【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及蛋鸡遗传标记筛选，尤其涉及一种slc25a38基因中与蛋鸡蛋品质性状相关的单倍型snp分子标记组合、引物对及其应用。
技术介绍
1、随着生活水平的提高，人们越来越追求优质的畜禽产品。鸡蛋因其营养价值高且有效转化率高达98％以上成为被人们所喜爱的食品之一。蛋壳颜色和蛋壳强度虽不能决定蛋的品质与营养价值，然而消费者往往会把蛋壳颜色作为购买鸡蛋的直观性状，同时，由于蛋壳强度影响鸡蛋的破损率，同样被人们重视。目前，市场上鸡蛋主要有四种，褐壳鸡蛋、粉壳鸡蛋、白壳鸡蛋和绿壳鸡蛋，其中褐壳鸡蛋和粉壳鸡蛋在我国占据主要市场。在生产实践中发现褐壳蛋鸡群体中存在褐壳蛋颜色不均一、蛋壳颜色变浅等现象，这制约着养殖者的养殖效益。蛋壳褐色深浅度取决于蛋壳中原卟啉ⅸ的总量。同一品种不同个体之间所产的褐壳蛋颜色不同，这是因为合成原卟啉的能力因蛋鸡个体不同而有差异，和个体的遗传基础有关；此外，同一个体不同产蛋阶段所产的蛋，蛋壳褐色度也存在一定差异，这可能与多个因素相关，如周龄、应激、营养、药物和疾病等因素都会影响褐壳蛋颜色均一性，导致褐壳蛋颜色呈现由深棕色到浅褐色之间的不同颜色。
2、褐壳蛋中的主要色素成分是原卟啉ⅸ，它是血红素合成的前提。血红素生物合成的第一步是甘氨酸和琥珀酰辅酶a缩合形成δ-氨基乙酰丙酸(aminolevuinic acid，ala)，ala被催化缩合成卟胆原，4分子的卟胆原进一步缩合成尿卟啉原ⅲ，经脱羧生成粪卟啉原ⅲ，粪卟啉原ⅲ氧化脱羧形成原卟啉ⅸ，再经亚铁螯合酶催化，将亚铁掺入原卟啉ⅸ中，形成血红素。氨基乙酰丙
3、然而，迄今为止，关于slc25a38基因在蛋鸡上的研究尚未见报道，无有关蛋鸡slc25a38基因作为蛋鸡蛋品质性状的分子标记的研究。
技术实现思路
1、本专利技术提供的一种slc25a38基因中与蛋鸡蛋品质性状相关的单倍型snp分子标记组合、引物对及其应用，旨在解决上述
技术介绍
中存在的问题。
2、为了实现上述技术目的，本专利技术主要采用如下技术方案：
3、第一方面，本专利技术公开了一种slc25a38基因中与蛋鸡蛋品质性状相关的单倍型snp分子标记组合，所述蛋鸡蛋品质性状包括蛋壳颜色l、蛋壳强度、sci中的一种或多种；所述snp分子标记位于蛋鸡slc25a38基因编码区，包括snp位点1、snp位点2、snp位点3、snp位点4和snp位点5；
4、所述snp位点1为在如seq id no：1所示序列的第473位，或slc25a38基因反向互补序列第3515位，存在a/g突变；
5、所述snp位点2为在如seq id no：1所示序列的第603位，或slc25a38基因反向互补序列第3645位，存在t/c突变；
6、所述snp位点3为在如seq id no：2所示序列的第566位，或slc25a38基因反向互补序列第4247位，存在g/a突变；
7、所述snp位点4为在如seq id no：3所示序列的第350位，或slc25a38基因反向互补序列第5431位，存在a/g突变；
8、所述snp位点5为在如seq id no：3所示序列的第413位，或slc25a38基因反向互补序列第5494位，存在c/g突变。
9、在本专利技术的较佳实施方式中，当所述snp分子标记组合为atgac/atgac单倍型时，蛋壳颜色l和sci方面显著优于其他单倍型组合；当所述snp分子标记组合为acaac/atgac单倍型时，蛋壳强度方面显著优于其他单倍型组合。
10、第二方面，本专利技术公开了一种如第一方面所述的单倍型snp分子标记组合在蛋鸡辅助育种或蛋鸡蛋品质性状辅助选择中的应用。
11、第三方面，本专利技术公开了一种检测第一方面中所述snp位点1和/或snp位点2的引物，其特征在于，核苷酸序列为：上游引物1-f的核苷酸序列如seq id no：4所示，下游引物1-r的核苷酸序列如seq id no：5所示。
12、第四方面，本专利技术公开了一种检测第一方面中所述snp位点3的引物，其特征在于，核苷酸序列为：上游引物2-f的核苷酸序列如seq id no：6所示，下游引物2-r的核苷酸序列如seq id no：7所示。
13、第五方面，本专利技术公开了一种检测第一方面中所述snp位点4和/或snp位点5的引物，其特征在于，核苷酸序列为：上游引物3-f的核苷酸序列如seq id no：8所示，下游引物3-r的核苷酸序列如seq id no：9所示。
14、第六方面，本专利技术公开了一种如第三方面、第四方面、第五方面任一项所述的引物在蛋鸡辅助育种或蛋鸡蛋品质性状辅助选择中的应用。
15、第七方面，本专利技术公开了一种检测蛋鸡蛋品质性状的试剂盒，所述蛋鸡蛋品质性状包括蛋壳颜色l、蛋壳强度、sci中的一种或多种；包括如第三方面、第四方面、第五方面所述的引物。
16、第八方面，本专利技术公开了一种如第七方面所述的试剂盒在检测蛋鸡蛋品质性状中的应用。
17、第九方面，本专利技术公开了一种蛋鸡蛋品质性状筛选的方法，所述蛋鸡蛋品质性状包括蛋壳颜色l、蛋壳强度、sci中的一种或多种；包括如下步骤：
18、(1)从蛋鸡血液中提取基因组dna；
19、(2)利用如第三方面所述的引物进行pcr扩增，得到第一方面中如seq id no：1所示序列；利用如第四方面所述的引物进行pcr扩增，得到第一方面中如seq id no：2所示序列；利用如第五方面所述的引物进行pcr扩增，得到第一方面中如seq id no：3所示序列；
20、(3)对seq id no：1、seq id no：2和seq id no：3所示序列进行测序，筛查dna序列突变位点，分析slc25a38基因的单本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种SLC25A38基因中与蛋鸡蛋品质性状相关的单倍型SNP分子标记组合，其特征在于，所述蛋鸡蛋品质性状包括蛋壳颜色L、蛋壳强度、SCI中的一种或多种；所述SNP分子标记位于蛋鸡SLC25A38基因编码区，包括SNP位点1、SNP位点2、SNP位点3、SNP位点4和SNP位点5；
2.根据权利要求1所述的单倍型SNP分子标记组合，其特征在于，当所述SNP分子标记组合为ATGAC/ATGAC单倍型时，蛋壳颜色L和SCI方面显著优于其他单倍型组合；当所述SNP分子标记组合为ACAAC/ATGAC单倍型时，蛋壳强度方面显著优于其他单倍型组合。
3.如权利要求1所述的单倍型SNP分子标记组合在蛋鸡辅助育种或蛋鸡蛋品质性状辅助选择中的应用。
4.检测权利要求1中所述SNP位点1和/或SNP位点2的引物，其特征在于，核苷酸序列为：上游引物1-F的核苷酸序列如SEQ ID NO：4所示，下游引物1-R的核苷酸序列如SEQ ID NO：5所示。
5.检测权利要求1中所述SNP位点3的引物，其特征在于，核苷酸序列为：上游引物2-F的核苷酸序列如S
6.检测权利要求1中所述SNP位点4和/或SNP位点5的引物，其特征在于，核苷酸序列为：上游引物3-F的核苷酸序列如SEQ ID NO：8所示，下游引物3-R的核苷酸序列如SEQ ID NO：9所示。
7.如权利要求4-6任一项所述的引物在蛋鸡辅助育种或蛋鸡蛋品质性状辅助选择中的应用。
8.一种检测蛋鸡蛋品质性状的试剂盒，其特征在于，所述蛋鸡蛋品质性状包括蛋壳颜色L、蛋壳强度、SCI中的一种或多种；包括如权利要求4所述的引物、权利要求5所述的引物和权利要求6所述的引物。
9.如权利要求8所述的试剂盒在检测蛋鸡蛋品质性状中的应用。
10.一种蛋鸡蛋品质性状筛选的方法，其特征在于，所述蛋鸡蛋品质性状包括蛋壳颜色L、蛋壳强度、SCI中的一种或多种；包括如下步骤：
...【技术特征摘要】
1.一种slc25a38基因中与蛋鸡蛋品质性状相关的单倍型snp分子标记组合，其特征在于，所述蛋鸡蛋品质性状包括蛋壳颜色l、蛋壳强度、sci中的一种或多种；所述snp分子标记位于蛋鸡slc25a38基因编码区，包括snp位点1、snp位点2、snp位点3、snp位点4和snp位点5；
2.根据权利要求1所述的单倍型snp分子标记组合，其特征在于，当所述snp分子标记组合为atgac/atgac单倍型时，蛋壳颜色l和sci方面显著优于其他单倍型组合；当所述snp分子标记组合为acaac/atgac单倍型时，蛋壳强度方面显著优于其他单倍型组合。
3.如权利要求1所述的单倍型snp分子标记组合在蛋鸡辅助育种或蛋鸡蛋品质性状辅助选择中的应用。
4.检测权利要求1中所述snp位点1和/或snp位点2的引物，其特征在于，核苷酸序列为：上游引物1-f的核苷酸序列如seq id no：4所示，下游引物1-r的核苷酸序列如seq id no：5所示。
5.检测...
【专利技术属性】
技术研发人员：吴艳，刘慧敏，皮劲松，付明，张昊，潘爱銮，黄涛，申杰，陈亚茹，
申请(专利权)人：湖北省农业科学院畜牧兽医研究所，
类型：发明
国别省市：
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。