【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及抗病毒药物，具体涉及一种抗病毒药物的筛选方法。
技术介绍
1、根据分子进化理论，病毒导致的流行病是病毒在人群(环境)中进行的适应性的越来越广传播，是适应性进化。在此进化过程中，有两种类型的基因起了重要的作用：一种是对其传播有促进作用的基因，另外一种就是维持正常功能的基因。这两类基因编码的蛋白具有加强病毒感染力和扩散的重要功能。
2、病毒具有迅速的传播性，造成大量的人员感染，因此，尽快找到抗病毒药物阻止病毒的传播是十分紧迫的。传统实验室方法，从头设计研发药物耗时长，而且耗资巨大。较长的流程和较高的失败率，使得短时间内获得有效抗病毒新药的难度是极大的；然而，通过已获批药物的老药新用，可大幅缩短抗病毒药物研发所需的时间。
3、有鉴于此，特提出本专利技术。
技术实现思路
1、本专利技术的目的在于提供一种抗病毒药物的筛选方法，本专利技术抗病毒药物的筛选方法能够从现有药物中筛选抗病毒药物，一周左右即可筛选得到抗病毒药物，快速可靠、无副作用，无需开发费用成本较低。
2、为了实现本专利技术的上述目的，特采用以下技术方案：
3、本专利技术第一方面提供了一种抗病毒药物的筛选方法，所述抗病毒药物的筛选方法包括如下步骤：
4、(a)靶基因的确定：
5、获取病毒的基因组，再计算基因组中基因的dn/ds比值，选择dn/ds比值＞1或dn/ds比值＜0.5的基因作为靶基因；
6、(b)抗病毒药物筛选：
8、(c)抗病毒药物复筛：
9、将靶基因进行表达纯化，再与筛选的抗病毒药物进行表面等离子体共振实验，去除不适用的抗病毒药物。
10、优选地，所述步骤(c)中，表面等离子体共振实验中靶基因表达蛋白与抗病毒药物的摩尔比为1∶(0.8～1.2)。
11、优选地，所述步骤(c)中，表面等离子体共振实验中靶基因表达蛋白浓度为10～50μg/ml，ph值为4.0～4.5。
12、优选地，所述步骤(a)中，从paml中获取病毒的基因组。
13、优选地，所述步骤(b)中，采用alphafold2预测靶基因编码蛋白的三维结构。
14、优选地，所述步骤(b)中，采用autodock4软件筛选与所述三维结构结合的抗病毒药物。
15、优选地，所述病毒包括猴痘病毒、新冠病毒、腺病毒a、腺病毒b、腺病毒c、a型流感病毒、乙型冠状病毒和乙型肝炎。
16、优选地，所述步骤(b)中，药物包括药物包括维萘妥拉(venetoclax)、尼罗替尼(nilotinib)、伊屈泼帕(eltrombopag)、arv-110试剂(bavdegalutamide)、金丝桃素(hypericin)、洋地黄毒苷(digitoxin)、西多福韦(cidofovir)、噻唑呋林、ribavirin、dutasteride、irinotecan hydrochloirde、tecovirimat和brincidofovir。
17、与现有技术相比，本专利技术的有益效果至少包括：
18、本专利技术抗病毒药物的筛选方法利用分子进化理论和蛋白和药物的docking，能够快速(一周左右)的从市场上已经出售的药物中筛选抗病毒药物，该筛选方法适应于所有的病毒；其速度取决于测定基因组的速度，筛选时间短；此外，本专利技术筛选方法能够从市场已有出售的药品中选择药物，绕过了疫苗，缩短研发时间和降低成本，该筛选方法快速可靠、无副作用、价格较低，并能够快速的找到抗病毒的特效药。
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1.一种抗病毒药物的筛选方法，其特征在于，所述抗病毒药物的筛选方法包括如下步骤：
2.根据权利要求1所述的抗病毒药物的筛选方法，其特征在于，所述步骤(c)中，表面等离子体共振实验中靶基因表达蛋白与抗病毒药物的摩尔比为1∶(0.8～1.2)。
3.根据权利要求1所述的抗病毒药物的筛选方法，其特征在于，所述步骤(c)中，表面等离子体共振实验中靶基因表达蛋白浓度为10～50μg/ml，pH值为4.0～4.5。
4.根据权利要求1所述的抗病毒药物的筛选方法，其特征在于，所述步骤(a)中，从PAML中获取病毒的基因组。
5.根据权利要求1所述的抗病毒药物的筛选方法，其特征在于，所述步骤(b)中，采用AlphaFold2预测靶基因编码蛋白的三维结构。
6.根据权利要求1所述的抗病毒药物的筛选方法，其特征在于，所述步骤(b)中，采用AutoDock4软件筛选与所述三维结构结合的抗病毒药物。
7.根据权利要求1所述的抗病毒药物的筛选方法，其特征在于，所述病毒包括猴痘病毒、新冠病毒、腺病毒A、腺病毒B、腺病毒C、A型流感病毒、
8.根据权利要求1所述的抗病毒药物的筛选方法，其特征在于，所述步骤(b)中，药物包括维萘妥拉、尼罗替尼、伊屈泼帕、ARV-110试剂、金丝桃素、洋地黄毒苷、西多福韦、噻唑呋林、Ribavirin、Dutasteride、Irinotecan hydrochloirde、Tecovirimat和Brincidofovir。
...【技术特征摘要】
1.一种抗病毒药物的筛选方法，其特征在于，所述抗病毒药物的筛选方法包括如下步骤：
2.根据权利要求1所述的抗病毒药物的筛选方法，其特征在于，所述步骤(c)中，表面等离子体共振实验中靶基因表达蛋白与抗病毒药物的摩尔比为1∶(0.8～1.2)。
3.根据权利要求1所述的抗病毒药物的筛选方法，其特征在于，所述步骤(c)中，表面等离子体共振实验中靶基因表达蛋白浓度为10～50μg/ml，ph值为4.0～4.5。
4.根据权利要求1所述的抗病毒药物的筛选方法，其特征在于，所述步骤(a)中，从paml中获取病毒的基因组。
5.根据权利要求1所述的抗病毒药物的筛选方法，其特征在于，所述步骤(b)中，采用alphafold2预测靶基因编码...
【专利技术属性】
技术研发人员：曹焕生，李高阳，王云，张力戈，周荟源，李莎，刘俐，
申请(专利权)人：昆山杜克大学，
类型：发明
国别省市：
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