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【技术实现步骤摘要】
本申请涉及基因测序领域,具体地,涉及一种采用计算机系统控制测序设备进行测序的方法、装置和用途。
技术介绍
1、随着基因测序技术的不断发展和普及,越来越多的实验室和企业开始投入到这个领域中。在进行基因测序实验过程中,构建不同的文库,对应的实验流程不同。这就意味着,实验模式、环节不同,对应到具体的步骤上,则会涉及到不同的实验流程和实验参数以及使用不同的设备等。然而,目前的自动化测序的手段仍有待改进。
技术实现思路
1、本申请是基于专利技术人的下列发现而完成的:
2、现有的基因测序实验中多数采用事先封装好的工序进行组装,通常会面临下述问题:
3、1)不同的待测样品进入实验后,可能存在进行不同的工序流程,后续又合并走相同工序流程的情况;
4、2)样品进入实验流程后,存在中途切换工序流程的情况;
5、3)不同工序所在步骤需要记录或查看的实验参数不同,需要记录或操作的形式不同;
6、4)样品在实验流程中可能存在合并或拆分等情况(如,pooling文库,芯片按样本编号拆分等)。
7、基于上述问题而导致基因测序实验通常需要手动完成大量操作,这样容易出现实验误差和操作疏忽,同时也很耗费时间和精力。为适配不同的实验场景,需要开发一种能自动灵活组装技术路线并且快速适应不同实验模式的用户配置界面,减少或缩短因流程不同导致的新功能开发。目前尚未有可以自动灵活组装技术路线以适应不同实验模式的变化的界面配置。
8、为了解决这些问
9、因此,在本专利技术的第一方面,本申请提供了一种基于计算机系统控制动态调整基因测序成像流程的方法。换句话说,本申请提供了一种采用计算机系统控制测序设备进行测序的方法,所述计算机系统包括人机交互界面,所述计算机系统存储有多个技术路线,每个所述技术路线对应的工序流程以及所述工序流程的处理步骤,所述方法包括:在所述人机交互界面的第一界面展示技术路线选项、工序流程选项、处理步骤选项;获取用户对所述技术路线选项的选择指令,以使所述工序流程选项展示与所选择的所述技术路线对应的所述工序流程;获取用户对所述工序流程选项的选择指令,以使所述处理步骤选项展示所选择的所述工序流程的默认处理步骤;获取用户的技术路线配置指令,以在第二界面展示技术路线组装区域和预组装工序流程区域,所述技术路线组装区域展示全部可选用工序流程;获取用户在所述技术路线组装区域中的选择指令,以在所述预组装工序流程区域展示已选择的至少一个所述工序流程;获取用户在所述的预组装工序流程区域的排序指令,以对所述预组装工序流程区域展示的所述工序流程进行排序,以便完成对所述技术路线的配置;获取用户在所述工序流程组装区域的选择指令,以在所述预组装处理步骤区域显示与每个所选择的处理步骤的步骤方法选项;获取用户针对每个所选择的处理步骤确定的步骤方法选择指令,以在所述预组装处理步骤区域生成与所述工序流程对应的处理步骤;获取用户的步骤配置指令,以在第四界面展示设备配置区域和设备参数配置区域;获取用户在所述设备配置区域和设备参数配置区域的指令,以针对给定处理步骤生成所述处理步骤的处理指令;和基于所述处理步骤的处理指令,将至少一个样本输入至所述测序设备,按照所述处理指令依次在多个处理单元实施所述处理步骤。根据本专利技术实施例所述的方法,在控制基因测序方面具有自动化程度高、灵活性强、降低人为操作的失误率等优势,并且极大提高实验的效率。
10、在本专利技术的第二方面,本专利技术提出了一种第一方面所述方法在基因测序中的用途。根据本专利技术的实施例,所述方法应用与测序中能够灵活配置测序流程,减少人工操作导致的误差。
11、在本专利技术的第三方面,本专利技术提出了一种基于计算机系统的控制测序装置,即采用计算机系统控制测序设备进行测序的装置。根据本专利技术的实施例,所述装置包括:配置模块,通过人机交互界面的第一界面展示技术路线选项、工序流程选项、处理步骤选项,获取用户对所述技术路线选项的选择指令,使所述工序流程选项展示与所选择的所述技术路线对应的所述工序流程;获取用户对所述工序流程选项的选择指令,使所述处理步骤选项展示所选择的所述工序流程的默认处理步骤;获取用户的技术路线配置指令,在第二界面展示技术路线组装区域和预组装工序流程区域,所述技术路线组装区域展示全部可选用工序流程;获取用户在所述技术路线组装区域中的选择指令,在所述预组装工序流程区域展示已选择的至少一个所述工序流程;获取用户在所述的预组装工序流程区域的排序指令,对所述预组装工序流程区域展示的所述工序流程进行排序,以便完成对所述技术路线的配置;获取用户的工序流程配置指令,在第三界面展示工序流程组装区域和预组装处理步骤区域,所述工序流程组装区域展示可选用处理步骤;获取用户在所述工序流程组装区域的选择指令,在所述预组装处理步骤区域显示与每个所选择的处理步骤的步骤方法选项;获取用户针对每个所选择的处理步骤确定的步骤方法选择指令,在所述预组装处理步骤区域生成与所述工序流程对应的处理步骤;获取用户的步骤配置指令,在第四界面展示设备配置区域和设备参数配置区域;获取用户在所述设备配置区域和设备参数配置区域的指令,针对给定处理步骤生成所述处理步骤的处理指令;和处理模块,所述处理模块与所述配置模块相连,基于所述处理步骤的处理指令,将至少一个样本输入至所述测序设备,按照所述处理指令依次在多个处理单元实施所述处理步骤。
12、在本专利技术的第四方面,本专利技术提出了一种基因测序流程界面动态配置方法。根据本专利技术的实施例,所述方法包括:在技术路线界面获取目标技术路线;基于获取的所述目标技术路线动态配置目标工序流程。根据本申请的实施例,该方法在控制基因测序方面具有自动化程度高、灵活性强、降低人为操作的失误率等优势,并且极大提高实验的效率。
13、在本专利技术的第五方面,本专利技术提出了一种用户界面配置装置。根据本专利技术的实施例,所述装置包括:技术路线获取模块,用于从技术路线中获取目标技术路线;切换模块,所述切换模块与所述获取模块相连,用于根据获取到的所述目标技术路线确定目标基因测序流程;配置模块,所述配置模块与所述切换模块相连,用于根据所述目标基因测序流程配置所述用户界面。根据本专利技术的实施例,所述装置能够通过获取模块和切换模块自动确定目标基因测序流程,使得整个配置过程更为自动化和高效;所述配置模块可以根据需求灵活配置用户实验需求。
14、在本专利技术的第六方面,本专利技术提出了一种动态调整基因测序成像流程的方法。根据本专利技术的实施例,所述方法包括:针对多个测序工序流程中相同实验步骤进行合并处理,以便获得合并处理数据;针对多个测序工序流程中不同实验步骤进行分流处理,以便获得分流本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种采用计算机系统控制测序设备进行测序的方法,其特征在于,所述计算机系统包括人机交互界面,所述计算机系统存储有多个技术路线,每个所述技术路线对应的工序流程以及所述工序流程的处理步骤,所述方法包括:
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述处理单元接收多个与处理指令匹配的样本分别实施所述处理步骤。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述技术路线选项包括选自文库构建、基因测序和RNA转录中的至少之一。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述工序流程选项包括选自样本质量控制、文库构建、DNB制备、文库类型、DNB池化、DNB装载、测序和分析中的至少之一。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述处理步骤选项包括选自取样、PCR纯化后定量、片选后定量和片选后均一化中的至少之一。
6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,包括:
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,进一步包括:
8.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,进一步包括:
9.根据权利要求6所述的
10.一种采用计算机系统控制测序设备进行测序的装置,其特征在于,包括:
11.根据权利要求10所述的装置,其特征在于,
12.根据权利要求11所述的装置,其特征在于,所述处理装置进一步用于:
13.根据权利要求11所述的装置,其特征在于,所述配置模块基于所述样本流的合并或分流,确定所述样本流在至少一个区段中的传输时间。
14.根据权利要求11所述的装置,其特征在于,所述测序设备设置有等待区,用于容纳等待与其他至少一个样本进行合并处理的样本。
15.一种采用计算机系统控制测序设备进行测序的方法,其特征在于,包括:
16.根据权利要求15所述的方法,其特征在于,所述配置模块基于所述样本流的合并或分流,确定所述样本流在至少一个区段中的传输时间,
17.根据权利要求15所述的方法,其特征在于,所述测序设备设置有等待区,用于容纳等待与其他至少一个样本进行合并处理的样本。
18.一种计算机程序产品,其特征在于,所述计算机程序产品包括计算机指令,当部分或全部所述计算机指令在计算机上运行时,使得如权利要求1~9任一项所述的方法被执行。
19.一种电子设备,其特征在于,包括处理器和存储器,所述存储器存储有计算机程序,所述计算机程序被所述处理器执行时实现权利要求1~9任一项所述的方法。
20.一种包含计算机程序的计算机可读存储介质,其特征在于,当所述计算机程序被一个或多个处理器执行时,使得所述处理器执行权利要求1~9任一项所述的方法。
...【技术特征摘要】
1.一种采用计算机系统控制测序设备进行测序的方法,其特征在于,所述计算机系统包括人机交互界面,所述计算机系统存储有多个技术路线,每个所述技术路线对应的工序流程以及所述工序流程的处理步骤,所述方法包括:
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述处理单元接收多个与处理指令匹配的样本分别实施所述处理步骤。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述技术路线选项包括选自文库构建、基因测序和rna转录中的至少之一。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述工序流程选项包括选自样本质量控制、文库构建、dnb制备、文库类型、dnb池化、dnb装载、测序和分析中的至少之一。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述处理步骤选项包括选自取样、pcr纯化后定量、片选后定量和片选后均一化中的至少之一。
6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,包括:
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,进一步包括:
8.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,进一步包括:
9.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述测序设备设置有等待区,用于容纳等待与其他至少一个样本进行合并处理的样本。
10.一种采用计算机系统控制测序设备进行测序的装置,其特征在于,包括:
11.根据权利要求10所述的装置,其特征在...
【专利技术属性】
技术研发人员:张丹丹,付坤,杨文,许海芬,樊清华,
申请(专利权)人:深圳华大智造科技股份有限公司,
类型:发明
国别省市:
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