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【技术实现步骤摘要】
本文件涉及细胞分类,尤其涉及一种胸主动脉夹层关键细胞类型及亚型的分类方法及装置。
技术介绍
1、胸主动脉夹层(thoracic aortic dissection,tad)是一种极其凶险的心血管疾病,其特征是主动脉内膜的撕裂,导致主动脉壁内形成血管“假腔”,巨大的血流压力使撕裂口快速延伸,假腔压迫,最终导致血管壁的破裂。年轻患者的tad往往与遗传因素(如主动脉双瓣等)、结缔组织疾病(如马凡综合征、ehlews-danlos综合征等)或极端体力活动有关,其发病机制与其他患者具有显著差异。细胞类型/亚型在疾病发生发展中扮演着关键角色,但目前缺乏针对胸主动脉夹层患者关键细胞类型/亚型的深入研究,既往传统研究方法亦通常依赖于组织样本的宏观分析,难以精确识别和分析特定细胞类型/亚型。
技术实现思路
1、本专利技术提供一种胸主动脉夹层关键细胞类型及亚型的分类方法及装置,旨在解决上述问题。
2、本专利技术实施例提供一种胸主动脉夹层关键细胞类型及亚型的分类方法,包括:
3、s1、获取胸主动脉夹层及正常对照的组织样本的基因表达数据,并对所述基因表达数据进行预处理获得细胞类型;
4、s2、获取所述主动脉夹层和正常对照组织样本中的所述细胞类型的比例,将升高比例高于预设值的细胞类型确定为胸主动脉夹层疑似关键细胞类型;
5、s3、基于所述疑似关键细胞类型的基因表达数据,进行标准化、归一化、降维聚类分析,得到所述胸主动脉夹层疑似关键细胞类型对应的细胞亚型;
>6、s4、根据所述胸主动脉夹层疑似关键细胞类型对应的细胞亚型确定胸主动脉夹层疑似关键细胞亚型;
7、s5、根据所述胸主动脉夹层疑似关键细胞类型及所述胸主动脉夹层疑似关键细胞亚型通过通路与功能富集分析、轨迹分析、基因加权共表达网络分析、细胞通讯分析确定动脉夹层关键细胞类型及亚型。
8、本专利技术实施例提供一种胸主动脉夹层关键细胞类型及亚型的分类装置,包括:
9、数据获取模块,用于获取胸主动脉夹层及正常对照的组织样本的基因表达数据,并对所述基因表达数据进行预处理获得细胞类型;
10、疑似关键细胞类型确定模块,用于获取所述主动脉夹层和正常对照组织样本中的所述细胞类型的比例,将升高比例高于预设值的细胞类型确定为胸主动脉夹层疑似关键细胞类型;
11、对应细胞亚型确定模块,基于所述疑似关键细胞类型的基因表达数据,进行标准化、归一化、降维聚类分析,得到所述胸主动脉夹层疑似关键细胞类型对应的细胞亚型;
12、疑似关键细胞亚型,用于根据所述胸主动脉夹层疑似关键细胞类型对应的细胞亚型确定胸主动脉夹层疑似关键细胞亚型;
13、关键细胞类型及亚型确定模块,用于根据所述胸主动脉夹层疑似关键细胞类型及所述胸主动脉夹层疑似关键细胞亚型通过通路与功能富集分析、轨迹分析、基因加权共表达网络分析、细胞通讯分析确定动脉夹层关键细胞类型及亚型。
14、采用本专利技术实施例,通过对胸主动脉夹层及正常对照的组织样本的基因表达数据进行处理,并通过通路与功能富集分析、轨迹分析、基因加权共表达网络分析、细胞通讯分析确定动脉夹层关键细胞类型及亚型,有助于提高对胸主动脉夹层患者发病的认识。
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1.一种胸主动脉夹层关键细胞类型及亚型的分类方法,其特征在于包括:
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述并对所述基因表达数据进行预处理获得细胞类型具体包括:
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述细胞类型包括以下至少之一:平滑肌细胞、成纤维细胞、内皮细胞、髓系细胞、T细胞、B细胞、浆细胞、树突状细胞、NK/T细胞、肥大细胞、间充质细胞和神经鞘施万细胞。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述细胞亚型类型包括以下至少之一:成纤维类平滑肌、炎症性平滑肌、应激型平滑肌、收缩型平滑肌。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述S5具体包括:
6.一种胸主动脉夹层关键细胞类型及亚型的分类装置,其特征在于,包括:
7.根据权利要求6所述的装置,其特征在于,所述数据获取模块,具体用于:
8.根据权利要求6所述的装置,其特征在于,所述细胞类型包括以下至少之一:平滑肌细胞、成纤维细胞、内皮细胞、髓系细胞、T细胞、B细胞、浆细胞、树突状细胞、NK/T细胞、肥大细胞、间充质细胞和神经鞘施
9.根据权利要求6所述的装置,其特征在于,所述细胞亚型类型包括以下至少之一:成纤维类平滑肌、炎症性平滑肌、应激型平滑肌、收缩型平滑肌。
10.根据权利要求6所述的装置,其特征在于,所述关键细胞类型及亚型确定模块具体用于:
...【技术特征摘要】
1.一种胸主动脉夹层关键细胞类型及亚型的分类方法,其特征在于包括:
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述并对所述基因表达数据进行预处理获得细胞类型具体包括:
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述细胞类型包括以下至少之一:平滑肌细胞、成纤维细胞、内皮细胞、髓系细胞、t细胞、b细胞、浆细胞、树突状细胞、nk/t细胞、肥大细胞、间充质细胞和神经鞘施万细胞。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述细胞亚型类型包括以下至少之一:成纤维类平滑肌、炎症性平滑肌、应激型平滑肌、收缩型平滑肌。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述s5具体包括:
【专利技术属性】
技术研发人员:杨毅宁,彭辉,陶静,闫磊,永佳蕙,沈娟,杨焕杰,
申请(专利权)人:新疆维吾尔自治区人民医院,
类型:发明
国别省市:
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