种用于检测结直肠癌的甲基化标志物，其中，所述甲基化标志物为chga基因或skor2基因。
2.根据权利要求1所述的甲基化标志物，其中，所述甲基化标志物的靶序列如seq idnos:1-12中任一项所示或者包含如seq id nos:1-12中任一项所示的序列。
3.一种探针组合物，其中，所述探针组合物包含靶向权利要求1或2所述甲基化标志物靶序列甲基化的探针。
4.根据权利要求3所述的探针组合物，其中，所述探针组合物包含高甲基化的第一探针组合物和低甲基化的第二探针组合物，所述第一探针组合物用于与经重亚硫酸盐转化的cg高甲基化的区域杂交，所述第二探针组合物用于与经重亚硫酸盐转化的cg低甲基化的区域杂交；
5.用于检测甲基化标志物靶序列的核酸在制备用于检测结直...
【专利技术属性】
技术研发人员：李永君，魏闯，王秀秀，郭媛媛，刘栓平，关晋霞，杨亚东，
申请(专利权)人：博尔诚北京科技有限公司，
类型：发明
国别省市：
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