【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于分子生物学，具体涉及一种与结球甘蓝抽薹时间相关的分子标记及其应用。
技术介绍
1、甘蓝为世界广泛种植的主要蔬菜作物之一，其栽培历史悠久，品种资源及其丰富，目前我国结球甘蓝每年种植面积在40万公顷以上，占全国蔬菜种植面积的25%~30%，是东北、西北、华北等地区春、夏、秋季栽培的主要蔬菜，在南方也有大积栽培。
2、抽薹开花是其生产中的重要农艺性状，“先期抽薹”降低产品的产量和品质，是春季结球甘蓝生产的主要问题，给生产带来巨大损失。因此，开发一种与结球甘蓝抽薹时间相关的分子标记并应用其筛选和鉴定结球甘蓝早抽薹品种极为重要。
技术实现思路
1、本专利技术的目的之一是提供一种indel分子标记在鉴定或筛选结球甘蓝抽薹时间早晚中的应用，所述indel分子标记的核苷酸序列为tcaatcaactagtggagacaaaaacaaa，该序列存在于早抽薹结球甘蓝dna基因组3号染色体的非编码区，不存在于晚抽薹结球甘蓝dna基因组3号染色体的非编码区。
2、本专利技术的目的之二是提供引物对bb3在鉴定或筛选结球甘蓝抽薹时间早晚中的应用，所述引物对bb3的序列如下：
3、bb3f：gtcaatcaactagtggagac；
4、bb3r：aggtcgctactttctgccaa。
5、本专利技术的目的之三是提供一种鉴定结球甘蓝早抽薹品种或材料的方法，包括以下步骤：
6、步骤1，提取待鉴定品种或材料的基因组dna；>
7、步骤2，以步骤1提取的dna为模板，利用引物对bb3其进行pcr扩增，引物对bb3的序列如下：
8、bb3f：gtcaatcaactagtggagac
9、bb3r：aggtcgctactttctgccaa；
10、步骤3，以步骤2的pcr扩增产物进行电泳分离，获得各样品的带型，如果得到448bp的片段，则说明待鉴定品种或者材料为早抽薹。
11、进一步地，步骤2中pcr扩增的反应体系为20 µl，其中含基因组dna 1 µl，上下游引物各1 µl，2xeasytaq pcr supermix for page 10µl。
12、进一步地，步骤2中pcr扩增的反应条件为：94℃预变性3min；94℃ 变性50 s，56℃50 s，72℃延伸60 s，35个循环；72℃ 延伸10min。
13、本专利技术以保存的早晚抽薹材料为基础，根据其基因组重测序结果结合多年表型鉴定结果进行差异序列分析，进行差异目标区段功能注释分析，筛选出与抽薹性状密切相关的分子标记，对早晚抽薹结球甘蓝dna进行pcr扩增，并结合其连续多年的抽薹期表型，进一步验证该分子标记与抽薹性状密切相关，利用该分子标记的引物对实现在甘蓝苗期阶段晚早晚抽薹结球甘蓝的早期快速分子标记鉴定，提高甘蓝耐抽薹品种的育种效率。
14、本专利技术提供的鉴定结球甘蓝抽薹早晚的分子标记及其引物对，可用于早期耐抽薹结球甘蓝育种材料的快速鉴定，克服了传统方法所需时间周期长、不准确性高等缺点；同时还有利于结球甘蓝耐抽薹分子标记辅助育种体系的建立。因此，本专利技术在甘蓝类蔬菜育种实践及耐抽薹理论研究上均具有重要意义。
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1. InDel分子标记在鉴定或筛选结球甘蓝抽薹时间早晚中的应用，其特征在于，所述InDel分子标记的核苷酸序列为TCAATCAACTAGTGGAGACAAAAACAAA，该序列存在于早抽薹结球甘蓝DNA基因组3号染色体的非编码区，不存在于晚抽薹结球甘蓝DNA基因组3号染色体的非编码区。
2.引物对Bb3在鉴定或筛选结球甘蓝抽薹时间早晚中的应用，其特征在于，所述引物对Bb3的序列如下：
3.一种鉴定结球甘蓝早抽薹品种或材料的方法，其特征在于，包括以下步骤：
4. 根据权利要求3所述的方法，其特征在于，步骤2中PCR扩增的反应体系为20 µL，其中含基因组DNA 1 µL，上下游引物各1 µL，2xEasyTaq PCR SuperMix for PAGE 10µL。
5. 根据权利要求3所述的方法，其特征在于，步骤2中PCR扩增的反应条件为：94℃预变性3min；94℃ 变性50 S，56℃ 50 S，72℃延伸60 S，35个循环；72℃ 延伸10min。
【技术特征摘要】
1. indel分子标记在鉴定或筛选结球甘蓝抽薹时间早晚中的应用，其特征在于，所述indel分子标记的核苷酸序列为tcaatcaactagtggagacaaaaacaaa，该序列存在于早抽薹结球甘蓝dna基因组3号染色体的非编码区，不存在于晚抽薹结球甘蓝dna基因组3号染色体的非编码区。
2.引物对bb3在鉴定或筛选结球甘蓝抽薹时间早晚中的应用，其特征在于，所述引物对bb3的序列如下：
3.一种鉴定结球甘蓝早抽薹品种或材料的方法，其...
【专利技术属性】
技术研发人员：许园园，曾爱松，邢苗苗，卢昱宇，严继勇，
申请(专利权)人：江苏省农业科学院，
类型：发明
国别省市：
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